Definition Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome.
Accession NC_010718
Length 3,165,557

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The map label for this gene is 188587497

Identifier: 188587497

GI number: 188587497

Start: 3141576

End: 3142988

Strand: Reverse

Name: 188587497

Synonym: Nther_2908

Alternate gene names: NA

Gene position: 3142988-3141576 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188587498

Following gene: 188587495

Centisome position: 99.29

GC content: 36.87

Gene sequence:

>1413_bases
ATGACTGAGTACTCCGTTGGTTTTAGCATTTTGCTCTTAGGTATGCTATTATTAATTGGAAAATTTATTAGGGTTAAAAT
CACTTTATTACAGGATTTATTTCTCCCTAGTTCTGTAATAGCAGGTTTTGTAGCTTTATTATTGGGCCCAGAAGTTCTAG
GTAATATAGTAAATCTAACTGACGTATTTCACTGGTCTGAGGCAGGTCTATTTCCTAAACATAGCCTGGAAACTTGGGGG
TATTTACCTGCTCTAATGATCAATGTAGTTTTTGCCGCTCTTTTTCTTGGAAAGAAACTGCCAACTTTAAGTAAGGTTTG
GAATTTGGCGGGACCTCAAATAGTTTTAGGGTATATATTTTCTTTTGGTCAATATATTGTAGGTCTACTATTAGTTATTT
TCTTTTTAACTCCTGTCTTCGGAGTTGATCCATTAGCAGGAGCATTAATTGAGATTGGTTTTGTAGGAGGTCATGGTACA
GCAGCTGGATTGGGAGACACCTTTGCGGAAATGGGCTTTGAAGACGGAGAAGCACTTGCTACAGGTATGGCTACAGTTGG
AGTATTAGGAGGAGCCATTATTGGTATCACTCTGATTAATTGGGGTGTTAGAAAGCAAAAGTTTCAAAACAAAACTGAAC
CTCAAACAAGAGATGATGTTGAAAAGAAAGGATTAACTGAGCTAGATCAAAGACCTCCCGCCGGTCACCTTAGCACTAAA
GCCGAATCTATTGAACCATTATCATTGCATTTTGGGTATATTGCTTTGTCAATTATATTGGGTTACGGTATTTTACAAGG
ACTTGTTTGGATAGAATCCTTGACCTGGGGAAGTGCTACTGGTGTTTATTTAATTGAATACGTCCCTCTCTTTCCTCTGG
CAATGGTGGGAGGTATTATAGTTCAGTATGTTTTGGATAGGATTGATGTTTATAAAACTCTCGATCCGGATTTGATTTCT
AGAATTCAAGGCTTTGCTTTAGATATTTTGATAGTTAGTTCTTTGGCTACTCTTGAATTAGCTGTAATTAGGGATAATAT
AGTTCCGTTTACGGTGTTAGCTCTTGGTGGAATTATTTGGACTGTATTTGTCTTTAGAGTACTTGCTCCTAGAATTTTAA
CTTCGTTTTGGTTTGAAAGGGGTATAGGTGACTTTGGACAGTCTATGGGAGTTGCCGCTACTGGTTTATTATTAATGAAA
GTAGCAGATCCAGATAACGATACACCTGCCCTAGAAAGTTTTGGGTATAAACAAATTCTTTTTGAACCTATCGTTGGTGG
AGGTTTGTTTACAGCAGCCTCGGCACCACTAATTTTCCAATTTGGAGCTGTTAATATATTAATTTTTCTTTCAATTATTA
CAGTAGCGTTGTTGATTTTTGGATTACTCTACTTTAAGAAAATGAGGATATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCCATGTCCATCTGAAATTGACTAAAGGTTTTAATACCGGCTTTTAAAACAAATTGAGACAGTTGAATCAAATAAACTT
CGCCATAGGAGGTGGTGCTC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTAATAAAAAAAGAGCGGCCTTAGCCAATGTTCTAATAGGCTAAGGCCGCTTAAATTAACTCAACCGTTCTACATTATGT
ACCAATGGGATTAGTTTATC

Product: sodium/glutamate symporter

Products: NA

Alternate protein names: Na+/Glutamate Symporter; Sodium/Solute Symporter Family Protein; Na+/Glutamate Symporter-Like Protein; SodiumSolute Symporter ESS Family; Sodium/Glutamate Symport Carrier Protein; Integral Membrane Protein; Sodium/Glutamate Symporter Superfamily

Number of amino acids: Translated: 470; Mature: 469

Protein sequence:

>470_residues
MTEYSVGFSILLLGMLLLIGKFIRVKITLLQDLFLPSSVIAGFVALLLGPEVLGNIVNLTDVFHWSEAGLFPKHSLETWG
YLPALMINVVFAALFLGKKLPTLSKVWNLAGPQIVLGYIFSFGQYIVGLLLVIFFLTPVFGVDPLAGALIEIGFVGGHGT
AAGLGDTFAEMGFEDGEALATGMATVGVLGGAIIGITLINWGVRKQKFQNKTEPQTRDDVEKKGLTELDQRPPAGHLSTK
AESIEPLSLHFGYIALSIILGYGILQGLVWIESLTWGSATGVYLIEYVPLFPLAMVGGIIVQYVLDRIDVYKTLDPDLIS
RIQGFALDILIVSSLATLELAVIRDNIVPFTVLALGGIIWTVFVFRVLAPRILTSFWFERGIGDFGQSMGVAATGLLLMK
VADPDNDTPALESFGYKQILFEPIVGGGLFTAASAPLIFQFGAVNILIFLSIITVALLIFGLLYFKKMRI

Sequences:

>Translated_470_residues
MTEYSVGFSILLLGMLLLIGKFIRVKITLLQDLFLPSSVIAGFVALLLGPEVLGNIVNLTDVFHWSEAGLFPKHSLETWG
YLPALMINVVFAALFLGKKLPTLSKVWNLAGPQIVLGYIFSFGQYIVGLLLVIFFLTPVFGVDPLAGALIEIGFVGGHGT
AAGLGDTFAEMGFEDGEALATGMATVGVLGGAIIGITLINWGVRKQKFQNKTEPQTRDDVEKKGLTELDQRPPAGHLSTK
AESIEPLSLHFGYIALSIILGYGILQGLVWIESLTWGSATGVYLIEYVPLFPLAMVGGIIVQYVLDRIDVYKTLDPDLIS
RIQGFALDILIVSSLATLELAVIRDNIVPFTVLALGGIIWTVFVFRVLAPRILTSFWFERGIGDFGQSMGVAATGLLLMK
VADPDNDTPALESFGYKQILFEPIVGGGLFTAASAPLIFQFGAVNILIFLSIITVALLIFGLLYFKKMRI
>Mature_469_residues
TEYSVGFSILLLGMLLLIGKFIRVKITLLQDLFLPSSVIAGFVALLLGPEVLGNIVNLTDVFHWSEAGLFPKHSLETWGY
LPALMINVVFAALFLGKKLPTLSKVWNLAGPQIVLGYIFSFGQYIVGLLLVIFFLTPVFGVDPLAGALIEIGFVGGHGTA
AGLGDTFAEMGFEDGEALATGMATVGVLGGAIIGITLINWGVRKQKFQNKTEPQTRDDVEKKGLTELDQRPPAGHLSTKA
ESIEPLSLHFGYIALSIILGYGILQGLVWIESLTWGSATGVYLIEYVPLFPLAMVGGIIVQYVLDRIDVYKTLDPDLISR
IQGFALDILIVSSLATLELAVIRDNIVPFTVLALGGIIWTVFVFRVLAPRILTSFWFERGIGDFGQSMGVAATGLLLMKV
ADPDNDTPALESFGYKQILFEPIVGGGLFTAASAPLIFQFGAVNILIFLSIITVALLIFGLLYFKKMRI

Specific function: Unknown

COG id: COG0786

COG function: function code E; Na+/glutamate symporter

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 50879; Mature: 50748

Theoretical pI: Translated: 4.92; Mature: 4.92

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure 
TEYSVGFSILLLGMLLLIGKFIRVKITLLQDLFLPSSVIAGFVALLLGPEVLGNIVNLT
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHH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HHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA