Definition Methanosarcina mazei Go1 chromosome, complete genome.
Accession NC_003901
Length 4,096,345

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The map label for this gene is 21227744

Identifier: 21227744

GI number: 21227744

Start: 1957242

End: 1959467

Strand: Direct

Name: 21227744

Synonym: MM_1642

Alternate gene names: NA

Gene position: 1957242-1959467 (Clockwise)

Preceding gene: 21227743

Following gene: 21227745

Centisome position: 47.78

GC content: 29.47

Gene sequence:

>2226_bases
ATGATAATACCTGACTTATTTAGATTAAACGATTGGAGTACAAGAAGGTTTAATCTATTTATATGGTCTATTCTGGTAGC
TTATGATTTTTCTTTTATCTCAAATGTGCCTTTATATAGCATAGAAATATTGTCGAAAATACTCGGATTTGTTATTCTTA
CCTTCATTCCCGGATACATTATCTTAAGAATTTTTAAAGTACATGATATTGATAGAGTGGTAACCCTTCTATTAGCTATT
GGTTTGAGTCTTTCTTTTATTATGATCTTTGGATTTACTGTGAATATGTTTCTTCCATATATTGGGGTTTCGAAGCCAAT
TTCAACTTTTCCTCTTTTCTATTCTTTAAATATTTCAATTTTAGTCTTGATGATTATCTATTATTTCAGGGATAAAAAAT
TCAATTCATCTCAAAATCAGTTACGTATTACATTTTCTCCTATGTTATTTTATTTTATTCTTCTGCCCTTATTCAGTATA
CTTGGAACAGAATCTGTGAATCATTATAATTTCAATATGCCTGTTCTGATATTACTTTTTGTAATATCATTATCCCCCAT
ATTAATCGCTTTAGATAGGATCTCAAGGGACCTTTATCCTTTTATGATTTTATCCATTTCACTCGCAATACTGTATAATA
TGAACTTAATTTCAACTCATTTATGGTCTTATGATATATTTTATGAAGCACATACTTCAAAATACGTCCTAGAAAACGGC
ATATGGAATCCAGGTAATAAAACCATGGTACCTCTCCTTTTATTCACTATTTTAAGTCCAGTTTATTCTTTAATTTGTGA
TTTAAACGTTATATGGGTTTTCAAGATAATATTCCCATTTTTTTTCTCGTTAACCCCTCTTGCCTTATATTATGTCTATA
AAGAACTGGATTTTGGAAATTACAAAATAGACTCTGAAATAGCAATGCTATCAGTATTCGTATTCATATTTTTCTATGGA
TTTTATAAAGATATGCCCGATAAACAGCATATTGCAGAGTTGTTTCTAGCGCTTATTTTGATTCTAAGTATTTTTAATAC
TCAAAAAAGAATTCTTCTTTTTATATTTTCTTTTTCCTTAGTGGTATCCCATTATGGTATAAGTTATTTTTTTGTGTTTT
CTCTTATTTTTGTATCCATGATGAGCAGATTTAGAGTTAATGCGGATACCTCCTTTTTAACACCAACCTATACTCTTTTG
TTTTCTGTACTCACATTCAGCTGGTATATCTATATCTCAGCTGGAGATGTATTTGAGGTTATCACTCAGGTTGGGTATCA
CTTTCTAAGTGGCATAAAGGATATATTTCAAGCAAATAATGATGGTAGATCAGCTTCAGCTTATTTGTCATATCTCTCTA
ATGGAATATTATGGGTTATTTATATGTTGATACATTTAATTCTCCAGTTTTTCATATTTATTGGGGTCTTGAATCTATTG
TTATCTATTATGCATAACAAAACTAAATCCTTTGAGATTGCTCTACTTACAATTATTTTTTATGCGTTTCTCTTTGTACA
ATTCTTCAAAACTTATGGAATGGGGCTCGATAGAATTTTGCAAATAACTTTAATTTTATTATCTCCTTTATCAATTTGGG
GGTATAGTTTCTGTGTAAAAAATCTAAATAGTGTGTATGCGCGTATTATTTCTAAAAGGATTTATCGTAATAAAGAAAAT
GGAAATCTAAATTTAATTTTTGAATCCACATTAACCAGAAACGAAGCTATTAATAAAAATCACATAACTAATCTCTCTAA
AAAAGCAAGACTCTGTTTTTCTATATTTTTAATGATCTTTTTTGTATTTAATTCCGGATTTATATTTTGGATGACTGGAT
ACCCACTTCCGGGCTACTGTATAAATATAAATCCAAATTCCGGTTGGCCTGTTTATTCTGAAAGTGAGATTTGTGGAGTT
GACTGGCTCAAATCTCACGAGAATGAGCATAATAGAATAGCTGTATTCAACCAGTGGGATACTATAAAGAGCAGAGATGG
TTTATTAGTCGCAGAAAATTTCTACTCAAAGGATTTAATCCCAATACAAACAAACACAACAACACTATATAATTCATATT
TATTTCTCGGGAAATATTCCGTGGATAAAGTAGAAGATGGTGAAGAAGACGTGGATTTACAAGACACATTATTTTATAAT
TCCACATTAAAAAATTCTAATAAAATATATAATAGTGAAAAATCCCATTTATATCTGGCGGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GTAATTATCTACCTGTTTATACAAACAACACTCTTAAATAAAAAAAATTAAATTTCTCTTATTTGAGGATTAATTATCTT
ACCAGAAGAGGGACCATCTG

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAACAATTTTGCACAGGGATCGTAATAAGCAGGCAAGAAAACTATTAAACTAATGACAAATGAAGGAGTTCGACAATGA
TTTCATACATTCAAACAAAA

Product: transmembrane protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 741; Mature: 741

Protein sequence:

>741_residues
MIIPDLFRLNDWSTRRFNLFIWSILVAYDFSFISNVPLYSIEILSKILGFVILTFIPGYIILRIFKVHDIDRVVTLLLAI
GLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISILVLMIIYYFRDKKFNSSQNQLRITFSPMLFYFILLPLFSI
LGTESVNHYNFNMPVLILLFVISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG
IWNPGNKTMVPLLLFTILSPVYSLICDLNVIWVFKIIFPFFFSLTPLALYYVYKELDFGNYKIDSEIAMLSVFVFIFFYG
FYKDMPDKQHIAELFLALILILSIFNTQKRILLFIFSFSLVVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLL
FSVLTFSWYIYISAGDVFEVITQVGYHFLSGIKDIFQANNDGRSASAYLSYLSNGILWVIYMLIHLILQFFIFIGVLNLL
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GNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIFFVFNSGFIFWMTGYPLPGYCININPNSGWPVYSESEICGV
DWLKSHENEHNRIAVFNQWDTIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN
STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE

Sequences:

>Translated_741_residues
MIIPDLFRLNDWSTRRFNLFIWSILVAYDFSFISNVPLYSIEILSKILGFVILTFIPGYIILRIFKVHDIDRVVTLLLAI
GLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISILVLMIIYYFRDKKFNSSQNQLRITFSPMLFYFILLPLFSI
LGTESVNHYNFNMPVLILLFVISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG
IWNPGNKTMVPLLLFTILSPVYSLICDLNVIWVFKIIFPFFFSLTPLALYYVYKELDFGNYKIDSEIAMLSVFVFIFFYG
FYKDMPDKQHIAELFLALILILSIFNTQKRILLFIFSFSLVVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLL
FSVLTFSWYIYISAGDVFEVITQVGYHFLSGIKDIFQANNDGRSASAYLSYLSNGILWVIYMLIHLILQFFIFIGVLNLL
LSIMHNKTKSFEIALLTIIFYAFLFVQFFKTYGMGLDRILQITLILLSPLSIWGYSFCVKNLNSVYARIISKRIYRNKEN
GNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIFFVFNSGFIFWMTGYPLPGYCININPNSGWPVYSESEICGV
DWLKSHENEHNRIAVFNQWDTIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN
STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE
>Mature_741_residues
MIIPDLFRLNDWSTRRFNLFIWSILVAYDFSFISNVPLYSIEILSKILGFVILTFIPGYIILRIFKVHDIDRVVTLLLAI
GLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISILVLMIIYYFRDKKFNSSQNQLRITFSPMLFYFILLPLFSI
LGTESVNHYNFNMPVLILLFVISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG
IWNPGNKTMVPLLLFTILSPVYSLICDLNVIWVFKIIFPFFFSLTPLALYYVYKELDFGNYKIDSEIAMLSVFVFIFFYG
FYKDMPDKQHIAELFLALILILSIFNTQKRILLFIFSFSLVVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLL
FSVLTFSWYIYISAGDVFEVITQVGYHFLSGIKDIFQANNDGRSASAYLSYLSNGILWVIYMLIHLILQFFIFIGVLNLL
LSIMHNKTKSFEIALLTIIFYAFLFVQFFKTYGMGLDRILQITLILLSPLSIWGYSFCVKNLNSVYARIISKRIYRNKEN
GNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIFFVFNSGFIFWMTGYPLPGYCININPNSGWPVYSESEICGV
DWLKSHENEHNRIAVFNQWDTIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN
STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE

Specific function: Unknown

COG id: COG4906

COG function: function code S; Predicted membrane protein

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 86338; Mature: 86338

Theoretical pI: Translated: 8.13; Mature: 8.13

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
3.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
3.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MIIPDLFRLNDWSTRRFNLFIWSILVAYDFSFISNVPLYSIEILSKILGFVILTFIPGYI
CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILRIFKVHDIDRVVTLLLAIGLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISI
HHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCHHEEHHHHH
LVLMIIYYFRDKKFNSSQNQLRITFSPMLFYFILLPLFSILGTESVNHYNFNMPVLILLF
HHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
VISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHEEEEEEEECCCHHHHHCC
IWNPGNKTMVPLLLFTILSPVYSLICDLNVIWVFKIIFPFFFSLTPLALYYVYKELDFGN
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
YKIDSEIAMLSVFVFIFFYGFYKDMPDKQHIAELFLALILILSIFNTQKRILLFIFSFSL
EEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
VVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLLFSVLTFSWYIYISAGDVFEV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEEEEECCHHHHH
ITQVGYHFLSGIKDIFQANNDGRSASAYLSYLSNGILWVIYMLIHLILQFFIFIGVLNLL
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LSIMHNKTKSFEIALLTIIFYAFLFVQFFKTYGMGLDRILQITLILLSPLSIWGYSFCVK
HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NLNSVYARIISKRIYRNKENGNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIF
HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECHHCCCCCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHH
FVFNSGFIFWMTGYPLPGYCININPNSGWPVYSESEICGVDWLKSHENEHNRIAVFNQWD
HHHCCCEEEEEECCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCEEEEEECCC
TIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN
CCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCEEHHHCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHEEC
STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEC
>Mature Secondary Structure
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CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ILRIFKVHDIDRVVTLLLAIGLSLSFIMIFGFTVNMFLPYIGVSKPISTFPLFYSLNISI
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VISLSPILIALDRISRDLYPFMILSISLAILYNMNLISTHLWSYDIFYEAHTSKYVLENG
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VVSHYGISYFFVFSLIFVSMMSRFRVNADTSFLTPTYTLLFSVLTFSWYIYISAGDVFEV
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NLNSVYARIISKRIYRNKENGNLNLIFESTLTRNEAINKNHITNLSKKARLCFSIFLMIF
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TIKSRDGLLVAENFYSKDLIPIQTNTTTLYNSYLFLGKYSVDKVEDGEEDVDLQDTLFYN
CCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEECCCEEHHHCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHEEC
STLKNSNKIYNSEKSHLYLAE
CCCCCCCCCCCCCCCEEEEEC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA