| Definition | Macrococcus caseolyticus JCSC5402, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011999 |
| Length | 2,102,324 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is mprF [H]
Identifier: 222151265
GI number: 222151265
Start: 1125760
End: 1128294
Strand: Direct
Name: mprF [H]
Synonym: MCCL_1018
Alternate gene names: 222151265
Gene position: 1125760-1128294 (Clockwise)
Preceding gene: 222151264
Following gene: 222151267
Centisome position: 53.55
GC content: 33.77
Gene sequence:
>2535_bases ATGAAAATATTATTTAATAATTATCGGAATGTAATTAAGTTTTTATTTATGGCATTACTGTTTATTTTTGTGATATATCG TCTAAAGGGTGAGTTATCGACGATCGATTTCAAATCGACGATGACGGCATTTAAACATTTGAACTCTATACAGCTGGCTC TCCTTATTTTTTCTGGCCTTGCTTCAGTCAGTATTTTATCTCTGTATGATTTTGTGCTAGCTAAGAGAATGAATCTGGAA ATCAAACATATCAAACTCTTTAATGTTAGTTTTATTGCAAATGCATTAAATGCCGTTATCGGATTTGGAGGAATGATAGG GGCAGGGCTCCGCTTACTTATTTATAGAAATTATACCGAGGATGATAAAACGCTTATCAAGGTCATTTCAATGATGTTGT TATCGATGATTTCAGGAATGAGTATTCTGAGTTTAGGTATTGTTTTTGATATTTTTCCGAATACCCATGCTTTTGATCAG TATACGTGGTATAAAATTGGTATTTTTATCATTGCGCTCTATTTGCCGGTATTTCTTCTGTACACACTTATTAAACCTGT TAATAATGATAAATTTCTGGGAATAATATTTACACTTGTATCAAGCATCGAATGGTTGGCAGCGAGTGGGGTATTCTATC TGATATTTAAATTTATACATATCGATGTACAGTATTCGTTAATTATAGGTATCTTTGTTATCGCTGCTTTAGCTGGATTA CTCTCAATGGTTCCTGGTGGTTTTGGTGCTTTTGATCTGATGATCCTTATTGGATTTAAAAGTATTGGTATCACCGAAGA AAATGTATTGCTTGCACTCGTTATATACCGCGTTGTCTATTATTTCGTTCCCTTTCTTGTTGCAATGGTTTTATCCACCT TTGAGTTTAAGGGATTTGCAAAGAAACAATTTGAAGAACGCTTTGAAGATAATAAGTATTTTGCACCTGCGATTGAAACA AGCTCATTATTTTTAAATCTGTTAAAGGATGTGTTAATACATCTACCAGCTATAGCCCTTGGTATCCTTTCTTTTATTAC TGGGTTTGTATTTCTGATGACAAACAGTATATTGATAAACGATGCTATCTTTGATGTCCAGCACAATACATATACCTTCT TATCTTCTTTATTCACGCTTGCTTGCTTGCTGCTGATGATAAATGCGAAAGGTGTGATGCATGATACGAGACGTGCACAT ATCATCAGTATTGTTGCTGCTGCTGTAATATTAATCATTCTTTTCTTAACATTTGGAAACTGGCTTGTATACATTTGGAT TGCAGCACTTATTTTACTTCTATTTATCGGAAATATGAATATTAAGATGATTAAACGTCCAATCACACTGTTCAGAGCAG GTTTAACGATGCTCTTTGCTTTCATTATTCTTTCAATCAATAGCTGGCTCATCAGACTCCAGCTAAGTGAACTATTAGCA CAGGATAAGATAGAGTTTGATGGTAATTTAATGAGAAATTATTTTCTATTCTTTATTATTGCAACAATATTACTAATCAG TATAACTTCGTATTTCTTCAACAAGAAATATATTGCTAACATCGCTATGGAAGTTTCTGAAGAACAGCGTGAACAAATTA TTGAGATGTATGGAGGCAACTTTGTCAGTCATCTTCATTATTCTACCGATAAATCGTATTTCATTAATCAAGCTGAAGAT GCATTTATCATGTTTCAGACACATTATGATACAATTTTCGTGCTTGGTGATCCTATAGGTAACAAGCAGTCATTCAGAGA CTTATTATACGATTTCTACAACCAGGCTAGCTATTACGGATATGAAATCATCTTTTATCAGGTTAAACCCGATTATCTCC CTTTGTATCATGATTTCGGAAATATTTTCTTTAAGTTAGGTGAAGAAGCTGTAATACCTCTTAATGATTTTACTATCAGT GGTAAGAAGAAACGTGCATTTCGTGCAACAATGAATAAGTTTGAATCGCAAGGGTATTTTTATGAGGTTGTGCATCCACC ATTTAGTTCAGAGTTTGTAAACCAGTTACAAACTGTATCTGATGAATGGTTAAACGGAAGATCTGAAATGAACTTTTCAG TTGGGAGCTTTAATGCGTATTATCTCAATAAGGCACCAGTTGGCGTCATACGAAATGATGAAGACGTCATAGGATTTGTA TCATTTATGCCGACAAATTATAATCACTCTATCTCAGTTGATATGATTCGCTGGAAAGAGAATGAGTTTCAGATGATGGA TGGTCTATATTTAAATACGATGCTATCCGTCAAAGAACAGTATGATTATTTTAATATGGGCATGGCACCACTATCCAACG TCGGCAGCCATAAATATGCATTTTATAGAGAGCGATTCGCTGGAAGGATATTTGAGACAATTTCTCATATCTATAGTTTT AAAGGCTTACGAAACTATAAAGAAAAATTTAATCCGAACTGGGAGCCACGCTATCTCGTCTATAAAAAGGGGAATAGTCT AGTAACATCTATGATAAGAGTGAGTTATCTCATTAATAAAAAGACAAGAAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATGACTTATCTTTCATTTATTTCCAATAATATTTGGTTTTTTTCTTTTTTTTCTGTAGAATATGTATGAATTTAAATTAA TTATTGTGAGTAGGGATTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTTCTTGTCTTTTATTTTTTGTCTTGTTTCTTGTTCTCTTTTATAACGTTCAGGATCTTTCTGATAGAAGTCCTGATG ATATTCCTCTGCCTTATAGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: Lysylphosphatidylglycerol synthase; LPG synthase; Multiple peptide resistance factor [H]
Number of amino acids: Translated: 844; Mature: 844
Protein sequence:
>844_residues MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGLASVSILSLYDFVLAKRMNLE IKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTEDDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQ YTWYKIGIFIIALYLPVFLLYTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL LSMVPGGFGAFDLMILIGFKSIGITEENVLLALVIYRVVYYFVPFLVAMVLSTFEFKGFAKKQFEERFEDNKYFAPAIET SSLFLNLLKDVLIHLPAIALGILSFITGFVFLMTNSILINDAIFDVQHNTYTFLSSLFTLACLLLMINAKGVMHDTRRAH IISIVAAAVILIILFLTFGNWLVYIWIAALILLLFIGNMNIKMIKRPITLFRAGLTMLFAFIILSINSWLIRLQLSELLA QDKIEFDGNLMRNYFLFFIIATILLISITSYFFNKKYIANIAMEVSEEQREQIIEMYGGNFVSHLHYSTDKSYFINQAED AFIMFQTHYDTIFVLGDPIGNKQSFRDLLYDFYNQASYYGYEIIFYQVKPDYLPLYHDFGNIFFKLGEEAVIPLNDFTIS GKKKRAFRATMNKFESQGYFYEVVHPPFSSEFVNQLQTVSDEWLNGRSEMNFSVGSFNAYYLNKAPVGVIRNDEDVIGFV SFMPTNYNHSISVDMIRWKENEFQMMDGLYLNTMLSVKEQYDYFNMGMAPLSNVGSHKYAFYRERFAGRIFETISHIYSF KGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINKKTRN
Sequences:
>Translated_844_residues MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGLASVSILSLYDFVLAKRMNLE IKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTEDDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQ YTWYKIGIFIIALYLPVFLLYTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL LSMVPGGFGAFDLMILIGFKSIGITEENVLLALVIYRVVYYFVPFLVAMVLSTFEFKGFAKKQFEERFEDNKYFAPAIET SSLFLNLLKDVLIHLPAIALGILSFITGFVFLMTNSILINDAIFDVQHNTYTFLSSLFTLACLLLMINAKGVMHDTRRAH IISIVAAAVILIILFLTFGNWLVYIWIAALILLLFIGNMNIKMIKRPITLFRAGLTMLFAFIILSINSWLIRLQLSELLA QDKIEFDGNLMRNYFLFFIIATILLISITSYFFNKKYIANIAMEVSEEQREQIIEMYGGNFVSHLHYSTDKSYFINQAED AFIMFQTHYDTIFVLGDPIGNKQSFRDLLYDFYNQASYYGYEIIFYQVKPDYLPLYHDFGNIFFKLGEEAVIPLNDFTIS GKKKRAFRATMNKFESQGYFYEVVHPPFSSEFVNQLQTVSDEWLNGRSEMNFSVGSFNAYYLNKAPVGVIRNDEDVIGFV SFMPTNYNHSISVDMIRWKENEFQMMDGLYLNTMLSVKEQYDYFNMGMAPLSNVGSHKYAFYRERFAGRIFETISHIYSF KGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINKKTRN >Mature_844_residues MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGLASVSILSLYDFVLAKRMNLE IKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTEDDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQ YTWYKIGIFIIALYLPVFLLYTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL LSMVPGGFGAFDLMILIGFKSIGITEENVLLALVIYRVVYYFVPFLVAMVLSTFEFKGFAKKQFEERFEDNKYFAPAIET SSLFLNLLKDVLIHLPAIALGILSFITGFVFLMTNSILINDAIFDVQHNTYTFLSSLFTLACLLLMINAKGVMHDTRRAH IISIVAAAVILIILFLTFGNWLVYIWIAALILLLFIGNMNIKMIKRPITLFRAGLTMLFAFIILSINSWLIRLQLSELLA QDKIEFDGNLMRNYFLFFIIATILLISITSYFFNKKYIANIAMEVSEEQREQIIEMYGGNFVSHLHYSTDKSYFINQAED AFIMFQTHYDTIFVLGDPIGNKQSFRDLLYDFYNQASYYGYEIIFYQVKPDYLPLYHDFGNIFFKLGEEAVIPLNDFTIS GKKKRAFRATMNKFESQGYFYEVVHPPFSSEFVNQLQTVSDEWLNGRSEMNFSVGSFNAYYLNKAPVGVIRNDEDVIGFV SFMPTNYNHSISVDMIRWKENEFQMMDGLYLNTMLSVKEQYDYFNMGMAPLSNVGSHKYAFYRERFAGRIFETISHIYSF KGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINKKTRN
Specific function: Catalyzes the transfer of a lysyl group from L-lysyl- tRNA(Lys) to membrane-bound phosphatidylglycerol (PG), which produces lysylphosphatidylglycerol (LPG), a major component of the bacterial membrane with a positive net charge. LPG synthesis contributes
COG id: COG2898
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the LPG synthase family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787006, Length=288, Percent_Identity=24.3055555555556, Blast_Score=64, Evalue=5e-11,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR016181 - InterPro: IPR022791 [H]
Pfam domain/function: PF03706 UPF0104 [H]
EC number: =2.3.2.3 [H]
Molecular weight: Translated: 97383; Mature: 97383
Theoretical pI: Translated: 9.04; Mature: 9.04
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 3.8 %Met (Translated Protein) 3.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 3.8 %Met (Mature Protein) 3.9 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGL CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASVSILSLYDFVLAKRMNLEIKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCEEEEEECCCC DDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQYTWYKIGIFIIALYLPVFLL CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSMVPGGFGAFDLMILIGFKSIGITEENVLLALVIYRVVYYFVPFLVAMVLSTFEFKGFA HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH KKQFEERFEDNKYFAPAIETSSLFLNLLKDVLIHLPAIALGILSFITGFVFLMTNSILIN HHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE DAIFDVQHNTYTFLSSLFTLACLLLMINAKGVMHDTRRAHIISIVAAAVILIILFLTFGN CCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLVYIWIAALILLLFIGNMNIKMIKRPITLFRAGLTMLFAFIILSINSWLIRLQLSELLA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QDKIEFDGNLMRNYFLFFIIATILLISITSYFFNKKYIANIAMEVSEEQREQIIEMYGGN HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC FVSHLHYSTDKSYFINQAEDAFIMFQTHYDTIFVLGDPIGNKQSFRDLLYDFYNQASYYG HHHHEEECCCCCCEECCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEE YEIIFYQVKPDYLPLYHDFGNIFFKLGEEAVIPLNDFTISGKKKRAFRATMNKFESQGYF EEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCE YEVVHPPFSSEFVNQLQTVSDEWLNGRSEMNFSVGSFNAYYLNKAPVGVIRNDEDVIGFV EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEECCCHHEEEE SFMPTNYNHSISVDMIRWKENEFQMMDGLYLNTMLSVKEQYDYFNMGMAPLSNVGSHKYA EECCCCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHCCCCCHHH FYRERFAGRIFETISHIYSFKGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHC KTRN CCCC >Mature Secondary Structure MKILFNNYRNVIKFLFMALLFIFVIYRLKGELSTIDFKSTMTAFKHLNSIQLALLIFSGL CEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ASVSILSLYDFVLAKRMNLEIKHIKLFNVSFIANALNAVIGFGGMIGAGLRLLIYRNYTE HHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCEEEEEECCCC DDKTLIKVISMMLLSMISGMSILSLGIVFDIFPNTHAFDQYTWYKIGIFIIALYLPVFLL CHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YTLIKPVNNDKFLGIIFTLVSSIEWLAASGVFYLIFKFIHIDVQYSLIIGIFVIAALAGL HHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSMVPGGFGAFDLMILIGFKSIGITEENVLLALVIYRVVYYFVPFLVAMVLSTFEFKGFA HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH KKQFEERFEDNKYFAPAIETSSLFLNLLKDVLIHLPAIALGILSFITGFVFLMTNSILIN HHHHHHHHCCCCEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEE DAIFDVQHNTYTFLSSLFTLACLLLMINAKGVMHDTRRAHIISIVAAAVILIILFLTFGN CCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WLVYIWIAALILLLFIGNMNIKMIKRPITLFRAGLTMLFAFIILSINSWLIRLQLSELLA HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QDKIEFDGNLMRNYFLFFIIATILLISITSYFFNKKYIANIAMEVSEEQREQIIEMYGGN HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC FVSHLHYSTDKSYFINQAEDAFIMFQTHYDTIFVLGDPIGNKQSFRDLLYDFYNQASYYG HHHHEEECCCCCCEECCCCCEEEEEEECCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEE YEIIFYQVKPDYLPLYHDFGNIFFKLGEEAVIPLNDFTISGKKKRAFRATMNKFESQGYF EEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCCCE YEVVHPPFSSEFVNQLQTVSDEWLNGRSEMNFSVGSFNAYYLNKAPVGVIRNDEDVIGFV EEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEECCEEEEEECCCCEEEEECCCHHEEEE SFMPTNYNHSISVDMIRWKENEFQMMDGLYLNTMLSVKEQYDYFNMGMAPLSNVGSHKYA EECCCCCCCEEEEEEEEECCCHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCHHHCCCCCHHH FYRERFAGRIFETISHIYSFKGLRNYKEKFNPNWEPRYLVYKKGNSLVTSMIRVSYLINK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHC KTRN CCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 11342591; 12496209 [H]