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The map label for this gene is ntrY [C]

Identifier: 58617450

GI number: 58617450

Start: 1146408

End: 1148540

Strand: Reverse

Name: ntrY [C]

Synonym: ERGA_CDS_07230

Alternate gene names: 58617450

Gene position: 1148540-1146408 (Counterclockwise)

Preceding gene: 58617451

Following gene: 58617449

Centisome position: 76.57

GC content: 29.54

Gene sequence:

>2133_bases
ATGAAAAACTGGTTTATAAAGGTATATCGCAGCATAAATAAGTTAAAATTTTTTAAAATTGTTGCTTCATTTCTAGCTAT
ATCTATTTTTCTGTTTTCTGTTATAACTTATTGTGTTGTTTTCCATCATGATGATCCACTTGGGCCTGATCATAGTAAAG
CTATTAAATTAATATTTTTTGATTTAATATTATTTTTATTATTAATTACAAGTGTATCTTACAAGCTGATTAATATATGG
ATACAGAGGAAGAGAGGACGTTTAGGCTCACATTTGCAAACACGAATTGTGTTAATGTTTTCTGTGGTAGCTGTTATTCC
TACTATTATTATATCTGGATTTTCTAGCTTGTTTTTTAATTATAGTATTCAAGCTTGGTTTAATAAAAGGGTAGAAACTG
CTATGCATCAATCTATAAAAGTAGCAGAAGCCTATCTTAGAGAGCAGAAGAGAAATATTCGTTCTGATATCTTAGCTATA
TCGCATTATGTATCTGGTAATAAAGGATTATTATATTATGACAAAGGATATTTGCAGGATGTTGTTCAGTCTGAAGCAGA
TCTATTAGGATTATCAGAAGTATTGATTTTTCAACCAGGTAGAGTGATAGCAAGTAGTAAATTTAGCTTTGCTTTAAGTT
TTGATATGATTCCATGGTATGGTTTAGAAACAATAGATGATGATAAAGTGATTGTAATAACACAAGAAAATATGATACGT
GCTTTTTTGTTAATTGATGGGTTCTCATCTACGTATATTATGGTTGGCCGTATTATAGATATGAAAGTGTCTTCTCACTT
ATCTGCAACTAAGGGAGCTGTTAAATCTTATAGAGATTTACAATCTCAGATATCGTCGTTGCAAGTTCAATTTTCAATGA
TATTTATTTTAATATCATTGTTATTATTATTTACTGCGATTTGGTATGGTATTAATTTTTCTGGTGATATAGTTCGTCCA
TTATTGGATTTGTTTTATGCTACAAGGAAAGTTCAAAAGGGTGATTTATCTTTTAAAATAGAAGAAGGTAAAATTGGACA
AGAAATGTCTACGCTTGTGCGTGCATTTAACCAGATGACATCACAACTTAATACTCAACGTTCTCAGTTAATAAAATTAT
ATCAGGATATGAATGAAAGGAGAGAGTTTATAGAAGCTGTATTGTCAGGTATTTCTTCTGGGATAATAGCTGTAAATTGT
GCAGGTGTTATTACTTTAATGAATGATAAGGCAAAAGAATTGTTAGCTCCTGAAGTGTTAAATGTAGAACTTGATAGTGT
TTTTCCTGAAATATCTGAGTTGATAACAAGCAATAAGATGAAAGATGAAGTGATTGTAATTAGAAATAAAAAATCTTTTA
CTTTGTCTGTACGAATTAAAGTATTAGGCAGTGTTACAAAAGGATATATTATTACGTTTGATGATATTTCAAGTTTAGTT
GAAGCACAGAGATCAGCAGCATGGTCTGATGTTGCAAGAAGAATAGCACATGAGATAAAAAATCCTATTACTCCAATATA
TCTTGCTGCTGAAAGATTGAATAGCAAATATAAAAAAGAAATTGTATCTGACCAGGAAAGTTTTTCCAGGTATGTTGATA
CGATTATTCGTCATGTTACAAGTATTAGAGGGATTGTTGATGAATTTGCTAAATTTGCAAGGATGTCAGATCCTGTATTG
GTTAAGCATGATATTTGTAATATTATAAGGGATTTAGTATCTTCTGGGCAATTTAGCTGTGATCTTGTAGATTATAATTT
TAATGTACCAGATAAGCCAATTTTTGTGGTGTTAGATAAAAGTCAAATTAATCATGTATTTGTTAATTTATTTAAAAATG
CATGTGAGTCTATTGAAATTAAACATAATGTACATGGCAAAATAACTATTAGTGTAGTTGAAGATGATGACCAAGTTTAT
GTACAAGTACAAGATAATGGAATTGGTTTTCCAGAAGAGCTTATAGAAAAACTTACAGAACCTTATGTAACAACTCGTAG
TCAAGGAACGGGATTAGGTTTATCTATAGTAAAAAAAATATTAGATGAGCATCATGCATCAATAAATTTTTATAATATAG
AGGATGGTGGTATGGTTAAATTAACATTTATAAAATGTTTAGATAATGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATATTCTAAATATAGGTTCCTTTAGGCATGTTATAGTGTGTCATAGGCCTAAGAACTAATTGTTTTTGTATAAGTTAGTT
CATCACCGTTTGATACTCTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
ATACACTTTAAGTAGTCAATAATAAAGGTAGTAATCATTGGTAATAAATTTGATTTTTTTAATTAACAATGGTATTACAC
AGATTTTTAGCCATCTATTG

Product: nitrogen regulation protein NtrY

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 710; Mature: 710

Protein sequence:

>710_residues
MKNWFIKVYRSINKLKFFKIVASFLAISIFLFSVITYCVVFHHDDPLGPDHSKAIKLIFFDLILFLLLITSVSYKLINIW
IQRKRGRLGSHLQTRIVLMFSVVAVIPTIIISGFSSLFFNYSIQAWFNKRVETAMHQSIKVAEAYLREQKRNIRSDILAI
SHYVSGNKGLLYYDKGYLQDVVQSEADLLGLSEVLIFQPGRVIASSKFSFALSFDMIPWYGLETIDDDKVIVITQENMIR
AFLLIDGFSSTYIMVGRIIDMKVSSHLSATKGAVKSYRDLQSQISSLQVQFSMIFILISLLLLFTAIWYGINFSGDIVRP
LLDLFYATRKVQKGDLSFKIEEGKIGQEMSTLVRAFNQMTSQLNTQRSQLIKLYQDMNERREFIEAVLSGISSGIIAVNC
AGVITLMNDKAKELLAPEVLNVELDSVFPEISELITSNKMKDEVIVIRNKKSFTLSVRIKVLGSVTKGYIITFDDISSLV
EAQRSAAWSDVARRIAHEIKNPITPIYLAAERLNSKYKKEIVSDQESFSRYVDTIIRHVTSIRGIVDEFAKFARMSDPVL
VKHDICNIIRDLVSSGQFSCDLVDYNFNVPDKPIFVVLDKSQINHVFVNLFKNACESIEIKHNVHGKITISVVEDDDQVY
VQVQDNGIGFPEELIEKLTEPYVTTRSQGTGLGLSIVKKILDEHHASINFYNIEDGGMVKLTFIKCLDNG

Sequences:

>Translated_710_residues
MKNWFIKVYRSINKLKFFKIVASFLAISIFLFSVITYCVVFHHDDPLGPDHSKAIKLIFFDLILFLLLITSVSYKLINIW
IQRKRGRLGSHLQTRIVLMFSVVAVIPTIIISGFSSLFFNYSIQAWFNKRVETAMHQSIKVAEAYLREQKRNIRSDILAI
SHYVSGNKGLLYYDKGYLQDVVQSEADLLGLSEVLIFQPGRVIASSKFSFALSFDMIPWYGLETIDDDKVIVITQENMIR
AFLLIDGFSSTYIMVGRIIDMKVSSHLSATKGAVKSYRDLQSQISSLQVQFSMIFILISLLLLFTAIWYGINFSGDIVRP
LLDLFYATRKVQKGDLSFKIEEGKIGQEMSTLVRAFNQMTSQLNTQRSQLIKLYQDMNERREFIEAVLSGISSGIIAVNC
AGVITLMNDKAKELLAPEVLNVELDSVFPEISELITSNKMKDEVIVIRNKKSFTLSVRIKVLGSVTKGYIITFDDISSLV
EAQRSAAWSDVARRIAHEIKNPITPIYLAAERLNSKYKKEIVSDQESFSRYVDTIIRHVTSIRGIVDEFAKFARMSDPVL
VKHDICNIIRDLVSSGQFSCDLVDYNFNVPDKPIFVVLDKSQINHVFVNLFKNACESIEIKHNVHGKITISVVEDDDQVY
VQVQDNGIGFPEELIEKLTEPYVTTRSQGTGLGLSIVKKILDEHHASINFYNIEDGGMVKLTFIKCLDNG
>Mature_710_residues
MKNWFIKVYRSINKLKFFKIVASFLAISIFLFSVITYCVVFHHDDPLGPDHSKAIKLIFFDLILFLLLITSVSYKLINIW
IQRKRGRLGSHLQTRIVLMFSVVAVIPTIIISGFSSLFFNYSIQAWFNKRVETAMHQSIKVAEAYLREQKRNIRSDILAI
SHYVSGNKGLLYYDKGYLQDVVQSEADLLGLSEVLIFQPGRVIASSKFSFALSFDMIPWYGLETIDDDKVIVITQENMIR
AFLLIDGFSSTYIMVGRIIDMKVSSHLSATKGAVKSYRDLQSQISSLQVQFSMIFILISLLLLFTAIWYGINFSGDIVRP
LLDLFYATRKVQKGDLSFKIEEGKIGQEMSTLVRAFNQMTSQLNTQRSQLIKLYQDMNERREFIEAVLSGISSGIIAVNC
AGVITLMNDKAKELLAPEVLNVELDSVFPEISELITSNKMKDEVIVIRNKKSFTLSVRIKVLGSVTKGYIITFDDISSLV
EAQRSAAWSDVARRIAHEIKNPITPIYLAAERLNSKYKKEIVSDQESFSRYVDTIIRHVTSIRGIVDEFAKFARMSDPVL
VKHDICNIIRDLVSSGQFSCDLVDYNFNVPDKPIFVVLDKSQINHVFVNLFKNACESIEIKHNVHGKITISVVEDDDQVY
VQVQDNGIGFPEELIEKLTEPYVTTRSQGTGLGLSIVKKILDEHHASINFYNIEDGGMVKLTFIKCLDNG

Specific function: Member of the two-component regulatory system ntrY/ntrX involved in nitrogen level control. Probably activates ntrX by phosphorylation [H]

COG id: COG5000

COG function: function code T; Signal transduction histidine kinase involved in nitrogen fixation and metabolism regulation

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 PAS (PER-ARNT-SIM) domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788549, Length=378, Percent_Identity=21.6931216931217, Blast_Score=87, Evalue=3e-18,
Organism=Escherichia coli, GI1790300, Length=341, Percent_Identity=25.8064516129032, Blast_Score=82, Evalue=8e-17,
Organism=Escherichia coli, GI1790436, Length=214, Percent_Identity=26.1682242990654, Blast_Score=79, Evalue=8e-16,
Organism=Escherichia coli, GI1790861, Length=212, Percent_Identity=23.5849056603774, Blast_Score=66, Evalue=9e-12,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003594
- InterPro:   IPR003660
- InterPro:   IPR004358
- InterPro:   IPR003661
- InterPro:   IPR005467
- InterPro:   IPR017232 [H]

Pfam domain/function: PF00672 HAMP; PF02518 HATPase_c [H]

EC number: =2.7.13.3 [H]

Molecular weight: Translated: 80590; Mature: 80590

Theoretical pI: Translated: 8.31; Mature: 8.31

Prosite motif: PS50885 HAMP ; PS50109 HIS_KIN

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKNWFIKVYRSINKLKFFKIVASFLAISIFLFSVITYCVVFHHDDPLGPDHSKAIKLIFF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHH
DLILFLLLITSVSYKLINIWIQRKRGRLGSHLQTRIVLMFSVVAVIPTIIISGFSSLFFN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSIQAWFNKRVETAMHQSIKVAEAYLREQKRNIRSDILAISHYVSGNKGLLYYDKGYLQD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHH
VVQSEADLLGLSEVLIFQPGRVIASSKFSFALSFDMIPWYGLETIDDDKVIVITQENMIR
HHHHHHHHHCCCHHEEECCCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEE
AFLLIDGFSSTYIMVGRIIDMKVSSHLSATKGAVKSYRDLQSQISSLQVQFSMIFILISL
EEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLFTAIWYGINFSGDIVRPLLDLFYATRKVQKGDLSFKIEEGKIGQEMSTLVRAFNQMT
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH
SQLNTQRSQLIKLYQDMNERREFIEAVLSGISSGIIAVNCAGVITLMNDKAKELLAPEVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECEEEEEECHHHHHHCCCHHH
NVELDSVFPEISELITSNKMKDEVIVIRNKKSFTLSVRIKVLGSVTKGYIITFDDISSLV
CEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHH
EAQRSAAWSDVARRIAHEIKNPITPIYLAAERLNSKYKKEIVSDQESFSRYVDTIIRHVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SIRGIVDEFAKFARMSDPVLVKHDICNIIRDLVSSGQFSCDLVDYNFNVPDKPIFVVLDK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECC
SQINHVFVNLFKNACESIEIKHNVHGKITISVVEDDDQVYVQVQDNGIGFPEELIEKLTE
CHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCC
PYVTTRSQGTGLGLSIVKKILDEHHASINFYNIEDGGMVKLTFIKCLDNG
CCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCC
>Mature Secondary Structure
MKNWFIKVYRSINKLKFFKIVASFLAISIFLFSVITYCVVFHHDDPLGPDHSKAIKLIFF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCCCCHHHHHHHHHH
DLILFLLLITSVSYKLINIWIQRKRGRLGSHLQTRIVLMFSVVAVIPTIIISGFSSLFFN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YSIQAWFNKRVETAMHQSIKVAEAYLREQKRNIRSDILAISHYVSGNKGLLYYDKGYLQD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEECCHHHHH
VVQSEADLLGLSEVLIFQPGRVIASSKFSFALSFDMIPWYGLETIDDDKVIVITQENMIR
HHHHHHHHHCCCHHEEECCCCEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCEE
AFLLIDGFSSTYIMVGRIIDMKVSSHLSATKGAVKSYRDLQSQISSLQVQFSMIFILISL
EEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LLLFTAIWYGINFSGDIVRPLLDLFYATRKVQKGDLSFKIEEGKIGQEMSTLVRAFNQMT
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHH
SQLNTQRSQLIKLYQDMNERREFIEAVLSGISSGIIAVNCAGVITLMNDKAKELLAPEVL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECEEEEEECHHHHHHCCCHHH
NVELDSVFPEISELITSNKMKDEVIVIRNKKSFTLSVRIKVLGSVTKGYIITFDDISSLV
CEEHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCEEEEEEEEEEECCCCCEEEEHHHHHHHH
EAQRSAAWSDVARRIAHEIKNPITPIYLAAERLNSKYKKEIVSDQESFSRYVDTIIRHVT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
SIRGIVDEFAKFARMSDPVLVKHDICNIIRDLVSSGQFSCDLVDYNFNVPDKPIFVVLDK
HHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECC
SQINHVFVNLFKNACESIEIKHNVHGKITISVVEDDDQVYVQVQDNGIGFPEELIEKLTE
CHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCEEEEEEEECCCEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHCC
PYVTTRSQGTGLGLSIVKKILDEHHASINFYNIEDGGMVKLTFIKCLDNG
CCEECCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCEEEEEEECCCCEEEEEEEEEECCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7553451 [H]