| Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010718 |
| Length | 3,165,557 |
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The map label for this gene is 188587497
Identifier: 188587497
GI number: 188587497
Start: 3141576
End: 3142988
Strand: Reverse
Name: 188587497
Synonym: Nther_2908
Alternate gene names: NA
Gene position: 3142988-3141576 (Counterclockwise)
Preceding gene: 188587498
Following gene: 188587495
Centisome position: 99.29
GC content: 36.87
Gene sequence:
>1413_bases ATGACTGAGTACTCCGTTGGTTTTAGCATTTTGCTCTTAGGTATGCTATTATTAATTGGAAAATTTATTAGGGTTAAAAT CACTTTATTACAGGATTTATTTCTCCCTAGTTCTGTAATAGCAGGTTTTGTAGCTTTATTATTGGGCCCAGAAGTTCTAG GTAATATAGTAAATCTAACTGACGTATTTCACTGGTCTGAGGCAGGTCTATTTCCTAAACATAGCCTGGAAACTTGGGGG TATTTACCTGCTCTAATGATCAATGTAGTTTTTGCCGCTCTTTTTCTTGGAAAGAAACTGCCAACTTTAAGTAAGGTTTG GAATTTGGCGGGACCTCAAATAGTTTTAGGGTATATATTTTCTTTTGGTCAATATATTGTAGGTCTACTATTAGTTATTT TCTTTTTAACTCCTGTCTTCGGAGTTGATCCATTAGCAGGAGCATTAATTGAGATTGGTTTTGTAGGAGGTCATGGTACA GCAGCTGGATTGGGAGACACCTTTGCGGAAATGGGCTTTGAAGACGGAGAAGCACTTGCTACAGGTATGGCTACAGTTGG AGTATTAGGAGGAGCCATTATTGGTATCACTCTGATTAATTGGGGTGTTAGAAAGCAAAAGTTTCAAAACAAAACTGAAC CTCAAACAAGAGATGATGTTGAAAAGAAAGGATTAACTGAGCTAGATCAAAGACCTCCCGCCGGTCACCTTAGCACTAAA GCCGAATCTATTGAACCATTATCATTGCATTTTGGGTATATTGCTTTGTCAATTATATTGGGTTACGGTATTTTACAAGG ACTTGTTTGGATAGAATCCTTGACCTGGGGAAGTGCTACTGGTGTTTATTTAATTGAATACGTCCCTCTCTTTCCTCTGG CAATGGTGGGAGGTATTATAGTTCAGTATGTTTTGGATAGGATTGATGTTTATAAAACTCTCGATCCGGATTTGATTTCT AGAATTCAAGGCTTTGCTTTAGATATTTTGATAGTTAGTTCTTTGGCTACTCTTGAATTAGCTGTAATTAGGGATAATAT AGTTCCGTTTACGGTGTTAGCTCTTGGTGGAATTATTTGGACTGTATTTGTCTTTAGAGTACTTGCTCCTAGAATTTTAA CTTCGTTTTGGTTTGAAAGGGGTATAGGTGACTTTGGACAGTCTATGGGAGTTGCCGCTACTGGTTTATTATTAATGAAA GTAGCAGATCCAGATAACGATACACCTGCCCTAGAAAGTTTTGGGTATAAACAAATTCTTTTTGAACCTATCGTTGGTGG AGGTTTGTTTACAGCAGCCTCGGCACCACTAATTTTCCAATTTGGAGCTGTTAATATATTAATTTTTCTTTCAATTATTA CAGTAGCGTTGTTGATTTTTGGATTACTCTACTTTAAGAAAATGAGGATATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTCCATGTCCATCTGAAATTGACTAAAGGTTTTAATACCGGCTTTTAAAACAAATTGAGACAGTTGAATCAAATAAACTT CGCCATAGGAGGTGGTGCTC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTAATAAAAAAAGAGCGGCCTTAGCCAATGTTCTAATAGGCTAAGGCCGCTTAAATTAACTCAACCGTTCTACATTATGT ACCAATGGGATTAGTTTATC
Product: sodium/glutamate symporter
Products: NA
Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; Na+/Glutamate Symporter-Like Protein; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein; Integral Membrane Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily
Number of amino acids: Translated: 470; Mature: 469
Protein sequence:
>470_residues MTEYSVGFSILLLGMLLLIGKFIRVKITLLQDLFLPSSVIAGFVALLLGPEVLGNIVNLTDVFHWSEAGLFPKHSLETWG YLPALMINVVFAALFLGKKLPTLSKVWNLAGPQIVLGYIFSFGQYIVGLLLVIFFLTPVFGVDPLAGALIEIGFVGGHGT AAGLGDTFAEMGFEDGEALATGMATVGVLGGAIIGITLINWGVRKQKFQNKTEPQTRDDVEKKGLTELDQRPPAGHLSTK AESIEPLSLHFGYIALSIILGYGILQGLVWIESLTWGSATGVYLIEYVPLFPLAMVGGIIVQYVLDRIDVYKTLDPDLIS RIQGFALDILIVSSLATLELAVIRDNIVPFTVLALGGIIWTVFVFRVLAPRILTSFWFERGIGDFGQSMGVAATGLLLMK VADPDNDTPALESFGYKQILFEPIVGGGLFTAASAPLIFQFGAVNILIFLSIITVALLIFGLLYFKKMRI
Sequences:
>Translated_470_residues MTEYSVGFSILLLGMLLLIGKFIRVKITLLQDLFLPSSVIAGFVALLLGPEVLGNIVNLTDVFHWSEAGLFPKHSLETWG YLPALMINVVFAALFLGKKLPTLSKVWNLAGPQIVLGYIFSFGQYIVGLLLVIFFLTPVFGVDPLAGALIEIGFVGGHGT AAGLGDTFAEMGFEDGEALATGMATVGVLGGAIIGITLINWGVRKQKFQNKTEPQTRDDVEKKGLTELDQRPPAGHLSTK AESIEPLSLHFGYIALSIILGYGILQGLVWIESLTWGSATGVYLIEYVPLFPLAMVGGIIVQYVLDRIDVYKTLDPDLIS RIQGFALDILIVSSLATLELAVIRDNIVPFTVLALGGIIWTVFVFRVLAPRILTSFWFERGIGDFGQSMGVAATGLLLMK VADPDNDTPALESFGYKQILFEPIVGGGLFTAASAPLIFQFGAVNILIFLSIITVALLIFGLLYFKKMRI >Mature_469_residues TEYSVGFSILLLGMLLLIGKFIRVKITLLQDLFLPSSVIAGFVALLLGPEVLGNIVNLTDVFHWSEAGLFPKHSLETWGY LPALMINVVFAALFLGKKLPTLSKVWNLAGPQIVLGYIFSFGQYIVGLLLVIFFLTPVFGVDPLAGALIEIGFVGGHGTA AGLGDTFAEMGFEDGEALATGMATVGVLGGAIIGITLINWGVRKQKFQNKTEPQTRDDVEKKGLTELDQRPPAGHLSTKA ESIEPLSLHFGYIALSIILGYGILQGLVWIESLTWGSATGVYLIEYVPLFPLAMVGGIIVQYVLDRIDVYKTLDPDLISR IQGFALDILIVSSLATLELAVIRDNIVPFTVLALGGIIWTVFVFRVLAPRILTSFWFERGIGDFGQSMGVAATGLLLMKV ADPDNDTPALESFGYKQILFEPIVGGGLFTAASAPLIFQFGAVNILIFLSIITVALLIFGLLYFKKMRI
Specific function: Unknown
COG id: COG0786
COG function: function code E; Na+/glutamate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 50879; Mature: 50748
Theoretical pI: Translated: 4.92; Mature: 4.92
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 1.9 %Met (Translated Protein) 1.9 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 1.7 %Met (Mature Protein) 1.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MTEYSVGFSILLLGMLLLIGKFIRVKITLLQDLFLPSSVIAGFVALLLGPEVLGNIVNLT CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH DVFHWSEAGLFPKHSLETWGYLPALMINVVFAALFLGKKLPTLSKVWNLAGPQIVLGYIF HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHH SFGQYIVGLLLVIFFLTPVFGVDPLAGALIEIGFVGGHGTAAGLGDTFAEMGFEDGEALA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHH TGMATVGVLGGAIIGITLINWGVRKQKFQNKTEPQTRDDVEKKGLTELDQRPPAGHLSTK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCC AESIEPLSLHFGYIALSIILGYGILQGLVWIESLTWGSATGVYLIEYVPLFPLAMVGGII HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VQYVLDRIDVYKTLDPDLISRIQGFALDILIVSSLATLELAVIRDNIVPFTVLALGGIIW HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH TVFVFRVLAPRILTSFWFERGIGDFGQSMGVAATGLLLMKVADPDNDTPALESFGYKQIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHCCHHHHH FEPIVGGGLFTAASAPLIFQFGAVNILIFLSIITVALLIFGLLYFKKMRI HHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure TEYSVGFSILLLGMLLLIGKFIRVKITLLQDLFLPSSVIAGFVALLLGPEVLGNIVNLT CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH DVFHWSEAGLFPKHSLETWGYLPALMINVVFAALFLGKKLPTLSKVWNLAGPQIVLGYIF HHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHH SFGQYIVGLLLVIFFLTPVFGVDPLAGALIEIGFVGGHGTAAGLGDTFAEMGFEDGEALA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHEEECCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCHHHH TGMATVGVLGGAIIGITLINWGVRKQKFQNKTEPQTRDDVEKKGLTELDQRPPAGHLSTK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCHHHHCCCCCCCCCCC AESIEPLSLHFGYIALSIILGYGILQGLVWIESLTWGSATGVYLIEYVPLFPLAMVGGII HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VQYVLDRIDVYKTLDPDLISRIQGFALDILIVSSLATLELAVIRDNIVPFTVLALGGIIW HHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHH TVFVFRVLAPRILTSFWFERGIGDFGQSMGVAATGLLLMKVADPDNDTPALESFGYKQIL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHEEEECCCCCCCCHHHHCCHHHHH FEPIVGGGLFTAASAPLIFQFGAVNILIFLSIITVALLIFGLLYFKKMRI HHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA