| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46447276
Identifier: 46447276
GI number: 46447276
Start: 1971962
End: 1973137
Strand: Direct
Name: 46447276
Synonym: pc1642
Alternate gene names: NA
Gene position: 1971962-1973137 (Clockwise)
Preceding gene: 46447275
Following gene: 46447278
Centisome position: 81.67
GC content: 35.2
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases ATGATAAACGCCTATTAAAATGCAAAAAAATTTAGATTATTTAAAAAATACTCAATTTATTTTTATTGCCAGTAAGCTTC TAAATAGCCCTTTAGGAGCG
Downstream 100 bases:
>100_bases CCAATTTTAAACTCCTTTTAACAACAACTAAAGGCACGATTAGCTAGACAGCCTTTTAGTTTGGGCTTTAATTTCACTCT TTTTCACTTCATTTTTTAAA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 391; Mature: 391
Protein sequence:
>391_residues MYNLLSFIICKQLDATPFQITLLISSKPLVALISFYSSVFIKNRPERLKSLIISSTILSFIPCFAFPFVTNCWFFIFAFA LFMMSAKAMLPAWAEIFKRNIGPEGRSAIFSKGSTVNYLANIFVPLLLAPILDYYPSIWTEIFFILALIQLAHVVFLLRL KVRLEKHESSSFAPNSFSFRSVIFDPWKNSWQLMKQRPDFRNYQIVFLLGGTGLILSQPVLPLFFEQILHLSYTQLIFAV SLCKGIGFAITSPLWANAFNRISINLFNFFVTALAGLFAIVLATIQQEVLWLYLAYLIYGIMQAGSEMSWHLAGPQFAKQ EDSTLYTSVNIAMIGLRGCIAPFIGELLFCTTNFSVVFFCSAGCCLAGAFYSYWLEFQDRKADNLTFSAVE
Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 44326; Mature: 44326
Theoretical pI: Translated: 8.60; Mature: 8.60
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.3 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 2.3 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYNLLSFIICKQLDATPFQITLLISSKPLVALISFYSSVFIKNRPERLKSLIISSTILSF CHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IPCFAFPFVTNCWFFIFAFALFMMSAKAMLPAWAEIFKRNIGPEGRSAIFSKGSTVNYLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHH NIFVPLLLAPILDYYPSIWTEIFFILALIQLAHVVFLLRLKVRLEKHESSSFAPNSFSFR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHH SVIFDPWKNSWQLMKQRPDFRNYQIVFLLGGTGLILSQPVLPLFFEQILHLSYTQLIFAV HHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLCKGIGFAITSPLWANAFNRISINLFNFFVTALAGLFAIVLATIQQEVLWLYLAYLIYG HHHHCCCHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMQAGSEMSWHLAGPQFAKQEDSTLYTSVNIAMIGLRGCIAPFIGELLFCTTNFSVVFFC HHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE SAGCCLAGAFYSYWLEFQDRKADNLTFSAVE CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECC >Mature Secondary Structure MYNLLSFIICKQLDATPFQITLLISSKPLVALISFYSSVFIKNRPERLKSLIISSTILSF CHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IPCFAFPFVTNCWFFIFAFALFMMSAKAMLPAWAEIFKRNIGPEGRSAIFSKGSTVNYLA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHH NIFVPLLLAPILDYYPSIWTEIFFILALIQLAHVVFLLRLKVRLEKHESSSFAPNSFSFR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHH SVIFDPWKNSWQLMKQRPDFRNYQIVFLLGGTGLILSQPVLPLFFEQILHLSYTQLIFAV HHHCCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SLCKGIGFAITSPLWANAFNRISINLFNFFVTALAGLFAIVLATIQQEVLWLYLAYLIYG HHHHCCCHHHCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IMQAGSEMSWHLAGPQFAKQEDSTLYTSVNIAMIGLRGCIAPFIGELLFCTTNFSVVFFC HHHCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEE SAGCCLAGAFYSYWLEFQDRKADNLTFSAVE CCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA