Definition Halothermothrix orenii H 168 chromosome, complete genome.
Accession NC_011899
Length 2,578,146

Click here to switch to the map view.

The map label for this gene is yhaN [H]

Identifier: 220931482

GI number: 220931482

Start: 687497

End: 690403

Strand: Direct

Name: yhaN [H]

Synonym: Hore_06380

Alternate gene names: 220931482

Gene position: 687497-690403 (Clockwise)

Preceding gene: 220931481

Following gene: 220931484

Centisome position: 26.67

GC content: 35.4

Gene sequence:

>2907_bases
GTGAGGATTAAGAGTCTTTATATAAAGGATTTTGGTATCTTCCGGGAGCAGAAGCTGGAAAAGATAGCTCCAGGTATGGT
TGTGATTGGTGGCCCCAATAGAGCTGGAAAAACTACTTTTCTTAATATAATTAGGTATCTCTGGTTTGGTTTTCCATCTA
AAAAAACTCTACCGCCTGCCCTGAGGAAGTATGAAGTGGAGGCAGATATTGCCCTTGACAACGAAGATGAATATAACATC
TATGTAGAAGGACAGGCTCCTCCGAAAATTACAGCTATTAGGGCAAACTCAGACCAGATAAAAAGTTTTGAAGAACTGGT
CGGGGTAGATGAGTTTACATACCATCGTTTGTTTACCATACCCCTGAATGAGCTAAATAAAATCCCCTCAGGGGTTGAAG
ATGAAGAAAGGATTCAGTCCCTTCTGCTGGGGGCAGGACTTAAAGAAATTTTATTAATTCCCAGGATTAAAGATGAACTA
TATAAAAAGGCCTATAATATAGGGAGAAAACACGGCAACCCAAGATATGGCCAGTTTAAACCCTATTTTGATAGAATTAA
AGAAGGTATAAAAAATAGACAAAAGGCCCTGTCACAGGTCCGGGAGTATGAAAAAATTAAGGATAAATTATCTAAGGTTA
ACTTTGAAATTAATGAACTGGAAAATTCAACAATTCCTGACCTGGAACATAGATTGACACTTCTGGATGTACTTCACAAC
AATTATCAGGATTTCCAGCAACTTAATAAATTAAAAATCAGTTTAAACCGACCAGAGATAAAGGACCTTTTATTAAATTT
TCCTGTTGAACTTGTGGAAAGGGTAAAGGGGCTTAAAGATAAGTATTTAAATTTGAAGGAAAATTATAATAATCTAAAAA
CAGAATTTAAAATTGAGACCGGGGTTCAGGATGTTAAAAACAATATTGAAAAATTACTGGACCATGATGACAGGATTAAA
ACCATGTTCCAAAAATTATCGGGTCTCAGGGAAAAAGTTAAACAATATAAAAAACAAAAAGAGAATTTAACGCGGAACAG
GAATGAATTATTTATTGAAATGGAACAAATAAATTCAGCCTGGCAAAGCTTTAAAGATCTTAAGGAAATTAAAACTGATG
CAATTGAACAAAAGGATCTTGAAGATTGTCTTATCAACTATACAGAATTGAGTAATACCAGGAATAATTATTTAAAAGAG
ATAAATGAACTGGAAGATGAAAAGGCCAGACTGGAGGAACAATTAAAGAGTATATCAGAAAAACATGTGGTTATTAATCT
TGGGAAATATTTTATTCTGGCCCTTATTATTACTATATCAGGGGCTGGTCTTTCTATTATAAATCCTGTTATGGGGATAA
TTATTGGGACAGGTGGTGTCTCTGTACTTGCATTGTACTGGTGGTATAAAGGATTTTTAACCCGGGTAAGTTATGAAAGA
AAGGAAGATTTAAACCAACGTCTGAAAGACATCAATGGGAAGCTAAATTATAAAAACAGTGAATTTAATAAAATTCAGGA
CAGGCTTTCTTCTGTAATTAATAAATTTCATGGGTATAGCCAAAAGCTGGGCCTTAAAGAAGAATCCCCTCCTGAACTTG
TAAGGTTGTATTTTGATAAGGTTCAGGGATTAAAGAAAAAAATTAAAGGGTGGCAACAGAGGATTGAAGATAATGAAAAA
TATGCCCGGGAACTTGATGAACGGTTATTTGAAATTATTAAGTTGCTAACTTCTTTTCCAGACATATCAGGAGGAGAAAT
AGTCAATTATTTTCTTAATTTAAAAAACTATGATTACAGAATAACATACAGTGATAAGTTGTTTTCAGCGGTAGAAGAAT
TATATGAATATCTCCAGTTAGCCCGGAGGATTAAGGAGCAAGAAGAAAAACTTGCCGGGGTTACCCGGGAAATAGTTGAC
CTAATAAAGCCCAATAATCAGGAGAAATTAATGGAAGAAATAACTATTTTTTTTAAACGGGCTGAGGATTATGAAAAATA
TGCAGAAATGAGGTCAGAGGCAAGGCTTCTGGAGGTTAAAATAACCGGAAATTTGAATACCCGGAGGGTTAGAAACTCTC
TGGAATACGCTGCAGTAAATAATATACTGGTAAATATAGATCGAAATTACATTAAATCAAATGATGGCTCCGGATTAATA
AATATACTGGATAAGTTATACCGGGATTATACTTCGCAAAAAGATATAGAAAAGGATTTTAGACAGACAGAAACTCGTCT
TGAAAAGGTGTCCGGAAAACTTGAGAATCTCAAAGAAGAAAGGAAACTTCTACAGGATAAATTAAAAGAACTGTCTACTG
TTGAAAAGTTACATAATGCCCAGGCTCAGATTGATGAAGGCAGGAACCGGTTGCAATATCTGGCTGAAAAGTATGCTCTC
TATAAGACAGCAACCTATCTTCTTGACCAGGTGCAAAACAGGTTTATTGAAAGGGCCCGGGAGACCCTGTTGAGTGATGC
CAGTAATCTATTTAATCAGATAACAGGTGGCGAATATAAAAAAATATTACCACCGGATAATCTACTCAAAATTGATTTCC
AGGCTGTATTAAGTAATGGTAATACCCAGAAAACAGTTAATGTTTTAAGCCGGGGAACAAGGGAACAGCTCTATCTGGCT
ATCAGGGTCAGTAGGTTAAGGCAAATAAAGCCACCCCTGCCTGTTATAATTGACGATTCCCTTGTAAATTTTGATAGCAG
GCATTTAGAAAAAACTATAGAAATATTATCTGACCTCGCCGAAACCCATCAGGTATTTATTTTGACCTGCCATCATCGTT
TAGTTGATTACATTGAGAGAAAGAATCATAAAACCCAGTTCTGGAAATTGGAGAAAGGTGTTTTTAACCCTTCAAGTGGA
GCAGAACTAAAAACAGTGTTAAAGTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATGAAACAAAGATACAATTGGATAAAGAAACCATGAAAACAATTATTGATCAGGCCCGACATCTGGTAATAGAAAAAAT
TTTAGAGAGGGGGGGCTGGG

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTTCCGGTTTAATTCCGGAAGTTTTTTTTAAAAAATTTATCAGGTTGATTTTTATATAAATTTCAGGAAAAAATATTAAG
ACAATATAAGTTAAATGAGG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 968; Mature: 968

Protein sequence:

>968_residues
MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPALRKYEVEADIALDNEDEYNI
YVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTIPLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDEL
YKKAYNIGRKHGNPRYGQFKPYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN
NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIETGVQDVKNNIEKLLDHDDRIK
TMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSAWQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKE
INELEDEKARLEEQLKSISEKHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER
KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDKVQGLKKKIKGWQQRIEDNEK
YARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYRITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVD
LIKPNNQEKLMEEITIFFKRAEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI
NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNAQAQIDEGRNRLQYLAEKYAL
YKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYKKILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLA
IRVSRLRQIKPPLPVIIDDSLVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG
AELKTVLK

Sequences:

>Translated_968_residues
MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPALRKYEVEADIALDNEDEYNI
YVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTIPLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDEL
YKKAYNIGRKHGNPRYGQFKPYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN
NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIETGVQDVKNNIEKLLDHDDRIK
TMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSAWQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKE
INELEDEKARLEEQLKSISEKHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER
KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDKVQGLKKKIKGWQQRIEDNEK
YARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYRITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVD
LIKPNNQEKLMEEITIFFKRAEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI
NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNAQAQIDEGRNRLQYLAEKYAL
YKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYKKILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLA
IRVSRLRQIKPPLPVIIDDSLVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG
AELKTVLK
>Mature_968_residues
MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPALRKYEVEADIALDNEDEYNI
YVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTIPLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDEL
YKKAYNIGRKHGNPRYGQFKPYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN
NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIETGVQDVKNNIEKLLDHDDRIK
TMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSAWQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKE
INELEDEKARLEEQLKSISEKHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER
KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDKVQGLKKKIKGWQQRIEDNEK
YARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYRITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVD
LIKPNNQEKLMEEITIFFKRAEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI
NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNAQAQIDEGRNRLQYLAEKYAL
YKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYKKILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLA
IRVSRLRQIKPPLPVIIDDSLVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG
AELKTVLK

Specific function: Unknown

COG id: COG4717

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Single-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 113363; Mature: 113363

Theoretical pI: Translated: 9.41; Mature: 9.41

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
0.7 %Met     (Translated Protein)
0.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
0.7 %Met     (Mature Protein)
0.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
LRKYEVEADIALDNEDEYNIYVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTI
HHHHCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEE
PLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDELYKKAYNIGRKHGNPRYGQFK
EHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
PYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHC
NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIET
CHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCHHHHHCCHHHHHCCCCEEEEECC
GVQDVKNNIEKLLDHDDRIKTMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSA
CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHHHHHH
WQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKEINELEDEKARLEEQLKSISE
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDK
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH
VQGLKKKIKGWQQRIEDNEKYARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYR
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEE
ITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVDLIKPNNQEKLMEEITIFFKR
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
AEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI
HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHCCCCCCHHH
NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNA
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAQIDEGRNRLQYLAEKYALYKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
KILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLAIRVSRLRQIKPPLPVIIDDS
CCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCH
LVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC
AELKTVLK
CCHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MRIKSLYIKDFGIFREQKLEKIAPGMVVIGGPNRAGKTTFLNIIRYLWFGFPSKKTLPPA
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHH
LRKYEVEADIALDNEDEYNIYVEGQAPPKITAIRANSDQIKSFEELVGVDEFTYHRLFTI
HHHHCCEEEEEECCCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHEEEEE
PLNELNKIPSGVEDEERIQSLLLGAGLKEILLIPRIKDELYKKAYNIGRKHGNPRYGQFK
EHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCC
PYFDRIKEGIKNRQKALSQVREYEKIKDKLSKVNFEINELENSTIPDLEHRLTLLDVLHN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHC
NYQDFQQLNKLKISLNRPEIKDLLLNFPVELVERVKGLKDKYLNLKENYNNLKTEFKIET
CHHHHHHHHHHEEECCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHCHHHHHCCHHHHHCCCCEEEEECC
GVQDVKNNIEKLLDHDDRIKTMFQKLSGLREKVKQYKKQKENLTRNRNELFIEMEQINSA
CHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEHHHHHHH
WQSFKDLKEIKTDAIEQKDLEDCLINYTELSNTRNNYLKEINELEDEKARLEEQLKSISE
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
KHVVINLGKYFILALIITISGAGLSIINPVMGIIIGTGGVSVLALYWWYKGFLTRVSYER
CCEEEEHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KEDLNQRLKDINGKLNYKNSEFNKIQDRLSSVINKFHGYSQKLGLKEESPPELVRLYFDK
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHH
VQGLKKKIKGWQQRIEDNEKYARELDERLFEIIKLLTSFPDISGGEIVNYFLNLKNYDYR
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCEE
ITYSDKLFSAVEELYEYLQLARRIKEQEEKLAGVTREIVDLIKPNNQEKLMEEITIFFKR
EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHH
AEDYEKYAEMRSEARLLEVKITGNLNTRRVRNSLEYAAVNNILVNIDRNYIKSNDGSGLI
HHHHHHHHHHHHCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECHHHHCCCCCCHHH
NILDKLYRDYTSQKDIEKDFRQTETRLEKVSGKLENLKEERKLLQDKLKELSTVEKLHNA
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
QAQIDEGRNRLQYLAEKYALYKTATYLLDQVQNRFIERARETLLSDASNLFNQITGGEYK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
KILPPDNLLKIDFQAVLSNGNTQKTVNVLSRGTREQLYLAIRVSRLRQIKPPLPVIIDDS
CCCCCCCEEHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEECCH
LVNFDSRHLEKTIEILSDLAETHQVFILTCHHRLVDYIERKNHKTQFWKLEKGVFNPSSG
HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHCCCCCCCCC
AELKTVLK
CCHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9579061; 9384377 [H]