Definition Sulfolobus islandicus M.14.25 chromosome, complete genome.
Accession NC_012588
Length 2,608,832

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The map label for this gene is 227828821

Identifier: 227828821

GI number: 227828821

Start: 2414903

End: 2416492

Strand: Direct

Name: 227828821

Synonym: M1425_2595

Alternate gene names: NA

Gene position: 2414903-2416492 (Clockwise)

Preceding gene: 227828818

Following gene: 227828822

Centisome position: 92.57

GC content: 36.1

Gene sequence:

>1590_bases
ATGCCAGATAAAAACCAATCTGTTTTCATAAGACGATCCTCTGGTTTAGTAAGAGAAGTTAGTCCTTGGGCATCATTCTT
CGCTACATTTGGACTGGTAACGGGTGGAATACCTATATTAATAGTATCATGGCTTTATCTCGCTCCGGGGGCAAATTGGA
CCTTATCTTACTTAATATCACTATTACCCACTTTAGGAATGGCATTTCTTTTTTACGTTGCGTCAATCTCAACCCCTAGA
TCAGGTGGAGATTACGTATTTCAAGCTAGATCATCACATCCCCTAGTTGCATTTGTCAATTATTGGGCGTTATGGATAGC
CTTTGCGCTATCCTTGGGATTATATAGCTATTTAGGCGCGCAATGGTTTGCTTATTTATTTAGTGGCTTAGGGCTTTTTT
ACAATGATCAAGCATTAATAAACTTAGGCTCGTTTTTTACCACAACTCTAGGAAGTGTAATAGTAGGTATTATCATATTG
ATTATGGGGGCAATCGTAGCCTCTATAGGAAAATACGGTTGGAGTTTTGTATTTGTAACTGGTATTATATCGATACTCTC
AACGATTGTAACATTCGTGGCTTTAGCCCTAATAAGTCCTTCACAGTTCTCTAGTGCATTATCGTCTTTTACTGGAGTAA
ACAATGCATATGACGAAGTAATATCAACCACTACTTCAAATGGCTTAAGTTTCGTATCACCATTTTACGGAGCCTTACTA
GCAATTCCAGTAGTATGGTATTATTATGTATGGTATAATTTACCAGCATCTTGGAGTGGAGAGATGAAGAAAGTAAAGTA
TAATTCACTACTAGGTATAGTGGTTGCAGTACTATTCATAGGAGTCTACTATATTCTATTTACCTCCCTTAATCTCCACG
CCTTTGGTGAGAGATTTTTAACATCTTGGTCATACATTTCCGCAAATTCGTTAAATAGTACAGTTTATAATGATTTAAGT
ACCATGGGTACGTTCACTCCCTTTTTTGCCTTATTAGTAAACCACAACGTATTCTTATACATTATAATGTGGATAGCATT
TTGGCTACCCAATTTCTATAGCAATCCTCCCTTAGTTGTTTCCCTAACTAGATATCTCTTTGCATGGGCGTTTGATAGGA
TAATGCCAGAGAAATTGGCTGATGTAAATGAAAGGTTTCACATACCATTAATCTCTACAATAATTACTGTAATTGTTGGT
TTAATAGGAGTACTACTTTACGCATATGTGTCGTCAATATCAATCGTAGATGTAACAGTGATATTCGAAATAAGCTATGG
AATTTTCGCCTTAACTACTGCGTTATCACCTTTCATAAAGAGGAACTTCTTCAACAGAGCTGTCCCTATTAAAAATATAG
GTGGCATTCCCATAGTATCTCTGATAGGGTTTCCAGTATTTGGATTCCTTCTTTACGCGTTATATCAAACTTGGGGAAAT
CCAGTGTTACTACCAATAAACTTTCCTACAATACTTTCATTAGTAATAATATATGCAAGCGGAATTATGATTTACGTAGC
ATCATACATCATTAATAAGGAGAGAGGAATTCAGATGAACTTGATTTTTGAGGAAATACCACCAGAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TGTCAAAAAAAGAAAATTCGAATCCACATATAACTTTAAATACTTTAAAAATTTGATAGTAGTAAGGTTTTTAAGCACTT
TACATACCACACTACTTAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
GTTAACTCTTTTCTTTTATTCTTTCATCTTCTTTTTAGATATTTAATTTTAAATATGAGTTAATGCGAGTTTAACACTTG
TGGGACTATTCAAAAGGAAT

Product: amino acid transporter

Products: NA

Alternate protein names: Amino Acid Transporter; Amino Acid Transporter-Like Protein; Amino Acid Permease Superfamily

Number of amino acids: Translated: 529; Mature: 528

Protein sequence:

>529_residues
MPDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLISLLPTLGMAFLFYVASISTPR
SGGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGAQWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIIL
IMGAIVASIGKYGWSFVFVTGIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALL
AIPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFLTSWSYISANSLNSTVYNDLS
TMGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVVSLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVG
LIGVLLYAYVSSISIVDVTVIFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGN
PVLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE

Sequences:

>Translated_529_residues
MPDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLISLLPTLGMAFLFYVASISTPR
SGGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGAQWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIIL
IMGAIVASIGKYGWSFVFVTGIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALL
AIPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFLTSWSYISANSLNSTVYNDLS
TMGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVVSLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVG
LIGVLLYAYVSSISIVDVTVIFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGN
PVLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE
>Mature_528_residues
PDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLISLLPTLGMAFLFYVASISTPRS
GGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGAQWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIILI
MGAIVASIGKYGWSFVFVTGIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALLA
IPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFLTSWSYISANSLNSTVYNDLST
MGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVVSLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVGL
IGVLLYAYVSSISIVDVTVIFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGNP
VLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 58808; Mature: 58676

Theoretical pI: Translated: 8.75; Mature: 8.75

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.5 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLIS
CCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
LLPTLGMAFLFYVASISTPRSGGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIILIMGAIVASIGKYGWSFVFVT
HHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
AIPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
TSWSYISANSLNSTVYNDLSTMGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVV
HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHH
SLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVGLIGVLLYAYVSSISIVDVTV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEE
IFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGN
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PVLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE
CEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
PDKNQSVFIRRSSGLVREVSPWASFFATFGLVTGGIPILIVSWLYLAPGANWTLSYLIS
CCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
LLPTLGMAFLFYVASISTPRSGGDYVFQARSSHPLVAFVNYWALWIAFALSLGLYSYLGA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QWFAYLFSGLGLFYNDQALINLGSFFTTTLGSVIVGIIILIMGAIVASIGKYGWSFVFVT
HHHHHHHHCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIISILSTIVTFVALALISPSQFSSALSSFTGVNNAYDEVISTTTSNGLSFVSPFYGALL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHH
AIPVVWYYYVWYNLPASWSGEMKKVKYNSLLGIVVAVLFIGVYYILFTSLNLHAFGERFL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
TSWSYISANSLNSTVYNDLSTMGTFTPFFALLVNHNVFLYIIMWIAFWLPNFYSNPPLVV
HCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHH
SLTRYLFAWAFDRIMPEKLADVNERFHIPLISTIITVIVGLIGVLLYAYVSSISIVDVTV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEEEE
IFEISYGIFALTTALSPFIKRNFFNRAVPIKNIGGIPIVSLIGFPVFGFLLYALYQTWGN
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PVLLPINFPTILSLVIIYASGIMIYVASYIINKERGIQMNLIFEEIPPE
CEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA