| Definition | Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_005861 |
| Length | 2,414,465 |
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The map label for this gene is 46445992
Identifier: 46445992
GI number: 46445992
Start: 484092
End: 486749
Strand: Reverse
Name: 46445992
Synonym: pc0358
Alternate gene names: NA
Gene position: 486749-484092 (Counterclockwise)
Preceding gene: 46445993
Following gene: 46445983
Centisome position: 20.16
GC content: 35.93
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TTCTGGACTGATAGCTCAGTGGATAGAGCACCCGCCTTCTAAGCGGGTGGTCGTAGGTTCGAATCCTACTCGGTCCGATT TGACTCAAAAGAAAATTACA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTCTTCTTTTAACCAAAAATTAAAATGTTATTTCCTAATTTCAAAACAGATTTTTTAGTCGTTTATAGGGAGCTAAAATA AAATTTAGTGAAAAATTAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 885; Mature: 884
Protein sequence:
>885_residues MTKSLESLPSTASAFPSSPCFSLCHISQAQTFPDIQALIDSFRSTEFLNLSFRHRFRMINKTLCDLINQAPTQSFLLSAI LDFMERVNREKILSESLTMNTFEFWLNNFSELSDEENYAIRAKIVGKWIPRSDYQAFFPIGMDKSYNGTHFIAAHLSPDV DTMIASFWGWVDAFASRVTRGLHQWCLPGGPPDSPISSIVSEMFGEGLFNCLARTAQTITLTAIDLVSQKDFIKEAKETL TGYIDHETNEKAIILIDENGHYLGDWQSSDVETVRQIIILFKSCLRWFKNNLHTKLISLFAKTNLSVIDFPLFNSSVFDV KIKDCEPVQEFNEKQKNDLHDFFYKILHVKKGLSGTFDDLIQALNFLSVSELLYFQHSIKSLPKSSIFDEQGKLKEDCPK IFLKLEKIINQLDAAIQNVRNYVERLDIVLGVKHKVLGSSLLYVNLRSDIDEIRHKMQSHDFITVVIPEKDGSLFPVGVI RATDLRMNGLGTITLRDFCNLEEVKMASYLEVISVVDHHKSSLKTLSVPTALIGDTQSCNVLIAEQAFLINDRYSLGGMT AQAIDNRIQKLALSTGNSSQIRILQRLLQRRLVTYQTNQFFVHPQREFQEYLCYLHAILDDTDLLTKVSNRDLFCIAQLL NRLKSLSMGYETEIIHFDDIPLDKKFTKIAAQRILQQQDMYQFYKKIYDLRESSVQKNLQLCVEGCYSNIFLDAKEQNGC ARVGQTKMFAFNFPFFLEHAQSIRSTWLNKSREINRDKPEIDLHLHMISTIASSEEVYRNQIGPYSHQDELWFWIPNTLQ ASDHLNSFLTGFQTVAKSFVENMSVEFLGPNAQNYQIIFSSHFPHIPQKIVNESQKGMSLAILRFKAGALNSRKSMVTPF LPRLT
Sequences:
>Translated_885_residues MTKSLESLPSTASAFPSSPCFSLCHISQAQTFPDIQALIDSFRSTEFLNLSFRHRFRMINKTLCDLINQAPTQSFLLSAI LDFMERVNREKILSESLTMNTFEFWLNNFSELSDEENYAIRAKIVGKWIPRSDYQAFFPIGMDKSYNGTHFIAAHLSPDV DTMIASFWGWVDAFASRVTRGLHQWCLPGGPPDSPISSIVSEMFGEGLFNCLARTAQTITLTAIDLVSQKDFIKEAKETL TGYIDHETNEKAIILIDENGHYLGDWQSSDVETVRQIIILFKSCLRWFKNNLHTKLISLFAKTNLSVIDFPLFNSSVFDV KIKDCEPVQEFNEKQKNDLHDFFYKILHVKKGLSGTFDDLIQALNFLSVSELLYFQHSIKSLPKSSIFDEQGKLKEDCPK IFLKLEKIINQLDAAIQNVRNYVERLDIVLGVKHKVLGSSLLYVNLRSDIDEIRHKMQSHDFITVVIPEKDGSLFPVGVI RATDLRMNGLGTITLRDFCNLEEVKMASYLEVISVVDHHKSSLKTLSVPTALIGDTQSCNVLIAEQAFLINDRYSLGGMT AQAIDNRIQKLALSTGNSSQIRILQRLLQRRLVTYQTNQFFVHPQREFQEYLCYLHAILDDTDLLTKVSNRDLFCIAQLL NRLKSLSMGYETEIIHFDDIPLDKKFTKIAAQRILQQQDMYQFYKKIYDLRESSVQKNLQLCVEGCYSNIFLDAKEQNGC ARVGQTKMFAFNFPFFLEHAQSIRSTWLNKSREINRDKPEIDLHLHMISTIASSEEVYRNQIGPYSHQDELWFWIPNTLQ ASDHLNSFLTGFQTVAKSFVENMSVEFLGPNAQNYQIIFSSHFPHIPQKIVNESQKGMSLAILRFKAGALNSRKSMVTPF LPRLT >Mature_884_residues TKSLESLPSTASAFPSSPCFSLCHISQAQTFPDIQALIDSFRSTEFLNLSFRHRFRMINKTLCDLINQAPTQSFLLSAIL DFMERVNREKILSESLTMNTFEFWLNNFSELSDEENYAIRAKIVGKWIPRSDYQAFFPIGMDKSYNGTHFIAAHLSPDVD TMIASFWGWVDAFASRVTRGLHQWCLPGGPPDSPISSIVSEMFGEGLFNCLARTAQTITLTAIDLVSQKDFIKEAKETLT GYIDHETNEKAIILIDENGHYLGDWQSSDVETVRQIIILFKSCLRWFKNNLHTKLISLFAKTNLSVIDFPLFNSSVFDVK IKDCEPVQEFNEKQKNDLHDFFYKILHVKKGLSGTFDDLIQALNFLSVSELLYFQHSIKSLPKSSIFDEQGKLKEDCPKI FLKLEKIINQLDAAIQNVRNYVERLDIVLGVKHKVLGSSLLYVNLRSDIDEIRHKMQSHDFITVVIPEKDGSLFPVGVIR ATDLRMNGLGTITLRDFCNLEEVKMASYLEVISVVDHHKSSLKTLSVPTALIGDTQSCNVLIAEQAFLINDRYSLGGMTA QAIDNRIQKLALSTGNSSQIRILQRLLQRRLVTYQTNQFFVHPQREFQEYLCYLHAILDDTDLLTKVSNRDLFCIAQLLN RLKSLSMGYETEIIHFDDIPLDKKFTKIAAQRILQQQDMYQFYKKIYDLRESSVQKNLQLCVEGCYSNIFLDAKEQNGCA RVGQTKMFAFNFPFFLEHAQSIRSTWLNKSREINRDKPEIDLHLHMISTIASSEEVYRNQIGPYSHQDELWFWIPNTLQA SDHLNSFLTGFQTVAKSFVENMSVEFLGPNAQNYQIIFSSHFPHIPQKIVNESQKGMSLAILRFKAGALNSRKSMVTPFL PRLT
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 101405; Mature: 101274
Theoretical pI: Translated: 6.91; Mature: 6.91
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.7 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 3.7 %Cys+Met (Translated Protein) 1.7 %Cys (Mature Protein) 1.9 %Met (Mature Protein) 3.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTKSLESLPSTASAFPSSPCFSLCHISQAQTFPDIQALIDSFRSTEFLNLSFRHRFRMIN CCCCHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHH KTLCDLINQAPTQSFLLSAILDFMERVNREKILSESLTMNTFEFWLNNFSELSDEENYAI HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE RAKIVGKWIPRSDYQAFFPIGMDKSYNGTHFIAAHLSPDVDTMIASFWGWVDAFASRVTR EEEEHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLHQWCLPGGPPDSPISSIVSEMFGEGLFNCLARTAQTITLTAIDLVSQKDFIKEAKETL HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGYIDHETNEKAIILIDENGHYLGDWQSSDVETVRQIIILFKSCLRWFKNNLHTKLISLF HHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKTNLSVIDFPLFNSSVFDVKIKDCEPVQEFNEKQKNDLHDFFYKILHVKKGLSGTFDDL HHCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH IQALNFLSVSELLYFQHSIKSLPKSSIFDEQGKLKEDCPKIFLKLEKIINQLDAAIQNVR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NYVERLDIVLGVKHKVLGSSLLYVNLRSDIDEIRHKMQSHDFITVVIPEKDGSLFPVGVI HHHHHHHHHHCCHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEE RATDLRMNGLGTITLRDFCNLEEVKMASYLEVISVVDHHKSSLKTLSVPTALIGDTQSCN EEECEEECCCEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCC VLIAEQAFLINDRYSLGGMTAQAIDNRIQKLALSTGNSSQIRILQRLLQRRLVTYQTNQF EEEECCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEE FVHPQREFQEYLCYLHAILDDTDLLTKVSNRDLFCIAQLLNRLKSLSMGYETEIIHFDDI EECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC PLDKKFTKIAAQRILQQQDMYQFYKKIYDLRESSVQKNLQLCVEGCYSNIFLDAKEQNGC CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCC ARVGQTKMFAFNFPFFLEHAQSIRSTWLNKSREINRDKPEIDLHLHMISTIASSEEVYRN HHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH QIGPYSHQDELWFWIPNTLQASDHLNSFLTGFQTVAKSFVENMSVEFLGPNAQNYQIIFS CCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEEE SHFPHIPQKIVNESQKGMSLAILRFKAGALNSRKSMVTPFLPRLT CCCCCCCHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCC >Mature Secondary Structure TKSLESLPSTASAFPSSPCFSLCHISQAQTFPDIQALIDSFRSTEFLNLSFRHRFRMIN CCCHHHCCCHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHH KTLCDLINQAPTQSFLLSAILDFMERVNREKILSESLTMNTFEFWLNNFSELSDEENYAI HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEE RAKIVGKWIPRSDYQAFFPIGMDKSYNGTHFIAAHLSPDVDTMIASFWGWVDAFASRVTR EEEEHCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLHQWCLPGGPPDSPISSIVSEMFGEGLFNCLARTAQTITLTAIDLVSQKDFIKEAKETL HHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TGYIDHETNEKAIILIDENGHYLGDWQSSDVETVRQIIILFKSCLRWFKNNLHTKLISLF HHHHCCCCCCCEEEEEECCCCEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AKTNLSVIDFPLFNSSVFDVKIKDCEPVQEFNEKQKNDLHDFFYKILHVKKGLSGTFDDL HHCCCCEEEEECCCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH IQALNFLSVSELLYFQHSIKSLPKSSIFDEQGKLKEDCPKIFLKLEKIINQLDAAIQNVR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH NYVERLDIVLGVKHKVLGSSLLYVNLRSDIDEIRHKMQSHDFITVVIPEKDGSLFPVGVI HHHHHHHHHHCCHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEE RATDLRMNGLGTITLRDFCNLEEVKMASYLEVISVVDHHKSSLKTLSVPTALIGDTQSCN EEECEEECCCEEEEHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCC VLIAEQAFLINDRYSLGGMTAQAIDNRIQKLALSTGNSSQIRILQRLLQRRLVTYQTNQF EEEECCEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEE FVHPQREFQEYLCYLHAILDDTDLLTKVSNRDLFCIAQLLNRLKSLSMGYETEIIHFDDI EECCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECCC PLDKKFTKIAAQRILQQQDMYQFYKKIYDLRESSVQKNLQLCVEGCYSNIFLDAKEQNGC CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCC ARVGQTKMFAFNFPFFLEHAQSIRSTWLNKSREINRDKPEIDLHLHMISTIASSEEVYRN HHCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH QIGPYSHQDELWFWIPNTLQASDHLNSFLTGFQTVAKSFVENMSVEFLGPNAQNYQIIFS CCCCCCCCCCEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCEEEEEE SHFPHIPQKIVNESQKGMSLAILRFKAGALNSRKSMVTPFLPRLT CCCCCCCHHHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCHHHHCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA