Definition Synechococcus sp. PCC 7002 chromosome, complete genome.
Accession NC_010475
Length 3,008,047

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The map label for this gene is 170078147

Identifier: 170078147

GI number: 170078147

Start: 1622752

End: 1625319

Strand: Reverse

Name: 170078147

Synonym: SYNPCC7002_A1538

Alternate gene names: NA

Gene position: 1625319-1622752 (Counterclockwise)

Preceding gene: 170078152

Following gene: 170078145

Centisome position: 54.03

GC content: 52.88

Gene sequence:

>2568_bases
ATGGGATTTAATGGGAAAGGCTGCCATTTCCCGAAGTTTTTTAACCCTTGTTCTATGTCTGCTTCTAAGTCTCCAGCCCC
TTTATTGGCCTACTTCACCGCTTTTTTTTACATTCTCTTTAGCCTCATTCCCGATAGCCATAGCATGATGGTGGCCTGGT
CATGGGTGTTTGTGTGGCAGGTGGGTCTGTTCTGTCCTTTGTTGTGGTTTTTGGTGCAGCTATGGGATAACCGCCGCCTC
TATCTGTTGGGCAACGGGTTTGATCAGGGTCTAATTGCAATTTTAATCAGCTTGGGGATTTCCACCCTGGGGGCAGAATT
TCCCCAGCAAGCCCGCTGGCAAGCCTGGGCCTGTTTAGGGTTTATCGCCGCGCTCTACCCCATTAGTCGTTGGCTGAATA
GTGTGACTGGTCGTTATCGATTATTTTTGGGACAAGGATATTTAAGTTTGGCCTTCGTTGCTTTTAGTTTGGCGCTGTGG
CTGAGTCGGACATTTTTGCCGGAAATTGAGCGGCTCCGGGATTTGGGCGTTGATGGGGCGGTGCAACAGTTTGATTTTTC
GCTGCTGGAACTGCGCAACTGGGCTCCCTTGGGTCACCAAAATTATGTGGCCGGTTATCTGATTCTTTGTTTACCAACCC
TCCTGGGCTTGGCGATTTTACATCGGGATTGGCGGCGCTGGCTTTGGCTGACGGGGGGGGTGATTGGGGCGGTAGATCTC
TATACCACGAGCTCTCGGGGGGGTTGGCTTGGGTTGGCGATCGCCTCGGTGGTGGCCTTCGGGTTTGCTTGGGGGTTTAG
TCAGATTCGCAAATTTTACTTAGTGCTGGCGGGAATCATTTCCACAGGGGTTTTAGGGATTTTTGTGCTGACCAATAACC
GCCTCTACAATCTCGTGGTGCCGATTTTGCAGGGGGAATTTGGGGAATTAAATTACCGTTGGGTCAATGCCCAGGTGGGT
GGGGCCATGGGTCTCGACCATTGGTGGACGGGGGCTGGTTTAGGAAATGCGTTCTTGTTGTATCAAAATTACCGCCCAAT
CACAGCGGGTCGCCTTTCGGAAATCATTTATCAACTCCACAGTACCCCGGTGCAACTCTGGGCGGAAATGGGCATCTGGG
GCTTGGGTTTGTTCTTTGGTTCGATTGTTTTTCTGGGGGTGATCCTCTGGCGACTGCGGGGCCATGTTAAAGGGATGGCA
CGGGAAGACCGCATTTTGTTGGGCAGTATTTATACCGGGCTAGTCGGCTATTGGGCCTTGAGTTGGACCGATTATCAACT
GGATAATGTGGCCATTAGCGGCATCATTACAATTCTGGTGGCCCTGCTCGCGGCGATCGCCCGTCAAGATCAACCCCAAA
TATCTCTCCCGTTCCAGCCAAACCCAGAAAAATTTTTAGGAAAACCCCGTCTCGTCGCTCTCGGCCTAGTGGGAATTTAC
GGTGCCGTTGCCATCTGGTTAGCGCCGATCCAAGCCGCCTGGGAGCGATCCAGCACCGGATTTTTAGCATTGCGCCAGGA
AACCCCTGATTATGACCGTTTTGTGGAAAATTTGACCGCCGCCCATGACCTCGCTCCCTGGGAACCTTACTATTCCTATC
AGTTGGGTTGGAACCTCGGAGAATTAGCTCTCCAGACCACAGACTTAGAACAACGGCAACACTATCTCCAGGAGGCGATC
CAATGGTTTGACCAGGGCAACCAAGCATCTCCCTACCGGGAATTTGGCCGCAGCAACGTGGCCTGGCTCCACATCGCCAA
CAATGAACCCAATCTAGCAACGGCGGATTTTTACCAATCGGCCCAGCTTGTGCCCGCGAAACGAGGCATTTTCTACGGGT
TGGGGTTAAGTTTGTTGGCCCAGGACAAAACAGATCTTGCGGTCGAGGCGATCGCCTTAGAAATTCTTCGTGATCCCCCA
TTTATCACCAGTCCCATTTGGCGAGGCGGGGGCTTGGGAGAGCTTTATCCAGCGGTGGTGGCGCGGGTGATGGGTCACTA
CGAACAGCTACTGGCGCAATATCCCGATGATCCGTTGTTACATCGCTGTCGGGGTGGCATCGCCTGGTGGATTGGGGATT
TTGCCCTGGCCGAAACGGAATTTCGGCAATATTTCGACGCCACGGCCCTCAGTTTACTCCCCGGTCGGGAGGCCCTGGGT
CAGGAAACGGCGATCGCCCTGTTGCAAGCCACCTGGGAAAACCCAGAAAAACGCTTAGAACTTCTAGAGGAAGCCTGGGC
TAGGGTTTCGCCCCAACAGCCCCTCACCGACCAACAACGGCAAGAATTTTTAGCCACCATGGCCAATAGTCCAGATTTTG
CCACTTGGATTCGCGTCGGTGCCCCAGTCCTCCAGTACCGTCGCCAGCGCAGCGGGTTTAATGTGAACAGTCGCCACATT
GACGGGGACAATCCCACGGATTTTTGGACGGTGAGCGAAAACCTCGCAATTAACACCTGGTTCGGCGAATTTTTCCCGTC
CGTTGTCTATAAACCTCGGTTTGACTTGCAATTACAGCCCCTCAGGGACAGTCTTTATGCAACCCTCAAAACGGAAATTA
ACCCCTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTTGCCTGTGGTGGCCTTATCAGAGAAAAGAGGCATGGGTTGAGGGGGATGACTTAAAAATCCTATCTATTTTAGCCCAT
GGCCATGGGAGTTCTAGAAA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAATTGAGCCAATTACTCAAGCCAGCGGGTAACGGCAAGAAAATTAACGCCACAAAAACCAGGGTAAACATCCCCAACAG
GTCGCGGCGATTGTCCAAAT

Product: O-antigen polymerase domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: O-Antigen Polymerase Domain-Containing Protein; O-Antigen Polymerase Family

Number of amino acids: Translated: 855; Mature: 854

Protein sequence:

>855_residues
MGFNGKGCHFPKFFNPCSMSASKSPAPLLAYFTAFFYILFSLIPDSHSMMVAWSWVFVWQVGLFCPLLWFLVQLWDNRRL
YLLGNGFDQGLIAILISLGISTLGAEFPQQARWQAWACLGFIAALYPISRWLNSVTGRYRLFLGQGYLSLAFVAFSLALW
LSRTFLPEIERLRDLGVDGAVQQFDFSLLELRNWAPLGHQNYVAGYLILCLPTLLGLAILHRDWRRWLWLTGGVIGAVDL
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DGDNPTDFWTVSENLAINTWFGEFFPSVVYKPRFDLQLQPLRDSLYATLKTEINP

Sequences:

>Translated_855_residues
MGFNGKGCHFPKFFNPCSMSASKSPAPLLAYFTAFFYILFSLIPDSHSMMVAWSWVFVWQVGLFCPLLWFLVQLWDNRRL
YLLGNGFDQGLIAILISLGISTLGAEFPQQARWQAWACLGFIAALYPISRWLNSVTGRYRLFLGQGYLSLAFVAFSLALW
LSRTFLPEIERLRDLGVDGAVQQFDFSLLELRNWAPLGHQNYVAGYLILCLPTLLGLAILHRDWRRWLWLTGGVIGAVDL
YTTSSRGGWLGLAIASVVAFGFAWGFSQIRKFYLVLAGIISTGVLGIFVLTNNRLYNLVVPILQGEFGELNYRWVNAQVG
GAMGLDHWWTGAGLGNAFLLYQNYRPITAGRLSEIIYQLHSTPVQLWAEMGIWGLGLFFGSIVFLGVILWRLRGHVKGMA
REDRILLGSIYTGLVGYWALSWTDYQLDNVAISGIITILVALLAAIARQDQPQISLPFQPNPEKFLGKPRLVALGLVGIY
GAVAIWLAPIQAAWERSSTGFLALRQETPDYDRFVENLTAAHDLAPWEPYYSYQLGWNLGELALQTTDLEQRQHYLQEAI
QWFDQGNQASPYREFGRSNVAWLHIANNEPNLATADFYQSAQLVPAKRGIFYGLGLSLLAQDKTDLAVEAIALEILRDPP
FITSPIWRGGGLGELYPAVVARVMGHYEQLLAQYPDDPLLHRCRGGIAWWIGDFALAETEFRQYFDATALSLLPGREALG
QETAIALLQATWENPEKRLELLEEAWARVSPQQPLTDQQRQEFLATMANSPDFATWIRVGAPVLQYRRQRSGFNVNSRHI
DGDNPTDFWTVSENLAINTWFGEFFPSVVYKPRFDLQLQPLRDSLYATLKTEINP
>Mature_854_residues
GFNGKGCHFPKFFNPCSMSASKSPAPLLAYFTAFFYILFSLIPDSHSMMVAWSWVFVWQVGLFCPLLWFLVQLWDNRRLY
LLGNGFDQGLIAILISLGISTLGAEFPQQARWQAWACLGFIAALYPISRWLNSVTGRYRLFLGQGYLSLAFVAFSLALWL
SRTFLPEIERLRDLGVDGAVQQFDFSLLELRNWAPLGHQNYVAGYLILCLPTLLGLAILHRDWRRWLWLTGGVIGAVDLY
TTSSRGGWLGLAIASVVAFGFAWGFSQIRKFYLVLAGIISTGVLGIFVLTNNRLYNLVVPILQGEFGELNYRWVNAQVGG
AMGLDHWWTGAGLGNAFLLYQNYRPITAGRLSEIIYQLHSTPVQLWAEMGIWGLGLFFGSIVFLGVILWRLRGHVKGMAR
EDRILLGSIYTGLVGYWALSWTDYQLDNVAISGIITILVALLAAIARQDQPQISLPFQPNPEKFLGKPRLVALGLVGIYG
AVAIWLAPIQAAWERSSTGFLALRQETPDYDRFVENLTAAHDLAPWEPYYSYQLGWNLGELALQTTDLEQRQHYLQEAIQ
WFDQGNQASPYREFGRSNVAWLHIANNEPNLATADFYQSAQLVPAKRGIFYGLGLSLLAQDKTDLAVEAIALEILRDPPF
ITSPIWRGGGLGELYPAVVARVMGHYEQLLAQYPDDPLLHRCRGGIAWWIGDFALAETEFRQYFDATALSLLPGREALGQ
ETAIALLQATWENPEKRLELLEEAWARVSPQQPLTDQQRQEFLATMANSPDFATWIRVGAPVLQYRRQRSGFNVNSRHID
GDNPTDFWTVSENLAINTWFGEFFPSVVYKPRFDLQLQPLRDSLYATLKTEINP

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 96444; Mature: 96313

Theoretical pI: Translated: 6.33; Mature: 6.33

Prosite motif: PS00092 N6_MTASE

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.7 %Cys     (Translated Protein)
1.1 %Met     (Translated Protein)
1.8 %Cys+Met (Translated Protein)
0.7 %Cys     (Mature Protein)
0.9 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MGFNGKGCHFPKFFNPCSMSASKSPAPLLAYFTAFFYILFSLIPDSHSMMVAWSWVFVWQ
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
VGLFCPLLWFLVQLWDNRRLYLLGNGFDQGLIAILISLGISTLGAEFPQQARWQAWACLG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
FIAALYPISRWLNSVTGRYRLFLGQGYLSLAFVAFSLALWLSRTFLPEIERLRDLGVDGA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
VQQFDFSLLELRNWAPLGHQNYVAGYLILCLPTLLGLAILHRDWRRWLWLTGGVIGAVDL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
YTTSSRGGWLGLAIASVVAFGFAWGFSQIRKFYLVLAGIISTGVLGIFVLTNNRLYNLVV
EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCEEEHHH
PILQGEFGELNYRWVNAQVGGAMGLDHWWTGAGLGNAFLLYQNYRPITAGRLSEIIYQLH
HHHCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHH
STPVQLWAEMGIWGLGLFFGSIVFLGVILWRLRGHVKGMAREDRILLGSIYTGLVGYWAL
CCHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
SWTDYQLDNVAISGIITILVALLAAIARQDQPQISLPFQPNPEKFLGKPRLVALGLVGIY
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEECCCCCCCHHHCCCCHHHHHHHHHHH
GAVAIWLAPIQAAWERSSTGFLALRQETPDYDRFVENLTAAHDLAPWEPYYSYQLGWNLG
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCEEEECCCHH
ELALQTTDLEQRQHYLQEAIQWFDQGNQASPYREFGRSNVAWLHIANNEPNLATADFYQS
HHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHCCCCEEEEEEECCCCCCEEHHHHHC
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HHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHC
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HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCEECC
LRDSLYATLKTEINP
HHHHHHHHHHCCCCC
>Mature Secondary Structure 
GFNGKGCHFPKFFNPCSMSASKSPAPLLAYFTAFFYILFSLIPDSHSMMVAWSWVFVWQ
CCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHH
VGLFCPLLWFLVQLWDNRRLYLLGNGFDQGLIAILISLGISTLGAEFPQQARWQAWACLG
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHH
FIAALYPISRWLNSVTGRYRLFLGQGYLSLAFVAFSLALWLSRTFLPEIERLRDLGVDGA
HHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCH
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HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEE
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EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEEEECCCEEEHHH
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HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECCCCEEEEHHHHHHHHHHCCCCCCCEECC
LRDSLYATLKTEINP
HHHHHHHHHHCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA