Definition Clostridium perfringens str. 13, complete genome.
Accession NC_003366
Length 3,031,430

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The map label for this gene is 18311509

Identifier: 18311509

GI number: 18311509

Start: 2893448

End: 2895163

Strand: Reverse

Name: 18311509

Synonym: CPE2527

Alternate gene names: NA

Gene position: 2895163-2893448 (Counterclockwise)

Preceding gene: 18311510

Following gene: 18311506

Centisome position: 95.5

GC content: 32.23

Gene sequence:

>1716_bases
ATGAGAAACAAAACTAGATTTAAAGTTTTTCTAACGGTTTTTGCAATGACAATGTTATGCTCAACCTTAGTCTTTGCTGC
TGAAGATGCTGCGGCAGTAAACTCAGTTAAGTTTGGAATGTGGACAGTGCTACCACCATTAGTGTCAATTGTATTAGCTT
TTTTAACTAAGAATGTTGTAGTTTCATTATTCATAGGAACAATTACAGGATGTATAATGCTTCAATTAAATGGATTTAAT
ATAATTACAGCTTTAGCTCAAGGATTTATTGATTTTACTTATAGAGCTTTAAATTCCTTAGCGGATCCTTGGAATGCAGG
GATAATTCTTCAGGTTTTAGTTATTGGAGGAGTAATTCATTTAGTAGCTAAAATGGGAGGCGCAAAGGCCATAGCTGAAG
CTTTAGCAAGAAAGGCTAAAACTGTTAAGAGTGCACAACTTACAACTTGGCTTTTAGGCTTAGCTGTTTTCTTTGATGAT
TATGCTAACTCATTAATTGTAGGACCAATAATGAGACCAGTTACAGATAAATTAGGAGTTTCAAGGGAAAAATTAGCCTT
TGTTATAGATGCAACAGCAGCTCCAATTGCAGGGTTAGCAATAATATCAACTTGGATAGGATTAGAGGTTGGATTAATTG
GAGATGCTTTAAAAAGTGTAGGAATACAAGCAGATGGTTTTGGAGTATTTTTAGAAACAATACCATATAGATTTTATAAT
ATATTAATTTTAGCTTTTGTTGTTATATCAGCAATAACTTTAAGAGAATTTGGACCAATGCTTAAAGCTGAGAGAAGAGC
TAGAAGAGGAGAAGTTTTATCTGATACAGAAATTTCATCAGATAGTGAAGATTTAGAACCTATAGAAGGAATTAAATTAA
GTGTTTGGAATGCAATAATTCCAATTGGAGTTTTAATAGTATCATCTTTAATAGGATTTTATTATAGTGGATGGGTAACT
ATAATGGGTGGAGAAGATTTAGCCATAATAGAGCTTATGAATAATACACCTTTTAGTTTTGCTGGAATACAAGCAGCCTT
TTCAAATGCAGATGCTTCAGTAGTTTTATTCCAATCAGCTTTATTAGCAACTATATTAGCTCTTATATTAGGAGTTTCTA
GAAAAATCTTTACTATTTCAGAAGGAATAGGAATTTGGATTGAAGGAATGAAAGGACTTTTAATAACAGGAGTAATTCTT
ATATTAGCTTGGTCTTTAAGTTCTGTAATTAAAGAATTAGGAACTGCTTCCTACTTAGTAGGAGTATTATCAGATGCAAT
ACCAGCATTTTTATTACCAGCAATAATATTTATTTTAGGTTCAATAATAGCCTTTGCTACAGGTACGGCTTATGGAACAA
TGGGAATATTAATGCCACTTGCAATTCCATTAGCCTTTGCAATAAATCCAGAATGGAATTTTGTTATAGTAAGTACCTCA
GCAGTATTAACAGGTGCCATCTTTGGAGATCATTGTTCACCTATTTCTGATACCACAATACTTTCTTCAACAGGTGCAGG
ATGCGATCATATAGAACACGTTAGAACTCAAATATGGTATGCGATATTTGTTGGAATAGTAACTGTATTATTTGGATATA
TTCCAGCTGGTTTAGGATTAAGTATTTTCATAGTGTTACCTTTATCCTTAGTAGCTTTATTCATATTAACAATGATATTT
GGTAAAAAAGTAGATGAAAAAGTAGTTAGCAATTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
GATCAAGCCTAAGGTCTTTTTTGCAGAAATTTTATAATAAGAAAAAATAAGGGAATACCTCTGTAAATTAATTCACTGCA
TATTTAAGGGGGAATTTATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAGGACATGTACCAAAATAACTTTTTATAAAACTTACAAATATTATGAAGAGAATATCTAGATGAGCTTTAGAATTTAA
ATTATTACGTAGAAAATATC

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 571; Mature: 571

Protein sequence:

>571_residues
MRNKTRFKVFLTVFAMTMLCSTLVFAAEDAAAVNSVKFGMWTVLPPLVSIVLAFLTKNVVVSLFIGTITGCIMLQLNGFN
IITALAQGFIDFTYRALNSLADPWNAGIILQVLVIGGVIHLVAKMGGAKAIAEALARKAKTVKSAQLTTWLLGLAVFFDD
YANSLIVGPIMRPVTDKLGVSREKLAFVIDATAAPIAGLAIISTWIGLEVGLIGDALKSVGIQADGFGVFLETIPYRFYN
ILILAFVVISAITLREFGPMLKAERRARRGEVLSDTEISSDSEDLEPIEGIKLSVWNAIIPIGVLIVSSLIGFYYSGWVT
IMGGEDLAIIELMNNTPFSFAGIQAAFSNADASVVLFQSALLATILALILGVSRKIFTISEGIGIWIEGMKGLLITGVIL
ILAWSLSSVIKELGTASYLVGVLSDAIPAFLLPAIIFILGSIIAFATGTAYGTMGILMPLAIPLAFAINPEWNFVIVSTS
AVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSTGAGCDHIEHVRTQIWYAIFVGIVTVLFGYIPAGLGLSIFIVLPLSLVALFILTMIF
GKKVDEKVVSN

Sequences:

>Translated_571_residues
MRNKTRFKVFLTVFAMTMLCSTLVFAAEDAAAVNSVKFGMWTVLPPLVSIVLAFLTKNVVVSLFIGTITGCIMLQLNGFN
IITALAQGFIDFTYRALNSLADPWNAGIILQVLVIGGVIHLVAKMGGAKAIAEALARKAKTVKSAQLTTWLLGLAVFFDD
YANSLIVGPIMRPVTDKLGVSREKLAFVIDATAAPIAGLAIISTWIGLEVGLIGDALKSVGIQADGFGVFLETIPYRFYN
ILILAFVVISAITLREFGPMLKAERRARRGEVLSDTEISSDSEDLEPIEGIKLSVWNAIIPIGVLIVSSLIGFYYSGWVT
IMGGEDLAIIELMNNTPFSFAGIQAAFSNADASVVLFQSALLATILALILGVSRKIFTISEGIGIWIEGMKGLLITGVIL
ILAWSLSSVIKELGTASYLVGVLSDAIPAFLLPAIIFILGSIIAFATGTAYGTMGILMPLAIPLAFAINPEWNFVIVSTS
AVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSTGAGCDHIEHVRTQIWYAIFVGIVTVLFGYIPAGLGLSIFIVLPLSLVALFILTMIF
GKKVDEKVVSN
>Mature_571_residues
MRNKTRFKVFLTVFAMTMLCSTLVFAAEDAAAVNSVKFGMWTVLPPLVSIVLAFLTKNVVVSLFIGTITGCIMLQLNGFN
IITALAQGFIDFTYRALNSLADPWNAGIILQVLVIGGVIHLVAKMGGAKAIAEALARKAKTVKSAQLTTWLLGLAVFFDD
YANSLIVGPIMRPVTDKLGVSREKLAFVIDATAAPIAGLAIISTWIGLEVGLIGDALKSVGIQADGFGVFLETIPYRFYN
ILILAFVVISAITLREFGPMLKAERRARRGEVLSDTEISSDSEDLEPIEGIKLSVWNAIIPIGVLIVSSLIGFYYSGWVT
IMGGEDLAIIELMNNTPFSFAGIQAAFSNADASVVLFQSALLATILALILGVSRKIFTISEGIGIWIEGMKGLLITGVIL
ILAWSLSSVIKELGTASYLVGVLSDAIPAFLLPAIIFILGSIIAFATGTAYGTMGILMPLAIPLAFAINPEWNFVIVSTS
AVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSTGAGCDHIEHVRTQIWYAIFVGIVTVLFGYIPAGLGLSIFIVLPLSLVALFILTMIF
GKKVDEKVVSN

Specific function: Unknown

COG id: COG1757

COG function: function code C; Na+/H+ antiporter

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR018461 [H]

Pfam domain/function: PF03553 Na_H_antiporter [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 60900; Mature: 60900

Theoretical pI: Translated: 5.47; Mature: 5.47

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
2.5 %Met     (Translated Protein)
3.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
2.5 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MRNKTRFKVFLTVFAMTMLCSTLVFAAEDAAAVNSVKFGMWTVLPPLVSIVLAFLTKNVV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSLFIGTITGCIMLQLNGFNIITALAQGFIDFTYRALNSLADPWNAGIILQVLVIGGVIH
HHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LVAKMGGAKAIAEALARKAKTVKSAQLTTWLLGLAVFFDDYANSLIVGPIMRPVTDKLGV
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHCC
SREKLAFVIDATAAPIAGLAIISTWIGLEVGLIGDALKSVGIQADGFGVFLETIPYRFYN
CHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ILILAFVVISAITLREFGPMLKAERRARRGEVLSDTEISSDSEDLEPIEGIKLSVWNAII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
PIGVLIVSSLIGFYYSGWVTIMGGEDLAIIELMNNTPFSFAGIQAAFSNADASVVLFQSA
HHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
LLATILALILGVSRKIFTISEGIGIWIEGMKGLLITGVILILAWSLSSVIKELGTASYLV
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
GVLSDAIPAFLLPAIIFILGSIIAFATGTAYGTMGILMPLAIPLAFAINPEWNFVIVSTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECH
AVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSTGAGCDHIEHVRTQIWYAIFVGIVTVLFGYIPAGLGL
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
SIFIVLPLSLVALFILTMIFGKKVDEKVVSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure
MRNKTRFKVFLTVFAMTMLCSTLVFAAEDAAAVNSVKFGMWTVLPPLVSIVLAFLTKNVV
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
VSLFIGTITGCIMLQLNGFNIITALAQGFIDFTYRALNSLADPWNAGIILQVLVIGGVIH
HHHHHHHHHHHHEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
LVAKMGGAKAIAEALARKAKTVKSAQLTTWLLGLAVFFDDYANSLIVGPIMRPVTDKLGV
HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHHHHHHHHCC
SREKLAFVIDATAAPIAGLAIISTWIGLEVGLIGDALKSVGIQADGFGVFLETIPYRFYN
CHHHHEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
ILILAFVVISAITLREFGPMLKAERRARRGEVLSDTEISSDSEDLEPIEGIKLSVWNAII
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
PIGVLIVSSLIGFYYSGWVTIMGGEDLAIIELMNNTPFSFAGIQAAFSNADASVVLFQSA
HHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHH
LLATILALILGVSRKIFTISEGIGIWIEGMKGLLITGVILILAWSLSSVIKELGTASYLV
HHHHHHHHHHCCCCCEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHH
GVLSDAIPAFLLPAIIFILGSIIAFATGTAYGTMGILMPLAIPLAFAINPEWNFVIVSTS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCEEEEECH
AVLTGAIFGDHCSPISDTTILSSTGAGCDHIEHVRTQIWYAIFVGIVTVLFGYIPAGLGL
HHHHHHHHCCCCCCCCCCCEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCH
SIFIVLPLSLVALFILTMIFGKKVDEKVVSN
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]