Definition Escherichia coli SMS-3-5 chromosome, complete genome.
Accession NC_010498
Length 5,068,389

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The map label for this gene is 170682597

Identifier: 170682597

GI number: 170682597

Start: 311216

End: 314491

Strand: Reverse

Name: 170682597

Synonym: EcSMS35_0303

Alternate gene names: NA

Gene position: 314491-311216 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170684180

Following gene: 170680899

Centisome position: 6.2

GC content: 30.46

Gene sequence:

>3276_bases
ATGAAAAAAAATTCTTTAAATGTGATTTTGGATACTGTTTTCTCGGCGAAAAGCATCAATGGTGAGAAATCTCATTCTTT
TATATCGTATAAATTAGTTAAAGCTGTAGAAAATTTAAGTGGATATGACTTGGATCTTTTCCTCAATCGTGCGATAAACC
ATCCTAACTTCCCTAGCAATATGGATTTTTCCTTACGAACAGTTTTTACAATTGAACAATCTAACACTATTGAATTTAAA
AATTTCATTTCAGAATTGGTGTGGTACAAGCATATTTTCATACGATATAAAAAACACCTTAATGATATATTATCGGCAAA
GGCAAGACTTGAGAAGTTAGTTCTTTTCGCAACAGGTAGTGAATGTATAAAATATTTAGATGAAATAGAAAGCTCTTATG
GAGTTAGTTTTTGGAGCATTGATGCTCGTCTCTTAATAAATAAAGTTTTGCTTAACGAAAGCAATGGGTTATATGTTAAA
TCAATTCTATCTAAAACCCACTATAAACTTACAGAGTTTATGTTACAGCAGCTATTATTTAAGCATCAAGTACATAACTT
TGATGATTTTTCAAAGAACCTTATAAAAATACTAGATGATATGCGCACCACTCAAGATAATGGGTATGCTAGAAATTTAG
CTGATGGTATTTCATCCTTTTTAATACCTTTAGAGTTTGATAAAAATATAGATCTCAAAAATAGAACCTTAGCACCATTT
ACCAACCTTCCTTTAATAGATCAATTTATCATATTCCAGAGAACTATAAGCGATTTACAACTTCATGGAAATGGTTTAAG
AAATAGCGAGTTAAGCTTAATTGCAGAAATTAACAGCTTTATTAAAAATAACTATCTCAACAATATTTTAGATGGAAGAG
AGCGTAATATAGAGAATATTGATGAACACTATAAAAGTGTTATTCGACGTTATACTATAGGTGATTATACTGGGTGTATT
TCAGAAATAAATTCAGTTCGAACGCAGAAGACAATTTTGCCATTAATTGAAATATATGCAAAATCCCATGTGTATCTTGA
TAAGAAAATTTCAGACTCATGCATATTCAATAAATTAACAAACTGGCTTATAGCAATTATAAAATGCGACAGACGCGCTG
GAAAATACATCGATGAATTTGAACTTTTAGCATCTAAGATATATTTCAATTCAAATTCATCCTCTCTATTCTTCACATTA
TATAATTTAATAAGTGATAACCATAATAAATTAAACATATCTCGTATAAATCTAACCAAAAATGGTTCCTTTGTAACATC
CCTTCATTTGAATATAACAATCAAGGAACTATGGACTGAACTTGGAATAAAAGAGAATGAGATACCAAAATATCGATTAT
TTAAATTCAAAGACCTAGCAAATCTATCCTTTGATGAAATCAAAAAACACTACGAAGTATACAATGATAATGTAATAATT
CGCTCTGAATATTTAAAAGATTATACTAACTTTTTATTAGAAAATGAAAAGTATGAATTATGCATCCAATTTATAGCTGA
AAACTGCATCGGCAACCCCGCAAATTATTACTACTTCCCAATCCGAAAAATAATTGATTTTGTAAAAGACAATATTTTTG
ACTATGCAAGCGTGGCCTTATCTATATTGATAGATATTTTTGTCAAAAGCACATCAAACACTTCAAATGAGCTTCTTCTC
GAAAGTTATGAGAGTTTAGTAGATATTTCAAATATTAATAGGCCATCTACCCATTATTGCTCTAAGCAATTAACTCCATT
AGAGCACTATTTCCTTAAGTTTATCTGTATACCTTCCGTGATGGATTCAGACCCTTCATTCACAGGCACGGACGACTTGA
AGAAGGAAAGAATTGCTATTATAGATCTATTATTAAAAGAACACGATGATGCAGATTTATTGAAAGAGAAAGACGAAATT
ATAGATGAAATATCATTCGAAGAAATAAAAACAAAATATGAGACAGGAAAAATATTTGTTGATATAGAAAATTTAAAACG
GGCAAAGCTTGAAAGATACAGATATTATTTTGATGCACTTAAGGATTCGCTTATTCTCGGACTAGAACCACCTGAAGACT
TTGCTTTAATTACAGACGATGGGAATATCACAGCCATTCCATCTGGCGATACAAACTCTATAATCCATGAACTTCTAAAA
GAACTAATCTCCGATTTTGTTAAAAATGAAAATTACGGTCTTGATAAATATTTGAGTGCAGATATACGGCATGGTGTTTT
TGAAAATCAACTCAGATCAAGTGCTGAAAAATCGCAATTAATAACTGATATGGATGGTACTGGACAGTATTCGAAAAGCA
ATTTAATTATTGAGACATATCCATTAATTAACCCTATTATAAATAACGAAATAGGGACAGCAATAGCTGATTTCTCTTAT
CACTTTGACATTGAATTGGCTAAAGCCAATTCCTGGTTCAATGTCAAGACAATGCTCATAAGTGAATCACAGCAAGGTAT
GATTGATTTCCTCATTTCTGTTGATATGTTTAATTCATTTAAAGCAGCAGTTTCAAATCAAGCATCTTTTGAGAAGTTTT
TTGACGCTTGTATTAACTTCATGTGGGAAAGAACGTTCAGATGTTTGAATGATATTAAAGAGCGATTGCATTACGAATTT
AAGAGGAATATTTTAGATTTAATTGCCACTCTTAGGCATCAAATTGATATCTATAGAAGACGTAGTTCCATGAGAGAAAT
CCAGGAGAAAATTGACCTCTTGGCCGAAAGCATTAATAAAGAAATTGCAACAGTCTGCGATTGGTTAAATGTACTTGAGT
ATAACGAGGAGAAAATATATAAAATATCATCCGTGATGCAGGCATGTAGGAAAACTTTTTTTAATATACACCATTGTTCT
GATGATGCTATCGTTTTTGATTCAATGTATCATGATGATGAACCAAAATTATCTTATAAAGAAGCCAAGCCTCTAATCAC
ATCAATAATAACAGCGTTAAACAATGCTATGGCCTATGGTAATAAAAAAATCTTTATCAGTATTAAGCCTGAAGAAAAGT
CATGGAAAATAACCATCAGAAATTTGATAATTGAGACAAAGAACAGAACTACCAACCAAATTTTACAAGAGATTGATGAT
AAAATAAAACGAGGGGATAATAGTCTAAATATAAAAGAAGGCGGAGCTGGAATATATAAAATATATGATTTATTATGTTC
ATTACCGCAAAGATTTAATGTGAATCATTGCATCCAAAATAACGAATTCATTTTAAATATTGAGATAAAGAAATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
ACTTGATTTCGTAAACGCAAAACTACGATACTATTAACAAATTCTTCTATGCATTCTTACCGAATGTTGGCGGTAGCGTG
CTTAATCACTCGGATTTAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTCTTCTTGTTGAGGATATTGAATATAAGCGTGATAAGGTGATCGGTTTACTAGAGTCTATTTCTGCCGATGTATCA
GTCGATGTAGCTAAATCTTA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 1091; Mature: 1091

Protein sequence:

>1091_residues
MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSNMDFSLRTVFTIEQSNTIEFK
NFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGSECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVK
SILSKTHYKLTEFMLQQLLFKHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF
TNLPLIDQFIIFQRTISDLQLHGNGLRNSELSLIAEINSFIKNNYLNNILDGRERNIENIDEHYKSVIRRYTIGDYTGCI
SEINSVRTQKTILPLIEIYAKSHVYLDKKISDSCIFNKLTNWLIAIIKCDRRAGKYIDEFELLASKIYFNSNSSSLFFTL
YNLISDNHNKLNISRINLTKNGSFVTSLHLNITIKELWTELGIKENEIPKYRLFKFKDLANLSFDEIKKHYEVYNDNVII
RSEYLKDYTNFLLENEKYELCIQFIAENCIGNPANYYYFPIRKIIDFVKDNIFDYASVALSILIDIFVKSTSNTSNELLL
ESYESLVDISNINRPSTHYCSKQLTPLEHYFLKFICIPSVMDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEI
IDEISFEEIKTKYETGKIFVDIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK
ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETYPLINPIINNEIGTAIADFSY
HFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSFKAAVSNQASFEKFFDACINFMWERTFRCLNDIKERLHYEF
KRNILDLIATLRHQIDIYRRRSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS
DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIRNLIIETKNRTTNQILQEIDD
KIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQNNEFILNIEIKK

Sequences:

>Translated_1091_residues
MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSNMDFSLRTVFTIEQSNTIEFK
NFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGSECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVK
SILSKTHYKLTEFMLQQLLFKHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF
TNLPLIDQFIIFQRTISDLQLHGNGLRNSELSLIAEINSFIKNNYLNNILDGRERNIENIDEHYKSVIRRYTIGDYTGCI
SEINSVRTQKTILPLIEIYAKSHVYLDKKISDSCIFNKLTNWLIAIIKCDRRAGKYIDEFELLASKIYFNSNSSSLFFTL
YNLISDNHNKLNISRINLTKNGSFVTSLHLNITIKELWTELGIKENEIPKYRLFKFKDLANLSFDEIKKHYEVYNDNVII
RSEYLKDYTNFLLENEKYELCIQFIAENCIGNPANYYYFPIRKIIDFVKDNIFDYASVALSILIDIFVKSTSNTSNELLL
ESYESLVDISNINRPSTHYCSKQLTPLEHYFLKFICIPSVMDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEI
IDEISFEEIKTKYETGKIFVDIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK
ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETYPLINPIINNEIGTAIADFSY
HFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSFKAAVSNQASFEKFFDACINFMWERTFRCLNDIKERLHYEF
KRNILDLIATLRHQIDIYRRRSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS
DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIRNLIIETKNRTTNQILQEIDD
KIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQNNEFILNIEIKK
>Mature_1091_residues
MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSNMDFSLRTVFTIEQSNTIEFK
NFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGSECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVK
SILSKTHYKLTEFMLQQLLFKHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF
TNLPLIDQFIIFQRTISDLQLHGNGLRNSELSLIAEINSFIKNNYLNNILDGRERNIENIDEHYKSVIRRYTIGDYTGCI
SEINSVRTQKTILPLIEIYAKSHVYLDKKISDSCIFNKLTNWLIAIIKCDRRAGKYIDEFELLASKIYFNSNSSSLFFTL
YNLISDNHNKLNISRINLTKNGSFVTSLHLNITIKELWTELGIKENEIPKYRLFKFKDLANLSFDEIKKHYEVYNDNVII
RSEYLKDYTNFLLENEKYELCIQFIAENCIGNPANYYYFPIRKIIDFVKDNIFDYASVALSILIDIFVKSTSNTSNELLL
ESYESLVDISNINRPSTHYCSKQLTPLEHYFLKFICIPSVMDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEI
IDEISFEEIKTKYETGKIFVDIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK
ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETYPLINPIINNEIGTAIADFSY
HFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSFKAAVSNQASFEKFFDACINFMWERTFRCLNDIKERLHYEF
KRNILDLIATLRHQIDIYRRRSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS
DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIRNLIIETKNRTTNQILQEIDD
KIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQNNEFILNIEIKK

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 126874; Mature: 126874

Theoretical pI: Translated: 6.03; Mature: 6.03

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.4 %Cys     (Translated Protein)
1.3 %Met     (Translated Protein)
2.7 %Cys+Met (Translated Protein)
1.4 %Cys     (Mature Protein)
1.3 %Met     (Mature Protein)
2.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSN
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCC
MDFSLRTVFTIEQSNTIEFKNFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGS
CCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCH
ECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVKSILSKTHYKLTEFMLQQLLF
HHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCEEEEECCCCCCCCCCCCCCC
TNLPLIDQFIIFQRTISDLQLHGNGLRNSELSLIAEINSFIKNNYLNNILDGRERNIENI
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHH
DEHYKSVIRRYTIGDYTGCISEINSVRTQKTILPLIEIYAKSHVYLDKKISDSCIFNKLT
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECCCCCHHHHHHHHH
NWLIAIIKCDRRAGKYIDEFELLASKIYFNSNSSSLFFTLYNLISDNHNKLNISRINLTK
HHHHHHHHHCCHHCCHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCCEEEEEEEEEEC
NGSFVTSLHLNITIKELWTELGIKENEIPKYRLFKFKDLANLSFDEIKKHYEVYNDNVII
CCCEEEEEEEEEEHHHHHHHHCCCCCCCCCCCEEEEHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCEEE
RSEYLKDYTNFLLENEKYELCIQFIAENCIGNPANYYYFPIRKIIDFVKDNIFDYASVAL
EHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SILIDIFVKSTSNTSNELLLESYESLVDISNINRPSTHYCSKQLTPLEHYFLKFICIPSV
HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCHH
MDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEIIDEISFEEIKTKYETGKIFV
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEE
DIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK
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ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETY
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEC
PLINPIINNEIGTAIADFSYHFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSF
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HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECC
DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIR
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NLIIETKNRTTNQILQEIDDKIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQN
HHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEECC
NEFILNIEIKK
CCEEEEEEECC
>Mature Secondary Structure
MKKNSLNVILDTVFSAKSINGEKSHSFISYKLVKAVENLSGYDLDLFLNRAINHPNFPSN
CCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCC
MDFSLRTVFTIEQSNTIEFKNFISELVWYKHIFIRYKKHLNDILSAKARLEKLVLFATGS
CCCEEEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCH
ECIKYLDEIESSYGVSFWSIDARLLINKVLLNESNGLYVKSILSKTHYKLTEFMLQQLLF
HHHHHHHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
KHQVHNFDDFSKNLIKILDDMRTTQDNGYARNLADGISSFLIPLEFDKNIDLKNRTLAPF
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HHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCHH
MDSDPSFTGTDDLKKERIAIIDLLLKEHDDADLLKEKDEIIDEISFEEIKTKYETGKIFV
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCCEEEE
DIENLKRAKLERYRYYFDALKDSLILGLEPPEDFALITDDGNITAIPSGDTNSIIHELLK
EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCCCCCCEEEECCCCEEEECCCCHHHHHHHHHH
ELISDFVKNENYGLDKYLSADIRHGVFENQLRSSAEKSQLITDMDGTGQYSKSNLIIETY
HHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCEEEEEC
PLINPIINNEIGTAIADFSYHFDIELAKANSWFNVKTMLISESQQGMIDFLISVDMFNSF
CHHHHHHCCCHHHHHHCCEEEEEEEEECCCCCEEEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
KAAVSNQASFEKFFDACINFMWERTFRCLNDIKERLHYEFKRNILDLIATLRHQIDIYRR
HHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RSSMREIQEKIDLLAESINKEIATVCDWLNVLEYNEEKIYKISSVMQACRKTFFNIHHCS
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEECC
DDAIVFDSMYHDDEPKLSYKEAKPLITSIITALNNAMAYGNKKIFISIKPEEKSWKITIR
CCCEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCEEEEE
NLIIETKNRTTNQILQEIDDKIKRGDNSLNIKEGGAGIYKIYDLLCSLPQRFNVNHCIQN
HHEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHEECC
NEFILNIEIKK
CCEEEEEEECC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9163424 [H]