| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57238566
Identifier: 57238566
GI number: 57238566
Start: 1620475
End: 1622805
Strand: Direct
Name: 57238566
Synonym: CJE1721
Alternate gene names: NA
Gene position: 1620475-1622805 (Clockwise)
Preceding gene: 57238564
Following gene: 57238567
Centisome position: 91.15
GC content: 22.69
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AATGACAAATTTACCACAGGGTTGGGAAGTTAAAAAGCTTGAAGAAATTGCAAATATCAAAGGAGGTAAAAGACTTCCCA AGGGTAAAAATTTATTAGAC
Product: RloC protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 776; Mature: 776
Protein sequence:
>776_residues MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFLDGNFKIKLEDGSFLTQNDVI NSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKDIKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTL NEKLIDKAKLVKSEPNLIKQGSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNIKDDSGEKEQIEKELKDLLDN FESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIANYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQIL NKIENLCKENNEYAKNLLSKQDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGECSLVAFCYFVASLEDAKTKDK NPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQLFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDI KILPDYIRKYVTEFNYLFEQIFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK
Sequences:
>Translated_776_residues MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFLDGNFKIKLEDGSFLTQNDVI NSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKDIKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTL NEKLIDKAKLVKSEPNLIKQGSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNIKDDSGEKEQIEKELKDLLDN FESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIANYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQIL NKIENLCKENNEYAKNLLSKQDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGECSLVAFCYFVASLEDAKTKDK NPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQLFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDI KILPDYIRKYVTEFNYLFEQIFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK >Mature_776_residues MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFLDGNFKIKLEDGSFLTQNDVI NSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKDIKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTL NEKLIDKAKLVKSEPNLIKQGSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNIKDDSGEKEQIEKELKDLLDN FESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIANYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQIL NKIENLCKENNEYAKNLLSKQDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGECSLVAFCYFVASLEDAKTKDK NPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQLFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDI KILPDYIRKYVTEFNYLFEQIFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK
Specific function: Unknown
COG id: COG4694
COG function: function code S; Uncharacterized protein conserved in bacteria
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 91644; Mature: 91644
Theoretical pI: Translated: 7.79; Mature: 7.79
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.8 %Cys (Translated Protein) 1.0 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.8 %Cys (Mature Protein) 1.0 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFL CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DGNFKIKLEDGSFLTQNDVINSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKD CCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHH IKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTLNEKLIDKAKLVKSEPNLIKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHC GSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF CCCCCHHCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEH TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCC KDDSGEKEQIEKELKDLLDNFESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIA CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHH NYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQILNKIENLCKENNEYAKNLLSK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHC QDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHH KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGEC HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHCCCHHHCCCCCCCH SLVAFCYFVASLEDAKTKDKNPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQ HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE LFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDIKILPDYIRKYVTEFNYLFEQ EEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHH IFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI HHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHH NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKILKFNEINFGSYKNFKWGNNLEEFKTINIFYGRNYSGKTTLSRIARSFELKKHNEDFL CCEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DGNFKIKLEDGSFLTQNDVINSNLDIRVYNSDFAKENLNYLYDKKGNIKGFKSIGVEQKD CCCEEEEECCCCEEECCCCCCCCCEEEEECCCHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHCCCCHHH IKESIEKRKEILKTRNEKLKDIQANRENISKTQQAKIKTLNEKLIDKAKLVKSEPNLIKQ HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHC GSNYDKRNLENDLIEIKDNINAYILNNEEQNQLIKILEDKEKQNIIFKNTFNKDNFQGIF CCCCCHHCCHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCEEH TYSLKILEKEVIIKENLTSELRKWLEEGLEFHKEHSFTQQCKFCNNPLTLERIAWIENNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCC KDDSGEKEQIEKELKDLLDNFESYKLESKKLLLGIEYENFYSNYKDIFIGLKEQLGVSIA CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCCHH NYNEELLKIEKKLTKKKKDVFTPMKLENINDFSDEILQILNKIENLCKENNEYAKNLLSK CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHC QDEARKKLRLNEVAKFAKDSDCFAKQDEIKNLGQKLSNMQSTIETEKNEINNYNLEIEKY HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHH KEKLSNLETSTSNINKYLKSYFGHNMLELKVKKDDKGQLNGEFEILRNGKQAKNLSEGEC HHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCCCHHHHCCCHHHCCCCCCCH SLVAFCYFVASLEDAKTKDKNPIIWIDDPISSLDNNHIFFIFSLIEAKIAKKIKDNKYSQ HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEECCCHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE LFISTHNLDFLKYLKSLTGYDKNDKKSFMYLIEKTNNSDIKILPDYIRKYVTEFNYLFEQ EEEEECCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCEECHHHHHHHHHHHHHHHHH IFKNYNNTNITIDSYYSLANNIRKFLDTYMYFKYPNNDSLMTKYYIFFGEENAILINRVI HHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCEEEEEEEEECCCCCCHHHHHH NEFSHLENIERAKMPLDLLEIHKVINIIIENIKNKDKEQFEALLKSLDIEENDNAK HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA