| Definition | Clostridium botulinum B1 str. Okra, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_010516 |
| Length | 3,958,233 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 170755751
Identifier: 170755751
GI number: 170755751
Start: 3348866
End: 3350284
Strand: Reverse
Name: 170755751
Synonym: CLD_1437
Alternate gene names: NA
Gene position: 3350284-3348866 (Counterclockwise)
Preceding gene: 170754542
Following gene: 170756338
Centisome position: 84.64
GC content: 22.55
Gene sequence:
>1419_bases TTGATATATAATTTATTTATGGTATTTTTTACATTTGCTATATCTTGTATTTTATTTAAAAAAGCTAGTGGAACTCTAAA ACCCAACAAACTAAATCTTATTTCTTATATATTTTATCTATTTATATTGCAAAGCTTTATAGGAAGCAGTTTAATTTATT TAGGTTTTAGGGAACATTATTTAATACAAAAGGTAACTAATTTTTCCACTATAGGTAAAACATATGATATGATATGTTTT ACTGCCATAGCCCTACCCTTAACTATTCTTTTAGTATATAAAATATTTAATATAAATATGAGTAAAGATTATAATGATTA CTTAAATAAAGAAGTAATTTTAGAATATGAGGACAATATTTTTGTAATAACAGTATTAATAAGTATAGTATGCTTAATAT TCACATTAATTTTGTTTATCAAAATGAGATCAATTCCATTGATTGATTTGATAATTCATAGAAGTTCAGGAAATATAGGA AATAAAAGAATCAATATATCACATGGTAATTATATGAATCAATATATACAAAATCTATTAGTTTTAGGACTAACGCCTAT ACTATCTTATCTTTCATATATTTATTACAAATGTACCAAGGCAAATAGATGGAGGATTTTATTTTTTATTTTGTTTATAG CATCTATATTTTTAAAAACTTATAATTATGCAAAGACACCTGTAGTATTTTACATATTTGTTTTCATACTAATAAATATA GTAATAGAAGGTAGTATACCTATAAGGAAATTATTAACAGTATTAGTTTTATGTGTTTTTATAATATTATTAATGTATAT AAAAATAGGATATGACTTTAATAAAGGATTAGATATATATAATGGTCCAATAGGGAGGACTATATTCACTCAAGTAGGAA CTTTGTTTTTACATGTAGATTTATTTCCTTATTATATTCCATATTTAGGTGGGAGAAGTTTTTCTCCAACTATTTTAAAA TTATTTTTAGGAGGAGTATCACAATTTAGATCAGGAAGAGTAGTTATGAATTTTTATAGTCCTGAAAAAGTTGTAGGTGG AACTGCTGGTGTTATGAATTCATTATTTATAGGAGAGGCTTATGCTAATTTTGGTACTATAGGAGTGTTATCATCAGTAT TGTACATTGGACTTTTGTTAAGTATAATATTAATTATTTTTGTGAAAATTAAGAAAACTCCTATAAATATTGTAATATAT GTTACAATAACATCTATATTAGCATCCGCATCTCAAGGTGGATTTATAGATTTTGTATATAATTTTAATATAATATTTAT TACGGTTACACTAATATTAATTAGTTTATTTGCTAAATATATGGATAAAATTAAAATTTTAAAACATATAAAAGTTTATG TACTAAAATTTACTTCCTTAAATATTAAAATTAAGAAAGAGGATAAAAATGAGTGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases GACCTATAGAAAATATGAAAAATCAGTTAAAAAATGCTGATTCATATACTAAAGCTAAACTTTTGAATAAAGAAATTTTT AAATGATGGGATGATGAGAG
Downstream 100 bases:
>100_bases GAATTGTATTTTTCATATACCTTACTATTTAGATTTAAAATGGCCTTCAGGTTCTAATATTAGACCAATAAAAATGATAA AGGCATTTGAAAGTATAGGA
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 472; Mature: 472
Protein sequence:
>472_residues MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHYLIQKVTNFSTIGKTYDMICF TAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNIFVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIG NKRINISHGNYMNQYIQNLLVLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVDLFPYYIPYLGGRSFSPTILK LFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEAYANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIY VTITSILASASQGGFIDFVYNFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC
Sequences:
>Translated_472_residues MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHYLIQKVTNFSTIGKTYDMICF TAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNIFVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIG NKRINISHGNYMNQYIQNLLVLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVDLFPYYIPYLGGRSFSPTILK LFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEAYANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIY VTITSILASASQGGFIDFVYNFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC >Mature_472_residues MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHYLIQKVTNFSTIGKTYDMICF TAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNIFVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIG NKRINISHGNYMNQYIQNLLVLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVDLFPYYIPYLGGRSFSPTILK LFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEAYANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIY VTITSILASASQGGFIDFVYNFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 54088; Mature: 54088
Theoretical pI: Translated: 9.95; Mature: 9.95
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.3 %Cys (Translated Protein) 2.1 %Met (Translated Protein) 3.4 %Cys+Met (Translated Protein) 1.3 %Cys (Mature Protein) 2.1 %Met (Mature Protein) 3.4 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHY CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH LIQKVTNFSTIGKTYDMICFTAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCEEEEEECCCE FVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIGNKRINISHGNYMNQYIQNLL EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHH VLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVD HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LFPYYIPYLGGRSFSPTILKLFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEA HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH YANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIYVTITSILASASQGGFIDFVY HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEE NFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEECCCCCCC >Mature Secondary Structure MIYNLFMVFFTFAISCILFKKASGTLKPNKLNLISYIFYLFILQSFIGSSLIYLGFREHY CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEHHHHHH LIQKVTNFSTIGKTYDMICFTAIALPLTILLVYKIFNINMSKDYNDYLNKEVILEYEDNI HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHCCCEEEEEECCCE FVITVLISIVCLIFTLILFIKMRSIPLIDLIIHRSSGNIGNKRINISHGNYMNQYIQNLL EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHH VLGLTPILSYLSYIYYKCTKANRWRILFFILFIASIFLKTYNYAKTPVVFYIFVFILINI HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH VIEGSIPIRKLLTVLVLCVFIILLMYIKIGYDFNKGLDIYNGPIGRTIFTQVGTLFLHVD HHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH LFPYYIPYLGGRSFSPTILKLFLGGVSQFRSGRVVMNFYSPEKVVGGTAGVMNSLFIGEA HHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCCHHHCCCHHHHHHHHHHHHH YANFGTIGVLSSVLYIGLLLSIILIIFVKIKKTPINIVIYVTITSILASASQGGFIDFVY HHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEHHHHHHCCCCCCEEEEEE NFNIIFITVTLILISLFAKYMDKIKILKHIKVYVLKFTSLNIKIKKEDKNEC ECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEEEEEEECCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA