| Definition | Campylobacter jejuni RM1221, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_003912 |
| Length | 1,777,831 |
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The map label for this gene is 57238206
Identifier: 57238206
GI number: 57238206
Start: 631554
End: 632996
Strand: Direct
Name: 57238206
Synonym: CJE0701
Alternate gene names: NA
Gene position: 631554-632996 (Clockwise)
Preceding gene: 57238207
Following gene: 57238205
Centisome position: 35.52
GC content: 29.73
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases AAAATGAGTCAAAAGAAGATAGCAATTTTTGGATAGCTTATGCTGATTTAATGGCAGGATTGCTGTTTGTTTTTATTTTA CTAATAGGTGCTATTGTTGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 480; Mature: 480
Protein sequence:
>480_residues MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTGVIFFTALIFARHSAEYAYSI FEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTYIKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSD TAALEQEIADLLSGVGTAFYVSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRDLGKLYSEMLNGIGLLNQNLK EINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGKNFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKS IDAKIKMMDELKKEMKALDEETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK
Sequences:
>Translated_480_residues MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTGVIFFTALIFARHSAEYAYSI FEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTYIKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSD TAALEQEIADLLSGVGTAFYVSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRDLGKLYSEMLNGIGLLNQNLK EINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGKNFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKS IDAKIKMMDELKKEMKALDEETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK >Mature_480_residues MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTGVIFFTALIFARHSAEYAYSI FEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTYIKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSD TAALEQEIADLLSGVGTAFYVSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRDLGKLYSEMLNGIGLLNQNLK EINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGKNFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKS IDAKIKMMDELKKEMKALDEETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 55670; Mature: 55670
Theoretical pI: Translated: 4.80; Mature: 4.80
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
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Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTG CCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIFFTALIFARHSAEYAYSIFEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH IKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSDTAALEQEIADLLSGVGTAFY HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRD HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGKLYSEMLNGIGLLNQNLKEINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKSIDAKIKMMDELKKEMKALDE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCC >Mature Secondary Structure MDIKSDEISELVLPEGKDARGSLVYFKIIFIPAFLYILILLGYFNVIDFKVELHTVIMTG CCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VIFFTALIFARHSAEYAYSIFEQQKDEFKQALKRHIMRHFLAIGKDTKSNANFDDFAYTY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHH IKGARNENFASIGSAIFPMMGILGTFISIAFSMPNFSSSDTAALEQEIADLLSGVGTAFY HHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VSIYGIFLALWWMFFEKYGKSKIDRLLNRQKNATSGFFWTKEELDQRYLTESLQHFEKIG HHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AIFKQVSNDDFFAELDHAIDRKFGIFQDMLNVEEKAIRLSSEHIKQTMGELSKAQRDQRD HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGKLYSEMLNGIGLLNQNLKEINTRMSEQYNRLLDISSDKIHHLDKTLSAFDEKIERFGK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC NFELYEKAMLESQEKVFEGFKASLFEGMHKFKEVYEEEKSIDAKIKMMDELKKEMKALDE CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ETSQMMSKLSGDENQNKENETKQIEDFSESKTEENQDEIQAEISKQESNDELKNEDKENK HHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCC
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Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
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Specific activity: NA
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Specific reaction: NA
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Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA