Definition Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome.
Accession NC_011999
Length 2,102,324

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The map label for this gene is mprF [H]

Identifier: 222151265

GI number: 222151265

Start: 1125760

End: 1128294

Strand: Direct

Name: mprF [H]

Synonym: MCCL_1018

Alternate gene names: 222151265

Gene position: 1125760-1128294 (Clockwise)

Preceding gene: 222151264

Following gene: 222151267

Centisome position: 53.55

GC content: 33.77

Gene sequence:

>2535_bases
ATGAAAATATTATTTAATAATTATCGGAATGTAATTAAGTTTTTATTTATGGCATTACTGTTTATTTTTGTGATATATCG
TCTAAAGGGTGAGTTATCGACGATCGATTTCAAATCGACGATGACGGCATTTAAACATTTGAACTCTATACAGCTGGCTC
TCCTTATTTTTTCTGGCCTTGCTTCAGTCAGTATTTTATCTCTGTATGATTTTGTGCTAGCTAAGAGAATGAATCTGGAA
ATCAAACATATCAAACTCTTTAATGTTAGTTTTATTGCAAATGCATTAAATGCCGTTATCGGATTTGGAGGAATGATAGG
GGCAGGGCTCCGCTTACTTATTTATAGAAATTATACCGAGGATGATAAAACGCTTATCAAGGTCATTTCAATGATGTTGT
TATCGATGATTTCAGGAATGAGTATTCTGAGTTTAGGTATTGTTTTTGATATTTTTCCGAATACCCATGCTTTTGATCAG
TATACGTGGTATAAAATTGGTATTTTTATCATTGCGCTCTATTTGCCGGTATTTCTTCTGTACACACTTATTAAACCTGT
TAATAATGATAAATTTCTGGGAATAATATTTACACTTGTATCAAGCATCGAATGGTTGGCAGCGAGTGGGGTATTCTATC
TGATATTTAAATTTATACATATCGATGTACAGTATTCGTTAATTATAGGTATCTTTGTTATCGCTGCTTTAGCTGGATTA
CTCTCAATGGTTCCTGGTGGTTTTGGTGCTTTTGATCTGATGATCCTTATTGGATTTAAAAGTATTGGTATCACCGAAGA
AAATGTATTGCTTGCACTCGTTATATACCGCGTTGTCTATTATTTCGTTCCCTTTCTTGTTGCAATGGTTTTATCCACCT
TTGAGTTTAAGGGATTTGCAAAGAAACAATTTGAAGAACGCTTTGAAGATAATAAGTATTTTGCACCTGCGATTGAAACA
AGCTCATTATTTTTAAATCTGTTAAAGGATGTGTTAATACATCTACCAGCTATAGCCCTTGGTATCCTTTCTTTTATTAC
TGGGTTTGTATTTCTGATGACAAACAGTATATTGATAAACGATGCTATCTTTGATGTCCAGCACAATACATATACCTTCT
TATCTTCTTTATTCACGCTTGCTTGCTTGCTGCTGATGATAAATGCGAAAGGTGTGATGCATGATACGAGACGTGCACAT
ATCATCAGTATTGTTGCTGCTGCTGTAATATTAATCATTCTTTTCTTAACATTTGGAAACTGGCTTGTATACATTTGGAT
TGCAGCACTTATTTTACTTCTATTTATCGGAAATATGAATATTAAGATGATTAAACGTCCAATCACACTGTTCAGAGCAG
GTTTAACGATGCTCTTTGCTTTCATTATTCTTTCAATCAATAGCTGGCTCATCAGACTCCAGCTAAGTGAACTATTAGCA
CAGGATAAGATAGAGTTTGATGGTAATTTAATGAGAAATTATTTTCTATTCTTTATTATTGCAACAATATTACTAATCAG
TATAACTTCGTATTTCTTCAACAAGAAATATATTGCTAACATCGCTATGGAAGTTTCTGAAGAACAGCGTGAACAAATTA
TTGAGATGTATGGAGGCAACTTTGTCAGTCATCTTCATTATTCTACCGATAAATCGTATTTCATTAATCAAGCTGAAGAT
GCATTTATCATGTTTCAGACACATTATGATACAATTTTCGTGCTTGGTGATCCTATAGGTAACAAGCAGTCATTCAGAGA
CTTATTATACGATTTCTACAACCAGGCTAGCTATTACGGATATGAAATCATCTTTTATCAGGTTAAACCCGATTATCTCC
CTTTGTATCATGATTTCGGAAATATTTTCTTTAAGTTAGGTGAAGAAGCTGTAATACCTCTTAATGATTTTACTATCAGT
GGTAAGAAGAAACGTGCATTTCGTGCAACAATGAATAAGTTTGAATCGCAAGGGTATTTTTATGAGGTTGTGCATCCACC
ATTTAGTTCAGAGTTTGTAAACCAGTTACAAACTGTATCTGATGAATGGTTAAACGGAAGATCTGAAATGAACTTTTCAG
TTGGGAGCTTTAATGCGTATTATCTCAATAAGGCACCAGTTGGCGTCATACGAAATGATGAAGACGTCATAGGATTTGTA
TCATTTATGCCGACAAATTATAATCACTCTATCTCAGTTGATATGATTCGCTGGAAAGAGAATGAGTTTCAGATGATGGA
TGGTCTATATTTAAATACGATGCTATCCGTCAAAGAACAGTATGATTATTTTAATATGGGCATGGCACCACTATCCAACG
TCGGCAGCCATAAATATGCATTTTATAGAGAGCGATTCGCTGGAAGGATATTTGAGACAATTTCTCATATCTATAGTTTT
AAAGGCTTACGAAACTATAAAGAAAAATTTAATCCGAACTGGGAGCCACGCTATCTCGTCTATAAAAAGGGGAATAGTCT
AGTAACATCTATGATAAGAGTGAGTTATCTCATTAATAAAAAGACAAGAAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATGACTTATCTTTCATTTATTTCCAATAATATTTGGTTTTTTTCTTTTTTTTCTGTAGAATATGTATGAATTTAAATTAA
TTATTGTGAGTAGGGATTTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTTCTTGTCTTTTATTTTTTGTCTTGTTTCTTGTTCTCTTTTATAACGTTCAGGATCTTTCTGATAGAAGTCCTGATG
ATATTCCTCTGCCTTATAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: Lysylphosphatidylglycerol synthase; LPG synthase; Multiple peptide resistance factor [H]

Number of amino acids: Translated: 844; Mature: 844

Protein sequence:

>844_residues
MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGLASVSILSLYDFVLAKRMNLE
IKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTEDDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQ
YTWYKIGIFIIALYLPVFLLYTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL
LSMVPGGFGAFDLMILIGFKSIGITEENVLLALVIYRVVYYFVPFLVAMVLSTFEFKGFAKKQFEERFEDNKYFAPAIET
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AFIMFQTHYDTIFVLGDPIGNKQSFRDLLYDFYNQASYYGYEIIFYQVKPDYLPLYHDFGNIFFKLGEEAVIPLNDFTIS
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SFMPTNYNHSISVDMIRWKENEFQMMDGLYLNTMLSVKEQYDYFNMGMAPLSNVGSHKYAFYRERFAGRIFETISHIYSF
KGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINKKTRN

Sequences:

>Translated_844_residues
MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGLASVSILSLYDFVLAKRMNLE
IKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTEDDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQ
YTWYKIGIFIIALYLPVFLLYTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL
LSMVPGGFGAFDLMILIGFKSIGITEENVLLALVIYRVVYYFVPFLVAMVLSTFEFKGFAKKQFEERFEDNKYFAPAIET
SSLFLNLLKDVLIHLPAIALGILSFITGFVFLMTNSILINDAIFDVQHNTYTFLSSLFTLACLLLMINAKGVMHDTRRAH
IISIVAAAVILIILFLTFGNWLVYIWIAALILLLFIGNMNIKMIKRPITLFRAGLTMLFAFIILSINSWLIRLQLSELLA
QDKIEFDGNLMRNYFLFFIIATILLISITSYFFNKKYIANIAMEVSEEQREQIIEMYGGNFVSHLHYSTDKSYFINQAED
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KGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINKKTRN
>Mature_844_residues
MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGLASVSILSLYDFVLAKRMNLE
IKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTEDDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQ
YTWYKIGIFIIALYLPVFLLYTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL
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SSLFLNLLKDVLIHLPAIALGILSFITGFVFLMTNSILINDAIFDVQHNTYTFLSSLFTLACLLLMINAKGVMHDTRRAH
IISIVAAAVILIILFLTFGNWLVYIWIAALILLLFIGNMNIKMIKRPITLFRAGLTMLFAFIILSINSWLIRLQLSELLA
QDKIEFDGNLMRNYFLFFIIATILLISITSYFFNKKYIANIAMEVSEEQREQIIEMYGGNFVSHLHYSTDKSYFINQAED
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KGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINKKTRN

Specific function: Catalyzes the transfer of a lysyl group from L-lysyl- tRNA(Lys) to membrane-bound phosphatidylglycerol (PG), which produces lysylphosphatidylglycerol (LPG), a major component of the bacterial membrane with a positive net charge. LPG synthesis contributes

COG id: COG2898

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the LPG synthase family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787006, Length=288, Percent_Identity=24.3055555555556, Blast_Score=64, Evalue=5e-11,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR016181
- InterPro:   IPR022791 [H]

Pfam domain/function: PF03706 UPF0104 [H]

EC number: =2.3.2.3 [H]

Molecular weight: Translated: 97383; Mature: 97383

Theoretical pI: Translated: 9.04; Mature: 9.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
3.8 %Met     (Translated Protein)
3.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
3.8 %Met     (Mature Protein)
3.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGL
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASVSILSLYDFVLAKRMNLEIKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCEEEEEECCCC
DDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQYTWYKIGIFIIALYLPVFLL
CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSMVPGGFGAFDLMILIGFKSIGITEENVLLALVIYRVVYYFVPFLVAMVLSTFEFKGFA
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
KKQFEERFEDNKYFAPAIETSSLFLNLLKDVLIHLPAIALGILSFITGFVFLMTNSILIN
HHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE
DAIFDVQHNTYTFLSSLFTLACLLLMINAKGVMHDTRRAHIISIVAAAVILIILFLTFGN
CCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WLVYIWIAALILLLFIGNMNIKMIKRPITLFRAGLTMLFAFIILSINSWLIRLQLSELLA
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QDKIEFDGNLMRNYFLFFIIATILLISITSYFFNKKYIANIAMEVSEEQREQIIEMYGGN
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
FVSHLHYSTDKSYFINQAEDAFIMFQTHYDTIFVLGDPIGNKQSFRDLLYDFYNQASYYG
HHHHEEECCCCCCEECCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
YEIIFYQVKPDYLPLYHDFGNIFFKLGEEAVIPLNDFTISGKKKRAFRATMNKFESQGYF
EEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCE
YEVVHPPFSSEFVNQLQTVSDEWLNGRSEMNFSVGSFNAYYLNKAPVGVIRNDEDVIGFV
EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEECCCHHEEEE
SFMPTNYNHSISVDMIRWKENEFQMMDGLYLNTMLSVKEQYDYFNMGMAPLSNVGSHKYA
EECCCCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHCCCCCHHH
FYRERFAGRIFETISHIYSFKGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHC
KTRN
CCCC
>Mature Secondary Structure
MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGL
CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ASVSILSLYDFVLAKRMNLEIKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTE
HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCEEEEEECCCC
DDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQYTWYKIGIFIIALYLPVFLL
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YTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL
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KKQFEERFEDNKYFAPAIETSSLFLNLLKDVLIHLPAIALGILSFITGFVFLMTNSILIN
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CCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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HHHHEEECCCCCCEECCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEE
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YEVVHPPFSSEFVNQLQTVSDEWLNGRSEMNFSVGSFNAYYLNKAPVGVIRNDEDVIGFV
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SFMPTNYNHSISVDMIRWKENEFQMMDGLYLNTMLSVKEQYDYFNMGMAPLSNVGSHKYA
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FYRERFAGRIFETISHIYSFKGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHC
KTRN
CCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11342591; 12496209 [H]