Definition Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25, complete genome.
Accession NC_005861
Length 2,414,465

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The map label for this gene is 46445637

Identifier: 46445637

GI number: 46445637

Start: 1055

End: 4024

Strand: Direct

Name: 46445637

Synonym: pc0003

Alternate gene names: NA

Gene position: 1055-4024 (Clockwise)

Preceding gene: 46445636

Following gene: 46445638

Centisome position: 0.04

GC content: 34.11

Gene sequence:

>2970_bases
TTGTGTGAGAAAGTGAATAAAGAAAAAATTAATACAATTTTAAGCTTAGTCAAAGCTCCTCTTAATCATCCATTTTTTTA
TCCACGAATTTTTGCTTTAATCGCTAAACAAAAAAAGCAAGAAAGATTAGCAGCGGATAAAATTTGTGCTTATATAGTTG
AAGAATACGAAGAAATTTCTCGACGGTTAGATCGTTCGCAAATTCAAGAAAGTTGTTCTGTTCGCAACATTTTACGAACA
GGCCATTTAGCGGCCCTTTTAATCGATGATAAAGGTGAAATTAATTTCGCGGTCTTGCCAACGCTTATTCAAAAATTTAA
ATCCCATTTATATTCTCTTGGACCTAACAGACAATATGATTCTAAACGTCAAGAGCATATCTTGAAAGTTTTACAATTTT
TGTTAACTAATAAAGAGCTAGTCCGATCCTTAAAAAAAATTTCAAAACCTTTATCGAATAAAATTGCTGAAGACATTATT
AAGCAAACGTTGCAAATTCCTTCACAAACCGTTATTACAGATGCGCATGCAAAAAGAGCTGTTTTAGCTGCCTGGTTATG
TTATTTACGGCAAAATGTTGGATCTTGTTTTGCAACCGCACCGGCTGAAATTATTCAAAATGAACAGCCCGAACAATTTT
TGCAGGATATGACCGATTTACTCGCGACAGGCCGTTTAAAACGTACATTTGGGGGAGCAGAATATTCAGTTCCCATTAGT
GCAAGTTGGGGAAGTGGGGATTTAAAAAAACCTTTGCTCCTTTCTATCTCTTCTAAAAAAATCTCGCCTGAGATTTGGTA
TTCTCCTGGATTAATAGTCGCTTTTGAAGCTGTTGGATTACTTCAAAAAAATGAAAAGCTTAAAGATAAAATCAAAAGGC
TTAAAGATTGGATTGATCCAATCATTTTACAACATTCGCGTCACACTAATTATTGCATAGTGACAGCAGAAGTGATTTTA
AGAACTATTTTAAGGCAGTCTATAGGACTTTCAGAACAACAAATTAAAGATTACGAAGAGCGTCCTAGAGGCATGATTCA
AAGTAATTTAATGCAAATACCTGCTATTGGTAAACAAACAGGAGGAATTGGAGAAAAATGTGCTAATTTTCTTTATTTGT
TTGAAATAGGTAAAAATGCTTTTAAATCTTTAGCTGATAATGCCTTACTAAAAACTTGGGAATTTACTTTAGCTTCTTTT
TCCGAAACTAAATTAGAGTTTACGACTTGGAATTTGTATGCCAGTTTAGGAATGGGTTCCCACGAGCAAGGAGGAATTGG
ACATTGTATCCAAGAGCAGATTCAATATAAACTAGATCAAGCAAATAAACTTGTTCAAGATGCTCAATATGAGTATGAGA
TGATGTATACGCATGTCAAAACTTTAGAATCACGCATTAGGCATGCCAGTGAGAAAGAAGCTCAGTGGTTGAAAATGGAA
TATCAAAACAGAGCTAATGAATTATATTTTATCCAAGATCAACGAGACGATGCTCATCAGCGCGCTTCTGCTTTAGTTAA
TCTTTATGAATCTCTTTATAAAATCTATTTAGAGTTGTTTAGAGAGTATTTCCAAGAAGTTTACGATGCAGATATGCAAG
AAGTGTTGACAGGTCCTTTTGATGATAGTCCTGCAGGATTCAGGTTGCTTTATAAGCACGGAAGAAGCAATTCTTCACAA
TGGACAAGAATCAAAAATCAAACAGATTTTATTGATTCATTAACATCTTTTTTTGTCGCAACAGAACCTCAAATTGCCTC
CATGTTACAAAATTTAGGGTTAGAAAAAGATCTTGGTGAAGTTGTTACAGCTATTGTTAATCACGTAAAAACTAAAGAGT
TTTTAGAAACAGCTTTTTATCGCATGGCAGCAGCTCATCGTATGCCCATTCCTCAAAATCCTCTTGACCATTTAGACCAA
ATAGAAAAAAAACCTTGGGTTTATACCTCTGGAGGAACGATGAATACGCTTGTTAGTTGTTATTATCGAATAGAAGACAA
GCCACAGGAAGGGGCGAAATGGGTAGAAAGTGAGATGGAATTACTCGTTTTTTTTGCCGATACTTTAAAGCATATTCCAC
GAAAGCAGATGGAGCCTTACTTAGAAGGAAGGCGGCAATCTATGCTAATTCAATCACCTACACATGCTTTTTTATTAAAA
CCCAATTTAACTCCTTTTAAGGATGCTTGGATAGGTGATGAATTTACGTATACATCCGTTCGAGATAAATTTGTTAAACC
GGCTGAGTTTTTTATTGAAAAAATTGTTTTAGATCACAATATGATCCATTCATTTTTACAAGAATTAATAGAAAAGATTC
CGGAAAATTTTCAACCTCGTTTTAAAGCTGTTTTTCAGAATTTGACAGGTCCTTTAAATCCCCTATATTTTAGAGAAATT
ATTGTAGATACTTTGCAACAAGATAGAGGATTAAATATCGGTAAAAAATCCATCTTATCAGCAGACGAATTAGATAGCCT
TTTATATTCTAGACTTCCTTATTTTTCAATTTATGAGCTGAAAGAAAAAATTTATCAAATTTTAATTCTTTTACCAGGCA
TAACCTCCTCAAAAGCAGATGAAATTTTGAGCTATTTTGATCAAATTTCTTTATCTAAATCTCAGTACGTCATGAGCGCT
AATCAGTTGCAAGATATTTGTAAAGCATTGATTTGCCTCTCTGAAATGCAAACAACTTTTTCAATCGATTATCATTGGCA
TATTAGTTTTACTTGTCAAAAACTTGGTTTTGCTATGCCAGCTCCCATTATCTTTGCAGATACAAATTGGGTGAAAGATG
AATTTGGGTTTGTTGTGAATCCTGGTACAGGACGTTTAGAATTGTGGCGAGTTGATTATACAGGTTCTATTGGATATCCG
ATGTCTATTTGGAAAGAATGGGTAAATGGAACCCGCACAGATCTAAAATGGGGAATTTATATAAAGCCAACCGAATATGG
ACAAGTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGAGAGTATTTCCTATATAAAGAAAAATATTGTAAATTTACAAAAAACTCCCGCTAATGCACAAATTTGTATTCCTGCTT
TTTGATTGATCAAACGTTTA

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTTCCTACGTATAGTTTGTATTACAAAAATAATAATAAAAATATGTAAGTTAGAATTAATTTAATTTTGTTTGCAAAAC
CCTAACTATAATCAAAATTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 989; Mature: 989

Protein sequence:

>989_residues
MCEKVNKEKINTILSLVKAPLNHPFFYPRIFALIAKQKKQERLAADKICAYIVEEYEEISRRLDRSQIQESCSVRNILRT
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WTRIKNQTDFIDSLTSFFVATEPQIASMLQNLGLEKDLGEVVTAIVNHVKTKEFLETAFYRMAAAHRMPIPQNPLDHLDQ
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PNLTPFKDAWIGDEFTYTSVRDKFVKPAEFFIEKIVLDHNMIHSFLQELIEKIPENFQPRFKAVFQNLTGPLNPLYFREI
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NQLQDICKALICLSEMQTTFSIDYHWHISFTCQKLGFAMPAPIIFADTNWVKDEFGFVVNPGTGRLELWRVDYTGSIGYP
MSIWKEWVNGTRTDLKWGIYIKPTEYGQV

Sequences:

>Translated_989_residues
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GHLAALLIDDKGEINFAVLPTLIQKFKSHLYSLGPNRQYDSKRQEHILKVLQFLLTNKELVRSLKKISKPLSNKIAEDII
KQTLQIPSQTVITDAHAKRAVLAAWLCYLRQNVGSCFATAPAEIIQNEQPEQFLQDMTDLLATGRLKRTFGGAEYSVPIS
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SETKLEFTTWNLYASLGMGSHEQGGIGHCIQEQIQYKLDQANKLVQDAQYEYEMMYTHVKTLESRIRHASEKEAQWLKME
YQNRANELYFIQDQRDDAHQRASALVNLYESLYKIYLELFREYFQEVYDADMQEVLTGPFDDSPAGFRLLYKHGRSNSSQ
WTRIKNQTDFIDSLTSFFVATEPQIASMLQNLGLEKDLGEVVTAIVNHVKTKEFLETAFYRMAAAHRMPIPQNPLDHLDQ
IEKKPWVYTSGGTMNTLVSCYYRIEDKPQEGAKWVESEMELLVFFADTLKHIPRKQMEPYLEGRRQSMLIQSPTHAFLLK
PNLTPFKDAWIGDEFTYTSVRDKFVKPAEFFIEKIVLDHNMIHSFLQELIEKIPENFQPRFKAVFQNLTGPLNPLYFREI
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NQLQDICKALICLSEMQTTFSIDYHWHISFTCQKLGFAMPAPIIFADTNWVKDEFGFVVNPGTGRLELWRVDYTGSIGYP
MSIWKEWVNGTRTDLKWGIYIKPTEYGQV
>Mature_989_residues
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NQLQDICKALICLSEMQTTFSIDYHWHISFTCQKLGFAMPAPIIFADTNWVKDEFGFVVNPGTGRLELWRVDYTGSIGYP
MSIWKEWVNGTRTDLKWGIYIKPTEYGQV

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 114090; Mature: 114090

Theoretical pI: Translated: 7.46; Mature: 7.46

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.1 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.1 %Met     (Mature Protein)
3.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MCEKVNKEKINTILSLVKAPLNHPFFYPRIFALIAKQKKQERLAADKICAYIVEEYEEIS
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RRLDRSQIQESCSVRNILRTGHLAALLIDDKGEINFAVLPTLIQKFKSHLYSLGPNRQYD
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HHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHEEEHHHHHHH
VLAAWLCYLRQNVGSCFATAPAEIIQNEQPEQFLQDMTDLLATGRLKRTFGGAEYSVPIS
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ASWGSGDLKKPLLLSISSKKISPEIWYSPGLIVAFEAVGLLQKNEKLKDKIKRLKDWIDP
CCCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCCCC
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FKAVFQNLTGPLNPLYFREIIVDTLQQDRGLNIGKKSILSADELDSLLYSRLPYFSIYEL
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KEKIYQILILLPGITSSKADEILSYFDQISLSKSQYVMSANQLQDICKALICLSEMQTTF
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SIDYHWHISFTCQKLGFAMPAPIIFADTNWVKDEFGFVVNPGTGRLELWRVDYTGSIGYP
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MSIWKEWVNGTRTDLKWGIYIKPTEYGQV
HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MCEKVNKEKINTILSLVKAPLNHPFFYPRIFALIAKQKKQERLAADKICAYIVEEYEEIS
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VLAAWLCYLRQNVGSCFATAPAEIIQNEQPEQFLQDMTDLLATGRLKRTFGGAEYSVPIS
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IILQHSRHTNYCIVTAEVILRTILRQSIGLSEQQIKDYEERPRGMIQSNLMQIPAIGKQT
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CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH
YQNRANELYFIQDQRDDAHQRASALVNLYESLYKIYLELFREYFQEVYDADMQEVLTGPF
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YYRIEDKPQEGAKWVESEMELLVFFADTLKHIPRKQMEPYLEGRRQSMLIQSPTHAFLLK
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PNLTPFKDAWIGDEFTYTSVRDKFVKPAEFFIEKIVLDHNMIHSFLQELIEKIPENFQPR
CCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHH
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SIDYHWHISFTCQKLGFAMPAPIIFADTNWVKDEFGFVVNPGTGRLELWRVDYTGSIGYP
EEEEEEEEEEEHHHCCCCCCCCEEEECCCCCHHHCCEEECCCCCCEEEEEEEECCCCCCC
MSIWKEWVNGTRTDLKWGIYIKPTEYGQV
HHHHHHHHCCCCCCEEEEEEECCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA