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The map label for this gene is 54020302

Identifier: 54020302

GI number: 54020302

Start: 879458

End: 881020

Strand: Direct

Name: 54020302

Synonym: mhp691

Alternate gene names: NA

Gene position: 879458-881020 (Clockwise)

Preceding gene: 54020301

Following gene: 54020303

Centisome position: 98.51

GC content: 31.93

Gene sequence:

>1563_bases
ATGCGTCTTTCAGTCCGTCAATTTTTCCCTGATTCGGCTGAAAAATGAAAAAAATTTGTTAAAATTGTAATTCCAGTTAT
ATTTGCTACACTTTTTATCTCAATAAATAATTTTATTGATAATTTTATGGTATCACAAATAAGCGGAGGAATTACTGCCG
TGGGGATTGCTAATGTCTGAACAGCAATAATTTTTTCCTTTATTGTCTCGATTAATTCGATTGGTTCAATTATTTTTAGC
CAATATTGGGGGAAAAAACAAAGAAAGCTAGCCAGACAAGTTAACAATATCCGGTATATTTTAGCAGTCACAACCGTTTT
GATATTTGCAATTTTTGCCTGGATAATCCCAGATCAAATGCTAAGCGCGGTTCAGCGAAATAAAAATTTGACAAATTTGG
ATAAAAATATTTTTGAAGAAGCAAAAAGTTACCTATTTATAATCGCCTTTTCGTGAATTTTGTTTGCCTATATTGTCACA
TCTTCAGCAATTTTGCGTGAAATTGGGATAATGAAAATTGCGCTTTTTTTTACTTTGCTGACCCTAATCTCAAATGTAAG
CCTAAATTTAGTGCTAATCCCGAAAATGGGTGTTGCTGGTTCAGCGCTGGCAACGGTAATTTCCCGTTGTATAAGCGCAA
TTTTAATGACTTTTTACATTTTTTTCTATAAAAAAGATATCAGAATAAGCATTTTAAAGCTGTTCAAAATTGAAAAAAAA
ATTTGAAAACAGTATTTTCGCCGGTTTTTCGGGATGAATTTAGTAATTATTACTTCACTTATTATCTCAATACGTTCGAT
TTTATGAGCACAAAGTTTACCGCCGGGATCAATTGGCAGCGATGACGGGACTGGTTTTTATAAGTATTGGGGCATCGGGT
TTCTGACAATTTCCGGAATAGTGATGACAATTGTTAACATTTTACTAGCAACTTTTACATCAATTCAGACCAGTGTCTCA
ATTGTTGTCAGCCGCAATTTAGGTCAGGATAAAATTGAAAAAGCGCGAAAAAACGCGGCAATGTTGAAAGGTTTTTTATT
TATTGTCTCCCTTGCAATGTCAATTTTAGCACTAATTGTTGTAATTATTATCACAAAAACTAACTTAATCACAAAGGGAT
TAGAAATTCAGGTGCAAAAGGGGATGGAAAATTATTTCACTGAACACAATTTAGCAATAAATCTAGAAATTATCCAAAAA
CAGCAGGGTCTGGCAACTAATTTTTATCTTAGTCAAATTTTTTGAATCTGCCTTTTAATAGTTTTTCTAAACCCAATTTG
AGTCCAAATTAATTCCTCGCTTAACATAATTCAGGCTGGCGGTCGCGCAAATTTTGCCAGTTTATGTGACTTTTTTATCG
GAATTTCCCAGTTTTTATGGCAGCTTCTTGTTGTTTTTGTATTTTTACCGTTACTAAAAGATGTAAAAACAAAACTGTTT
TTTTCAATGTTGATTTTTTATTTTTCTGATATCATAAAGTGGATAATTTATGAAATTTTATATCTCAAAACTAACTGAGC
AATAAATTTAACTCTAGAAAAAACGGCGAAAAAAATACTATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGATTGCACAGGCTCTTTTAGGACAACACCAAGGTGATGAAGTTGAAGTTGATGTAAATGAAAAATATTCTGTAAGAATT
TTGGAAGTAATTAACGAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTCTTTACTTTTTTTTATTTTTAGATTATAATTTATAATAATATTAATAACTAAAAATTTCAGATAAAGGAGAAAGTTC
ATGCCTAGATTAACAAATAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 520; Mature: 520

Protein sequence:

>520_residues
MRLSVRQFFPDSAEKWKKFVKIVIPVIFATLFISINNFIDNFMVSQISGGITAVGIANVWTAIIFSFIVSINSIGSIIFS
QYWGKKQRKLARQVNNIRYILAVTTVLIFAIFAWIIPDQMLSAVQRNKNLTNLDKNIFEEAKSYLFIIAFSWILFAYIVT
SSAILREIGIMKIALFFTLLTLISNVSLNLVLIPKMGVAGSALATVISRCISAILMTFYIFFYKKDIRISILKLFKIEKK
IWKQYFRRFFGMNLVIITSLIISIRSILWAQSLPPGSIGSDDGTGFYKYWGIGFLTISGIVMTIVNILLATFTSIQTSVS
IVVSRNLGQDKIEKARKNAAMLKGFLFIVSLAMSILALIVVIIITKTNLITKGLEIQVQKGMENYFTEHNLAINLEIIQK
QQGLATNFYLSQIFWICLLIVFLNPIWVQINSSLNIIQAGGRANFASLCDFFIGISQFLWQLLVVFVFLPLLKDVKTKLF
FSMLIFYFSDIIKWIIYEILYLKTNWAINLTLEKTAKKIL

Sequences:

>Translated_520_residues
MRLSVRQFFPDSAEK*KKFVKIVIPVIFATLFISINNFIDNFMVSQISGGITAVGIANV*TAIIFSFIVSINSIGSIIFS
QYWGKKQRKLARQVNNIRYILAVTTVLIFAIFAWIIPDQMLSAVQRNKNLTNLDKNIFEEAKSYLFIIAFS*ILFAYIVT
SSAILREIGIMKIALFFTLLTLISNVSLNLVLIPKMGVAGSALATVISRCISAILMTFYIFFYKKDIRISILKLFKIEKK
I*KQYFRRFFGMNLVIITSLIISIRSIL*AQSLPPGSIGSDDGTGFYKYWGIGFLTISGIVMTIVNILLATFTSIQTSVS
IVVSRNLGQDKIEKARKNAAMLKGFLFIVSLAMSILALIVVIIITKTNLITKGLEIQVQKGMENYFTEHNLAINLEIIQK
QQGLATNFYLSQIF*ICLLIVFLNPI*VQINSSLNIIQAGGRANFASLCDFFIGISQFLWQLLVVFVFLPLLKDVKTKLF
FSMLIFYFSDIIKWIIYEILYLKTN*AINLTLEKTAKKIL
>Mature_520_residues
MRLSVRQFFPDSAEK*KKFVKIVIPVIFATLFISINNFIDNFMVSQISGGITAVGIANV*TAIIFSFIVSINSIGSIIFS
QYWGKKQRKLARQVNNIRYILAVTTVLIFAIFAWIIPDQMLSAVQRNKNLTNLDKNIFEEAKSYLFIIAFS*ILFAYIVT
SSAILREIGIMKIALFFTLLTLISNVSLNLVLIPKMGVAGSALATVISRCISAILMTFYIFFYKKDIRISILKLFKIEKK
I*KQYFRRFFGMNLVIITSLIISIRSIL*AQSLPPGSIGSDDGTGFYKYWGIGFLTISGIVMTIVNILLATFTSIQTSVS
IVVSRNLGQDKIEKARKNAAMLKGFLFIVSLAMSILALIVVIIITKTNLITKGLEIQVQKGMENYFTEHNLAINLEIIQK
QQGLATNFYLSQIF*ICLLIVFLNPI*VQINSSLNIIQAGGRANFASLCDFFIGISQFLWQLLVVFVFLPLLKDVKTKLF
FSMLIFYFSDIIKWIIYEILYLKTN*AINLTLEKTAKKIL

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 57603; Mature: 57603

Theoretical pI: Translated: 10.57; Mature: 10.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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HHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA