| Definition | Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011899 |
| Length | 2,578,146 |
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The map label for this gene is 220932477
Identifier: 220932477
GI number: 220932477
Start: 1762711
End: 1764672
Strand: Reverse
Name: 220932477
Synonym: Hore_16410
Alternate gene names: NA
Gene position: 1764672-1762711 (Counterclockwise)
Preceding gene: 220932478
Following gene: 220932476
Centisome position: 68.45
GC content: 38.63
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
>100_bases TCAGGGGACTGGGGTTACCGGTTAAAGTGGAAGAGGTTTTAATTAAATCTGGTGAAGTAGAAATTAACGGTGGTAAATCG GTGAGAAAGGCGGTATCCTC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTAAATGGGGTCTTAAAACAGGACTGAAAAAATTAATTTTTATGGTTAATTATTGTAAACAAGCTTTTTATTATGAAA TTGTTAAATTTAAAAACAGG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 653; Mature: 653
Protein sequence:
>653_residues MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGIQFFNELKSAGLNGVAVYENN VETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYDLKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQA VIYFPDWKDSYLNLSVGFDRNMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNVRILYLKPVIKESVPEKDLLQ VNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTGIGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFL LPETLFRQLLALGASIVFPVLAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPFLPVPPWELILRERLEKLLYV RPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIGQVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIAC KWVYNKFIRPFHN
Sequences:
>Translated_653_residues MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGIQFFNELKSAGLNGVAVYENN VETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYDLKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQA VIYFPDWKDSYLNLSVGFDRNMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNVRILYLKPVIKESVPEKDLLQ VNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTGIGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFL LPETLFRQLLALGASIVFPVLAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPFLPVPPWELILRERLEKLLYV RPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIGQVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIAC KWVYNKFIRPFHN >Mature_653_residues MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGIQFFNELKSAGLNGVAVYENN VETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYDLKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQA VIYFPDWKDSYLNLSVGFDRNMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNVRILYLKPVIKESVPEKDLLQ VNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTGIGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFL LPETLFRQLLALGASIVFPVLAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPFLPVPPWELILRERLEKLLYV RPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIGQVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIAC KWVYNKFIRPFHN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 74259; Mature: 74259
Theoretical pI: Translated: 9.77; Mature: 9.77
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCH QFFNELKSAGLNGVAVYENNVETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYD HHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHEECCCEEEECCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCC LKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQAVIYFPDWKDSYLNLSVGFDR CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCC NMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE HHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNV CCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC RILYLKPVIKESVPEKDLLQVNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTG EEEEECCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHH IGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFLLPETLFRQLLALGASIVFPV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHHH LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPF HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCC LPVPPWELILRERLEKLLYVRPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIG CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC QVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIACKWVYNKFIRPFHN CEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC >Mature Secondary Structure MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGI CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCH QFFNELKSAGLNGVAVYENNVETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYD HHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHEECCCEEEECCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCC LKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQAVIYFPDWKDSYLNLSVGFDR CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCC NMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE HHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNV CCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC RILYLKPVIKESVPEKDLLQVNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTG EEEEECCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHH IGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFLLPETLFRQLLALGASIVFPV HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHHH LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPF HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCC LPVPPWELILRERLEKLLYVRPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIG CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC QVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIACKWVYNKFIRPFHN CEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA