| Definition | Legionella pneumophila str. Lens, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_006369 |
| Length | 3,345,687 |
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The map label for this gene is yejM [H]
Identifier: 54294206
GI number: 54294206
Start: 1414448
End: 1416361
Strand: Direct
Name: yejM [H]
Synonym: lpl1271
Alternate gene names: 54294206
Gene position: 1414448-1416361 (Clockwise)
Preceding gene: 54294205
Following gene: 54294207
Centisome position: 42.28
GC content: 33.54
Gene sequence:
>1914_bases ATGAATATAAAAACATATCTAAAAAAAAATGATTTAACCTTACGATTTGTTGGATGGTTCTTTTTAATAAACTCATTCAT ATTTTGGCTTGTTGGCTTGGGGTATTTAAAGTCCATTTTATTAAATGCCTCCCTATTTAAAAATTATATCGCCGATTATT CAAGTCTATCAGGAAAAATTCTCATTCTGGTTTTCTCAGTTTTAAATTATTTTACTTATATGATGTTTTTAGCTTTTCTC CCTGCAATACCAATCATAATAATGACATTTTTTTTACCTTATAAACGAATAATTTGGATTATCAGTGTTGTTGCAGCTGC CACAAGTCTTATTTTTTTATTTGTTGATAGTCAAGTTTTTTCAATGTTTAAGTTTCATCTTAATAAAACAATATTATCGT TTGTTTTTAATTCAGATTGGAGTGTCATTTTCACTTTTTCCAGATATGAACTGATTTTGTCTTTTTTTATGATTGTCTTT ATACTCTTTCTGGAGTCTATTGTTGCCTGGTTGGTATGGAAAAAAATAGTTTTAAAAGAACGTTTGAAAATTGGTAAAAC TATTTCATTATTTTGGCTCGGTGGGGCATTAATAAGTTATTTTATATTGCTCTTATCGATAGCTCAAAATAATAATTTAT TTGCTCAGCAAATACCTAATTTGCCCCTTTATAATCAACTCATTGCTTATACTATCCCTGATAAAAACGCGGATGATATA TTACGCCGCTACAGCGAGCACCATTTTACACAGCCTCTTTTCCCCAATTATCCATTGCATTATCCCTTACATCCCATGCA ATGTAAGATGCCTGAAAAACCTTATAACATTATCCTTATAATGGTAGATTCACTTCGCTATGATTCCCTAAAGGCAAAAT ATATGCCGAATACGGCACAATTTGCAAAAAGAAGTTGGCAATTTTCTCAGCATATGAGTGCTGGAAATGCCACACAACCA GGATTGTTTTCTTTATTTTATTCGATTCCCAGTAATTACTCGACGGCAGTCCTGGAGCAAAAAAAATCACCAGTTTTAGT TGATTTATTATTACAACATGGTTATCAGACAAAAATTATTTGGTCTGGCTCTATGGCTCCACTACCATTAGATCAGACTA TTTATAAAAAAATTGCCAATCTCAATACCAATGGAGCGCCAATAGATGATACCGGAGACAAGGACAGATATTCCACCAGA GAAGCTATCCAATTTTTAACAGATACTAAAACAAATAACCCATTCTTTCTTCATATTTTTTACAATGCGCCACATGACTA TTGTAGATATCAAAGTTTTCCGCAGTTATACAAACCTGCAATAGAAGAATGTGTACGAATTGGAATGACAAATCATGTTG ATCCAATGCCTTACTACAATCGTTATTTGAATGCAGTCACATTTATTGACCAGGAAATTTCGAAAGTATTAGGGGTTATC GAAAAAAAAGGTTATTTAAAAAACAGCATCATTATAATTACCTCTGATCATGGCCAAGAATTTAATGATAATCGTCAAAA TTATTGGGGACATACCAGTAATTTTACCCCTATTCAACTACACGTTCCCTTGATCATTCATTGGCCAGGGGAGTTAGCTC GTCGTTTTAATTATCTCACAAGCAGCTATGATATTGTCCCTACAATATTACAGCGTTTATTTGCTTGCAAAAATCCTGTT TCTGACTACAGCATCGGGTATAACTTGCTAATTGAGGGCAATCGAGCCCCATTTCTATTGGTAGGAAGTTATATTAATAT GGGAATTTTTGAAGCAGATCGCGCTACAGCATTAGAAACCTCCGGAAGAATTACAATTACTGGTATGAAGGCAGAGCCTC TTGACGATGCGGTACCAAGAATGGATGTTATTACCCAGGCATTGGATTTGATGCGCAAGTATTATGGGAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CTTTTCAGAAATTTTAAATCAGGTATATTGGCTAAATTAATTGCTATTTATTGACTGGATTGTTCATTAAGATAAATTCG AAATTACATTTGAATTCGTA
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGATTGTCTTTAAAAATAAATTAGCAATTAACCTTTTTATTCTAATTTAGGCCATACAGCGGATGTCTTTAAATTTCCA GGCAAAAATATGGCTATAAT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 637; Mature: 637
Protein sequence:
>637_residues MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKILILVFSVLNYFTYMMFLAFL PAIPIIIMTFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQVFSMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMIVF ILFLESIVAWLVWKKIVLKERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLKAKYMPNTAQFAKRSWQFSQHMSAGNATQP GLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLVDLLLQHGYQTKIIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTR EAIQFLTDTKTNNPFFLHIFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPMPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLGVI EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLTSSYDIVPTILQRLFACKNPV SDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALETSGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK
Sequences:
>Translated_637_residues MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKILILVFSVLNYFTYMMFLAFL PAIPIIIMTFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQVFSMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMIVF ILFLESIVAWLVWKKIVLKERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLKAKYMPNTAQFAKRSWQFSQHMSAGNATQP GLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLVDLLLQHGYQTKIIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTR EAIQFLTDTKTNNPFFLHIFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPMPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLGVI EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLTSSYDIVPTILQRLFACKNPV SDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALETSGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK >Mature_637_residues MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKILILVFSVLNYFTYMMFLAFL PAIPIIIMTFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQVFSMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMIVF ILFLESIVAWLVWKKIVLKERLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLKAKYMPNTAQFAKRSWQFSQHMSAGNATQP GLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLVDLLLQHGYQTKIIWSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTR EAIQFLTDTKTNNPFFLHIFYNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPMPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLGVI EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLTSSYDIVPTILQRLFACKNPV SDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALETSGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK
Specific function: Unknown
COG id: COG3083
COG function: function code R; Predicted hydrolase of alkaline phosphatase superfamily
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To H.influenzae HI_0842 [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1788515, Length=636, Percent_Identity=25.6289308176101, Blast_Score=208, Evalue=8e-55,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR017849 - InterPro: IPR017850 - InterPro: IPR012159 - InterPro: IPR000917 [H]
Pfam domain/function: PF00884 Sulfatase [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 73743; Mature: 73743
Theoretical pI: Translated: 9.45; Mature: 9.45
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.8 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKI CCCHHHEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH LILVFSVLNYFTYMMFLAFLPAIPIIIMTFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMIVFILFLESIVAWLVWKKIVLKE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI HHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCHHHH LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLKAKYMPNTAQ HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHH FAKRSWQFSQHMSAGNATQPGLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLVDLLLQHGYQTKII HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEE WSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTREAIQFLTDTKTNNPFFLHIF ECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE YNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPMPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLGVI ECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLT HHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHH SSYDIVPTILQRLFACKNPVSDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALET CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECHHCCCEEECCCCCEEEC SGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK CCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MNIKTYLKKNDLTLRFVGWFFLINSFIFWLVGLGYLKSILLNASLFKNYIADYSSLSGKI CCCHHHEECCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH LILVFSVLNYFTYMMFLAFLPAIPIIIMTFFLPYKRIIWIISVVAAATSLIFLFVDSQVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SMFKFHLNKTILSFVFNSDWSVIFTFSRYELILSFFMIVFILFLESIVAWLVWKKIVLKE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RLKIGKTISLFWLGGALISYFILLLSIAQNNNLFAQQIPNLPLYNQLIAYTIPDKNADDI HHHCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHCCCCCCCHHEEEEECCCCCHHHH LRRYSEHHFTQPLFPNYPLHYPLHPMQCKMPEKPYNIILIMVDSLRYDSLKAKYMPNTAQ HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCHHH FAKRSWQFSQHMSAGNATQPGLFSLFYSIPSNYSTAVLEQKKSPVLVDLLLQHGYQTKII HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCEEEE WSGSMAPLPLDQTIYKKIANLNTNGAPIDDTGDKDRYSTREAIQFLTDTKTNNPFFLHIF ECCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEE YNAPHDYCRYQSFPQLYKPAIEECVRIGMTNHVDPMPYYNRYLNAVTFIDQEISKVLGVI ECCCHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EKKGYLKNSIIIITSDHGQEFNDNRQNYWGHTSNFTPIQLHVPLIIHWPGELARRFNYLT HHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHHH SSYDIVPTILQRLFACKNPVSDYSIGYNLLIEGNRAPFLLVGSYINMGIFEADRATALET CCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEEECHHCCCEEECCCCCEEEC SGRITITGMKAEPLDDAVPRMDVITQALDLMRKYYGK CCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11206551; 11258796 [H]