Definition Bacillus clausii KSM-K16, complete genome.
Accession NC_006582
Length 4,303,871

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The map label for this gene is yjbB [H]

Identifier: 56963479

GI number: 56963479

Start: 1840238

End: 1841860

Strand: Direct

Name: yjbB [H]

Synonym: ABC1714

Alternate gene names: 56963479

Gene position: 1840238-1841860 (Clockwise)

Preceding gene: 56963478

Following gene: 56963480

Centisome position: 42.76

GC content: 42.08

Gene sequence:

>1623_bases
GTGGGAGAGTTTCAAACGTTGCTGTTTACGTTTCTTGGAGGAATAGGGATCTTTCTATTTGCCGTCAAGTATATGGGTGA
CGGACTCCAAAAGACAGCAGGAGACCGGTTGCGGGATTTGCTAGACAAATACACAACGAATCCTTTTATGGGTCTAATTT
CGGGGATTGTCGTCACGATTTTACTGCAGAGCAGCACAGCGACAACGGTGTTGACGATCGGACTTGTGAATGCAGGCTTT
ATGCGGCTTAGGCAAGCGATTGCTGTTATAATGGGCGCAAATATTGGGACAACAACAACAGCCTTTATTATTGGACTAAA
TTTAAAAGAATACAGCTTGCCCATTATGGCAGTAGGGGCCTTTTTAATTTTCTTTTTCAAAAAGAAAAAAGTCAATCATA
TCGGCCAGATCGTGTTTGGGTTTGGCGGGCTTTTTTATGGTCTAGATCTAATGGGAAGTAGCTTGCGGCCGCTTAGCAAT
TGGGAACCATTTGTCGATTTTACTGTTAGGATGGGAGATAACCCATTTTTAGGAGTGATTGTAGGGGTGATTTTAGCTGT
CGCCTTGCAAAGCTCGACTGCAGCAATCGGTCTGGTTCAGCAATTGTACGAGCAAGGAGCAATGGAACTACAAGCTGCGC
TTCCCGTTTTAATTGGCGACAACATTGGTACTACCCTTACAGCTGTATTAGTTGCGATTGGTGCGACTGTAGGAGCACGA
AGGGCTGCGCTCACCCATGTCGTGTTTAATGTCATTGGTGCGGTGTTAGTCATGATCGCGTTTCCTATTTTTGTAAACTT
TATTGCTTTTTTAGGCGAACAATTCAATTTAGGCCCTTCCATGCAAATTGCATCAGCTCACGGTGTCTATAATGTCGCAA
ATGTGATCATTCAATTTCCGTGTATCGCTTTACTGGCCTATATCGTTACGAAGCTTGTTCCAGGAGATGAACTTGCTTTA
GATTACAAACCAAAACATTTAGATCCGATCTTTATCGGAAACTCGCCAGCAATTGCTTTAGGACAAGCCAAACAAGAAAT
TATCCATATGGCCGATTACTCAAAAAAGGGATTAGAGCAAGCGATTCGCTATATGGAAACAGGCGAAAAGAAGGACGCCG
AGTTGGCACTCCAGTATGAACAAGCGATTAACAATTTAGACCGCGAGATCACCGACTATTTGGTTAAAGTGTCGGCACGT
TCCTTGTCGCCGACGGATTCCAATCTCCATTCAACGCTATTAAATGTTGTTAGGGATATTGAACGGATTGGCGATCATAT
GGAAAACATTGTTGAACTGAAAGATTATCAAAAAGCGAATAAAGTGAAAATGAGCGATATTGCCTTAAATGACTTAAACG
AGATGTTCAAATTAACGTATTCGACATTAGAAGAAGCAATGGATTCCCTTGAACGGGATGACCTTGATAAAGCCCATGAC
GTTTTAAAACATGAAGATTTAATTGATAGCATGGAAAGAAAGCTAAGAAAACAACACATTAAACGGATAAATGAGGGCAA
ATGTTCTGGTTCGGCGGGGATTGTCTTTGTCGATATTATTAGCAATTTAGAACGAATTGGCGACCATTCGGTCAACATTG
CCCAATCGGTAATTGGCGATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTACAAATACTCAATAATTGTTTAATAATAGACACGGACCATAATGTTGAGGTTTGTCGAAAGACGCCCAAAAATGAGT
TGGATGAAGGGATGAGATGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
CCTATATAACGGCCGGAAGTAAAAGCCGGCCGTTTTTTCTTAAATAATCGTTGCATCAAAGAGAAAAACGTGGTAATATA
ATTTTTGTCCGAATGAGGAG

Product: sodium-dependent phosphate transporter

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 540; Mature: 539

Protein sequence:

>540_residues
MGEFQTLLFTFLGGIGIFLFAVKYMGDGLQKTAGDRLRDLLDKYTTNPFMGLISGIVVTILLQSSTATTVLTIGLVNAGF
MRLRQAIAVIMGANIGTTTTAFIIGLNLKEYSLPIMAVGAFLIFFFKKKKVNHIGQIVFGFGGLFYGLDLMGSSLRPLSN
WEPFVDFTVRMGDNPFLGVIVGVILAVALQSSTAAIGLVQQLYEQGAMELQAALPVLIGDNIGTTLTAVLVAIGATVGAR
RAALTHVVFNVIGAVLVMIAFPIFVNFIAFLGEQFNLGPSMQIASAHGVYNVANVIIQFPCIALLAYIVTKLVPGDELAL
DYKPKHLDPIFIGNSPAIALGQAKQEIIHMADYSKKGLEQAIRYMETGEKKDAELALQYEQAINNLDREITDYLVKVSAR
SLSPTDSNLHSTLLNVVRDIERIGDHMENIVELKDYQKANKVKMSDIALNDLNEMFKLTYSTLEEAMDSLERDDLDKAHD
VLKHEDLIDSMERKLRKQHIKRINEGKCSGSAGIVFVDIISNLERIGDHSVNIAQSVIGD

Sequences:

>Translated_540_residues
MGEFQTLLFTFLGGIGIFLFAVKYMGDGLQKTAGDRLRDLLDKYTTNPFMGLISGIVVTILLQSSTATTVLTIGLVNAGF
MRLRQAIAVIMGANIGTTTTAFIIGLNLKEYSLPIMAVGAFLIFFFKKKKVNHIGQIVFGFGGLFYGLDLMGSSLRPLSN
WEPFVDFTVRMGDNPFLGVIVGVILAVALQSSTAAIGLVQQLYEQGAMELQAALPVLIGDNIGTTLTAVLVAIGATVGAR
RAALTHVVFNVIGAVLVMIAFPIFVNFIAFLGEQFNLGPSMQIASAHGVYNVANVIIQFPCIALLAYIVTKLVPGDELAL
DYKPKHLDPIFIGNSPAIALGQAKQEIIHMADYSKKGLEQAIRYMETGEKKDAELALQYEQAINNLDREITDYLVKVSAR
SLSPTDSNLHSTLLNVVRDIERIGDHMENIVELKDYQKANKVKMSDIALNDLNEMFKLTYSTLEEAMDSLERDDLDKAHD
VLKHEDLIDSMERKLRKQHIKRINEGKCSGSAGIVFVDIISNLERIGDHSVNIAQSVIGD
>Mature_539_residues
GEFQTLLFTFLGGIGIFLFAVKYMGDGLQKTAGDRLRDLLDKYTTNPFMGLISGIVVTILLQSSTATTVLTIGLVNAGFM
RLRQAIAVIMGANIGTTTTAFIIGLNLKEYSLPIMAVGAFLIFFFKKKKVNHIGQIVFGFGGLFYGLDLMGSSLRPLSNW
EPFVDFTVRMGDNPFLGVIVGVILAVALQSSTAAIGLVQQLYEQGAMELQAALPVLIGDNIGTTLTAVLVAIGATVGARR
AALTHVVFNVIGAVLVMIAFPIFVNFIAFLGEQFNLGPSMQIASAHGVYNVANVIIQFPCIALLAYIVTKLVPGDELALD
YKPKHLDPIFIGNSPAIALGQAKQEIIHMADYSKKGLEQAIRYMETGEKKDAELALQYEQAINNLDREITDYLVKVSARS
LSPTDSNLHSTLLNVVRDIERIGDHMENIVELKDYQKANKVKMSDIALNDLNEMFKLTYSTLEEAMDSLERDDLDKAHDV
LKHEDLIDSMERKLRKQHIKRINEGKCSGSAGIVFVDIISNLERIGDHSVNIAQSVIGD

Specific function: Unknown

COG id: COG1283

COG function: function code P; Na+/phosphate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To B.subtilis yqeW [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=534, Percent_Identity=23.2209737827715, Blast_Score=147, Evalue=2e-36,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003841
- InterPro:   IPR004633 [H]

Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59053; Mature: 58922

Theoretical pI: Translated: 5.81; Mature: 5.81

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.4 %Cys     (Translated Protein)
3.3 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.4 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
3.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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>Mature Secondary Structure 
GEFQTLLFTFLGGIGIFLFAVKYMGDGLQKTAGDRLRDLLDKYTTNPFMGLISGIVVTI
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH
LLQSSTATTVLTIGLVNAGFMRLRQAIAVIMGANIGTTTTAFIIGLNLKEYSLPIMAVGA
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHEEECCCHHHCCHHHHHHH
FLIFFFKKKKVNHIGQIVFGFGGLFYGLDLMGSSLRPLSNWEPFVDFTVRMGDNPFLGVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHHH
VGVILAVALQSSTAAIGLVQQLYEQGAMELQAALPVLIGDNIGTTLTAVLVAIGATVGAR
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RAALTHVVFNVIGAVLVMIAFPIFVNFIAFLGEQFNLGPSMQIASAHGVYNVANVIIQFP
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHCCHHHHHHHHHHHH
CIALLAYIVTKLVPGDELALDYKPKHLDPIFIGNSPAIALGQAKQEIIHMADYSKKGLEQ
HHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCCCCCCCEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
AIRYMETGEKKDAELALQYEQAINNLDREITDYLVKVSARSLSPTDSNLHSTLLNVVRDI
HHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
ERIGDHMENIVELKDYQKANKVKMSDIALNDLNEMFKLTYSTLEEAMDSLERDDLDKAHD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
VLKHEDLIDSMERKLRKQHIKRINEGKCSGSAGIVFVDIISNLERIGDHSVNIAQSVIGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11206551; 11258796 [H]