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The map label for this gene is 52842182

Identifier: 52842182

GI number: 52842182

Start: 2200794

End: 2203760

Strand: Reverse

Name: 52842182

Synonym: lpg1965

Alternate gene names: NA

Gene position: 2203760-2200794 (Counterclockwise)

Preceding gene: 52842183

Following gene: 52842180

Centisome position: 64.86

GC content: 33.27

Gene sequence:

>2967_bases
TTGCTGAAATTTTACTCAGATTCAGGTGCAAAAATGATTAAAAAATTGTTAATTAAAGTCGAAAAATTAATTAATAATCT
CCCAAAAGAGTTTAAATTATCTGAAACAGTTTTATTCTCCATTAAAGAAGATATAAACAGCTTGGCAAGTCGTTTTGATG
GGTCAAAAGGCTATATTAATTATTATTCTCCAAAAGTCGTGCAACAAATCAATGACAAACAAAAGTTACTTGAGAAATAC
AAAAGTTATTTAACTGCATTACTCGCTGTTTTAATTTGTTCTAAGCAAAGCAAAGACATTAGAGACAATAAAAAACTTCA
ACCTGTTTATGAGATTACCGATTTAAAAAATTTATTAGAACGCAAGGATGTCGAAAAAATTATCAATGAAATTACCCAAT
TTGATGAGGATCAAAGAGAACTTCAGAGAATTGAACGTCAGATACAAAAAGATGAGGAGAAAGAGGATAATCAAAAAATG
CATCTTGGTAAAAGATCCAAATTAGAGCTTAGGAGGGCAGAGCTTTCTAAAAGAGTTCAATTGTTTAATAATAAGTTAAA
AAACATTCCACAAGCTGAGGAAATCAAAGCCGTTTTAGATTATTGTCAAAAATACATCGAGAAACATATCAACCTTAGCA
AGCAATTACCAAAAGGAATGCTTGATGTTAAACGAGCATTGTCTTTATTTGACGAGATAAATTCCACCAAGACCCAAATT
AGGAAGTTAAGCAAAGACAAACTGGATTCTTCAGGGCAAATAAAACTTGAAGGTTTAAAAAAGGAACTTACAAAGGCTGA
ATTGGCTTTGCAATTTAGTTATTCAGAGGAAGAAGATAAAACTCTCAAAGACATGCTCAATGATTTGAAAAGGCTTATGA
AAATGAGCATCAGAGATTATCAAAAGTTAGCTACATCTGGCGGAGAAATAAATGTTTTTTTGCATAAGACAACTGGTTTT
TATTGGGAAAGCCTTTTTCTGTACAGAAATGTTTTGTGCGAAATTAATGAATATCTTAAAAAAAATAAAAAGAAACTGTC
TGAGCAAGGAATGCTGGTAGCTGAATGCATTTCTAAAGCCTTCAGCCAGATGCCTGAATTGGATACCATTGAAAAAGCTT
TAGAAAAAGTCAAAAGAATAGATGGTGATCTTCACAGACAAGAAGAATATAACGACAAAATCAATGGTGCTTGGATTCGG
TTTTATAAAAAGGGTCCAGTAAAATTTGTTCAAAAAGTCCTTGAACAAAACTTAGATGAGAAAATTTTTTACATACCGTA
TAATCCGCATAATTACGTGCTGGATCATCCTGCCCAATCTGATTTCGCCGATACCTTAGGAAATTGCTATGGCGAAACAC
AGATGTTTCTCAAACAAATAAACAGTAAATCTCCTTCAATTAACAATATTTGTCCTGAGAGAGTATTAATTAATTATCAG
CTTGATCAATCCAGGACAATTGCTAAAAATACCAAAAAAGAAAAAATAGGGATATTTGAGGCAGATGAGAAGACAAAAGC
ACAAGTAACATGGGATGGAATTAAAGATATCTTAACATCAAAAGTTACCTCTACCGCTTTTGGTGATGTGTGCATGATCA
CTTTGACGGGAGCTCAAGTTTCTGGTCGTGAAAAATTAGTAGGTCATGGTATTGGCCTTATCAAAATGAAGAATCCTGCT
CCTTATAAATATGTGGTATATGATTATGCTTTTGGCGGTGCAATGGGATTCAGCAGTGATACTCAACTGGAGCTATTCTT
TAAACAAATCCTTGAAGGAGAGGGATCTTATGTTCCTTTTAAGGAATGTCTGGTTGAAAAAGTAGGAGAGGTGAGTAAAG
AATGTCAACAATTTATTAATGGTAATCCGGGTATTGCTTCTCTGGCACAAAAAAGTCTTGATAAAACATGTAAGAGAGAC
TTCTGGGATAAAGATCGCATCAGTTTTTTGATAAGATATCACCCCATCGGCACAGATGAAAGCAGGATACTTGATTTAAT
AGAAAAGTTACCTCTATCTAAGGATAGAATAGAGCTATATGAACAGCTTGTTAAAGAGCCTAAAATTGGTATCGGTAACC
TGGTTAAGTGTATCATTCGCTCAGGTAAGATAAGTTACCTGGCAAATCTTTTGACAACCAATTTATTGACCGTTGATATT
ACAAATAAAATAAAATTTAAGTTGAATGAACAAGTTAAAAAAGAAATAGTGGCTTTAATTAATAATGATCAGATTGAACC
AAACACAACTTGTAAACTATTCTCTAACAATCAAGCGATTGTTTTGGCAACCTATAAAAAGGACAAAAACTCACTCCAAT
ATGCGGACATAGATCCGGTTGTAACGCTTTTGCAAGGGAAGAATACCATCGTACCCTCTGATGCTTGTCGGGCTTTTCCT
AAGGCAGAAAAAATAGTCATCGCAGCCTATAAATCGGATCCATTATCGTTGCAATTTGCCGATCTTGGTTTGGTTCAACA
ATTATTACGAAAAGGTTCTATTAATCTCGAGCATGCTTCTAAAGCTTTTACAGAGAGCTCACAATTCAAGGAGGCCAATG
AAGCTTATCAGCTTTTAAAATCTCTGAAGCTTCTGCCAAAAAATGAAAAAGAAACTGAGAAAGCCAAGAGAATCGAGTTA
TTAAAATCGATTGATCAAAAGCTGGAAATTACTAATTTGAGACAAGAACTTTATCCCTTAATTTCAAATATGTGTATTCG
ATTACTTGATGATATTCGAATCCTGTCCCTTGAAGATACAATAATCAAAAACACCAGATTGTCCAAGTTAATCAGTTCGA
AACAGTGTGATATCAATACATTAAAAACACTTGAAAATAAAAAAATGGAATTAACTAAAACATGTTCTCTGGCAAAATCA
AATTTTACTTTATTTGGAGCTACAGATAATAAAGTTGATGGAGGAAATGCTAATACTCATAACCACATCACTCCAGAGAA
TAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTGATTTTCTGGTTTTTTATAAACCAAGGAAATAGACGATCCCGTAATTCCTTGGTTTTGAAAACTTCATTACTACAAAT
TTCAGTTAAATGTCACTGAC

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAGTGTTTTGTTGGAATTGGTCGTATAGATGCGGCCAATTTGTTAAATTGAATTAGTTTCGGCTTAATCTGACACAGTTA
TTTAAACACTGCTATCAAGC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 988; Mature: 988

Protein sequence:

>988_residues
MLKFYSDSGAKMIKKLLIKVEKLINNLPKEFKLSETVLFSIKEDINSLASRFDGSKGYINYYSPKVVQQINDKQKLLEKY
KSYLTALLAVLICSKQSKDIRDNKKLQPVYEITDLKNLLERKDVEKIINEITQFDEDQRELQRIERQIQKDEEKEDNQKM
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KAEKIVIAAYKSDPLSLQFADLGLVQQLLRKGSINLEHASKAFTESSQFKEANEAYQLLKSLKLLPKNEKETEKAKRIEL
LKSIDQKLEITNLRQELYPLISNMCIRLLDDIRILSLEDTIIKNTRLSKLISSKQCDINTLKTLENKKMELTKTCSLAKS
NFTLFGATDNKVDGGNANTHNHITPENK

Sequences:

>Translated_988_residues
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KSYLTALLAVLICSKQSKDIRDNKKLQPVYEITDLKNLLERKDVEKIINEITQFDEDQRELQRIERQIQKDEEKEDNQKM
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FWDKDRISFLIRYHPIGTDESRILDLIEKLPLSKDRIELYEQLVKEPKIGIGNLVKCIIRSGKISYLANLLTTNLLTVDI
TNKIKFKLNEQVKKEIVALINNDQIEPNTTCKLFSNNQAIVLATYKKDKNSLQYADIDPVVTLLQGKNTIVPSDACRAFP
KAEKIVIAAYKSDPLSLQFADLGLVQQLLRKGSINLEHASKAFTESSQFKEANEAYQLLKSLKLLPKNEKETEKAKRIEL
LKSIDQKLEITNLRQELYPLISNMCIRLLDDIRILSLEDTIIKNTRLSKLISSKQCDINTLKTLENKKMELTKTCSLAKS
NFTLFGATDNKVDGGNANTHNHITPENK
>Mature_988_residues
MLKFYSDSGAKMIKKLLIKVEKLINNLPKEFKLSETVLFSIKEDINSLASRFDGSKGYINYYSPKVVQQINDKQKLLEKY
KSYLTALLAVLICSKQSKDIRDNKKLQPVYEITDLKNLLERKDVEKIINEITQFDEDQRELQRIERQIQKDEEKEDNQKM
HLGKRSKLELRRAELSKRVQLFNNKLKNIPQAEEIKAVLDYCQKYIEKHINLSKQLPKGMLDVKRALSLFDEINSTKTQI
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YWESLFLYRNVLCEINEYLKKNKKKLSEQGMLVAECISKAFSQMPELDTIEKALEKVKRIDGDLHRQEEYNDKINGAWIR
FYKKGPVKFVQKVLEQNLDEKIFYIPYNPHNYVLDHPAQSDFADTLGNCYGETQMFLKQINSKSPSINNICPERVLINYQ
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PYKYVVYDYAFGGAMGFSSDTQLELFFKQILEGEGSYVPFKECLVEKVGEVSKECQQFINGNPGIASLAQKSLDKTCKRD
FWDKDRISFLIRYHPIGTDESRILDLIEKLPLSKDRIELYEQLVKEPKIGIGNLVKCIIRSGKISYLANLLTTNLLTVDI
TNKIKFKLNEQVKKEIVALINNDQIEPNTTCKLFSNNQAIVLATYKKDKNSLQYADIDPVVTLLQGKNTIVPSDACRAFP
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LKSIDQKLEITNLRQELYPLISNMCIRLLDDIRILSLEDTIIKNTRLSKLISSKQCDINTLKTLENKKMELTKTCSLAKS
NFTLFGATDNKVDGGNANTHNHITPENK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 113315; Mature: 113315

Theoretical pI: Translated: 9.45; Mature: 9.45

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.6 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
1.6 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLKFYSDSGAKMIKKLLIKVEKLINNLPKEFKLSETVLFSIKEDINSLASRFDGSKGYIN
CCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEE
YYSPKVVQQINDKQKLLEKYKSYLTALLAVLICSKQSKDIRDNKKLQPVYEITDLKNLLE
CCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH
RKDVEKIINEITQFDEDQRELQRIERQIQKDEEKEDNQKMHLGKRSKLELRRAELSKRVQ
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ISNMCIRLLDDIRILSLEDTIIKNTRLSKLISSKQCDINTLKTLENKKMELTKTCSLAKS
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NFTLFGATDNKVDGGNANTHNHITPENK
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>Mature Secondary Structure
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NFTLFGATDNKVDGGNANTHNHITPENK
CEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA