| Definition | Borrelia duttonii Ly, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_011229 |
| Length | 931,674 |
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The map label for this gene is recN
Identifier: 203284231
GI number: 203284231
Start: 332210
End: 333796
Strand: Reverse
Name: recN
Synonym: BDU_313
Alternate gene names: NA
Gene position: 333796-332210 (Counterclockwise)
Preceding gene: 203284232
Following gene: 203284230
Centisome position: 35.83
GC content: 23.06
Gene sequence:
>1587_bases ATGTGTCATATATTGATTGAACTTTTTATAAAAAATTTGATTTTAATTAAAAAGTTTTATATGAGGCTAAATGTGGGATT ATTTGCATTTGAGGATGAATCTGATAATATCAGGGGTATATTGTTGTTGTCTTTATTTTATTATTTATTTGGTTACAAAA TTAAACATGATGTAATTTCTAATGAAGGATGTAGAGATGTTTTAGTTGCTAAATTTCAAGCAAGTGATGAGTTTAGACGT TGTTTATTTTTTAGGGGAATTTTGGTCAAAGATTTAAAAACAATAATATTTGATTTTGTAAATGTCATTGTGGGTCATTA TTATGTCAATGACAAGCCAATTTCTATTTTCGTATTAAATTCGATTTTTAATATGGAATTTAAAATTTGTTTTCAAAATT GGGAATATTTATTTTTAAAAAATATTTTAGATTGTCTTAATATTTTGAATGATTATGTTAATTTAAATATTAAATTAGAA ACATATAAATTAGAGTTTAAATCGTATATTAGGTGTTTAAATAGTTATTATGGTTTTATTTTAAAACAAAAATTGTATGG TGATAATATAGAGAAATATGAAAAAACAATTAAAAATGAACTTAAAAGTTACAAATCTATATATAATTCAATCTTAAATT TAAGAAATGTTTTAAACTTGGATGATAATGTTTGTTGTTTAAGAGAGATAATAAAGGTGATTTGTGATGCTGAGTATTTT TTAAAAGTAAATATTTGTTATTTTGAATTTGAAAATTGTTTTAAAAATTTTTACTATGAACTTGAGGATATTGGTCACGA TTATAGTGGAGTTTGTCTTGGAAAAGCTTGTGATGAAAATGAGCTTGAATTAGTAGATAGACGTTTATATTTTTTTCCTT GTCTTAATAAAAAATATGGACCAAATTTTAAAAATGTTATAGTGTTAGTAAATAAGTATAGTGAGATTATTAATTTGTTG CTTAATATTGCAACATTTAAATTAGCTAATGAGCAAAAATTAAATGTTTTGTTTGAAAATTTGCAAAAATTATCATTTGG TATTTCAAATATTATAAAAACAGTTGCTTTAAAATTTGCATCGGGAGTAATTGAGATTTTTCATAAATTTAATATGAGGG ATGTAAAATTCTTTGTATCAGTATTTGAAGGTAAAATGAATTTGGCAGCTGTAGGTGATTTAAAGTTTTTTATTTCTAAT TATATTGCTTTAAAAGTGCAATCAATAATGTATAGAGTTGCATCTGTAGGGGAGATTTTAAAAACAATATTGACTATTCA GAGTGTTCAAAGCATTGATGATAATCATATAATAGTTAATGGTATTGATTATGCTATAGAGAGTAAGTTTAATGTAACTT TGGGTAAATATTTGAAAAGTTTATCGCAAAATATGCATATATTTATTGTCACTTATCTTACTAATATTGCAAACTTTTTA TATTTTAGTAAAGAAAAGTGTATTAAAAGAGAATTTGTGCTTAAGGAGGTGTCTTTGTTGTTTGCCTATGAGAGTGTTTT AGGAATTGTTAGAATGCTTTATGGTAATATTAGTAATATTAATTTTGGGTATGTAGTAGTCTTTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases ATAATAAAAGTTTACGTTTTGCATCCTTTTGTACGGATACTTTTGTTAGAAGACTGAAAAATAAGTTATTATAGACTATG GTTTTATAATAATTTATTTT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAGTAATAATTGATTGCAAGTGTAGGTATTTATGGATTTAGTGCATAATGAAAATTATCAAAAAATTTTGTTTATTGATA GTCTTATTTTGCAAACTTTA
Product: DNA repair ATPase
Products: NA
Alternate protein names: ATPase Involved In DNA Repair; DNA Repair ATPase
Number of amino acids: Translated: 528; Mature: 528
Protein sequence:
>528_residues MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVISNEGCRDVLVAKFQASDEFRR CLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLNSIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLE TYKLEFKSYIRCLNSYYGFILKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYGPNFKNVIVLVNKYSEIINLL LNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFASGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISN YIALKVQSIMYRVASVGEILKTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF
Sequences:
>Translated_528_residues MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVISNEGCRDVLVAKFQASDEFRR CLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLNSIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLE TYKLEFKSYIRCLNSYYGFILKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYGPNFKNVIVLVNKYSEIINLL LNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFASGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISN YIALKVQSIMYRVASVGEILKTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF >Mature_528_residues MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVISNEGCRDVLVAKFQASDEFRR CLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLNSIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLE TYKLEFKSYIRCLNSYYGFILKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYGPNFKNVIVLVNKYSEIINLL LNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFASGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISN YIALKVQSIMYRVASVGEILKTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF
Specific function: Unknown
COG id: COG0497
COG function: function code L; ATPase involved in DNA repair
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 61896; Mature: 61896
Theoretical pI: Translated: 8.33; Mature: 8.33
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
2.8 %Cys (Translated Protein) 1.5 %Met (Translated Protein) 4.4 %Cys+Met (Translated Protein) 2.8 %Cys (Mature Protein) 1.5 %Met (Mature Protein) 4.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVIS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHC NEGCRDVLVAKFQASDEFRRCLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLN CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEE SIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLETYKLEFKSYIRCLNSYYGFI HHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH LKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEE LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYG EEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCC PNFKNVIVLVNKYSEIINLLLNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFA CCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISNYIALKVQSIMYRVASVGEIL HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHH YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEC >Mature Secondary Structure MCHILIELFIKNLILIKKFYMRLNVGLFAFEDESDNIRGILLLSLFYYLFGYKIKHDVIS CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHC NEGCRDVLVAKFQASDEFRRCLFFRGILVKDLKTIIFDFVNVIVGHYYVNDKPISIFVLN CCCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCEEEEEEE SIFNMEFKICFQNWEYLFLKNILDCLNILNDYVNLNIKLETYKLEFKSYIRCLNSYYGFI HHHCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHH LKQKLYGDNIEKYEKTIKNELKSYKSIYNSILNLRNVLNLDDNVCCLREIIKVICDAEYF HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCEEE LKVNICYFEFENCFKNFYYELEDIGHDYSGVCLGKACDENELELVDRRLYFFPCLNKKYG EEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEECCCCCCCHHHHHHHHHEEEECCCCCCC PNFKNVIVLVNKYSEIINLLLNIATFKLANEQKLNVLFENLQKLSFGISNIIKTVALKFA CCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SGVIEIFHKFNMRDVKFFVSVFEGKMNLAAVGDLKFFISNYIALKVQSIMYRVASVGEIL HHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KTILTIQSVQSIDDNHIIVNGIDYAIESKFNVTLGKYLKSLSQNMHIFIVTYLTNIANFL HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCHHHCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEHHHHHHHHHHH YFSKEKCIKREFVLKEVSLLFAYESVLGIVRMLYGNISNINFGYVVVF HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA