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The map label for this gene is 209554176

Identifier: 209554176

GI number: 209554176

Start: 851807

End: 853429

Strand: Reverse

Name: 209554176

Synonym: UUR10_0687

Alternate gene names: NA

Gene position: 853429-851807 (Counterclockwise)

Preceding gene: 209554100

Following gene: 209554212

Centisome position: 97.59

GC content: 29.21

Gene sequence:

>1623_bases
ATGCGCTTCGATTTTTTTAAAAAATCACGAAAAACAAAAGTAAATTGGTTAACGAATCAGTTTGGCGACAAAGTTTTCAT
GAAAACCGCTGCTAAGTTATTTTTTCCAGCAATTCTTGAAGTTATTATTTTATCGTCTGTTAACTATTTTGATAGTCTTT
TCATTGCTTTATTTACACCTGATAATATGGGGGCAGCTGCAAAAACTGCAACAGTGTTAGCAACACAATTGATGTTCTTA
CCAACAATTTTTTTCTATGCTATTGTAGCAGCGGCAGGAATTTTAGCCGCACAATATTATGGTAAAAGAGATTATTTAAG
ATTTAAGGAAACAATAAACTTTATGTTATTGTTTGGTTCCATTGTAGTAGTGATATTTGTCATTATTTATATGGTAGTAC
CACTAGAAATGATTCAATTATATTCAGGAAATACTTTAGATGATTCAGCTTCTGAAGAAGCAAAACGTATTTATGATTTA
ACAAATCATTGAGCAGCAAGTTATTTACGTTGACAATCATTAACTTTAATTCCTTACATGTTTACATTCTCAATTGCGAC
TGCTTATCGTCAACACAACAATGCCATTATGCCATTGATTTCTAGTTCAATTGCGGTGTTAGTTAATATTATCTTAGACC
CAGTGTTAATTAAATATTGTGCAACAAGACCCTTTGAAGCAATTTTATTTGTGGCTATTGCTACAATTATTGCTAGATGT
ATAGATGCTGGCATTATGTTAGTTTTAACATTATTCCGCAAGAGTTATCCATACTACTTCTTTAACCATTTAAAATTAAG
TAAAAGAGTTATTAAACTAATTTTTATTCATGGTTGACAAGTATTAGTTAATGAAATTTTATTCTCAGTTGGTACAACAA
TCATTTTAATGTTCTATACAAGATATAGTCAAGATCATCGTGATGCAATTTCAACAGTTACTTTAATTATTCAATTTACT
AACTTGATTTGACCAGGGGCTGCATCAACAGTTGCTGTTTTAGTATTAGCTAATCTTGGTGCTAATAAACATGATTTGGC
AAAAGAAAATACACGAAAATTAATTAATTGAGGTATTGTTGTAGGGGTTAGCATAGGAATTATTTTATTAATTCTATCAA
CATTTGTGAACCAATTATTAAACCCACCTCTAGATTATACAGAACAAGGTTTAAAACAAGCAGCACATACTGCAACAATT
GCAATGTATTTAGAATGAATTGTAATTATGGTTGTTCTAACACAAGGTCCATATTCAGTAATTTACTTCTGTATTCGTGG
TGGTGGTAGTCGTTGATTATTAACAATCGATTGCTTATCAACTTTTATTTGATTAATTATTATGGGTTGTGTAACACATA
TTAATGTTCCAGAAAATTATAGTGATCGTTTACATGTTGTGCTTTTATTCTTCATCATGGAATCTCAAAATATTTCTAAA
TTAATTATGGCTATAGTTATCTTTAAAAAGACAAATTGAGCACAAAATTTAGTTGATGAAGAAAAAGAAATTACTTCTGA
AATTGGTAATGAAAAAGAAGAAAAGCCAAAAAAACAATTAGAATCAAAAATAGAAAATAAAGTGATTAATACTAATTCAC
AAGGTGTGATGAATGAAATTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
ATTGTTTAAAAAGTCGTTATAGATTATTTATTGAAGCTAAATAAAAACTCATTCATTTATCTTTTAGAAAACAACTAAAA
GCATTTTAAAGGAGAAACAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TGATAATAATTATCAAAAATGAATCCTTGATTCTTTAGCTGATCAAAAGATTTTTGAACCAACTCCTATACAAACAAAAG
CTATACCATTAATTAGTAAA

Product: DNA damage inducible protein - mate transporter family

Products: NA

Alternate protein names: Mate Efflux Family Protein; DNA Damage Inducible Protein; MATE Transporter Family DNA Damage Inducible Protein; Na+ Driven Multidrug Efflux Pump; Multi Anti Extrusion Family Protein

Number of amino acids: Translated: 540; Mature: 540

Protein sequence:

>540_residues
MRFDFFKKSRKTKVNWLTNQFGDKVFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTPDNMGAAAKTATVLATQLMFL
PTIFFYAIVAAAGILAAQYYGKRDYLRFKETINFMLLFGSIVVVIFVIIYMVVPLEMIQLYSGNTLDDSASEEAKRIYDL
TNHWAASYLRWQSLTLIPYMFTFSIATAYRQHNNAIMPLISSSIAVLVNIILDPVLIKYCATRPFEAILFVAIATIIARC
IDAGIMLVLTLFRKSYPYYFFNHLKLSKRVIKLIFIHGWQVLVNEILFSVGTTIILMFYTRYSQDHRDAISTVTLIIQFT
NLIWPGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLINWGIVVGVSIGIILLILSTFVNQLLNPPLDYTEQGLKQAAHTATI
AMYLEWIVIMVVLTQGPYSVIYFCIRGGGSRWLLTIDCLSTFIWLIIMGCVTHINVPENYSDRLHVVLLFFIMESQNISK
LIMAIVIFKKTNWAQNLVDEEKEITSEIGNEKEEKPKKQLESKIENKVINTNSQGVMNEI

Sequences:

>Translated_540_residues
MRFDFFKKSRKTKVNWLTNQFGDKVFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTPDNMGAAAKTATVLATQLMFL
PTIFFYAIVAAAGILAAQYYGKRDYLRFKETINFMLLFGSIVVVIFVIIYMVVPLEMIQLYSGNTLDDSASEEAKRIYDL
TNH*AASYLR*QSLTLIPYMFTFSIATAYRQHNNAIMPLISSSIAVLVNIILDPVLIKYCATRPFEAILFVAIATIIARC
IDAGIMLVLTLFRKSYPYYFFNHLKLSKRVIKLIFIHG*QVLVNEILFSVGTTIILMFYTRYSQDHRDAISTVTLIIQFT
NLI*PGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLIN*GIVVGVSIGIILLILSTFVNQLLNPPLDYTEQGLKQAAHTATI
AMYLE*IVIMVVLTQGPYSVIYFCIRGGGSR*LLTIDCLSTFI*LIIMGCVTHINVPENYSDRLHVVLLFFIMESQNISK
LIMAIVIFKKTN*AQNLVDEEKEITSEIGNEKEEKPKKQLESKIENKVINTNSQGVMNEI
>Mature_540_residues
MRFDFFKKSRKTKVNWLTNQFGDKVFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTPDNMGAAAKTATVLATQLMFL
PTIFFYAIVAAAGILAAQYYGKRDYLRFKETINFMLLFGSIVVVIFVIIYMVVPLEMIQLYSGNTLDDSASEEAKRIYDL
TNH*AASYLR*QSLTLIPYMFTFSIATAYRQHNNAIMPLISSSIAVLVNIILDPVLIKYCATRPFEAILFVAIATIIARC
IDAGIMLVLTLFRKSYPYYFFNHLKLSKRVIKLIFIHG*QVLVNEILFSVGTTIILMFYTRYSQDHRDAISTVTLIIQFT
NLI*PGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLIN*GIVVGVSIGIILLILSTFVNQLLNPPLDYTEQGLKQAAHTATI
AMYLE*IVIMVVLTQGPYSVIYFCIRGGGSR*LLTIDCLSTFI*LIIMGCVTHINVPENYSDRLHVVLLFFIMESQNISK
LIMAIVIFKKTN*AQNLVDEEKEITSEIGNEKEEKPKKQLESKIENKVINTNSQGVMNEI

Specific function: Unknown

COG id: COG0534

COG function: function code V; Na+-driven multidrug efflux pump

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 59534; Mature: 59534

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.9 %Cys     (Translated Protein)
3.1 %Met     (Translated Protein)
4.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.9 %Cys     (Mature Protein)
3.1 %Met     (Mature Protein)
4.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRFDFFKKSRKTKVNWLTNQFGDKVFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTP
CCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHEEEEECC
DNMGAAAKTATVLATQLMFLPTIFFYAIVAAAGILAAQYYGKRDYLRFKETINFMLLFGS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVVVIFVIIYMVVPLEMIQLYSGNTLDDSASEEAKRIYDLTNHAASYLRQSLTLIPYMFT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSIATAYRQHNNAIMPLISSSIAVLVNIILDPVLIKYCATRPFEAILFVAIATIIARCID
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGIMLVLTLFRKSYPYYFFNHLKLSKRVIKLIFIHGQVLVNEILFSVGTTIILMFYTRYS
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QDHRDAISTVTLIIQFTNLIPGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLINGIVVGVSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIILLILSTFVNQLLNPPLDYTEQGLKQAAHTATIAMYLEIVIMVVLTQGPYSVIYFCIR
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEEE
GGGSRLLTIDCLSTFILIIMGCVTHINVPENYSDRLHVVLLFFIMESQNISKLIMAIVIF
CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
KKTNAQNLVDEEKEITSEIGNEKEEKPKKQLESKIENKVINTNSQGVMNEI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRFDFFKKSRKTKVNWLTNQFGDKVFMKTAAKLFFPAILEVIILSSVNYFDSLFIALFTP
CCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHEEEEECC
DNMGAAAKTATVLATQLMFLPTIFFYAIVAAAGILAAQYYGKRDYLRFKETINFMLLFGS
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IVVVIFVIIYMVVPLEMIQLYSGNTLDDSASEEAKRIYDLTNHAASYLRQSLTLIPYMFT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSIATAYRQHNNAIMPLISSSIAVLVNIILDPVLIKYCATRPFEAILFVAIATIIARCID
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AGIMLVLTLFRKSYPYYFFNHLKLSKRVIKLIFIHGQVLVNEILFSVGTTIILMFYTRYS
HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QDHRDAISTVTLIIQFTNLIPGAASTVAVLVLANLGANKHDLAKENTRKLINGIVVGVSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GIILLILSTFVNQLLNPPLDYTEQGLKQAAHTATIAMYLEIVIMVVLTQGPYSVIYFCIR
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHEEEEEE
GGGSRLLTIDCLSTFILIIMGCVTHINVPENYSDRLHVVLLFFIMESQNISKLIMAIVIF
CCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHH
KKTNAQNLVDEEKEITSEIGNEKEEKPKKQLESKIENKVINTNSQGVMNEI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA