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The map label for this gene is flaJ [H]

Identifier: 45359239

GI number: 45359239

Start: 1617174

End: 1618850

Strand: Direct

Name: flaJ [H]

Synonym: MMP1676

Alternate gene names: 45359239

Gene position: 1617174-1618850 (Clockwise)

Preceding gene: 45359238

Following gene: 45359241

Centisome position: 97.35

GC content: 38.04

Gene sequence:

>1677_bases
ATGTTTTTTGATATACTCCCAAGGGTCGGACTAAAACCAAAAGATTACATTCTTAAATTTATACTTCCTGCAAGCGTTAT
TTCACTTTTGTTGTTAATCTTAGGAATAACCTACTTTTCAGGCTACACTCGGTTGGTCGTATTATTTCTGCCGCTTCTTT
TAATGGGAAGCGCCATAGGTTATCCATATATTGAACTTGATTCCCAACGTCAAAAGATAAATGAAAGACTCCACATATTT
ATTACAAAATTTGGTGTTCTTTCAATTACGGATTTGGATAGAAAAGAATTAATGCACCTTTTGGCAACTGAAAAGGAAGA
ATTAGGCCAGCTTGCAACAGAATCTCATAAAATTTTTGTATTAATTAAAAGATGGAACCAGTCACTTGCAGAATCCTGTA
GGTTCTTGGCAAACAGGTCTCCAAGCAGTCAGTTTGGTGATTTTTTAGATCGTATGGCTTATTCAATAGACAGCGGTCAG
GAATTAAAAGAATTTTTGCACGGTGAACAGGACATCGTGATGGAAGACTACGGTGAATTCTACAAAAGGGCAATTTACAC
GCTTGACACGTTTAAAGAGATGTATGTCAGCGCAGTAACTTCAGTGTCATTTTTCGTAACTTTCGCAATAATTGCGCCAT
TTTTGCTCCCCTACGACTTCGTTACAATGGTTACAGTTGCACTGTTAGGTTTTGTACTTATTGAAGTACTCTTGGTCTAT
GCAATAAAAAGCAGACTTCCTTATGATCGTCTGTGGCACACTGGAGAAAAACCAACCAAAATCGACCTGAAACTAAAAAA
ATGGCTAATAATATCAGTTATCGGAACAGTATTATTTACATTATTCCTGTTATGGGGAAAATTCATTGGAGAAATTCCCC
AAATAATGAAAATACCCTACCAAATCATTTTTGCGCTTGGAATGAGCCCCCTTGCCATTGGAGGGTATTTCGCACAGCGT
GAAGAAAACCTCGTGATCAGAAAAGAATTCAACTTTCCAGACTTTTTAAGGTCGCTAGGGGATTCTGTTAGTGCAAAAGG
TGGAGGTATGACGGATTCATTAGAATACCTCTCATCAAACGACTTTGGTCCATTGACAAAAGATTTGGAAGGTCTTTACA
AAAGAGTATCTATTCGAGTAAACAGCCAAAAAGCATGGCGATACTTTGGATATGATACCTGCAGCTACATGATACAGCTG
TTCTCTGAAATGTTTGAACGCTGTACCTTTTTAGGTGGAAACGCAGGGGTTGCTGCCCACATGATTGGGAAAAACTTCAG
AAAAATCATTAACTTAAGAAAAGCAAAATATCAAAGTGTCAGCCAGTTCTCCGGAATCATGTACGGATTAGCTGGAGGTA
TGGCCCTTACCCTTTACGCTTCGGCAGGGGTTGCAAACATGGTTAATGGACTTTATACAAGTTTAGATATACCTGACACA
ATGATATCGATTGTAAATATCATAACCCCTGAAGATTTCAGCCTTATTGCTTATTTAATCTACGGAGTACTTGTAATTTA
TTCAATTGTTTCAGGCTACCTGATAAAATTAATGGATGGAGGACACTACCAGGTTTCATTGATGCATTTTGTAATAATGC
TCTGGGTTGCATCAATTGTTGGGTATATTGCAGAAGTAATGACTGGAAGCCTCCTTGGAACGAGCCTTCCGATTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GCAAGAGGAATTTTTGGATACTACGAGGTTTTAGATATTATCTGGAGTTTCTATGAAAAAGGATTGGAAGGACTGCCATT
CCAGGTTTAAGGTGTTTCTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTATTTAAAAAATCATTTGAATAGTGAACCGATTAAGAACGCTATTAAAACCAGATTTGTTACTATTTTTATATTTCTT
GAAGCTTTTTTTGCTTCCAT

Product: flagellar assembly protein J

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 558; Mature: 558

Protein sequence:

>558_residues
MFFDILPRVGLKPKDYILKFILPASVISLLLLILGITYFSGYTRLVVLFLPLLLMGSAIGYPYIELDSQRQKINERLHIF
ITKFGVLSITDLDRKELMHLLATEKEELGQLATESHKIFVLIKRWNQSLAESCRFLANRSPSSQFGDFLDRMAYSIDSGQ
ELKEFLHGEQDIVMEDYGEFYKRAIYTLDTFKEMYVSAVTSVSFFVTFAIIAPFLLPYDFVTMVTVALLGFVLIEVLLVY
AIKSRLPYDRLWHTGEKPTKIDLKLKKWLIISVIGTVLFTLFLLWGKFIGEIPQIMKIPYQIIFALGMSPLAIGGYFAQR
EENLVIRKEFNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMTDSLEYLSSNDFGPLTKDLEGLYKRVSIRVNSQKAWRYFGYDTCSYMIQL
FSEMFERCTFLGGNAGVAAHMIGKNFRKIINLRKAKYQSVSQFSGIMYGLAGGMALTLYASAGVANMVNGLYTSLDIPDT
MISIVNIITPEDFSLIAYLIYGVLVIYSIVSGYLIKLMDGGHYQVSLMHFVIMLWVASIVGYIAEVMTGSLLGTSLPI

Sequences:

>Translated_558_residues
MFFDILPRVGLKPKDYILKFILPASVISLLLLILGITYFSGYTRLVVLFLPLLLMGSAIGYPYIELDSQRQKINERLHIF
ITKFGVLSITDLDRKELMHLLATEKEELGQLATESHKIFVLIKRWNQSLAESCRFLANRSPSSQFGDFLDRMAYSIDSGQ
ELKEFLHGEQDIVMEDYGEFYKRAIYTLDTFKEMYVSAVTSVSFFVTFAIIAPFLLPYDFVTMVTVALLGFVLIEVLLVY
AIKSRLPYDRLWHTGEKPTKIDLKLKKWLIISVIGTVLFTLFLLWGKFIGEIPQIMKIPYQIIFALGMSPLAIGGYFAQR
EENLVIRKEFNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMTDSLEYLSSNDFGPLTKDLEGLYKRVSIRVNSQKAWRYFGYDTCSYMIQL
FSEMFERCTFLGGNAGVAAHMIGKNFRKIINLRKAKYQSVSQFSGIMYGLAGGMALTLYASAGVANMVNGLYTSLDIPDT
MISIVNIITPEDFSLIAYLIYGVLVIYSIVSGYLIKLMDGGHYQVSLMHFVIMLWVASIVGYIAEVMTGSLLGTSLPI
>Mature_558_residues
MFFDILPRVGLKPKDYILKFILPASVISLLLLILGITYFSGYTRLVVLFLPLLLMGSAIGYPYIELDSQRQKINERLHIF
ITKFGVLSITDLDRKELMHLLATEKEELGQLATESHKIFVLIKRWNQSLAESCRFLANRSPSSQFGDFLDRMAYSIDSGQ
ELKEFLHGEQDIVMEDYGEFYKRAIYTLDTFKEMYVSAVTSVSFFVTFAIIAPFLLPYDFVTMVTVALLGFVLIEVLLVY
AIKSRLPYDRLWHTGEKPTKIDLKLKKWLIISVIGTVLFTLFLLWGKFIGEIPQIMKIPYQIIFALGMSPLAIGGYFAQR
EENLVIRKEFNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMTDSLEYLSSNDFGPLTKDLEGLYKRVSIRVNSQKAWRYFGYDTCSYMIQL
FSEMFERCTFLGGNAGVAAHMIGKNFRKIINLRKAKYQSVSQFSGIMYGLAGGMALTLYASAGVANMVNGLYTSLDIPDT
MISIVNIITPEDFSLIAYLIYGVLVIYSIVSGYLIKLMDGGHYQVSLMHFVIMLWVASIVGYIAEVMTGSLLGTSLPI

Specific function: Unknown

COG id: COG1955

COG function: function code NU; Archaeal flagella assembly protein J

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential). Archaeal flagellum (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To M.jannaschii flaJ [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018076 [H]

Pfam domain/function: PF00482 GSPII_F [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 63048; Mature: 63048

Theoretical pI: Translated: 8.02; Mature: 8.02

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.5 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
4.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.5 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
4.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFFDILPRVGLKPKDYILKFILPASVISLLLLILGITYFSGYTRLVVLFLPLLLMGSAIG
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
YPYIELDSQRQKINERLHIFITKFGVLSITDLDRKELMHLLATEKEELGQLATESHKIFV
CCEEEECCHHHHHHHHHHHHEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEEE
LIKRWNQSLAESCRFLANRSPSSQFGDFLDRMAYSIDSGQELKEFLHGEQDIVMEDYGEF
EHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
YKRAIYTLDTFKEMYVSAVTSVSFFVTFAIIAPFLLPYDFVTMVTVALLGFVLIEVLLVY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIKSRLPYDRLWHTGEKPTKIDLKLKKWLIISVIGTVLFTLFLLWGKFIGEIPQIMKIPY
HHHHCCCHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
QIIFALGMSPLAIGGYFAQREENLVIRKEFNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMTDSLEYLSSN
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCC
DFGPLTKDLEGLYKRVSIRVNSQKAWRYFGYDTCSYMIQLFSEMFERCTFLGGNAGVAAH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
MIGKNFRKIINLRKAKYQSVSQFSGIMYGLAGGMALTLYASAGVANMVNGLYTSLDIPDT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHH
MISIVNIITPEDFSLIAYLIYGVLVIYSIVSGYLIKLMDGGHYQVSLMHFVIMLWVASIV
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYIAEVMTGSLLGTSLPI
HHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MFFDILPRVGLKPKDYILKFILPASVISLLLLILGITYFSGYTRLVVLFLPLLLMGSAIG
CCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
YPYIELDSQRQKINERLHIFITKFGVLSITDLDRKELMHLLATEKEELGQLATESHKIFV
CCEEEECCHHHHHHHHHHHHEECCCEEEECCCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCCEEEE
LIKRWNQSLAESCRFLANRSPSSQFGDFLDRMAYSIDSGQELKEFLHGEQDIVMEDYGEF
EHHHHCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHH
YKRAIYTLDTFKEMYVSAVTSVSFFVTFAIIAPFLLPYDFVTMVTVALLGFVLIEVLLVY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AIKSRLPYDRLWHTGEKPTKIDLKLKKWLIISVIGTVLFTLFLLWGKFIGEIPQIMKIPY
HHHHCCCHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
QIIFALGMSPLAIGGYFAQREENLVIRKEFNFPDFLRSLGDSVSAKGGGMTDSLEYLSSN
HHHHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHCCC
DFGPLTKDLEGLYKRVSIRVNSQKAWRYFGYDTCSYMIQLFSEMFERCTFLGGNAGVAAH
CCCCHHHHHHHHHHHHHHEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
MIGKNFRKIINLRKAKYQSVSQFSGIMYGLAGGMALTLYASAGVANMVNGLYTSLDIPDT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEHHHHCCHHHHHHHHHHCCCCCHH
MISIVNIITPEDFSLIAYLIYGVLVIYSIVSGYLIKLMDGGHYQVSLMHFVIMLWVASIV
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GYIAEVMTGSLLGTSLPI
HHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA