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The map label for this gene is yhgE [H]

Identifier: 229917404

GI number: 229917404

Start: 1627614

End: 1630226

Strand: Reverse

Name: yhgE [H]

Synonym: EAT1b_1679

Alternate gene names: 229917404

Gene position: 1630226-1627614 (Counterclockwise)

Preceding gene: 229917405

Following gene: 229917403

Centisome position: 54.34

GC content: 52.01

Gene sequence:

>2613_bases
ATGAATGGATGGAAACTGTGGACGGCGGAGTGGCGAAGTATCTTTAAGAACCCACGTGTGTTGGTTCCGATTCTCGCAGT
CGCACTCGTACCGTTAATGTACGCCGGTATGTTCTTATGGGCTTTTTGGGATCCGTATGGACAGATGAAAGATTTGCCGG
TCGCCATCGTCAATGAAGACAAAGGGGCAACGTTTGAAGGAGAGTCGCTTGCAATCGGAGATGACCTCATTGATAAGCTG
TTGGATTCGGAGGCGTTCGAGTTCGTCGAAACGACGAAGGAAGAAGCGGAATCTGGACTAAAAGACCATGACTACTACAT
GGCGATTGAGATTCCAGAAGACTTTTCAGAAAAAGCGACGACTGCTTTAGATGAACATCCGGAGCAACTCGAACTGAAGT
ACATCGCGAATGAATCGTATAACTTCTTGGCTGCACAAATCGGTGGTTCCGCGATGGAACAAGTCAAAGCGGAACTGTCG
ACCGAAGTCTCGAAACAGTATGTCAGTGCGTTGAAAGACGGATTGAACGATGTGGCAGACGGACTCGGTGAGGCCGCAGA
TGGTGCAACGACACTTGCGGACGGCTCAACGTCAGCGAAAGACGGTGCCGTCAAACTAGCGGACGGGACGAAGCTTCTCG
CTTCGAAACAGCGTGAGCTCGCGGATGGAGCAAGCCAATTAAACGATGGGATGACTCAGTTGGCCGATGGTTCATCTGAA
CTCGCGGATGGGACGAAGCTTCTCGCTTCGAAACAACGGGAGCTCGCGAATGGAGCAAGTCAATTACGTGATGGTGTTTC
GCAATTGGCTGATGGCTCATCTGCACTCGCAGATGGCAGTCAACAAGTGTACGAGGGCTCAGCCTCACTTGCGGACGGGG
TCCATCGTGTCAGCGAGGGCGCTTCTGCCTTACAAGGCGGGACGAGCCAACTCGTTGACGGAACAGGGGCGTTCGCATCG
AAACTAGATGAACTACACACAGGTGCGAAGACGTTGAACCAAGGTGTTCAAGACCTTGCTGCCGGCATCGAGCGCTCAAA
AGAGGGGGCATCTGCATTACAGGATGGTGCCACAAAACTCACAGGAGCGTTGACTCAGGCGAAGGATGGAAACGCGGCAC
TTGTCGCGGGTCAAACAGACGTGGTCAATGGGATCGGACAAATGAAGTCTGAATTGACTGCGAAACAAGATGAGTTGATT
GGACAATTGACAGCACTCGCTGAGTCGGGTCAATCGGCATCACCTGAAATGCTTCAAGCCATCGCGGCACAACTGAGCGA
TGGGAAGCAAGAGACGGCAGCCGGGTTTGATCAACTATCCGCTGGTGCTGCAAAAGTGAAAGAAGGACAGGTCGCACTTG
GTGCAGGTCTTGATCAGGCAGGTACAGGTGCAAACAAACTGTCGACTGGACTTTCTGACTTGAGTGCCGGTCAAACGAAA
TTAGCCGAAGGTGCGAACGCGTTGGCAAGTGGTTCAAGTCAAATCGAGCAAGGTACGCAAACGGCGGCCGATCGTTCCCA
AGAACTTGTGTCAGCGAGTGCGAAGCTCAATCAAGGCGCGACACAACTTCAAGATGGGACAACTGAACTCGCCGTTGGAA
GTGACAAGCTTGTAGACGCGACCGGACAGTTGTCTGAAGGTAGCGAGAAGCTTGCGGATGGAGCGAAGAGCGCAAGCACC
GGTACAAGTGAATTGGTGAATGGTGCGAATCAGTTAGCGGATGGTGGTCAAAAGCTGCAGTCAGGAAGTCGTGAACTGGC
CGAAGGCGCGAAGAGTGCCGGAGCCGGAACGAGCAAGCTGACGGATGGCGCGAATCAGCTCGCGAATGGTGGAGAAGAAC
TTTCAGACGGTAGCGGTGAACTCGCTGACGGCATGAAGGAGCTCGCATCAGGTAGCGATGAACTTCGTGACGCCTTAGTG
AAAGGTGCGAAAGACGCAGACATCGGTTTAACGGATGACAACGTCGAGATGATGGCCGGTCCAGTGTCGCTCGTCGACAA
CTCGATTCACGAGGTGCCTAACTACGGTACTGGATTCGCTCCATACTTCATGTCGCTCGGACTTTTCGTTGGGGCACTCC
TTCTCTCGATCGTTTATCCGTTATACGATCCAGCAGGACGTCCGAAACGTAGTCTATCGTGGGTATTGTCGAAATCTGGT
GTCCTCATGGTCGTCGGATTCCTGCAAGCCTTGATTCTCGATGTGGCGATGGTGCAACTGCTCGGTCTTGAAGTGAGCGA
ACCGTTGAAATTCTTCGGTTTCAGCTGGTTGACGAGCATCACGTTCCTCTTTATCGTACAGTTGCTCGTGACAACACTCG
GAAACCCTGGACGTTTCGTGGCGATCGTCTTGTTGATTTTACAATTGACGACGTCAGCCGGGACGTTCCCGCTTGAATTG
ATTCCAAGAGCGTTGCAACCGTTCAATGCACTGCTTCCAATGACATATACGGTTGCCGGATATAAAGAAATTTTATCGGC
AGATGGTGCGCAGTACTTGCAGACGGCGACAACCTATTTAGTATTTGTGGCTGCCGGATGCTTTGCCTTACTATGGGCAT
ACTTCCGCATTGCATGGAAGAAAAAATATCGTCAAGTCGCATCAGAAGCATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATAAAAAATAACTAAAAGAGTTGCTTTTTTTCGAGGAAGGGAGCAAAATAGGGAACATGAAAAAATAGTTATGTTTTATA
AGTGAAGGTGGAGAGAAAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGTAAAAACGGTACAAAATCGTGTATAGTGGTTAAGACGACACTATGCACGATTTTTTTCTTAAAAAAATATAAAAAAAG
AATTGACACTCGAATGGTGA

Product: YhgE/Pip N-terminal domain protein

Products: NA

Alternate protein names: ORFB [H]

Number of amino acids: Translated: 870; Mature: 870

Protein sequence:

>870_residues
MNGWKLWTAEWRSIFKNPRVLVPILAVALVPLMYAGMFLWAFWDPYGQMKDLPVAIVNEDKGATFEGESLAIGDDLIDKL
LDSEAFEFVETTKEEAESGLKDHDYYMAIEIPEDFSEKATTALDEHPEQLELKYIANESYNFLAAQIGGSAMEQVKAELS
TEVSKQYVSALKDGLNDVADGLGEAADGATTLADGSTSAKDGAVKLADGTKLLASKQRELADGASQLNDGMTQLADGSSE
LADGTKLLASKQRELANGASQLRDGVSQLADGSSALADGSQQVYEGSASLADGVHRVSEGASALQGGTSQLVDGTGAFAS
KLDELHTGAKTLNQGVQDLAAGIERSKEGASALQDGATKLTGALTQAKDGNAALVAGQTDVVNGIGQMKSELTAKQDELI
GQLTALAESGQSASPEMLQAIAAQLSDGKQETAAGFDQLSAGAAKVKEGQVALGAGLDQAGTGANKLSTGLSDLSAGQTK
LAEGANALASGSSQIEQGTQTAADRSQELVSASAKLNQGATQLQDGTTELAVGSDKLVDATGQLSEGSEKLADGAKSAST
GTSELVNGANQLADGGQKLQSGSRELAEGAKSAGAGTSKLTDGANQLANGGEELSDGSGELADGMKELASGSDELRDALV
KGAKDADIGLTDDNVEMMAGPVSLVDNSIHEVPNYGTGFAPYFMSLGLFVGALLLSIVYPLYDPAGRPKRSLSWVLSKSG
VLMVVGFLQALILDVAMVQLLGLEVSEPLKFFGFSWLTSITFLFIVQLLVTTLGNPGRFVAIVLLILQLTTSAGTFPLEL
IPRALQPFNALLPMTYTVAGYKEILSADGAQYLQTATTYLVFVAAGCFALLWAYFRIAWKKKYRQVASEA

Sequences:

>Translated_870_residues
MNGWKLWTAEWRSIFKNPRVLVPILAVALVPLMYAGMFLWAFWDPYGQMKDLPVAIVNEDKGATFEGESLAIGDDLIDKL
LDSEAFEFVETTKEEAESGLKDHDYYMAIEIPEDFSEKATTALDEHPEQLELKYIANESYNFLAAQIGGSAMEQVKAELS
TEVSKQYVSALKDGLNDVADGLGEAADGATTLADGSTSAKDGAVKLADGTKLLASKQRELADGASQLNDGMTQLADGSSE
LADGTKLLASKQRELANGASQLRDGVSQLADGSSALADGSQQVYEGSASLADGVHRVSEGASALQGGTSQLVDGTGAFAS
KLDELHTGAKTLNQGVQDLAAGIERSKEGASALQDGATKLTGALTQAKDGNAALVAGQTDVVNGIGQMKSELTAKQDELI
GQLTALAESGQSASPEMLQAIAAQLSDGKQETAAGFDQLSAGAAKVKEGQVALGAGLDQAGTGANKLSTGLSDLSAGQTK
LAEGANALASGSSQIEQGTQTAADRSQELVSASAKLNQGATQLQDGTTELAVGSDKLVDATGQLSEGSEKLADGAKSAST
GTSELVNGANQLADGGQKLQSGSRELAEGAKSAGAGTSKLTDGANQLANGGEELSDGSGELADGMKELASGSDELRDALV
KGAKDADIGLTDDNVEMMAGPVSLVDNSIHEVPNYGTGFAPYFMSLGLFVGALLLSIVYPLYDPAGRPKRSLSWVLSKSG
VLMVVGFLQALILDVAMVQLLGLEVSEPLKFFGFSWLTSITFLFIVQLLVTTLGNPGRFVAIVLLILQLTTSAGTFPLEL
IPRALQPFNALLPMTYTVAGYKEILSADGAQYLQTATTYLVFVAAGCFALLWAYFRIAWKKKYRQVASEA
>Mature_870_residues
MNGWKLWTAEWRSIFKNPRVLVPILAVALVPLMYAGMFLWAFWDPYGQMKDLPVAIVNEDKGATFEGESLAIGDDLIDKL
LDSEAFEFVETTKEEAESGLKDHDYYMAIEIPEDFSEKATTALDEHPEQLELKYIANESYNFLAAQIGGSAMEQVKAELS
TEVSKQYVSALKDGLNDVADGLGEAADGATTLADGSTSAKDGAVKLADGTKLLASKQRELADGASQLNDGMTQLADGSSE
LADGTKLLASKQRELANGASQLRDGVSQLADGSSALADGSQQVYEGSASLADGVHRVSEGASALQGGTSQLVDGTGAFAS
KLDELHTGAKTLNQGVQDLAAGIERSKEGASALQDGATKLTGALTQAKDGNAALVAGQTDVVNGIGQMKSELTAKQDELI
GQLTALAESGQSASPEMLQAIAAQLSDGKQETAAGFDQLSAGAAKVKEGQVALGAGLDQAGTGANKLSTGLSDLSAGQTK
LAEGANALASGSSQIEQGTQTAADRSQELVSASAKLNQGATQLQDGTTELAVGSDKLVDATGQLSEGSEKLADGAKSAST
GTSELVNGANQLADGGQKLQSGSRELAEGAKSAGAGTSKLTDGANQLANGGEELSDGSGELADGMKELASGSDELRDALV
KGAKDADIGLTDDNVEMMAGPVSLVDNSIHEVPNYGTGFAPYFMSLGLFVGALLLSIVYPLYDPAGRPKRSLSWVLSKSG
VLMVVGFLQALILDVAMVQLLGLEVSEPLKFFGFSWLTSITFLFIVQLLVTTLGNPGRFVAIVLLILQLTTSAGTFPLEL
IPRALQPFNALLPMTYTVAGYKEILSADGAQYLQTATTYLVFVAAGCFALLWAYFRIAWKKKYRQVASEA

Specific function: Unknown

COG id: COG1511

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: To L.lactis phage infection protein (PIP) [H]

Homologues:

Organism=Homo sapiens, GI310113161, Length=169, Percent_Identity=34.3195266272189, Blast_Score=79, Evalue=1e-14,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR013525
- InterPro:   IPR022703
- InterPro:   IPR017501
- InterPro:   IPR017500 [H]

Pfam domain/function: PF01061 ABC2_membrane; PF12051 DUF3533 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 90548; Mature: 90548

Theoretical pI: Translated: 4.19; Mature: 4.19

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
1.8 %Met     (Translated Protein)
2.0 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
1.8 %Met     (Mature Protein)
2.0 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNGWKLWTAEWRSIFKNPRVLVPILAVALVPLMYAGMFLWAFWDPYGQMKDLPVAIVNED
CCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECC
KGATFEGESLAIGDDLIDKLLDSEAFEFVETTKEEAESGLKDHDYYMAIEIPEDFSEKAT
CCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHH
TALDEHPEQLELKYIANESYNFLAAQIGGSAMEQVKAELSTEVSKQYVSALKDGLNDVAD
HHHHCCCHHEEEHHCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLGEAADGATTLADGSTSAKDGAVKLADGTKLLASKQRELADGASQLNDGMTQLADGSSE
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
LADGTKLLASKQRELANGASQLRDGVSQLADGSSALADGSQQVYEGSASLADGVHRVSEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
ASALQGGTSQLVDGTGAFASKLDELHTGAKTLNQGVQDLAAGIERSKEGASALQDGATKL
HHHHCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
TGALTQAKDGNAALVAGQTDVVNGIGQMKSELTAKQDELIGQLTALAESGQSASPEMLQA
HHHHHHCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHH
IAAQLSDGKQETAAGFDQLSAGAAKVKEGQVALGAGLDQAGTGANKLSTGLSDLSAGQTK
HHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCEEECCCCCCCCCCHHHHHHCHHHHHCCHHH
LAEGANALASGSSQIEQGTQTAADRSQELVSASAKLNQGATQLQDGTTELAVGSDKLVDA
HHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCCEECCCCHHHCC
TGQLSEGSEKLADGAKSASTGTSELVNGANQLADGGQKLQSGSRELAEGAKSAGAGTSKL
CCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHH
TDGANQLANGGEELSDGSGELADGMKELASGSDELRDALVKGAKDADIGLTDDNVEMMAG
HHHHHHHHCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHC
PVSLVDNSIHEVPNYGTGFAPYFMSLGLFVGALLLSIVYPLYDPAGRPKRSLSWVLSKSG
HHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCC
VLMVVGFLQALILDVAMVQLLGLEVSEPLKFFGFSWLTSITFLFIVQLLVTTLGNPGRFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
AIVLLILQLTTSAGTFPLELIPRALQPFNALLPMTYTVAGYKEILSADGAQYLQTATTYL
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VFVAAGCFALLWAYFRIAWKKKYRQVASEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNGWKLWTAEWRSIFKNPRVLVPILAVALVPLMYAGMFLWAFWDPYGQMKDLPVAIVNED
CCCCEEHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECC
KGATFEGESLAIGDDLIDKLLDSEAFEFVETTKEEAESGLKDHDYYMAIEIPEDFSEKAT
CCCCCCCCCEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCHHHHHHHH
TALDEHPEQLELKYIANESYNFLAAQIGGSAMEQVKAELSTEVSKQYVSALKDGLNDVAD
HHHHCCCHHEEEHHCCCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GLGEAADGATTLADGSTSAKDGAVKLADGTKLLASKQRELADGASQLNDGMTQLADGSSE
HHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHH
LADGTKLLASKQRELANGASQLRDGVSQLADGSSALADGSQQVYEGSASLADGVHRVSEG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHH
ASALQGGTSQLVDGTGAFASKLDELHTGAKTLNQGVQDLAAGIERSKEGASALQDGATKL
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IAAQLSDGKQETAAGFDQLSAGAAKVKEGQVALGAGLDQAGTGANKLSTGLSDLSAGQTK
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CCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCHHHHHHHHHHCCCCCHHH
TDGANQLANGGEELSDGSGELADGMKELASGSDELRDALVKGAKDADIGLTDDNVEMMAG
HHHHHHHHCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHC
PVSLVDNSIHEVPNYGTGFAPYFMSLGLFVGALLLSIVYPLYDPAGRPKRSLSWVLSKSG
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VLMVVGFLQALILDVAMVQLLGLEVSEPLKFFGFSWLTSITFLFIVQLLVTTLGNPGRFV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHH
AIVLLILQLTTSAGTFPLELIPRALQPFNALLPMTYTVAGYKEILSADGAQYLQTATTYL
HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHH
VFVAAGCFALLWAYFRIAWKKKYRQVASEA
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377; 1459957 [H]