Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46447019

Identifier: 46447019

GI number: 46447019

Start: 1662033

End: 1664282

Strand: Direct

Name: 46447019

Synonym: pc1385

Alternate gene names: NA

Gene position: 1662033-1664282 (Clockwise)

Preceding gene: 46447018

Following gene: 46447020

Centisome position: 68.84

GC content: 39.07

Gene sequence:

>2250_bases
ATGGGAAATACTATTTCTGATGGCAATAACTATCAATCTGCTGATTATACATTTCAATCTCCCTCTAATACAGGTACAGA
AACATCAAATTCTGTTCAATTCAAATTTGTTCTCACTGACGATACAATTGCGTCTGCAGATTTCTTTTCAACTATTCAAT
TTTTTGTACCGACTACTTACACTGCTGATGCTTCTGTTCCCACACTTGCTTCTCCCGAAACCGAAGAAATCGGTGAACAG
CTCCCTTACGGAACAACAGAACAAGGGATGATTAAAAAGTTTTTTTCAGATCAAGTAATCTCTGCTTTAAAGGGGCAAGG
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CCAAACTGTTTTAAATAAAGTGACAACATATTTAGAAGAACATGCCCTAGAACTAGATCCTGATCAAGCCATGAATTTAA
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ACACAAAAAGCTTTTGGATTACCAAATAGTTGGTTTAAAGGCACAACTACTGTAGATGATTGGAAACCTATAAATGTAGG
CCTAATCACTCCTGCCAAAGTTGCTAATGCTCGTTTAGAAGGATTACTTGGAAATGCTGAAGCCATATTCACAGACATCT
CCGCCGCAGCAAATGCGCTTTTAGATGGCCCTCCCCCTATTCCTGTGGATGATCCAAGAAGAGTTGCTTTAACAGAATTT
TTAAAAATTATTGGTGATGCTATCAAAGATTTAAAAGCAACTCTTCGGGAGATTCAAGTTCACGATGCCGAAAAATCAAA
AGAAAATGCAAAAGCCAAATTTGGTGAGTTAGCTGACAGACGCCTTCGAGCGCAAGAGCAAGCAGAAAAAATGGAAAAAA
TGCTGAAGAAGCAAAAACAAATGAAATCGATGGGCCTTGCGATGAAAATTATTGGGCCTATTATTGCTGCTTTATCAACG
ATTATAGGAACTCTTATTGCCATTGCTTCTTTAGGAACAGCAACAGCTGCATCAGTTGCTATAATCGCAGCTGGAGTTGC
AGTAGGTATCGCAATGACAGCCTATTCAATCGCAGATTCTGTAACTGGCGTCACTCAAAAAATTATCACAGCCTTTAAAG
ATGCCTTGGATAAACTGATGCCTGATTCACCGGATTGGGTTAAATCTCTTGTTAAAGCTTTAATTGTCGCTGCTGTTGTA
GCCGTTTTAGCTGTCATTATTGTTCTTGCTATGGCTTCAGGTAGTGGAGCTGGAGCAGCAACTAACGCGGCATCTCAAGC
TGTCCAACAAACCATTCGCATAGCAGTTACCGAAGCTATTAAGCAAATGGCTCTTCAGGCAATGATCATGGCTATTATGA
GCAGTAATGCTTTACCAGAGCTAGTTGGAGGCATTTTAAAAGCTTCTGGAGTAGACAAAAAAACTCAACAAATTGTTGAG
ATGGTTGTCATGGCTATCACTCTTATTGCGTGTGTCATCGCTATGGCAAAAGTCGGGGGCGCAAAATCGGGCGGGACTGA
GCAAAAAGCTGCTGATGCCGCAGAAGAAGCCACAAAAGAAGCTGCCAAAACTGTGACTCAACGAGCCTCAGACGCTTTAA
AAGATTTTAAATCGCAATTAGATAACGTAAAAGAATCCATAAAAAAACTTCCAGAAACTATGCAACAAGAATTTAAATCA
ATGATGCAAGGATTTAAAAACCTTGATAAATGGGACGTTTTAAACGCTGTTGCGCAATCTGCTCCATTAGCTGTTCAAAT
GACTGGAGGAGCTATAACTGGGTCTATGCAACTTAAAGTCAGCCGTTTATTAAAAGAAGTGGGTGAAATAAAATCTGCGG
AAGAGGAACTTGAAGGGTTAATTCAAGCTTTAGAAAAACTTTTAAAAAATATTCAGCAAGGAATGAATAATCGAGATGAC
TTTATTGCTCAGCTACAGCAAATGTACACAAGCATTTATGATGCCGCTGCAAAAACTCAAAATCAAATGTTCAATGCCCT
TCAGGGATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGACAGATGAATTAAAGGTGAAATTTAAGTCATCACAATCATCATTAATTTATCTGGTTAGACAATCATAAATTTACTT
AACCCTAAAAGAGGTTAACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GGAGAAAAAATTATGACAATTTCACAAGATCAAATTCGTGAAGCTATTGAAAAAGCTGACATCAATCTGTCTCCTAATAT
GCAGAAAAAAACAGAAGAAG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 749; Mature: 748

Protein sequence:

>749_residues
MGNTISDGNNYQSADYTFQSPSNTGTETSNSVQFKFVLTDDTIASADFFSTIQFFVPTTYTADASVPTLASPETEEIGEQ
LPYGTTEQGMIKKFFSDQVISALKGQGLTPEEAETVYEAIMSGTVPADPNLAEIAKKISKNVTAKTITEGNLPASWTLTS
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TQKAFGLPNSWFKGTTTVDDWKPINVGLITPAKVANARLEGLLGNAEAIFTDISAAANALLDGPPPIPVDDPRRVALTEF
LKIIGDAIKDLKATLREIQVHDAEKSKENAKAKFGELADRRLRAQEQAEKMEKMLKKQKQMKSMGLAMKIIGPIIAALST
IIGTLIAIASLGTATAASVAIIAAGVAVGIAMTAYSIADSVTGVTQKIITAFKDALDKLMPDSPDWVKSLVKALIVAAVV
AVLAVIIVLAMASGSGAGAATNAASQAVQQTIRIAVTEAIKQMALQAMIMAIMSSNALPELVGGILKASGVDKKTQQIVE
MVVMAITLIACVIAMAKVGGAKSGGTEQKAADAAEEATKEAAKTVTQRASDALKDFKSQLDNVKESIKKLPETMQQEFKS
MMQGFKNLDKWDVLNAVAQSAPLAVQMTGGAITGSMQLKVSRLLKEVGEIKSAEEELEGLIQALEKLLKNIQQGMNNRDD
FIAQLQQMYTSIYDAAAKTQNQMFNALQG

Sequences:

>Translated_749_residues
MGNTISDGNNYQSADYTFQSPSNTGTETSNSVQFKFVLTDDTIASADFFSTIQFFVPTTYTADASVPTLASPETEEIGEQ
LPYGTTEQGMIKKFFSDQVISALKGQGLTPEEAETVYEAIMSGTVPADPNLAEIAKKISKNVTAKTITEGNLPASWTLTS
TDAKDWTPLPILPYGSDQQAQVNEYYDQTVLNKVTTYLEEHALELDPDQAMNLMKAVQTGEVSSDIADIYIQLTAEARVE
TQKAFGLPNSWFKGTTTVDDWKPINVGLITPAKVANARLEGLLGNAEAIFTDISAAANALLDGPPPIPVDDPRRVALTEF
LKIIGDAIKDLKATLREIQVHDAEKSKENAKAKFGELADRRLRAQEQAEKMEKMLKKQKQMKSMGLAMKIIGPIIAALST
IIGTLIAIASLGTATAASVAIIAAGVAVGIAMTAYSIADSVTGVTQKIITAFKDALDKLMPDSPDWVKSLVKALIVAAVV
AVLAVIIVLAMASGSGAGAATNAASQAVQQTIRIAVTEAIKQMALQAMIMAIMSSNALPELVGGILKASGVDKKTQQIVE
MVVMAITLIACVIAMAKVGGAKSGGTEQKAADAAEEATKEAAKTVTQRASDALKDFKSQLDNVKESIKKLPETMQQEFKS
MMQGFKNLDKWDVLNAVAQSAPLAVQMTGGAITGSMQLKVSRLLKEVGEIKSAEEELEGLIQALEKLLKNIQQGMNNRDD
FIAQLQQMYTSIYDAAAKTQNQMFNALQG
>Mature_748_residues
GNTISDGNNYQSADYTFQSPSNTGTETSNSVQFKFVLTDDTIASADFFSTIQFFVPTTYTADASVPTLASPETEEIGEQL
PYGTTEQGMIKKFFSDQVISALKGQGLTPEEAETVYEAIMSGTVPADPNLAEIAKKISKNVTAKTITEGNLPASWTLTST
DAKDWTPLPILPYGSDQQAQVNEYYDQTVLNKVTTYLEEHALELDPDQAMNLMKAVQTGEVSSDIADIYIQLTAEARVET
QKAFGLPNSWFKGTTTVDDWKPINVGLITPAKVANARLEGLLGNAEAIFTDISAAANALLDGPPPIPVDDPRRVALTEFL
KIIGDAIKDLKATLREIQVHDAEKSKENAKAKFGELADRRLRAQEQAEKMEKMLKKQKQMKSMGLAMKIIGPIIAALSTI
IGTLIAIASLGTATAASVAIIAAGVAVGIAMTAYSIADSVTGVTQKIITAFKDALDKLMPDSPDWVKSLVKALIVAAVVA
VLAVIIVLAMASGSGAGAATNAASQAVQQTIRIAVTEAIKQMALQAMIMAIMSSNALPELVGGILKASGVDKKTQQIVEM
VVMAITLIACVIAMAKVGGAKSGGTEQKAADAAEEATKEAAKTVTQRASDALKDFKSQLDNVKESIKKLPETMQQEFKSM
MQGFKNLDKWDVLNAVAQSAPLAVQMTGGAITGSMQLKVSRLLKEVGEIKSAEEELEGLIQALEKLLKNIQQGMNNRDDF
IAQLQQMYTSIYDAAAKTQNQMFNALQG

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 80057; Mature: 79925

Theoretical pI: Translated: 4.66; Mature: 4.66

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.7 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.6 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGNTISDGNNYQSADYTFQSPSNTGTETSNSVQFKFVLTDDTIASADFFSTIQFFVPTTY
CCCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCE
TADASVPTLASPETEEIGEQLPYGTTEQGMIKKFFSDQVISALKGQGLTPEEAETVYEAI
ECCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
MSGTVPADPNLAEIAKKISKNVTAKTITEGNLPASWTLTSTDAKDWTPLPILPYGSDQQA
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH
QVNEYYDQTVLNKVTTYLEEHALELDPDQAMNLMKAVQTGEVSSDIADIYIQLTAEARVE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHEEEHHHHHH
TQKAFGLPNSWFKGTTTVDDWKPINVGLITPAKVANARLEGLLGNAEAIFTDISAAANAL
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
LDGPPPIPVDDPRRVALTEFLKIIGDAIKDLKATLREIQVHDAEKSKENAKAKFGELADR
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RLRAQEQAEKMEKMLKKQKQMKSMGLAMKIIGPIIAALSTIIGTLIAIASLGTATAASVA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
IIAAGVAVGIAMTAYSIADSVTGVTQKIITAFKDALDKLMPDSPDWVKSLVKALIVAAVV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
AVLAVIIVLAMASGSGAGAATNAASQAVQQTIRIAVTEAIKQMALQAMIMAIMSSNALPE
HHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
LVGGILKASGVDKKTQQIVEMVVMAITLIACVIAMAKVGGAKSGGTEQKAADAAEEATKE
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
AAKTVTQRASDALKDFKSQLDNVKESIKKLPETMQQEFKSMMQGFKNLDKWDVLNAVAQS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHC
APLAVQMTGGAITGSMQLKVSRLLKEVGEIKSAEEELEGLIQALEKLLKNIQQGMNNRDD
CCEEEEECCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
FIAQLQQMYTSIYDAAAKTQNQMFNALQG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
GNTISDGNNYQSADYTFQSPSNTGTETSNSVQFKFVLTDDTIASADFFSTIQFFVPTTY
CCCCCCCCCCCCCCCEECCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCE
TADASVPTLASPETEEIGEQLPYGTTEQGMIKKFFSDQVISALKGQGLTPEEAETVYEAI
ECCCCCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
MSGTVPADPNLAEIAKKISKNVTAKTITEGNLPASWTLTSTDAKDWTPLPILPYGSDQQA
HCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCCH
QVNEYYDQTVLNKVTTYLEEHALELDPDQAMNLMKAVQTGEVSSDIADIYIQLTAEARVE
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TQKAFGLPNSWFKGTTTVDDWKPINVGLITPAKVANARLEGLLGNAEAIFTDISAAANAL
HHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHH
LDGPPPIPVDDPRRVALTEFLKIIGDAIKDLKATLREIQVHDAEKSKENAKAKFGELADR
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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IIAAGVAVGIAMTAYSIADSVTGVTQKIITAFKDALDKLMPDSPDWVKSLVKALIVAAVV
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AVLAVIIVLAMASGSGAGAATNAASQAVQQTIRIAVTEAIKQMALQAMIMAIMSSNALPE
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LVGGILKASGVDKKTQQIVEMVVMAITLIACVIAMAKVGGAKSGGTEQKAADAAEEATKE
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CCEEEEECCCEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
FIAQLQQMYTSIYDAAAKTQNQMFNALQG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA