Definition Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome.
Accession NC_011899
Length 2,578,146

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is 220932477

Identifier: 220932477

GI number: 220932477

Start: 1762711

End: 1764672

Strand: Reverse

Name: 220932477

Synonym: Hore_16410

Alternate gene names: NA

Gene position: 1764672-1762711 (Counterclockwise)

Preceding gene: 220932478

Following gene: 220932476

Centisome position: 68.45

GC content: 38.63

Gene sequence:

>1962_bases
ATGGAAGGATTAAAAAAATACCAGAAAATGATGTTTGTATTTTTGGCGGTAATAGTTATTATTACCCTGATAAGTTCGGG
AGAACGTTATCGTGTCGAAAGAAATAATACCGGGGTTGATTTGATTATTGATTATAAAAGTCTGCAATCACTGGTTGATA
TCAGGGAGAGTGAAGGAATTCAATTCTTTAATGAACTAAAATCAGCCGGGCTTAATGGGGTTGCTGTCTATGAAAATAAT
GTGGAGACCTTAATAACAGAAGGGAAAGCACACTTACTTACCGGTGAAGATATTGACAGGTTAAAGTTTGTCACCGGGAA
TGTCACCCCTGTTATTGAATATATTGGAAAAAATTATGACCTCAAAGGGGGAGCCGTTTTAATATCAGATGATAACGGAG
TTATTGATAAACTGAAAACTTTAGCAGGTGACTGGAAAGAGCGGTACAACACTTCCTATAACAAAATTAATGGACAGGCA
GTTATCTATTTTCCTGACTGGAAAGACAGTTATCTAAATCTGAGTGTCGGCTTTGACCGAAATATGGTTTCGGTATTGGA
GGGAATGAACTTAAAGGTTATTCCCCGGGTCAGTAATAACTTACCACTGGAAAAGAGTATTCCTGCCTGGTTAAATCCCG
ATTATATTATATTTGAGGGTCAGGAAGTAACCGGTTATCCCGGTGACCTGGACAATACAGTCTCTTTTATGCAAGAGGAG
AACATAAAGTTTGGGATGATAGAACCCTTTATTGCCTATCAAAAGGGGGCTGTAGACCTGGCCCACAGGCTTAATTATGA
TGTCATCAGGGTTCACAGTATCCAGCAGGAGGAAATGGCTAAATATTCACTGAATAAGGTTGTTAATCGATATTTGAGGG
CAGTCAGGGAAAGAAATGTCAGGATATTGTACTTAAAACCGGTTATCAAAGAGTCTGTCCCAGAGAAAGACCTCTTACAG
GTTAACAGGCTTTTTATCAAGACTCTGTCAGCAAAACTGGTTAAGAGTGGTTATCAACCCGGGAAAGCAACTCCCTTTAA
CCATTTTAAAACCTCGAGGCCATTACTTATTTTAACCGGTATCGGTGTTATTCTGGGATTTATCCTTCTCTTAACATATC
TTTTTCCCCACCTGGATATCAAACTCATCCTGTATTCAGGAATAATTATGGTAGGCGGGGACTTAATATTAACATTTTTG
CTTCCAGAAACCCTGTTCCGTCAGCTGCTGGCCCTGGGAGCCAGTATAGTTTTCCCTGTCCTGGCTGTAATTAGCCAGCT
ACTGGCCGGAGACTCGTCTCAAAATTTAATGGTAAGATACGTAAAAACAACCTGCATTACTTTAATCGGAGCTCTATTTG
TGGTAACCAGTCTTGCCCGGACCAGTTTTCTTTTGAAGGTAGACCAATTTAGAGGGGTTAAAATTAGCTTTTTATTACCG
TTGTTAATTATTGTTTATTATTATATCCGTGAATATATTTATGGAGATAAAAAATTAAACTGGATGACAGAAATTGCTAA
TATAATGGATAAAAATATTAAAGTAAAACATATCTTTTATACTGGTCTACTGGTATTGGGGGGGCTGGTTTATATCGGAC
GGACCGGAAATTACCCTTTTTTACCGGTCCCGCCCTGGGAGCTTATACTCCGGGAGAGACTGGAGAAACTCCTTTATGTT
AGACCTCGCTTTAAGGAGTTTTTAATCGGACATCCCTTTTTATATCTCGGTCTCTTTTTAAAAAACAGGGTTAAACCCGG
AGTTATGTACTTAATCATTGTCGTACTGGCCAGTATCGGTCAGGTAACGGTTATCAATACTTTTGGCCATACCCATACTC
CTTTAATAATATCTTTAATACGGGTTGTTCATGGATTATGGCTCGGTTTGCTGATAGGAATTATATTAGCAATAGCCTGT
AAGTGGGTGTATAATAAATTTATCAGACCCTTTCATAACTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCAGGGGACTGGGGTTACCGGTTAAAGTGGAAGAGGTTTTAATTAAATCTGGTGAAGTAGAAATTAACGGTGGTAAATCG
GTGAGAAAGGCGGTATCCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTAAATGGGGTCTTAAAACAGGACTGAAAAAATTAATTTTTATGGTTAATTATTGTAAACAAGCTTTTTATTATGAAA
TTGTTAAATTTAAAAACAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 653; Mature: 653

Protein sequence:

>653_residues
MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGIQFFNELKSAGLNGVAVYENN
VETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYDLKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQA
VIYFPDWKDSYLNLSVGFDRNMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE
NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNVRILYLKPVIKESVPEKDLLQ
VNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTGIGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFL
LPETLFRQLLALGASIVFPVLAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP
LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPFLPVPPWELILRERLEKLLYV
RPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIGQVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIAC
KWVYNKFIRPFHN

Sequences:

>Translated_653_residues
MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGIQFFNELKSAGLNGVAVYENN
VETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYDLKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQA
VIYFPDWKDSYLNLSVGFDRNMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE
NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNVRILYLKPVIKESVPEKDLLQ
VNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTGIGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFL
LPETLFRQLLALGASIVFPVLAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP
LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPFLPVPPWELILRERLEKLLYV
RPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIGQVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIAC
KWVYNKFIRPFHN
>Mature_653_residues
MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGIQFFNELKSAGLNGVAVYENN
VETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYDLKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQA
VIYFPDWKDSYLNLSVGFDRNMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE
NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNVRILYLKPVIKESVPEKDLLQ
VNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTGIGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFL
LPETLFRQLLALGASIVFPVLAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP
LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPFLPVPPWELILRERLEKLLYV
RPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIGQVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIAC
KWVYNKFIRPFHN

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 74259; Mature: 74259

Theoretical pI: Translated: 9.77; Mature: 9.77

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCH
QFFNELKSAGLNGVAVYENNVETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYD
HHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHEECCCEEEECCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCC
LKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQAVIYFPDWKDSYLNLSVGFDR
CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCC
NMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE
HHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC
NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNV
CCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RILYLKPVIKESVPEKDLLQVNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTG
EEEEECCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHH
IGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFLLPETLFRQLLALGASIVFPV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHHH
LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPF
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCC
LPVPPWELILRERLEKLLYVRPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC
QVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIACKWVYNKFIRPFHN
CEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure
MEGLKKYQKMMFVFLAVIVIITLISSGERYRVERNNTGVDLIIDYKSLQSLVDIRESEGI
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCH
QFFNELKSAGLNGVAVYENNVETLITEGKAHLLTGEDIDRLKFVTGNVTPVIEYIGKNYD
HHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHEECCCEEEECCCCCCCEEEECCCCHHHHHHHCCCCC
LKGGAVLISDDNGVIDKLKTLAGDWKERYNTSYNKINGQAVIYFPDWKDSYLNLSVGFDR
CCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEECCEEEEEECCCCCCEEEEEECCCC
NMVSVLEGMNLKVIPRVSNNLPLEKSIPAWLNPDYIIFEGQEVTGYPGDLDNTVSFMQEE
HHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHC
NIKFGMIEPFIAYQKGAVDLAHRLNYDVIRVHSIQQEEMAKYSLNKVVNRYLRAVRERNV
CCCCCCCCHHHHHHCCHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
RILYLKPVIKESVPEKDLLQVNRLFIKTLSAKLVKSGYQPGKATPFNHFKTSRPLLILTG
EEEEECCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEHH
IGVILGFILLLTYLFPHLDIKLILYSGIIMVGGDLILTFLLPETLFRQLLALGASIVFPV
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LAVISQLLAGDSSQNLMVRYVKTTCITLIGALFVVTSLARTSFLLKVDQFRGVKISFLLP
HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEHHHCCCCHHHHHHH
LLIIVYYYIREYIYGDKKLNWMTEIANIMDKNIKVKHIFYTGLLVLGGLVYIGRTGNYPF
HHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCC
LPVPPWELILRERLEKLLYVRPRFKEFLIGHPFLYLGLFLKNRVKPGVMYLIIVVLASIG
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCC
QVTVINTFGHTHTPLIISLIRVVHGLWLGLLIGIILAIACKWVYNKFIRPFHN
CEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA