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The map label for this gene is ktrB

Identifier: 32266704

GI number: 32266704

Start: 1175065

End: 1176465

Strand: Direct

Name: ktrB

Synonym: HH1205

Alternate gene names: 32266704

Gene position: 1175065-1176465 (Clockwise)

Preceding gene: 32266703

Following gene: 32266705

Centisome position: 65.31

GC content: 35.4

Gene sequence:

>1401_bases
ATGACAAACCTAAAGAGTATGCAAATTCTCATCATAGGCTATGTGGGGATTATCATACTTGGAGCTTTGCTTTTGTTTTT
ACCTTGTATGCACTCCTCTTCTCTTAGTTTTATAGAAGCCCTTTTTACGAGCACTTCAGCTTTTACTTGCACAGGGCTTA
TTATAAAAGATACGGCACTTGATTTTACACCTTTTGGACAAGCTGTGATTTTAGCTCTTATTTGGCTTGGCGGATTGGGA
TATATGAGTATGCTTGGTATCGTGTATGTATTCCTTCGAAAGCGACTTTCAAATAGGGAACGCAATATGATAAAAGAATC
ACTTAATTATCCTTCCTATGATGGTATGATGAGTTTTTTAAAAAAAGTCTTGTTTTTTGTAATTTTAATTGAATCCTTTG
GTGCTTTGGCGCTTTTTATTTATTTTTATTTTGTGCAAGATTTTAGCGTTTTCACTGCTTTGTGGGCAGGTATATTTCAC
GCTATTTCGGCTTTTAATAATGCAGGATTCTCTATTTTTAGCACTAATCTTATGGCTTATCGCCAAAGCGTGTTTGTTAA
TAGTGTGATATGTTTTCTTATTATCGCTGGAGGAATGGGTTATATTGTGCTTATTGAACTCCATACCTTTATAAAGTCGC
GTTTATACATATTTTGGAATATTTGTCTAGCTTTTATGCGCAATAAACCATTATCAAATCTGCACACAATTCGCTTGAGT
TTGCATAGTAAGATTGTTGTAAGTTATACATTTGTGCTTTTAACTTTGGGATTTAGCTTTATATTTGTGCTTGAATATCA
CAATCCAAAGAGTATGGGTAATTTTGAGTTTTTTGACAAAATACTCTCAAGTTTTTTTATGTCGGTAAATTATCGCACCT
CTGGATTTAATAGCATTGATTTGGGAGGATTGAAAGATTCTACAATGTTTTTCTCTTCTTTGCTTATGATTATAGGAGGG
GCTCCGGGTGGCACAGCAGGAGGTATTAAAGTAACCACTCTCGCAACACTTTTTGCTTTTTGTGCCGCGCTTTTTTATGA
TACACAACCACGATTATTTAAACGTAGGATTATGGAAAAAAGTGTAAAAAAAGCCATTGGTGTAGGTATTATTGCTATGA
TTTGTATCACTTTAGCAAATTTCATTATTGCTGCTTTACAAGAGGATACGCGTTTTATGCTTATTATGTTTGAGGTTTCA
TCAGCTTTTGCAACTACGGGCGTGTCTGCAGGCAATGGTGGCACATTAAGCTTAAGTGCGAATTTCTCCCCACTCTCGCA
AATAGTAATTATTGGGCTTATGCTAATGGGAAAAGTAGGTATTTTAGCTTTTTGGCTGGCATTTGTGGGCAAACGTAAGC
AGAGTTATATTACTCTACAAGAGGAGCGCGTGATTATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AACTAAATAAAACTCCCACTTGCAATGAACTTGCAACATTAAAATTGTTTATAGTATAAAATACTTTATAAAAGGAGGGC
ATAGAATCTAAGGAGTAAGA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AATCTATCAATTTTAGGAGCACGAATGAAAACAAGTTATGCAGTTATTGGATTAGGGAAATTTGGGCAATATGTTGCCAA
AGGGCTTATACGAAATAATG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: K(+)-uptake protein ktrB [H]

Number of amino acids: Translated: 466; Mature: 465

Protein sequence:

>466_residues
MTNLKSMQILIIGYVGIIILGALLLFLPCMHSSSLSFIEALFTSTSAFTCTGLIIKDTALDFTPFGQAVILALIWLGGLG
YMSMLGIVYVFLRKRLSNRERNMIKESLNYPSYDGMMSFLKKVLFFVILIESFGALALFIYFYFVQDFSVFTALWAGIFH
AISAFNNAGFSIFSTNLMAYRQSVFVNSVICFLIIAGGMGYIVLIELHTFIKSRLYIFWNICLAFMRNKPLSNLHTIRLS
LHSKIVVSYTFVLLTLGFSFIFVLEYHNPKSMGNFEFFDKILSSFFMSVNYRTSGFNSIDLGGLKDSTMFFSSLLMIIGG
APGGTAGGIKVTTLATLFAFCAALFYDTQPRLFKRRIMEKSVKKAIGVGIIAMICITLANFIIAALQEDTRFMLIMFEVS
SAFATTGVSAGNGGTLSLSANFSPLSQIVIIGLMLMGKVGILAFWLAFVGKRKQSYITLQEERVII

Sequences:

>Translated_466_residues
MTNLKSMQILIIGYVGIIILGALLLFLPCMHSSSLSFIEALFTSTSAFTCTGLIIKDTALDFTPFGQAVILALIWLGGLG
YMSMLGIVYVFLRKRLSNRERNMIKESLNYPSYDGMMSFLKKVLFFVILIESFGALALFIYFYFVQDFSVFTALWAGIFH
AISAFNNAGFSIFSTNLMAYRQSVFVNSVICFLIIAGGMGYIVLIELHTFIKSRLYIFWNICLAFMRNKPLSNLHTIRLS
LHSKIVVSYTFVLLTLGFSFIFVLEYHNPKSMGNFEFFDKILSSFFMSVNYRTSGFNSIDLGGLKDSTMFFSSLLMIIGG
APGGTAGGIKVTTLATLFAFCAALFYDTQPRLFKRRIMEKSVKKAIGVGIIAMICITLANFIIAALQEDTRFMLIMFEVS
SAFATTGVSAGNGGTLSLSANFSPLSQIVIIGLMLMGKVGILAFWLAFVGKRKQSYITLQEERVII
>Mature_465_residues
TNLKSMQILIIGYVGIIILGALLLFLPCMHSSSLSFIEALFTSTSAFTCTGLIIKDTALDFTPFGQAVILALIWLGGLGY
MSMLGIVYVFLRKRLSNRERNMIKESLNYPSYDGMMSFLKKVLFFVILIESFGALALFIYFYFVQDFSVFTALWAGIFHA
ISAFNNAGFSIFSTNLMAYRQSVFVNSVICFLIIAGGMGYIVLIELHTFIKSRLYIFWNICLAFMRNKPLSNLHTIRLSL
HSKIVVSYTFVLLTLGFSFIFVLEYHNPKSMGNFEFFDKILSSFFMSVNYRTSGFNSIDLGGLKDSTMFFSSLLMIIGGA
PGGTAGGIKVTTLATLFAFCAALFYDTQPRLFKRRIMEKSVKKAIGVGIIAMICITLANFIIAALQEDTRFMLIMFEVSS
AFATTGVSAGNGGTLSLSANFSPLSQIVIIGLMLMGKVGILAFWLAFVGKRKQSYITLQEERVII

Specific function: Integral membrane subunit of the KtrAB potassium uptake transporter. The 2 major potassium transporter complexes KtrAB and KtrCD confer resistance to both suddenly imposed and prolonged osmotic stress [H]

COG id: COG0168

COG function: function code P; Trk-type K+ transport systems, membrane components

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the trkH potassium transport family. Ktr (TC 2.A.38.4) subfamily [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR003445
- InterPro:   IPR004772 [H]

Pfam domain/function: PF02386 TrkH [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 51803; Mature: 51671

Theoretical pI: Translated: 9.84; Mature: 9.84

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.3 %Cys     (Translated Protein)
4.5 %Met     (Translated Protein)
5.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.3 %Cys     (Mature Protein)
4.3 %Met     (Mature Protein)
5.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MTNLKSMQILIIGYVGIIILGALLLFLPCMHSSSLSFIEALFTSTSAFTCTGLIIKDTAL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCC
DFTPFGQAVILALIWLGGLGYMSMLGIVYVFLRKRLSNRERNMIKESLNYPSYDGMMSFL
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
KKVLFFVILIESFGALALFIYFYFVQDFSVFTALWAGIFHAISAFNNAGFSIFSTNLMAY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
RQSVFVNSVICFLIIAGGMGYIVLIELHTFIKSRLYIFWNICLAFMRNKPLSNLHTIRLS
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHEEEHH
LHSKIVVSYTFVLLTLGFSFIFVLEYHNPKSMGNFEFFDKILSSFFMSVNYRTSGFNSID
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC
LGGLKDSTMFFSSLLMIIGGAPGGTAGGIKVTTLATLFAFCAALFYDTQPRLFKRRIMEK
CCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
SVKKAIGVGIIAMICITLANFIIAALQEDTRFMLIMFEVSSAFATTGVSAGNGGTLSLSA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEC
NFSPLSQIVIIGLMLMGKVGILAFWLAFVGKRKQSYITLQEERVII
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCC
>Mature Secondary Structure 
TNLKSMQILIIGYVGIIILGALLLFLPCMHSSSLSFIEALFTSTSAFTCTGLIIKDTAL
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEECCCC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CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9384377 [H]