| Definition | Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010516 |
| Length | 3,958,233 |
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The map label for this gene is bceB [H]
Identifier: 170756576
GI number: 170756576
Start: 2280530
End: 2282524
Strand: Reverse
Name: bceB [H]
Synonym: CLD_2497
Alternate gene names: 170756576
Gene position: 2282524-2280530 (Counterclockwise)
Preceding gene: 170755326
Following gene: 170757642
Centisome position: 57.67
GC content: 24.11
Gene sequence:
>1995_bases ATGTATTCTAAGATAGCTCTTAAAAATATAAAAAAGAGTTATAAAGATTATACTATATATTTTTTAACACTAATATTAGC TGTTTGTATATTTTATAGCTTTAATTCAATAGAATCACAAAAGGTACTTATTGAAATAGAATTTATGTCTGCGATAATGA AGGCTATTTCAGGTGTTTCAGTGCTAGTATCCATAATATTAGGTGGATTAATAGTGTATGCAAATAATTTTTTAATAAAA AGACGTAAAAAAGAGTTAGGAATGTATATGATTTTAGGTATGGGAAAAAGAAAAATATCTAGAATTTTAGTGACAGAAAC CTTTATAGTGGGAGTTATATCTTTAGTTGGTGGACTTATATTAGGAATTGGAGCATCACAAGGGTTATCTACATTTACTT TAAAGTTATTTGATGTGGGGATGGATGAATATAAGTTTATAATTTCAATAAGTGCTATGGGTAAGACTATATTATACTTT GGAACAATGTTTTTGCTTGTTATGATATTTAATGTATTTGTTATTTCTAAATATAAGGTAATTGATCTATTAATAGCCAA CATAAAAAATGAAGACATAAAATTTAAAAATCCATTTATATATTTATTAACATTTGTTTTATGTCTAATATTTCTTGGAT TTTCATATAAATCCTTGCTAGAGATACCTTTTGATTTAGAACGTAATTTAGAACGTAATATGTCTATACCAATAGCTCTT GCAATAGTTGGTACAGTATTATTTTTCTTTAGCTTAGCTGGAGTTATATTATATGTAACAAATAAAAACAAAAAGATATA TTTTAAAGGGTTAAATATGTTTGTATTAAAACAAATGAACAGTAAAGTTAATACAAACTTTATATCAATGTCTTTAATAT GTTTAATGCTATTTATTACAATAGTAGTATTATCTACAGGAATAAATTTTAAAAAAGTTGAAGAAGAAGGACGTAGAAAA ATTACTCCCTTTGATGCCAGTGTAACGTTATACAATAAAGATGAAAACAAAAATCAAAAGAATCATATAGAAGATATGCT AAATAAAATTGATTTTAAAAAGAGTAAAAATGAAAAATATGCAATTTACAATGATTATTATACAGGGTTAAAGGCAAGTG AATTATTAAAGATTAAGGAAAGAAACTTTGCACGTTACAATGTATATTTTAGTAAAATATCTGATTATAATAAAATTTTA AAATTAAAGGGTGAAAAAGAAATAGCTTTAAATAAGAGTGAAGTTTTAATTTTATCAAGTTCAGGTGGTGCCATTAATCT AATTAATGAAAAATTAAAAAGTAATAGAAGAATTAATATAAAAGGAAAAGAATATTTGATTAAAAATGATAAAGTTATAG AAGAGAATCTTAAAACATCTTCCCGTGCGGATAACCCTTGCACAGTAGTTATAAATGATGAGCTTGTGTCTGATTATAAA ATTAGCTCCTCAGTACTTAATGTAATATATTTAGATACAAATAGAGAAGAGAATAATAAAAAATATAATAAAATTAATGA TAATTATATTAAAGATGGGTATAAGAATTTAGATATTTCTATAGATACCATTACCAAGGATGAGGTGTATTCTAAAAGTA ATGGAATAACAAGTATGATGCTATTTATTGCAATATATTTAGGTATAGTATTTTTAATGACTAGTATGGCTGTATTAGCT CTTCAACAATTATCAGAGGCTAGTGATAGCATAGAAAGATATAAAGCTTTAAAGAGAATTGGGGCAAACAAAAAAATGAT AGACAAAACAATTTTCATTCAAACCTTAATGTATTTTAGTCTTCCAGTGATTCTTGCATTAATTCATTCAATGGTCGTAA TTAAGATAATTAATGATCTTACCAGCATGATTATTAATACAGCTAATTTTAGGTATTCAATTTTAATAACTGTTTTAATA TTTATTATAGTTTATTTGGAATATTTCTATATAACCTATGCAGGATATAAAAATATAGTAAAAAGGAATATTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTACATGAGATGAAGTTAAAAAATCTACTTTAAGTTATGCGCATAGAATTCTTTAGTAGAATTATAGAAGTTATACCTCT TCTTGGAGGTGATGATAATA
Downstream 100 bases:
>100_bases TTTTGTTATATGTAAAATATGAAGATATTAAATAAGACATATGAAAGGATAATAAAACTATGAAAATTTCAGTTGAAAAT TTAAATATGATATATAAAGC
Product: ABC transporter, permease protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 664; Mature: 664
Protein sequence:
>664_residues MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVSVLVSIILGGLIVYANNFLIK RRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYF GTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVEEEGRRK ITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKYAIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKIL KLKGEKEIALNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMMLFIAIYLGIVFLMTSMAVLA LQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLI FIIVYLEYFYITYAGYKNIVKRNI
Sequences:
>Translated_664_residues MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVSVLVSIILGGLIVYANNFLIK RRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYF GTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVEEEGRRK ITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKYAIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKIL KLKGEKEIALNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMMLFIAIYLGIVFLMTSMAVLA LQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLI FIIVYLEYFYITYAGYKNIVKRNI >Mature_664_residues MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVSVLVSIILGGLIVYANNFLIK RRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLILGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYF GTMFLLVMIFNVFVISKYKVIDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFITIVVLSTGINFKKVEEEGRRK ITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKYAIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKIL KLKGEKEIALNKSEVLILSSSGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMMLFIAIYLGIVFLMTSMAVLA LQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFSLPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLI FIIVYLEYFYITYAGYKNIVKRNI
Specific function: Part of the ABC transporter complex BceAB (TC 3.A.1.123.5) involved in bacitracin export [H]
COG id: COG0577
COG function: function code V; ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the ABC-4 integral membrane protein family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003838 [H]
Pfam domain/function: PF02687 FtsX [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 76036; Mature: 76036
Theoretical pI: Translated: 9.99; Mature: 9.99
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 3.6 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH VLVSIILGGLIVYANNFLIKRRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLI HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYFGTMFLLVMIFNVFVISKYKV HHCCCCCCCHHEEEEHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL HHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHCCHHCCCCCCHHH AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFIT HHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IVVLSTGINFKKVEEEGRRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKY HHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCE AIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKILKLKGEKEIALNKSEVLILSS EEEECHHCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHEECCCCCEEECCCEEEEEEC SGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK CCCEEEHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHCCHH ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMM HCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHCCCCCCHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHH LFIAIYLGIVFLMTSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLIFIIVYLEYFYITYAGYKNIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRNI HCCC >Mature Secondary Structure MYSKIALKNIKKSYKDYTIYFLTLILAVCIFYSFNSIESQKVLIEIEFMSAIMKAISGVS CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHHH VLVSIILGGLIVYANNFLIKRRKKELGMYMILGMGKRKISRILVTETFIVGVISLVGGLI HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LGIGASQGLSTFTLKLFDVGMDEYKFIISISAMGKTILYFGTMFLLVMIFNVFVISKYKV HHCCCCCCCHHEEEEHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IDLLIANIKNEDIKFKNPFIYLLTFVLCLIFLGFSYKSLLEIPFDLERNLERNMSIPIAL HHHHHHHCCCCCCEECCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHCCCCCHHCCHHCCCCCCHHH AIVGTVLFFFSLAGVILYVTNKNKKIYFKGLNMFVLKQMNSKVNTNFISMSLICLMLFIT HHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCEEEEECCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH IVVLSTGINFKKVEEEGRRKITPFDASVTLYNKDENKNQKNHIEDMLNKIDFKKSKNEKY HHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCE AIYNDYYTGLKASELLKIKERNFARYNVYFSKISDYNKILKLKGEKEIALNKSEVLILSS EEEECHHCCCCHHHHHHHHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHEECCCCCEEECCCEEEEEEC SGGAINLINEKLKSNRRINIKGKEYLIKNDKVIEENLKTSSRADNPCTVVINDELVSDYK CCCEEEHHHHHHHCCCEEEECCCEEEECCCCHHHHHCCCCCCCCCCEEEEECCCHHCCHH ISSSVLNVIYLDTNREENNKKYNKINDNYIKDGYKNLDISIDTITKDEVYSKSNGITSMM HCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHCCCCCCHHHCCCCCCCEEEEECCHHHHHHCCCCHHHHH LFIAIYLGIVFLMTSMAVLALQQLSEASDSIERYKALKRIGANKKMIDKTIFIQTLMYFS HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH LPVILALIHSMVVIKIINDLTSMIINTANFRYSILITVLIFIIVYLEYFYITYAGYKNIV HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH KRNI HCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9387221; 9384377; 14612242; 12890034 [H]