Definition Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome.
Accession NC_010718
Length 3,165,557

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The map label for this gene is 188585594

Identifier: 188585594

GI number: 188585594

Start: 1025658

End: 1028537

Strand: Reverse

Name: 188585594

Synonym: Nther_0967

Alternate gene names: NA

Gene position: 1028537-1025658 (Counterclockwise)

Preceding gene: 188585595

Following gene: 188585587

Centisome position: 32.49

GC content: 37.26

Gene sequence:

>2880_bases
ATGTTTTGGAAAAAATATCGTAATTATATTATTTTGGCAATTATAGCCTTAATTCTCTTATTTAGCCGAAGATTCGCCGT
TATCGTGACTGATATTCAATGGTTTCAAGCTCTAGATTTTTTTGAACTGTTTTGGAAACCTATTGCTATCCAATACCTTT
TTTCGATAATCGCCTTCATTTTAGGAGCAGTTTTCATATATCTTAATTTAGGTCTTTTAATAAATAATTTAATAACTCCT
GAATATGAGACTAAGTTTTATGAGACGGGTTTAGCTGAATACGCTGATGTCATAACATCCATGGGTAAAATTGGAAGATT
AATCATTTCCATAATAATCAGTTTTATCTGGATTGGAAGTTTTGCTAATATTTGGGAAAACATCGTCTATGTGATAGGAA
GTCAAAGTACCGGTATTGTTGACCCTATTTTTAATATAGATGCGGTTTTTTATTTATTCCATTTACCCTTTTTACAGAGA
CTAGTAAGTCCAATTTTGGCTTTACTGATTTTAACAATTATAGCTGTTTCAATAATTTATTTTTCAAAAGGCCTGTTATC
ATGGACGATATTTCGTAAATATTCGCCATTACAGGCTCCTGCTTTAAAGCATCTCAATTACCTTCTAAGTGGAATATTTT
TAATACTGACATTCCGGTTTATATTGTCCTTATTTAATCTTATGTTCTCTCCTCGAGGTGCAGTTTACGGTATTGGATTT
ACTGATCTATACATATCAGCTCCCGTATATATTATTCTTGCATTATTGTCTATAGCCAGTTTGGTATTGACATTAGGTAA
TTTTAAATGGAAAAAATACCGACTATCTCTTTATTGTTTCGGAGGTATAATTGCAGTTTCTATTCTCGGCGGTATAGTAG
CTACTGCTGTTCAATCAATCGTTGTAGCCCCTAATGAACTTACTCGAGAGGGACCATTTATCAATAATCATTTAGAAATG
ACACAAAAAGCTTACGGTATTGATGATATTACTGAAAGAACCTGGGAAATTGAAGATAACGAAAATGGCACTGAAAATAC
TATTGAGAATAACGTTAATGAAGATGAAGCTAATCAAATTGAAGAGGATCTGGATCAAGAAGAGGGTGTTCCTCAAGAAG
AAGATGATGCTCCCCAAGAAGAGGGTTCTCCTCAGGAAGAAGGAGTAGCAGCTCCCGAAATCATTCCAGAAGTTATTAAC
AATGTCAGGTTACTGGATTATCGTCCTCTGAGAGACGTCTATCGGGAAGCTCAAGAATATCGACGCTATTATCATTTCAA
TGATGTAGATATAGCTAGATATACTATTGATGATCAATATCACCAAGTTATGTTGGCAGCGAGAGAGATGGATGTGGATC
GTCTTCCAACAGGTGCTCAAACGGCAGTTAACAGGCATTTAAAATATACACACGGTTACGGGCTAGCCATGAGCCCAGTC
GGAGATTTGACTCCAGATGGGCTTCCTCGTTATTTCTTCCAAGATATGCCCGTACAAGATCATCTCGATATGGGATTAGA
GCGGCCGGAACTTTATTTTGGCGAACTAACCAATGATTTTGTGATTGTTAACAGTGAAGAAACAGAATTTCATTATCCTG
GTCAAGAAGATGTAGAGTTAATCTATGAAGGTGAATCAGGCATTAACATGCATTTTATGAACCGATTGTTATTTGCCCTG
AGAAAATTCAATAGTTTCATACTCTTTTCAGGGGAGTTTTCATCGGAAAGCCAAATCTTATTCAACCGTAATATCAAAGA
ACGTGTAGAGCGAATAGCACCTTTCTTAAGATACGATCAAGATCCCTATCTTGCTGTAGCTGACGATAGACTTTACTGGA
TTATGGATGCCTATGTGGAAACCAATCAGTTCCCTTACAGCCAACCCTTTGAAGATAGTACTAATTATATTCGAAATCCA
GTTAAGGTAGTCATAGACGCTTACAGTGGTACTGTGGATTTTTATTTAATTGAAGACGATGAACCCTTCACTCAAGCACT
GGATAGAGCATTCCCTGACCTATTTTCCAACCTGGATGAGTTATCTAAGGAATTGAGAGCCCAATTCCGCTATCCAGAAG
ATTTATTTAGTGCCCAGGCCCATATACTACAAAATTATCATATGGAAAATCCCGTGATTTTCTACAACAGGGAAGATGCC
TGGGATATTCCTACTGAAAACTACCAAAATGAAACTATTACCATGGAACCGTATTATGCCACTTTAAATTTAGGTGAAGA
AGAACGGCCCGAGTTTGTCCTAATGATTCCCTATACTCCTGTAGAGCGGAATAATATGATTTCTTGGTTAGGTGCTAGAA
ATGATGGAGAAAATTACGGTGAATTGGTTCTGTTCAGATTCCCTTCAGGCGAACATATCTATGGCCCTCAACAAATTGAA
TTCCGAATAGATCAAGATCCCCAGATATCCCAACAGATCAGTTTATGGGATACCCGAGGATCAAGGGTAATCCGTGGAAA
TTTACTAGTAATTCCTTTAGAAAACGGCATCCTGTATATTGAACCTTTATACCTCCAAGCTGAAGCCAGTAGTTTTCCTG
AAATGAGAAGAGTCTTAAGCTTTTGGCAAGGAGATCTAGTTATGGCCGATACCCTGGATGAAGCTTTGGCTATGCATGGA
GTAGACCCTGAAGAATTAGATTTGGAAGATCCTGATGATATTGAAGATATTGAGGAGATTGAAGATTTACCTGATACTGA
TATCGCTGGGCTTGATCAATTATCTCAAGAAGCTTTGGATCTTTACCGTCAAGCTGATGAAGCTCTTCGCCAGGGTAATT
GGACAGAATACGGGGCCACTATTGAAGAGTTAGAAGGAGTCTTAGAAGAAATTCAGTTAAGAGTCGACGAAAACTTTTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGTAGCTTTGAATATTTAATTAAGAAAATAGACTTCTAGTTAATAAACAGGGTCAAACTTAAATTGGCCCTGTTACCCTT
AGATTTCAGGAGGCATAACT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAACTAGAACTTTTTACATTATTAAACACCTAAAGAAAGCAATAAGTTAAATAAAAATCCAGCAAAAATTGCTACAACTA
TTACCGTGATTATATAAGTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 959; Mature: 959

Protein sequence:

>959_residues
MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFILGAVFIYLNLGLLINNLITP
EYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGSFANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQR
LVSPILALLILTIIAVSIIYFSKGLLSWTIFRKYSPLQAPALKHLNYLLSGIFLILTFRFILSLFNLMFSPRGAVYGIGF
TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSIVVAPNELTREGPFINNHLEM
TQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQIEEDLDQEEGVPQEEDDAPQEEGSPQEEGVAAPEIIPEVIN
NVRLLDYRPLRDVYREAQEYRRYYHFNDVDIARYTIDDQYHQVMLAAREMDVDRLPTGAQTAVNRHLKYTHGYGLAMSPV
GDLTPDGLPRYFFQDMPVQDHLDMGLERPELYFGELTNDFVIVNSEETEFHYPGQEDVELIYEGESGINMHFMNRLLFAL
RKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQDPYLAVADDRLYWIMDAYVETNQFPYSQPFEDSTNYIRNP
VKVVIDAYSGTVDFYLIEDDEPFTQALDRAFPDLFSNLDELSKELRAQFRYPEDLFSAQAHILQNYHMENPVIFYNREDA
WDIPTENYQNETITMEPYYATLNLGEEERPEFVLMIPYTPVERNNMISWLGARNDGENYGELVLFRFPSGEHIYGPQQIE
FRIDQDPQISQQISLWDTRGSRVIRGNLLVIPLENGILYIEPLYLQAEASSFPEMRRVLSFWQGDLVMADTLDEALAMHG
VDPEELDLEDPDDIEDIEEIEDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF

Sequences:

>Translated_959_residues
MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFILGAVFIYLNLGLLINNLITP
EYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGSFANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQR
LVSPILALLILTIIAVSIIYFSKGLLSWTIFRKYSPLQAPALKHLNYLLSGIFLILTFRFILSLFNLMFSPRGAVYGIGF
TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSIVVAPNELTREGPFINNHLEM
TQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQIEEDLDQEEGVPQEEDDAPQEEGSPQEEGVAAPEIIPEVIN
NVRLLDYRPLRDVYREAQEYRRYYHFNDVDIARYTIDDQYHQVMLAAREMDVDRLPTGAQTAVNRHLKYTHGYGLAMSPV
GDLTPDGLPRYFFQDMPVQDHLDMGLERPELYFGELTNDFVIVNSEETEFHYPGQEDVELIYEGESGINMHFMNRLLFAL
RKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQDPYLAVADDRLYWIMDAYVETNQFPYSQPFEDSTNYIRNP
VKVVIDAYSGTVDFYLIEDDEPFTQALDRAFPDLFSNLDELSKELRAQFRYPEDLFSAQAHILQNYHMENPVIFYNREDA
WDIPTENYQNETITMEPYYATLNLGEEERPEFVLMIPYTPVERNNMISWLGARNDGENYGELVLFRFPSGEHIYGPQQIE
FRIDQDPQISQQISLWDTRGSRVIRGNLLVIPLENGILYIEPLYLQAEASSFPEMRRVLSFWQGDLVMADTLDEALAMHG
VDPEELDLEDPDDIEDIEEIEDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF
>Mature_959_residues
MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFILGAVFIYLNLGLLINNLITP
EYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGSFANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQR
LVSPILALLILTIIAVSIIYFSKGLLSWTIFRKYSPLQAPALKHLNYLLSGIFLILTFRFILSLFNLMFSPRGAVYGIGF
TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSIVVAPNELTREGPFINNHLEM
TQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQIEEDLDQEEGVPQEEDDAPQEEGSPQEEGVAAPEIIPEVIN
NVRLLDYRPLRDVYREAQEYRRYYHFNDVDIARYTIDDQYHQVMLAAREMDVDRLPTGAQTAVNRHLKYTHGYGLAMSPV
GDLTPDGLPRYFFQDMPVQDHLDMGLERPELYFGELTNDFVIVNSEETEFHYPGQEDVELIYEGESGINMHFMNRLLFAL
RKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQDPYLAVADDRLYWIMDAYVETNQFPYSQPFEDSTNYIRNP
VKVVIDAYSGTVDFYLIEDDEPFTQALDRAFPDLFSNLDELSKELRAQFRYPEDLFSAQAHILQNYHMENPVIFYNREDA
WDIPTENYQNETITMEPYYATLNLGEEERPEFVLMIPYTPVERNNMISWLGARNDGENYGELVLFRFPSGEHIYGPQQIE
FRIDQDPQISQQISLWDTRGSRVIRGNLLVIPLENGILYIEPLYLQAEASSFPEMRRVLSFWQGDLVMADTLDEALAMHG
VDPEELDLEDPDDIEDIEEIEDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF

Specific function: Unknown

COG id: COG1615

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0182 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005372 [H]

Pfam domain/function: PF03699 UPF0182 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 110846; Mature: 110846

Theoretical pI: Translated: 4.05; Mature: 4.05

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.1 %Cys     (Translated Protein)
2.0 %Met     (Translated Protein)
2.1 %Cys+Met (Translated Protein)
0.1 %Cys     (Mature Protein)
2.0 %Met     (Mature Protein)
2.1 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGAVFIYLNLGLLINNLITPEYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGS
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQRLVSPILALLILTIIAVSIIY
HHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FSKGLLSWTIFRKYSPLQAPALKHLNYLLSGIFLILTFRFILSLFNLMFSPRGAVYGIGF
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCH
TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VVAPNELTREGPFINNHLEMTQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQI
HCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEECCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHH
EEDLDQEEGVPQEEDDAPQEEGSPQEEGVAAPEIIPEVINNVRLLDYRPLRDVYREAQEY
HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHH
RRYYHFNDVDIARYTIDDQYHQVMLAAREMDVDRLPTGAQTAVNRHLKYTHGYGLAMSPV
HHHHCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHCCEEECCCCEEECCC
GDLTPDGLPRYFFQDMPVQDHLDMGLERPELYFGELTNDFVIVNSEETEFHYPGQEDVEL
CCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCCEEEECCCCCCEECCCCCCCEE
IYEGESGINMHFMNRLLFALRKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQ
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC
DPYLAVADDRLYWIMDAYVETNQFPYSQPFEDSTNYIRNPVKVVIDAYSGTVDFYLIEDD
CCEEEEECCCEEEEEEHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHEEEEECCCEEEEEEEECC
EPFTQALDRAFPDLFSNLDELSKELRAQFRYPEDLFSAQAHILQNYHMENPVIFYNREDA
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCC
WDIPTENYQNETITMEPYYATLNLGEEERPEFVLMIPYTPVERNNMISWLGARNDGENYG
CCCCCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCC
ELVLFRFPSGEHIYGPQQIEFRIDQDPQISQQISLWDTRGSRVIRGNLLVIPLENGILYI
CEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHEEHEECCCCEEEECCEEEEEECCCEEEE
EPLYLQAEASSFPEMRRVLSFWQGDLVMADTLDEALAMHGVDPEELDLEDPDDIEDIEEI
EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHH
EDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
>Mature Secondary Structure
MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFI
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LGAVFIYLNLGLLINNLITPEYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGS
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FANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQRLVSPILALLILTIIAVSIIY
HHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
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TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSI
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VVAPNELTREGPFINNHLEMTQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQI
HCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEECCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHH
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IYEGESGINMHFMNRLLFALRKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQ
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EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHH
EDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF
HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha Beta

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA