| Definition | Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010718 |
| Length | 3,165,557 |
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The map label for this gene is 188585594
Identifier: 188585594
GI number: 188585594
Start: 1025658
End: 1028537
Strand: Reverse
Name: 188585594
Synonym: Nther_0967
Alternate gene names: NA
Gene position: 1028537-1025658 (Counterclockwise)
Preceding gene: 188585595
Following gene: 188585587
Centisome position: 32.49
GC content: 37.26
Gene sequence:
>2880_bases ATGTTTTGGAAAAAATATCGTAATTATATTATTTTGGCAATTATAGCCTTAATTCTCTTATTTAGCCGAAGATTCGCCGT TATCGTGACTGATATTCAATGGTTTCAAGCTCTAGATTTTTTTGAACTGTTTTGGAAACCTATTGCTATCCAATACCTTT TTTCGATAATCGCCTTCATTTTAGGAGCAGTTTTCATATATCTTAATTTAGGTCTTTTAATAAATAATTTAATAACTCCT GAATATGAGACTAAGTTTTATGAGACGGGTTTAGCTGAATACGCTGATGTCATAACATCCATGGGTAAAATTGGAAGATT AATCATTTCCATAATAATCAGTTTTATCTGGATTGGAAGTTTTGCTAATATTTGGGAAAACATCGTCTATGTGATAGGAA GTCAAAGTACCGGTATTGTTGACCCTATTTTTAATATAGATGCGGTTTTTTATTTATTCCATTTACCCTTTTTACAGAGA CTAGTAAGTCCAATTTTGGCTTTACTGATTTTAACAATTATAGCTGTTTCAATAATTTATTTTTCAAAAGGCCTGTTATC ATGGACGATATTTCGTAAATATTCGCCATTACAGGCTCCTGCTTTAAAGCATCTCAATTACCTTCTAAGTGGAATATTTT TAATACTGACATTCCGGTTTATATTGTCCTTATTTAATCTTATGTTCTCTCCTCGAGGTGCAGTTTACGGTATTGGATTT ACTGATCTATACATATCAGCTCCCGTATATATTATTCTTGCATTATTGTCTATAGCCAGTTTGGTATTGACATTAGGTAA TTTTAAATGGAAAAAATACCGACTATCTCTTTATTGTTTCGGAGGTATAATTGCAGTTTCTATTCTCGGCGGTATAGTAG CTACTGCTGTTCAATCAATCGTTGTAGCCCCTAATGAACTTACTCGAGAGGGACCATTTATCAATAATCATTTAGAAATG ACACAAAAAGCTTACGGTATTGATGATATTACTGAAAGAACCTGGGAAATTGAAGATAACGAAAATGGCACTGAAAATAC TATTGAGAATAACGTTAATGAAGATGAAGCTAATCAAATTGAAGAGGATCTGGATCAAGAAGAGGGTGTTCCTCAAGAAG AAGATGATGCTCCCCAAGAAGAGGGTTCTCCTCAGGAAGAAGGAGTAGCAGCTCCCGAAATCATTCCAGAAGTTATTAAC AATGTCAGGTTACTGGATTATCGTCCTCTGAGAGACGTCTATCGGGAAGCTCAAGAATATCGACGCTATTATCATTTCAA TGATGTAGATATAGCTAGATATACTATTGATGATCAATATCACCAAGTTATGTTGGCAGCGAGAGAGATGGATGTGGATC GTCTTCCAACAGGTGCTCAAACGGCAGTTAACAGGCATTTAAAATATACACACGGTTACGGGCTAGCCATGAGCCCAGTC GGAGATTTGACTCCAGATGGGCTTCCTCGTTATTTCTTCCAAGATATGCCCGTACAAGATCATCTCGATATGGGATTAGA GCGGCCGGAACTTTATTTTGGCGAACTAACCAATGATTTTGTGATTGTTAACAGTGAAGAAACAGAATTTCATTATCCTG GTCAAGAAGATGTAGAGTTAATCTATGAAGGTGAATCAGGCATTAACATGCATTTTATGAACCGATTGTTATTTGCCCTG AGAAAATTCAATAGTTTCATACTCTTTTCAGGGGAGTTTTCATCGGAAAGCCAAATCTTATTCAACCGTAATATCAAAGA ACGTGTAGAGCGAATAGCACCTTTCTTAAGATACGATCAAGATCCCTATCTTGCTGTAGCTGACGATAGACTTTACTGGA TTATGGATGCCTATGTGGAAACCAATCAGTTCCCTTACAGCCAACCCTTTGAAGATAGTACTAATTATATTCGAAATCCA GTTAAGGTAGTCATAGACGCTTACAGTGGTACTGTGGATTTTTATTTAATTGAAGACGATGAACCCTTCACTCAAGCACT GGATAGAGCATTCCCTGACCTATTTTCCAACCTGGATGAGTTATCTAAGGAATTGAGAGCCCAATTCCGCTATCCAGAAG ATTTATTTAGTGCCCAGGCCCATATACTACAAAATTATCATATGGAAAATCCCGTGATTTTCTACAACAGGGAAGATGCC TGGGATATTCCTACTGAAAACTACCAAAATGAAACTATTACCATGGAACCGTATTATGCCACTTTAAATTTAGGTGAAGA AGAACGGCCCGAGTTTGTCCTAATGATTCCCTATACTCCTGTAGAGCGGAATAATATGATTTCTTGGTTAGGTGCTAGAA ATGATGGAGAAAATTACGGTGAATTGGTTCTGTTCAGATTCCCTTCAGGCGAACATATCTATGGCCCTCAACAAATTGAA TTCCGAATAGATCAAGATCCCCAGATATCCCAACAGATCAGTTTATGGGATACCCGAGGATCAAGGGTAATCCGTGGAAA TTTACTAGTAATTCCTTTAGAAAACGGCATCCTGTATATTGAACCTTTATACCTCCAAGCTGAAGCCAGTAGTTTTCCTG AAATGAGAAGAGTCTTAAGCTTTTGGCAAGGAGATCTAGTTATGGCCGATACCCTGGATGAAGCTTTGGCTATGCATGGA GTAGACCCTGAAGAATTAGATTTGGAAGATCCTGATGATATTGAAGATATTGAGGAGATTGAAGATTTACCTGATACTGA TATCGCTGGGCTTGATCAATTATCTCAAGAAGCTTTGGATCTTTACCGTCAAGCTGATGAAGCTCTTCGCCAGGGTAATT GGACAGAATACGGGGCCACTATTGAAGAGTTAGAAGGAGTCTTAGAAGAAATTCAGTTAAGAGTCGACGAAAACTTTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases AGTAGCTTTGAATATTTAATTAAGAAAATAGACTTCTAGTTAATAAACAGGGTCAAACTTAAATTGGCCCTGTTACCCTT AGATTTCAGGAGGCATAACT
Downstream 100 bases:
>100_bases AAACTAGAACTTTTTACATTATTAAACACCTAAAGAAAGCAATAAGTTAAATAAAAATCCAGCAAAAATTGCTACAACTA TTACCGTGATTATATAAGTA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 959; Mature: 959
Protein sequence:
>959_residues MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFILGAVFIYLNLGLLINNLITP EYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGSFANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQR LVSPILALLILTIIAVSIIYFSKGLLSWTIFRKYSPLQAPALKHLNYLLSGIFLILTFRFILSLFNLMFSPRGAVYGIGF TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSIVVAPNELTREGPFINNHLEM TQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQIEEDLDQEEGVPQEEDDAPQEEGSPQEEGVAAPEIIPEVIN NVRLLDYRPLRDVYREAQEYRRYYHFNDVDIARYTIDDQYHQVMLAAREMDVDRLPTGAQTAVNRHLKYTHGYGLAMSPV GDLTPDGLPRYFFQDMPVQDHLDMGLERPELYFGELTNDFVIVNSEETEFHYPGQEDVELIYEGESGINMHFMNRLLFAL RKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQDPYLAVADDRLYWIMDAYVETNQFPYSQPFEDSTNYIRNP VKVVIDAYSGTVDFYLIEDDEPFTQALDRAFPDLFSNLDELSKELRAQFRYPEDLFSAQAHILQNYHMENPVIFYNREDA WDIPTENYQNETITMEPYYATLNLGEEERPEFVLMIPYTPVERNNMISWLGARNDGENYGELVLFRFPSGEHIYGPQQIE FRIDQDPQISQQISLWDTRGSRVIRGNLLVIPLENGILYIEPLYLQAEASSFPEMRRVLSFWQGDLVMADTLDEALAMHG VDPEELDLEDPDDIEDIEEIEDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF
Sequences:
>Translated_959_residues MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFILGAVFIYLNLGLLINNLITP EYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGSFANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQR LVSPILALLILTIIAVSIIYFSKGLLSWTIFRKYSPLQAPALKHLNYLLSGIFLILTFRFILSLFNLMFSPRGAVYGIGF TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSIVVAPNELTREGPFINNHLEM TQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQIEEDLDQEEGVPQEEDDAPQEEGSPQEEGVAAPEIIPEVIN NVRLLDYRPLRDVYREAQEYRRYYHFNDVDIARYTIDDQYHQVMLAAREMDVDRLPTGAQTAVNRHLKYTHGYGLAMSPV GDLTPDGLPRYFFQDMPVQDHLDMGLERPELYFGELTNDFVIVNSEETEFHYPGQEDVELIYEGESGINMHFMNRLLFAL RKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQDPYLAVADDRLYWIMDAYVETNQFPYSQPFEDSTNYIRNP VKVVIDAYSGTVDFYLIEDDEPFTQALDRAFPDLFSNLDELSKELRAQFRYPEDLFSAQAHILQNYHMENPVIFYNREDA WDIPTENYQNETITMEPYYATLNLGEEERPEFVLMIPYTPVERNNMISWLGARNDGENYGELVLFRFPSGEHIYGPQQIE FRIDQDPQISQQISLWDTRGSRVIRGNLLVIPLENGILYIEPLYLQAEASSFPEMRRVLSFWQGDLVMADTLDEALAMHG VDPEELDLEDPDDIEDIEEIEDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF >Mature_959_residues MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFILGAVFIYLNLGLLINNLITP EYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGSFANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQR LVSPILALLILTIIAVSIIYFSKGLLSWTIFRKYSPLQAPALKHLNYLLSGIFLILTFRFILSLFNLMFSPRGAVYGIGF TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSIVVAPNELTREGPFINNHLEM TQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQIEEDLDQEEGVPQEEDDAPQEEGSPQEEGVAAPEIIPEVIN NVRLLDYRPLRDVYREAQEYRRYYHFNDVDIARYTIDDQYHQVMLAAREMDVDRLPTGAQTAVNRHLKYTHGYGLAMSPV GDLTPDGLPRYFFQDMPVQDHLDMGLERPELYFGELTNDFVIVNSEETEFHYPGQEDVELIYEGESGINMHFMNRLLFAL RKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQDPYLAVADDRLYWIMDAYVETNQFPYSQPFEDSTNYIRNP VKVVIDAYSGTVDFYLIEDDEPFTQALDRAFPDLFSNLDELSKELRAQFRYPEDLFSAQAHILQNYHMENPVIFYNREDA WDIPTENYQNETITMEPYYATLNLGEEERPEFVLMIPYTPVERNNMISWLGARNDGENYGELVLFRFPSGEHIYGPQQIE FRIDQDPQISQQISLWDTRGSRVIRGNLLVIPLENGILYIEPLYLQAEASSFPEMRRVLSFWQGDLVMADTLDEALAMHG VDPEELDLEDPDDIEDIEEIEDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF
Specific function: Unknown
COG id: COG1615
COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the UPF0182 family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR005372 [H]
Pfam domain/function: PF03699 UPF0182 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 110846; Mature: 110846
Theoretical pI: Translated: 4.05; Mature: 4.05
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.1 %Cys (Translated Protein) 2.0 %Met (Translated Protein) 2.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.1 %Cys (Mature Protein) 2.0 %Met (Mature Protein) 2.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGAVFIYLNLGLLINNLITPEYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQRLVSPILALLILTIIAVSIIY HHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FSKGLLSWTIFRKYSPLQAPALKHLNYLLSGIFLILTFRFILSLFNLMFSPRGAVYGIGF HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCH TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVAPNELTREGPFINNHLEMTQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQI HCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEECCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHH EEDLDQEEGVPQEEDDAPQEEGSPQEEGVAAPEIIPEVINNVRLLDYRPLRDVYREAQEY HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHH RRYYHFNDVDIARYTIDDQYHQVMLAAREMDVDRLPTGAQTAVNRHLKYTHGYGLAMSPV HHHHCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHCCEEECCCCEEECCC GDLTPDGLPRYFFQDMPVQDHLDMGLERPELYFGELTNDFVIVNSEETEFHYPGQEDVEL CCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCCEEEECCCCCCEECCCCCCCEE IYEGESGINMHFMNRLLFALRKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQ EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC DPYLAVADDRLYWIMDAYVETNQFPYSQPFEDSTNYIRNPVKVVIDAYSGTVDFYLIEDD CCEEEEECCCEEEEEEHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHEEEEECCCEEEEEEEECC EPFTQALDRAFPDLFSNLDELSKELRAQFRYPEDLFSAQAHILQNYHMENPVIFYNREDA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCC WDIPTENYQNETITMEPYYATLNLGEEERPEFVLMIPYTPVERNNMISWLGARNDGENYG CCCCCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCC ELVLFRFPSGEHIYGPQQIEFRIDQDPQISQQISLWDTRGSRVIRGNLLVIPLENGILYI CEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHEEHEECCCCEEEECCEEEEEECCCEEEE EPLYLQAEASSFPEMRRVLSFWQGDLVMADTLDEALAMHGVDPEELDLEDPDDIEDIEEI EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHH EDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MFWKKYRNYIILAIIALILLFSRRFAVIVTDIQWFQALDFFELFWKPIAIQYLFSIIAFI CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGAVFIYLNLGLLINNLITPEYETKFYETGLAEYADVITSMGKIGRLIISIIISFIWIGS HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FANIWENIVYVIGSQSTGIVDPIFNIDAVFYLFHLPFLQRLVSPILALLILTIIAVSIIY HHHHHHHHEEEECCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FSKGLLSWTIFRKYSPLQAPALKHLNYLLSGIFLILTFRFILSLFNLMFSPRGAVYGIGF HHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCH TDLYISAPVYIILALLSIASLVLTLGNFKWKKYRLSLYCFGGIIAVSILGGIVATAVQSI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH VVAPNELTREGPFINNHLEMTQKAYGIDDITERTWEIEDNENGTENTIENNVNEDEANQI HCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHCCEEEECCCCCCCCHHHHCCCCHHHHHHH EEDLDQEEGVPQEEDDAPQEEGSPQEEGVAAPEIIPEVINNVRLLDYRPLRDVYREAQEY HHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHH RRYYHFNDVDIARYTIDDQYHQVMLAAREMDVDRLPTGAQTAVNRHLKYTHGYGLAMSPV HHHHCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCCHHHHHHHCCEEECCCCEEECCC GDLTPDGLPRYFFQDMPVQDHLDMGLERPELYFGELTNDFVIVNSEETEFHYPGQEDVEL CCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHCCCCCCCHHCCCCCCCEEEECCCCCCEECCCCCCCEE IYEGESGINMHFMNRLLFALRKFNSFILFSGEFSSESQILFNRNIKERVERIAPFLRYDQ EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHCCC DPYLAVADDRLYWIMDAYVETNQFPYSQPFEDSTNYIRNPVKVVIDAYSGTVDFYLIEDD CCEEEEECCCEEEEEEHHHHCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCHHEEEEECCCEEEEEEEECC EPFTQALDRAFPDLFSNLDELSKELRAQFRYPEDLFSAQAHILQNYHMENPVIFYNREDA CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCC WDIPTENYQNETITMEPYYATLNLGEEERPEFVLMIPYTPVERNNMISWLGARNDGENYG CCCCCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCCC ELVLFRFPSGEHIYGPQQIEFRIDQDPQISQQISLWDTRGSRVIRGNLLVIPLENGILYI CEEEEECCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHEEHEECCCCEEEECCEEEEEECCCEEEE EPLYLQAEASSFPEMRRVLSFWQGDLVMADTLDEALAMHGVDPEELDLEDPDDIEDIEEI EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCCCCCCHHHHHHH EDLPDTDIAGLDQLSQEALDLYRQADEALRQGNWTEYGATIEELEGVLEEIQLRVDENF HCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha Beta
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA