Definition Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699 chromosome, complete genome.
Accession NC_011374
Length 874,478

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The map label for this gene is pheT [H]

Identifier: 209554347

GI number: 209554347

Start: 552285

End: 554603

Strand: Reverse

Name: pheT [H]

Synonym: UUR10_0501

Alternate gene names: 209554347

Gene position: 554603-552285 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209554440

Following gene: 209554574

Centisome position: 63.42

GC content: 23.59

Gene sequence:

>2319_bases
ATGATTTTAAGTTTAAATTTATTGCATAAGATTAGTCCAAAACTAAAAAAGATTTCTTTAAATGAATTATGTACAGCTTT
AATGGATTTAGGTTGTGAAGTTGAAACGATTAATACCATTAAACCAAGTACTAATTTAGTTTTTGCTAAAGTATTAGAAA
AAACTAAACATCCTAATGCTAATCATTTAAATTTAGTTAAAGTTAAAGCAAATCAAGAAGTTTATGAAATTGTTTGTGGT
GCAGATAATTTTAATGTTAACAATTGAGTTGTTTTAGCTAAGATAAATGCTGAATTAGCTAATGGTTTAAAAATTACACC
ACGTGAACTAAGAGGGTATGTTTCAAATGGAATGTTGTGTGCTTATAGTGAAATTAATCCTGAAGTTGCTCATTTTTTAG
GACAAACCGATTTGGATGGAATCTTAGTTTTACATGATAGTTATGATCATTATAAAACACCAAATCAAATTTTTAATTTA
GATGATGTTATTTTAGATTTATCAATTCCCTCAAATCGAAATGATTTAAATGGTTATTTTTGAATGGCTAAAGAACTATG
TGCTTATTTTGATTTAGAATATGTAATTGATGCGACAATTAACCATCGCTCACATAAAGAGATCGTTAATGTAAGAATTT
TATCTGATGATGTTAATTCATATGGAATGATTGAAGTTAAAAATATTCAAAACTATACTTTAAAATGAAATACTAAAAGT
GTATTAGTTAATAACCAAATCAAAATTGTTAATAATTTCGCTGATAACATGAATTTTTTAACACTACTAACTGCTAATCC
TCTTCATGCTTTTGATGCACATAAGATTAGTGGTCAAATTATTGTTAAAAACGCTGAAGAAGATAGTATTTTATTAGGTT
TAGATCAAAAAGAGTATGCAATTAAAAAAGGTGATCTAATTATTGTAGATGATCAAAAGATTTTAGCATTAGCTGGTATT
ATTGGTTCAAATGATTCTAAAATTGATAATAATACAACAACTGCTTATATTGAATGCGCTAATTTTAATCCCTTATTAAT
TGCAAACACTGCACGTCGTTTAAAAATTAATACAACAGCAGCAATGCGTTTTAGTAAACCTTTAACTAATTATGTTACTA
AAGCTACTTTAAAAAAATTATTAGCACATTTTAAATTAGATGCAAAACTAATTTGTTATTTCAAACATTTAGTTCATAAT
GTTATTAAAAATAAAATTGATCAAGTAAGTGATTTTGTGGGTACAAAAATTAATTTGGACACTGCACATACTTTTTTAAA
ACGTTTGGGCTATAAAATCAATAAAACTAATTTAATTACACCAAGTCATCGATATGATGTTTTAAATGAGTTTGATGTTT
ATGAAGATATTATGAAAAAATTTAGTATCCAACAAATTAAACCCCAACCAATTAATTTTGATATTTTAAGTTTTAAAAAC
AATATTGCTTATGACTTTGAAAAAAAAGTTAGTGATTTTTTAGTTGATCAAGGATTGTTTGAATGTAAAACTTATAATTT
AAAAAGCCAAACACAAGCTTATGAAATTGATTTCTTTAATTTTCAACAAGCTTATGAAATTAATAATCCAATTTCAAATA
TACGTTCACATCTAAAACTAAATAATCTTAATTCTTTACTTGAAGTATTAGAATACAATCAAAATCAAAAAAATGAATTA
GAAAATATCTTTGAAATTTCAAAGATTAATCCAATCAATTCAAATCAACAAACAATTTTATCAATTGTTTTATGTAAACC
ATTGATTAATGCAAAACTTAATGATTCAATAGTAGTTAATAATTTCGTAACTACAAAAGCTTTATTACACGTTTTATTAA
CAAAATTAAATATTAGTTATGTATATGATACAAATCATATTGTTAATGAACTATATGAAAATAATCAATTAGCTTTAGTT
AATGAAAACAAACAGGTTTTTGGTTTTATTGGTCAATTAAAAAATCAAATCAAAAAAACATATGGTTTAAATAATGATAT
TTTTGTTATTAATTTAAATTTAACTAGTTATTTAAATCAAGAACAAGCAATTACTAAAGTGATTAAACCAAGTGTATATC
ATGATATAGTGCGTGATGTTAGTGTTAAATTAGCTTCTAATGTTGATTTAAATGATGTAATGGATAATATTGAAAAAATT
AAAAATATTAGAAAAGTTGAAATTAGTGATCTTTATGTAAAAGATGATGAAATCATTTATACTTTTAAATACTATATTAA
TGATTACTCATCTAATTTAAGTAGCGAGCAAATTGCAGTTATTGAGCAAGAAGTTAATAACTATTTAAAACAATTCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTATGAAATTGATGATATTCGTTATTTATATTCAAACAACTTTAAATTTAATGCCCAAATTAAATAAATTCCTAAATTC
AATGAAAGAGTAAAAAAAAG

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTTTATAAATTTTTATTAACAACTAAACACCCTTTAGGGTGTTTTCTTTTTGTTTTGAAAAATTTGTCCTAAAATTGTTA
TATTTGTTTTTGTAATGTGT

Product: phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta

Products: NA

Alternate protein names: Phenylalanine--tRNA ligase beta chain; PheRS [H]

Number of amino acids: Translated: 772; Mature: 772

Protein sequence:

>772_residues
MILSLNLLHKISPKLKKISLNELCTALMDLGCEVETINTIKPSTNLVFAKVLEKTKHPNANHLNLVKVKANQEVYEIVCG
ADNFNVNNWVVLAKINAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCAYSEINPEVAHFLGQTDLDGILVLHDSYDHYKTPNQIFNL
DDVILDLSIPSNRNDLNGYFWMAKELCAYFDLEYVIDATINHRSHKEIVNVRILSDDVNSYGMIEVKNIQNYTLKWNTKS
VLVNNQIKIVNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDAHKISGQIIVKNAEEDSILLGLDQKEYAIKKGDLIIVDDQKILALAGI
IGSNDSKIDNNTTTAYIECANFNPLLIANTARRLKINTTAAMRFSKPLTNYVTKATLKKLLAHFKLDAKLICYFKHLVHN
VIKNKIDQVSDFVGTKINLDTAHTFLKRLGYKINKTNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKFSIQQIKPQPINFDILSFKN
NIAYDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKSQTQAYEIDFFNFQQAYEINNPISNIRSHLKLNNLNSLLEVLEYNQNQKNEL
ENIFEISKINPINSNQQTILSIVLCKPLINAKLNDSIVVNNFVTTKALLHVLLTKLNISYVYDTNHIVNELYENNQLALV
NENKQVFGFIGQLKNQIKKTYGLNNDIFVINLNLTSYLNQEQAITKVIKPSVYHDIVRDVSVKLASNVDLNDVMDNIEKI
KNIRKVEISDLYVKDDEIIYTFKYYINDYSSNLSSEQIAVIEQEVNNYLKQF

Sequences:

>Translated_772_residues
MILSLNLLHKISPKLKKISLNELCTALMDLGCEVETINTIKPSTNLVFAKVLEKTKHPNANHLNLVKVKANQEVYEIVCG
ADNFNVNN*VVLAKINAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCAYSEINPEVAHFLGQTDLDGILVLHDSYDHYKTPNQIFNL
DDVILDLSIPSNRNDLNGYF*MAKELCAYFDLEYVIDATINHRSHKEIVNVRILSDDVNSYGMIEVKNIQNYTLK*NTKS
VLVNNQIKIVNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDAHKISGQIIVKNAEEDSILLGLDQKEYAIKKGDLIIVDDQKILALAGI
IGSNDSKIDNNTTTAYIECANFNPLLIANTARRLKINTTAAMRFSKPLTNYVTKATLKKLLAHFKLDAKLICYFKHLVHN
VIKNKIDQVSDFVGTKINLDTAHTFLKRLGYKINKTNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKFSIQQIKPQPINFDILSFKN
NIAYDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKSQTQAYEIDFFNFQQAYEINNPISNIRSHLKLNNLNSLLEVLEYNQNQKNEL
ENIFEISKINPINSNQQTILSIVLCKPLINAKLNDSIVVNNFVTTKALLHVLLTKLNISYVYDTNHIVNELYENNQLALV
NENKQVFGFIGQLKNQIKKTYGLNNDIFVINLNLTSYLNQEQAITKVIKPSVYHDIVRDVSVKLASNVDLNDVMDNIEKI
KNIRKVEISDLYVKDDEIIYTFKYYINDYSSNLSSEQIAVIEQEVNNYLKQF
>Mature_772_residues
MILSLNLLHKISPKLKKISLNELCTALMDLGCEVETINTIKPSTNLVFAKVLEKTKHPNANHLNLVKVKANQEVYEIVCG
ADNFNVNN*VVLAKINAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCAYSEINPEVAHFLGQTDLDGILVLHDSYDHYKTPNQIFNL
DDVILDLSIPSNRNDLNGYF*MAKELCAYFDLEYVIDATINHRSHKEIVNVRILSDDVNSYGMIEVKNIQNYTLK*NTKS
VLVNNQIKIVNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDAHKISGQIIVKNAEEDSILLGLDQKEYAIKKGDLIIVDDQKILALAGI
IGSNDSKIDNNTTTAYIECANFNPLLIANTARRLKINTTAAMRFSKPLTNYVTKATLKKLLAHFKLDAKLICYFKHLVHN
VIKNKIDQVSDFVGTKINLDTAHTFLKRLGYKINKTNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKFSIQQIKPQPINFDILSFKN
NIAYDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKSQTQAYEIDFFNFQQAYEINNPISNIRSHLKLNNLNSLLEVLEYNQNQKNEL
ENIFEISKINPINSNQQTILSIVLCKPLINAKLNDSIVVNNFVTTKALLHVLLTKLNISYVYDTNHIVNELYENNQLALV
NENKQVFGFIGQLKNQIKKTYGLNNDIFVINLNLTSYLNQEQAITKVIKPSVYHDIVRDVSVKLASNVDLNDVMDNIEKI
KNIRKVEISDLYVKDDEIIYTFKYYINDYSSNLSSEQIAVIEQEVNNYLKQF

Specific function: Unknown

COG id: COG0072

COG function: function code J; Phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [H]

Metaboloic importance: Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 tRNA-binding domain [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788006, Length=766, Percent_Identity=24.4125326370757, Blast_Score=180, Evalue=2e-46,

Paralogues:

None

Copy number: 1,800 Molecules/Cell In: Glucose minimal media [C]

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005146
- InterPro:   IPR005147
- InterPro:   IPR009061
- InterPro:   IPR012340
- InterPro:   IPR016027
- InterPro:   IPR004532
- InterPro:   IPR020825
- InterPro:   IPR005121
- InterPro:   IPR002547 [H]

Pfam domain/function: PF03483 B3_4; PF03484 B5; PF01588 tRNA_bind [H]

EC number: =6.1.1.20 [H]

Molecular weight: Translated: 87754; Mature: 87754

Theoretical pI: Translated: 6.93; Mature: 6.93

Prosite motif: PS50886 TRBD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.2 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MILSLNLLHKISPKLKKISLNELCTALMDLGCEVETINTIKPSTNLVFAKVLEKTKHPNA
CEEEEEHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
NHLNLVKVKANQEVYEIVCGADNFNVNNVVLAKINAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCA
CCEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEE
YSEINPEVAHFLGQTDLDGILVLHDSYDHYKTPNQIFNLDDVILDLSIPSNRNDLNGYFM
ECCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHH
AKELCAYFDLEYVIDATINHRSHKEIVNVRILSDDVNSYGMIEVKNIQNYTLKNTKSVLV
HHHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEE
NNQIKIVNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDAHKISGQIIVKNAEEDSILLGLDQKEYAIKK
CCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEECCCHHHEEEC
GDLIIVDDQKILALAGIIGSNDSKIDNNTTTAYIECANFNPLLIANTARRLKINTTAAMR
CCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEECCCCEEEEECHHHHH
FSKPLTNYVTKATLKKLLAHFKLDAKLICYFKHLVHNVIKNKIDQVSDFVGTKINLDTAH
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHH
TFLKRLGYKINKTNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKFSIQQIKPQPINFDILSFKNNIA
HHHHHHCCEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEECCCCCC
YDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKSQTQAYEIDFFNFQQAYEINNPISNIRSHLKLNNL
CCHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCH
NSLLEVLEYNQNQKNELENIFEISKINPINSNQQTILSIVLCKPLINAKLNDSIVVNNFV
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECHH
TTKALLHVLLTKLNISYVYDTNHIVNELYENNQLALVNENKQVFGFIGQLKNQIKKTYGL
HHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NNDIFVINLNLTSYLNQEQAITKVIKPSVYHDIVRDVSVKLASNVDLNDVMDNIEKIKNI
CCCEEEEEECHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
RKVEISDLYVKDDEIIYTFKYYINDYSSNLSSEQIAVIEQEVNNYLKQF
EEEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MILSLNLLHKISPKLKKISLNELCTALMDLGCEVETINTIKPSTNLVFAKVLEKTKHPNA
CEEEEEHHHHCCCHHHCCCHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCC
NHLNLVKVKANQEVYEIVCGADNFNVNNVVLAKINAELANGLKITPRELRGYVSNGMLCA
CCEEEEEEECCCEEEEEEECCCCCCCCCEEEEEECHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCEEEE
YSEINPEVAHFLGQTDLDGILVLHDSYDHYKTPNQIFNLDDVILDLSIPSNRNDLNGYFM
ECCCCHHHHHHCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCHHCCCCCEEEEEECCCCCCCCCHHHH
AKELCAYFDLEYVIDATINHRSHKEIVNVRILSDDVNSYGMIEVKNIQNYTLKNTKSVLV
HHHHHHHHCHHHEEEECCCCCCCCEEEEEEEEECCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCEEEE
NNQIKIVNNFADNMNFLTLLTANPLHAFDAHKISGQIIVKNAEEDSILLGLDQKEYAIKK
CCEEEEEECCCCCCEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCEEEECCCHHHEEEC
GDLIIVDDQKILALAGIIGSNDSKIDNNTTTAYIECANFNPLLIANTARRLKINTTAAMR
CCEEEECCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEEECCCCCEEEECCCCEEEEECHHHHH
FSKPLTNYVTKATLKKLLAHFKLDAKLICYFKHLVHNVIKNKIDQVSDFVGTKINLDTAH
HCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEECHHHH
TFLKRLGYKINKTNLITPSHRYDVLNEFDVYEDIMKKFSIQQIKPQPINFDILSFKNNIA
HHHHHHCCEECCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCCCEEEEECCCCCC
YDFEKKVSDFLVDQGLFECKTYNLKSQTQAYEIDFFNFQQAYEINNPISNIRSHLKLNNL
CCHHHHHHHHHHHCCCHHEEECCCCCCCCEEEEEEECCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHCCH
NSLLEVLEYNQNQKNELENIFEISKINPINSNQQTILSIVLCKPLINAKLNDSIVVNNFV
HHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECHH
TTKALLHVLLTKLNISYVYDTNHIVNELYENNQLALVNENKQVFGFIGQLKNQIKKTYGL
HHHHHHHHHHHHCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NNDIFVINLNLTSYLNQEQAITKVIKPSVYHDIVRDVSVKLASNVDLNDVMDNIEKIKNI
CCCEEEEEECHHHHCCHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHCC
RKVEISDLYVKDDEIIYTFKYYINDYSSNLSSEQIAVIEQEVNNYLKQF
EEEEEEEEEEECCCEEEEEEEEEEHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 11048724 [H]