Definition Wolbachia sp. wRi, complete genome.
Accession NC_012416
Length 1,445,873

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The map label for this gene is 225630626

Identifier: 225630626

GI number: 225630626

Start: 974051

End: 975517

Strand: Direct

Name: 225630626

Synonym: WRi_008980

Alternate gene names: NA

Gene position: 974051-975517 (Clockwise)

Preceding gene: 225630624

Following gene: 225630627

Centisome position: 67.37

GC content: 33.67

Gene sequence:

>1467_bases
ATGAATCCGAGATTAAAAGCATTTTTGGTTGTTTGTAGTATTATTGCATTTTTGATTGCACTTTTGTTTCTCGTGTATTA
TTTAAATCTTCTTGTTAACTATATCCTTGACCCGATTCTAGTTCGTCCCTTTGAAAGATTATACAAAAACTTAATTGTTG
ATGGTCTTTATGCCTATTTATCTACAAGCACTTCTAGCCCTGCACTAGCATTTTTGGCTACAGGTTTTATTGTTATTGCT
GCGTTTATTTGCCTGAATAAAATGCTTCTTCCCTTGCAAGAGAAGATCATAAACAACTATACCTCCTTTAAAAACAACAA
TATTGATAGCAATAGCATGTTGTTTGAGGTTTATAAAGATCCAACAATAAAATTAAAGGACAAAATCTTATTCTTCAGTA
TACACTTGATATATTACCTACAGCTTCCATTTTTGTACATTGCATCAAAGGTATCAGCTCTACGTGAGTTTCTTATATTT
AATTTTGGTTTATTATTGTTAAATTATGCACTGCTAATTCCAGTAGCACTTCTTGAGTTAATAAAATATCCATCAGTAAA
ACTCTTTTCACCTTTGGGTTTGAATGTAAAGCAGCTAAGCTTTTTGTTTAATGTAAGTGATGTGGGCACTGGTAGTCAAA
GTGTTCATACTAGAAGTTTTGAAGAAAGCACCATTAAATGTGCTAAAGAATTAAAGGAAAAATATGGGGCACCATCAAAT
GAGTTAGATGAAGAGTTTAAAAGTTATATAAGCGGTTTAACAAGTCAGCAAAAACGAATGATAGAACCTTATCTAAGATT
GGATGGTTATGAAACTGGGGAGTGGGTAAATTGGGTAGATTCAAAAACCGGATTGACATTGACACAGGCTATAAATTTAG
TTTTAATTGCGGCAAGAAAGCAAAATTCAGACGTAGAACTATTGAAATCTATATTACTGGTTCGCTTTGATGAAAGTAAC
CGCCAATGTGGTCCTGGAATGCTTCTCCGCATTATTTATGCATTAAATGGCCTTGAAGCAGAAAACAACTTTGCAGCTCA
ACTAGAGCCTTGGCAAATAGGAGAGTTGGCTAGGTATACTACTAAAAGATTTTTTGAGAGATATGTGGATAAGCATTACT
ATAAGATAAAAGTTTTGAAAGAAAATTTTGATGATTTGTATTCACCAAGTTCTGAAGTGGATTTGAGCAACGTGAGTGAT
GAAGTAAAGGACGGCATTTCTTATACAAGAGATGCTATAAAAGAATTTGTGTTTAAGGAATTATATGTAAAGTTTTATAA
CGACTATGGGGAGCATATTCAGAGAGGGCAGATAAAACAAAGGTTAAGGGAGTTAATAACGGATGAAGTCGTAGACGCGG
CAATATATTCTAAAATAGATGAAATAGAAATCCCTGCAGAACCACCTACTTATCTTGAAAGAGTAAAAGCATTTTTTGGA
GGTCATGCAAGGTCTTCTGCTGCTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAAACTCAGAAATTTCAATTGATCTTTTAACATAAAAACTTGCATTTTTTTCAATTTATTCCTAAAATAGATTATATTAA
CAGATTATTAAGAGGGGGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGGTTTAGTTCGTGCTATATAGCTAAACTGACTTAGATTTACTGACAATTTTAAAACAACAAATTCGTCATTCCGCTACT
AGTTAGCGGAATCTATACCG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 488; Mature: 488

Protein sequence:

>488_residues
MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYLSTSTSSPALAFLATGFIVIA
AFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKDPTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIF
NFGLLLLNYALLIPVALLELIKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN
ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARKQNSDVELLKSILLVRFDESN
RQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYTTKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSD
EVKDGISYTRDAIKEFVFKELYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG
GHARSSAA

Sequences:

>Translated_488_residues
MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYLSTSTSSPALAFLATGFIVIA
AFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKDPTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIF
NFGLLLLNYALLIPVALLELIKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN
ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARKQNSDVELLKSILLVRFDESN
RQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYTTKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSD
EVKDGISYTRDAIKEFVFKELYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG
GHARSSAA
>Mature_488_residues
MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYLSTSTSSPALAFLATGFIVIA
AFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKDPTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIF
NFGLLLLNYALLIPVALLELIKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN
ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARKQNSDVELLKSILLVRFDESN
RQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYTTKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSD
EVKDGISYTRDAIKEFVFKELYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG
GHARSSAA

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 55999; Mature: 55999

Theoretical pI: Translated: 6.69; Mature: 6.69

Prosite motif: PS00443 GATASE_TYPE_II

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.8 %Cys     (Translated Protein)
1.0 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.8 %Cys     (Mature Protein)
1.0 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
STSTSSPALAFLATGFIVIAAFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKD
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC
PTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIFNFGLLLLNYALLIPVALLEL
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN
HCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHEEEECC
QNSDVELLKSILLVRFDESNRQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYT
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
TKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSDEVKDGISYTRDAIKEFVFKE
HHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC
GHARSSAA
CCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MNPRLKAFLVVCSIIAFLIALLFLVYYLNLLVNYILDPILVRPFERLYKNLIVDGLYAYL
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
STSTSSPALAFLATGFIVIAAFICLNKMLLPLQEKIINNYTSFKNNNIDSNSMLFEVYKD
HCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEECC
PTIKLKDKILFFSIHLIYYLQLPFLYIASKVSALREFLIFNFGLLLLNYALLIPVALLEL
CCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKYPSVKLFSPLGLNVKQLSFLFNVSDVGTGSQSVHTRSFEESTIKCAKELKEKYGAPSN
HCCCCCEECCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
ELDEEFKSYISGLTSQQKRMIEPYLRLDGYETGEWVNWVDSKTGLTLTQAINLVLIAARK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHEEEECC
QNSDVELLKSILLVRFDESNRQCGPGMLLRIIYALNGLEAENNFAAQLEPWQIGELARYT
CCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
TKRFFERYVDKHYYKIKVLKENFDDLYSPSSEVDLSNVSDEVKDGISYTRDAIKEFVFKE
HHHHHHHHHHHHHEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LYVKFYNDYGEHIQRGQIKQRLRELITDEVVDAAIYSKIDEIEIPAEPPTYLERVKAFFG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHC
GHARSSAA
CCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA