Definition Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF, complete genome.
Accession NC_010718
Length 3,165,557

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The map label for this gene is 188585536

Identifier: 188585536

GI number: 188585536

Start: 960565

End: 963402

Strand: Direct

Name: 188585536

Synonym: Nther_0908

Alternate gene names: NA

Gene position: 960565-963402 (Clockwise)

Preceding gene: 188585533

Following gene: 188585537

Centisome position: 30.34

GC content: 38.69

Gene sequence:

>2838_bases
TTGAGGAATAAGTTTATTATTTTAATGTTTGTTGTGATTTTTTTATTATTTTCAATGGGGTCTATAGCTAATTTCATTAC
AGAATGGCAATGGTTCTCCAGCTTGGGTTATTTGGATTTATTTGTGATGCCTTTTGTAATTCAAGTGGTGATTTCCATAG
CTGCCTTTATTGTTGGAACTGTATTTGTTTATTTTAATTTGAATACATTATCTAACTATTTATTGACCCCCAAAGAACAG
GTGAAGCTGTATGAAAGCAAGTACGCAGAACTAATTGACAAATTTCAATCATTCGGAAAATGGGCTAAAATTGGAATATC
TGCCTTTTTAGGACTGATCTGGGCAGGTTTATTTCAAGGTTTGTGGCTGAGAATCGTTTATTTTATACACGGTGAAGCCA
CAGGGGAACTTGAACCTGTTTATAATTTAGATTTAGCTTTTTACTTATTTAGATTGCCTATGTATCAACAGATTGTAACA
GCACTTATAAGTTTAGTTTTATTCACTTTAATTGCTGTTGTCGTAATTTACCTTGCAAGGGGCTTTCTATCATGGAATAC
TATCAAAGATGATGGTGGTTTTCCCGCTGGTCGTTTGGCGTTAAGACATATCAATATATTGTTAGGGATTTTCTTATTAG
TTTTAGCACTTAATGCCATACTGGGAAGGTATGAGTTGTTGTTTTCTGCCCGGGGAGCTGTCTTTGGTGCTGGATATACG
GATATCCATGTTACGCGACTGGTATACACAGGCCTTGGTGTGATTGGAACTTTAGGATTTGTTATTAGCTTAGCGAATCT
AAAATTAGCCAAGTATAAACTGGTATTCTTCTCTTTAGGAGCCTTTTTCCTTGTCTCTATATTGGGAGGGGTTGCCGGAC
AGATAGTGCAATCGACTATAGTATCTCCTAATGAATTGACTAGAGAAAGGCCTTTTATAGAAAATCACCTGGAAATGACG
CGTACGGCTTATGGACTAGCAGATATTCAGGAAGAAACCTGGGATGTGGATGTGGAAGGCGAGTTGGAAGATGACGCAGT
AGAAGAAGGAGAAGATATAGAAGAAGAACTCGAGGAAATCGAATCAGAACTTCCGCCACCTGAACTTGATGAAGTAACTT
ATAATAACATGCGATTATTGGACTATCGTCCAGTACAGGATGTATACAGGGAAGCACAAGAGTACAGAAGATATTATCAT
TTTAATGATGTAAATCTAGCCAGGTATCGGATAGATGATGAATATCATCAGGTGATGGTATCACCTCGGGAAATGGATGT
AGACAGAATACCATCTGAAGCTCAAACACCGGTTAATCGCCATTTAAAATATACCCATGGGTATGGCTTGGTGATGAGCC
CAGTAGGACAATTTACCGATGGCGGTATGCCTGAATACTATTTGAAAGATATGCCGATTGAGGATGATTTAGGATTGGGG
ATAGAAAGACCAGAATTATACTTTGGTGAACTGACTAACGATTTCGTATTAGTAAACACTGATGTAGAAGAGTTTCACTA
CCCTGGGCAAGAAGAAGTGGACTTGACCTATCAAGGAGAAACTGGTATTGATATGAGTTTACTTAATAGAATTCTGTTTG
CTATTCGTGAACGCAGCAGTTTCCTATTGTTTTCCCAGGAGTATTCTTCAGATAGTCAAATATTGATAAATCGAAATATC
CACGACAGAGTGGAAAGACTGGCACCCTTTTTAGAATATGATAATGACCCTTATATAGCAGCAGCTAATGGTGAATTATA
CTGGATTATGGATGCTTATGTTACTAGCGATAATTTTCCGTATAGTAGACCTTTCCAGGGAGATGACAATTATATTAAAA
ATCCGGTAAAAGTAGTTATAGATGCTTACACAGGTGAAACTTCATTTTACTTAGTAGAAGATGATGAGCCCTTGACCCAG
GCTATCTCCAATGCTTTTCCAGATCTGTTCTCTGACCCTCAGGAATTGTCAGATGAATTGAGGGCCCAGTTTAGGTATCC
TCATAATTTCTTTACTATCCAGGCTAATATGTTGAAAAACTATCACATGACAAATCCAGTGGTATTTTATAATCGGGAAG
ATGGTTGGGATATACCCACAGAAAGTTACGGAGAAACAAGTATTGAAATGGAACCTTATTATGCCACCTTAAATTTACCT
GATACAGACGAACCTGAATTTGTTTTGATGCAACCTTTCACACCAGTACAGAGAAATAACATGATTTCTTGGCTTGGTGC
TCGAAATGATGGAGATAAATATGGTGAATTAGTACTTTATCGCTTTCCTTCTGGACGCCATGTTTACGGACCCAGGCAAA
TTGATGCCAGGATAGACCAACATCCTGACATTTCAGAACAGCTGTCACTCTGGGATGGCCAAGGCTCACGGGTTATCAGG
GGTAACTTACTGGTAATACCACTAGAGGACGGTGTTCTATATATTGAACCCCTTTATTTACAGGCCGAGGATAGTAGTTA
CCCGGAAATGAGAAGGGTAATAGCTGCCTGGGGAGACTTGCTTGTTATGGAAGACAGCTTGGAAGAAGCTTTAGATGCCC
TGGGTACCACAGCGGAAGATGTAGACACCGAAGTTATGGAAGAAGAGTTACCCGAACGAGAAGTAGAAGAAGTGGAAGAA
CTGGTTGAACAAGAATTTGAAACTATAGGTGAACTTGTAGATGAAGCGCTTAGGCTTGAAAGAGAAGCTGAAGCAGCTAT
TAGTGAAGGAAATTGGGGAGAGTACGGAGAATTACAAACTGAACTAAGTGAAATTTTAAAAGAACTAGAGGAGAGACTAG
ATACAACCATAGAAGATGAAGACAGTGATGATCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AGGCCGGAATTTTCTAATGTCAATTACCGATGTGATTTGATATAATATATTACTGAATGAGTTTAAAATGGGAAGAGGGA
ATTTATTAGGAGGGTTGAGC

Downstream 100 bases:

>100_bases
ACCACTATTATGAGGTGAATATTATGTGGAAAGGAATAGTGAATTATTATCGTGAGTTTTTACCCGTGGATGAAGATTTT
CCTCAATGCTCTTTGCAAGA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 945; Mature: 945

Protein sequence:

>945_residues
MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGTVFVYFNLNTLSNYLLTPKEQ
VKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQGLWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVT
ALISLVLFTLIAVVVIYLARGFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT
DIHVTRLVYTGLGVIGTLGFVISLANLKLAKYKLVFFSLGAFFLVSILGGVAGQIVQSTIVSPNELTRERPFIENHLEMT
RTAYGLADIQEETWDVDVEGELEDDAVEEGEDIEEELEEIESELPPPELDEVTYNNMRLLDYRPVQDVYREAQEYRRYYH
FNDVNLARYRIDDEYHQVMVSPREMDVDRIPSEAQTPVNRHLKYTHGYGLVMSPVGQFTDGGMPEYYLKDMPIEDDLGLG
IERPELYFGELTNDFVLVNTDVEEFHYPGQEEVDLTYQGETGIDMSLLNRILFAIRERSSFLLFSQEYSSDSQILINRNI
HDRVERLAPFLEYDNDPYIAAANGELYWIMDAYVTSDNFPYSRPFQGDDNYIKNPVKVVIDAYTGETSFYLVEDDEPLTQ
AISNAFPDLFSDPQELSDELRAQFRYPHNFFTIQANMLKNYHMTNPVVFYNREDGWDIPTESYGETSIEMEPYYATLNLP
DTDEPEFVLMQPFTPVQRNNMISWLGARNDGDKYGELVLYRFPSGRHVYGPRQIDARIDQHPDISEQLSLWDGQGSRVIR
GNLLVIPLEDGVLYIEPLYLQAEDSSYPEMRRVIAAWGDLLVMEDSLEEALDALGTTAEDVDTEVMEEELPEREVEEVEE
LVEQEFETIGELVDEALRLEREAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ

Sequences:

>Translated_945_residues
MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGTVFVYFNLNTLSNYLLTPKEQ
VKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQGLWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVT
ALISLVLFTLIAVVVIYLARGFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT
DIHVTRLVYTGLGVIGTLGFVISLANLKLAKYKLVFFSLGAFFLVSILGGVAGQIVQSTIVSPNELTRERPFIENHLEMT
RTAYGLADIQEETWDVDVEGELEDDAVEEGEDIEEELEEIESELPPPELDEVTYNNMRLLDYRPVQDVYREAQEYRRYYH
FNDVNLARYRIDDEYHQVMVSPREMDVDRIPSEAQTPVNRHLKYTHGYGLVMSPVGQFTDGGMPEYYLKDMPIEDDLGLG
IERPELYFGELTNDFVLVNTDVEEFHYPGQEEVDLTYQGETGIDMSLLNRILFAIRERSSFLLFSQEYSSDSQILINRNI
HDRVERLAPFLEYDNDPYIAAANGELYWIMDAYVTSDNFPYSRPFQGDDNYIKNPVKVVIDAYTGETSFYLVEDDEPLTQ
AISNAFPDLFSDPQELSDELRAQFRYPHNFFTIQANMLKNYHMTNPVVFYNREDGWDIPTESYGETSIEMEPYYATLNLP
DTDEPEFVLMQPFTPVQRNNMISWLGARNDGDKYGELVLYRFPSGRHVYGPRQIDARIDQHPDISEQLSLWDGQGSRVIR
GNLLVIPLEDGVLYIEPLYLQAEDSSYPEMRRVIAAWGDLLVMEDSLEEALDALGTTAEDVDTEVMEEELPEREVEEVEE
LVEQEFETIGELVDEALRLEREAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ
>Mature_945_residues
MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGTVFVYFNLNTLSNYLLTPKEQ
VKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQGLWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVT
ALISLVLFTLIAVVVIYLARGFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT
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RTAYGLADIQEETWDVDVEGELEDDAVEEGEDIEEELEEIESELPPPELDEVTYNNMRLLDYRPVQDVYREAQEYRRYYH
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AISNAFPDLFSDPQELSDELRAQFRYPHNFFTIQANMLKNYHMTNPVVFYNREDGWDIPTESYGETSIEMEPYYATLNLP
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GNLLVIPLEDGVLYIEPLYLQAEDSSYPEMRRVIAAWGDLLVMEDSLEEALDALGTTAEDVDTEVMEEELPEREVEEVEE
LVEQEFETIGELVDEALRLEREAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ

Specific function: Unknown

COG id: COG1615

COG function: function code S; Uncharacterized conserved protein

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the UPF0182 family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR005372 [H]

Pfam domain/function: PF03699 UPF0182 [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 108526; Mature: 108526

Theoretical pI: Translated: 3.99; Mature: 3.99

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.0 %Cys     (Translated Protein)
2.3 %Met     (Translated Protein)
2.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.0 %Cys     (Mature Protein)
2.3 %Met     (Mature Protein)
2.3 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGT
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFVYFNLNTLSNYLLTPKEQVKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQG
HHHEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVTALISLVLFTLIAVVVIYLAR
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT
HHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEECCCC
DIHVTRLVYTGLGVIGTLGFVISLANLKLAKYKLVFFSLGAFFLVSILGGVAGQIVQSTI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
VSPNELTRERPFIENHLEMTRTAYGLADIQEETWDVDVEGELEDDAVEEGEDIEEELEEI
CCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHCCCCCHHHHHHHH
ESELPPPELDEVTYNNMRLLDYRPVQDVYREAQEYRRYYHFNDVNLARYRIDDEYHQVMV
HHHCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEECCHHHHHCC
SPREMDVDRIPSEAQTPVNRHLKYTHGYGLVMSPVGQFTDGGMPEYYLKDMPIEDDLGLG
CCCCCCHHHCCCCCCCCHHHCEEEECCCCEEECCCCCCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCC
IERPELYFGELTNDFVLVNTDVEEFHYPGQEEVDLTYQGETGIDMSLLNRILFAIRERSS
CCCCCCEECCCCCCEEEEECCHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC
FLLFSQEYSSDSQILINRNIHDRVERLAPFLEYDNDPYIAAANGELYWIMDAYVTSDNFP
EEEEEECCCCCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCC
YSRPFQGDDNYIKNPVKVVIDAYTGETSFYLVEDDEPLTQAISNAFPDLFSDPQELSDEL
CCCCCCCCCCHHCCCEEEEEEEECCCEEEEEEECCCHHHHHHHHHCCHHCCCHHHHHHHH
RAQFRYPHNFFTIQANMLKNYHMTNPVVFYNREDGWDIPTESYGETSIEMEPYYATLNLP
HHHHCCCCCEEEEEHHHHHCCCCCCCEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEECCEEEEEECC
DTDEPEFVLMQPFTPVQRNNMISWLGARNDGDKYGELVLYRFPSGRHVYGPRQIDARIDQ
CCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEECCCCCCCCCCCEEEEECCCCCEECCCHHHHCCCCC
HPDISEQLSLWDGQGSRVIRGNLLVIPLEDGVLYIEPLYLQAEDSSYPEMRRVIAAWGDL
CCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCEEEEEECCCEEEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHCC
LVMEDSLEEALDALGTTAEDVDTEVMEEELPEREVEEVEELVEQEFETIGELVDEALRLE
EEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ
HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure
MRNKFIILMFVVIFLLFSMGSIANFITEWQWFSSLGYLDLFVMPFVIQVVISIAAFIVGT
CCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VFVYFNLNTLSNYLLTPKEQVKLYESKYAELIDKFQSFGKWAKIGISAFLGLIWAGLFQG
HHHEEEHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LWLRIVYFIHGEATGELEPVYNLDLAFYLFRLPMYQQIVTALISLVLFTLIAVVVIYLAR
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
GFLSWNTIKDDGGFPAGRLALRHINILLGIFLLVLALNAILGRYELLFSARGAVFGAGYT
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EEEHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
REAEAAISEGNWGEYGELQTELSEILKELEERLDTTIEDEDSDDQ
HHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA