Definition Buchnera aphidicola str. Sg (Schizaphis graminum), complete genome.
Accession NC_004061
Length 641,454

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The map label for this gene is mviN

Identifier: 21672597

GI number: 21672597

Start: 367801

End: 369345

Strand: Reverse

Name: mviN

Synonym: BUsg321

Alternate gene names: 21672597

Gene position: 369345-367801 (Counterclockwise)

Preceding gene: 21672599

Following gene: 21672596

Centisome position: 57.58

GC content: 23.62

Gene sequence:

>1545_bases
ATGAATATTCTAAAGTCTTTAATATCAGTAGGCATAATGACATTAATATCACGCATATTTGGTTTTTTTCGTGATGTTTT
AATTGCTCACATCTTCGGTGCCTCTATGTTTACTGATGCTTTTTTTATAGCTTTTAAAATTCCTAATTTATTACGTCGAA
TTTTTGCTGAAGGGGCATTTTATCAATCTTTTATTCCTATTTTAATAGATTACAAATCAAGAAAAGACAAGGAATATATA
CAAGAATTCATTAGATCTACATGTGGTTTTACTATATTAGTTTTAACTACTTTTGTTATTTTAGGAATAATTTTTTCTGA
TTATATTATTTTTATTAGCGCTCCAGGATTTTCTGAATCGTCTAAAAAATTACAATTAGCTAGTAACTTGTTAAAAATTA
TGTTTCCTTATATTTTATTTATTTCTTTATCATCATTATGTTCATCTATTTTGAATAGTTATAATTATTTTTTTATCCCT
TCTCTTTCTTCTAGTCTGTTAAACATTAGTATAATAGTTTTTTCATTTTTTTTTAGTGATTATTTTGAACCTTCTATAAT
CTCCTTAGCATGGTCTGTTATGATAGGTGGTTTTTTTCAGCTATTTTATCAATTTCCACATTTGTATAAAATAAAAATGT
TGGTTTTTCCTAAGATTAATTTTAAAAATATTGGTCTTATAAAGGTTTTAAAGAAGATGGGACCTTCTACCTTAGGTTCT
TGTGCCAATCAAATTTCTTTAATCTTTAATACTATTTTTAGCTCTCTTTTGCACTCTGGTTCAATATCTTGGATTTATTA
TGCTGATCGATTAATTGAATTTCCAATAGGTATTATAGGTGTATCTTTAAGTACTATTTTATTTACATCTTTTTCTTGTA
GTTATTCAAATAATACTCAATCAGAATATAAAATATTACTTAATTGGGGAATTCGTTTTGGTTTAATTTTGTCTTTACCT
ATTTCTGTTATATTATTTATGTTTTCAAAACCATTAGTTATTATTTTATTTCAATATGGAAAATTTACAGATTTTGATGT
TCTAATGACTCAAAAAGCACTAGAATTGTATTCTTTTGGTTTAGTTTCTTTTATTTTAGTCAAAATTTTAGTTTCAGCTT
TTTATTCTTGTCAAGAAGTCAATATTCCAATGCGAATTTCAATTTTAACATTGTTTTTAACACAATTAATGAATCCATTC
TTAATTTTTTATTTTCAGCATTCAGGTCTTGCTTTGTCTTGTAGTATAGCTAGCTGGATAAATTTTTTTTTACTTTATTG
GAAATTATATCAAAAGGGAATAATCAATTTTAAATTGAATGATTTTATTTTTATTTTTCGTTTATTAATTGCAGTATTAG
TCATGACATTTTTTTTAATTTTTATGTTATATTTTATTCCTTCTTGGAAGATTGGTTCATTTTTTGATAAGATAATACGT
TTATTTACTATTTTATCAATTTCTGGAATAGTATATTTAATTGCTTTACATTTTTTAGGAATACGTTTATTGAATTATTC
TGATAAATTATTTCAAAAAAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTATTAAAACACTCTATATGTAAAAATATATTTATTTTTTAAAAATTAATTCTAAATTATGATTATAATGTTTTAACCTC
ATAGGTTAGATTAATTTCAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTATATATGGAAAAATTAATTTAAATATATTATTTTTAATACTAATATAGTATTTGTATTATAATTTAATATTATAAGTA
TTTTTTGTCAAAAATATAAA

Product: virulence factor MviN

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 514; Mature: 514

Protein sequence:

>514_residues
MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAFYQSFIPILIDYKSRKDKEYI
QEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSESSKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIP
SLSSSLLNISIIVFSFFFSDYFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS
CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQSEYKILLNWGIRFGLILSLP
ISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFGLVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPF
LIFYFQHSGLALSCSIASWINFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR
LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK

Sequences:

>Translated_514_residues
MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAFYQSFIPILIDYKSRKDKEYI
QEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSESSKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIP
SLSSSLLNISIIVFSFFFSDYFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS
CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQSEYKILLNWGIRFGLILSLP
ISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFGLVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPF
LIFYFQHSGLALSCSIASWINFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR
LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK
>Mature_514_residues
MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAFYQSFIPILIDYKSRKDKEYI
QEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSESSKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIP
SLSSSLLNISIIVFSFFFSDYFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS
CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQSEYKILLNWGIRFGLILSLP
ISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFGLVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPF
LIFYFQHSGLALSCSIASWINFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR
LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK

Specific function: Unknown

COG id: COG0728

COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the mviN family

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=509, Percent_Identity=48.7229862475442, Blast_Score=510, Evalue=1e-146,

Paralogues:

None

Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]

Swissprot (AC and ID): MVIN_BUCAP (Q8K9L3)

Other databases:

- EMBL:   AE013218
- RefSeq:   NP_660664.1
- EnsemblBacteria:   EBBUCT00000000243
- GeneID:   1005526
- GenomeReviews:   AE013218_GR
- KEGG:   bas:BUsg321
- GeneTree:   EBGT00050000007923
- HOGENOM:   HBG731814
- OMA:   MLKITFP
- ProtClustDB:   CLSK315891
- BioCyc:   BAPH198804:BUSG321-MONOMER
- InterPro:   IPR004268
- PRINTS:   PR01806
- TIGRFAMs:   TIGR01695

Pfam domain/function: PF03023 MVIN

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59243; Mature: 59243

Theoretical pI: Translated: 9.91; Mature: 9.91

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

HASH(0x40486c78)-; HASH(0xb923f98)-; HASH(0xc0674f8)-; HASH(0xc11ff28)-; HASH(0xb0dff78)-; HASH(0xc684958)-; HASH(0xc6ce830)-; HASH(0x40482cb8)-; HASH(0xb0e05c0)-; HASH(0xc4a8d20)-; HASH(0xb2cc788)-; HASH(0xb218584)-; HASH(0xbfd57a4)-; HASH(0xc0a3a48)-;

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
YQSFIPILIDYKSRKDKEYIQEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSES
HHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCC
SKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIPSLSSSLLNISIIVFSFFFSD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHH
CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
SEYKILLNWGIRFGLILSLPISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFG
HHHEEHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPFLIFYFQHSGLALSCSIASWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEHHHHHH
NFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR
HHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCH
>Mature Secondary Structure
MNILKSLISVGIMTLISRIFGFFRDVLIAHIFGASMFTDAFFIAFKIPNLLRRIFAEGAF
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHH
YQSFIPILIDYKSRKDKEYIQEFIRSTCGFTILVLTTFVILGIIFSDYIIFISAPGFSES
HHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCC
SKKLQLASNLLKIMFPYILFISLSSLCSSILNSYNYFFIPSLSSSLLNISIIVFSFFFSD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YFEPSIISLAWSVMIGGFFQLFYQFPHLYKIKMLVFPKINFKNIGLIKVLKKMGPSTLGS
HCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHCCHHHHH
CANQISLIFNTIFSSLLHSGSISWIYYADRLIEFPIGIIGVSLSTILFTSFSCSYSNNTQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCC
SEYKILLNWGIRFGLILSLPISVILFMFSKPLVIILFQYGKFTDFDVLMTQKALELYSFG
HHHEEHEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
LVSFILVKILVSAFYSCQEVNIPMRISILTLFLTQLMNPFLIFYFQHSGLALSCSIASWI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCCCEEEEHHHHHH
NFFLLYWKLYQKGIINFKLNDFIFIFRLLIAVLVMTFFLIFMLYFIPSWKIGSFFDKIIR
HHHHHHHHHHHCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHH
LFTILSISGIVYLIALHFLGIRLLNYSDKLFQKK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHCCH

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 12089438