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The map label for this gene is yfbS [C]

Identifier: 167625439

GI number: 167625439

Start: 4306085

End: 4307809

Strand: Reverse

Name: yfbS [C]

Synonym: Shal_3531

Alternate gene names: 167625439

Gene position: 4307809-4306085 (Counterclockwise)

Preceding gene: 167625440

Following gene: 167625438

Centisome position: 82.42

GC content: 48.52

Gene sequence:

>1725_bases
ATGGCCGATTTGTGGGTGTTGTCGTGCATATTATTTGCCTTAGTCGCCGCCTTGATGGCGGGGCTATGGACACCTGCAGC
GCTATTTTTTATTGCGTCGTTAACCACCTACTTGCTGGGAATGGTCGAGCTTGAAACGGCACTGGCAAGTTTTACCAATG
CCAGTTTAGTCACCCTAGTGCTGCTGATCATGTCGACGGCAGCGCTAGAGAAAACCTCATTACTGGGCAAGTTAAGCCAA
GTGGTGGGGCGTGGCTCGCTCGCATCGACCATGGCTAAGCTAGGTTTCTCGACGGCGATATTATCGTCGTTTACTAACAA
TACCGCGGTGGTGGCCTCACTCATAGGTGTGGTGCGCCGTAACCAAGCCCATGCGCCAGCTAAGCTGTTACTACCCTTAT
CTTATGCGGCAATTCTAGGTGGAACGCTAACGCTTATTGGCACCTCGACTAACTTAATCGTCAATTCATTTGTAGAAAAC
GCAGGCCTAGTACCTTTAGGCTTCTTTGAGTTTTCTATAATCGGCATTGTTATTGTTATCTCGGGCGTGGGTTTATTGGT
GTTGTTAGCTAACTGGTTACCCGATAGGCGGGAAGAGTCTGCTGATGAGACCCTGCCGTATTTACTCGAAGCTCGGGTTG
CTAAAGAGTCACAACTGATAGGCCAGAGCGTACAAGATAATCGTTTGCGCGCGCTTAAAAAGCTGTACTTAGTTGAGCTT
GAACGCAGCGGAATTCGTATCTGTCCGGTACCGCCGCATTTAGTCTTGCAGAGTGAAGATGTGCTGCGCTTTAGTGGCGC
GGTGGAGTCGGTTGAACTGCTGCATCAATTTGATGGCCTTGAATGGTTTGGTAAGCAACAGGCTAAAGGCCAAAACTTGA
TTGAAGCGGTATTGGCTCCTAGCTCAACCCTTGTTGGGCGCTCATTAAAGGAGTCTACCTTTAGAGAAAAGTTCGATGGC
GCCGTTTTGGCAATTCGTCGCGGGCACCATCCACTTAAAGGCGGTTTAGGTGACATAGCGCTGCAAGCGGGCGATGTGTT
GTTAATCACCCCAGGTGATAGTTTTATCAGTAATACTAAGTTGGCATCAGAGTTCGCCGCGGTGAGTGGCCTAGATTTAA
GTGTTAGGCTGGATTCTCGCCGTAGCCATTGGGTGCTAGCGGGTTTTTTAATTACCATCTTAGCGAGTTTGACCGGTGTT
TTGCCTTTAGTGAAGGGACTGCTTCTGCTGTTGCTGAGCTATATCGCTATAGGTGCGGTTAGCCTATCTGAGCTAAAGCG
TCGTTTTCCGTTTGAGCTGGTGGTCATCGTTGGCAGCGCATTAAGCTTGGCGAACTTGATGCTATCAACCGGACTTGCCG
ATGATATCGCCTCATTTATTTTAGGGGCGATTAATGGCTACGGGGTATTTGCGGCGTTTGTGGCGGTATATTTGATGACC
TTGTTGCTGACGGAGCTGATCACCAATAATGCCGCTGCGGCGCTCTCTTTTCCGGTGGCTTATGCTATCGCGCTCAGTTA
CGGCGTCGATACTCGGCCGTTTATTTTAGCTGTGGTGTTTGGCGCCAGCGCCAGCTTTATTTCACCCTACGGTTATCAAA
CTAACTTAATGGTTTATAACGCGGGTAATTATCGTTTTAGTGATTTTGTTCGATTGGGCTTACCGCTGTCGCTGTTGTAT
TCAGCAATTGTAGTGTTATTAGTTCCGTTGTTTTTCCCATTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CTCAGCAATACAGTAAATTTGAACTGGAGCTGAATGCATTAATTCGCAAGCAATATCCTCACTGGCAAGCGATAGATATT
AGCAAGGTTGAGGGCTAGCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCTTGTTGTGCAGTTCTTTTATGTACAGTTCTTTTATTTACAGTTCTTTTATGTGTGCCTCTAAGTTGGCTACGTATTGT
ATAGATTAAGTTTTTTGGAG

Product: TrkA domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 574; Mature: 573

Protein sequence:

>574_residues
MADLWVLSCILFALVAALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALASFTNASLVTLVLLIMSTAALEKTSLLGKLSQ
VVGRGSLASTMAKLGFSTAILSSFTNNTAVVASLIGVVRRNQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVEN
AGLVPLGFFEFSIIGIVIVISGVGLLVLLANWLPDRREESADETLPYLLEARVAKESQLIGQSVQDNRLRALKKLYLVEL
ERSGIRICPVPPHLVLQSEDVLRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAPSSTLVGRSLKESTFREKFDG
AVLAIRRGHHPLKGGLGDIALQAGDVLLITPGDSFISNTKLASEFAAVSGLDLSVRLDSRRSHWVLAGFLITILASLTGV
LPLVKGLLLLLLSYIAIGAVSLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYLMT
LLLTELITNNAAAALSFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYNAGNYRFSDFVRLGLPLSLLY
SAIVVLLVPLFFPF

Sequences:

>Translated_574_residues
MADLWVLSCILFALVAALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALASFTNASLVTLVLLIMSTAALEKTSLLGKLSQ
VVGRGSLASTMAKLGFSTAILSSFTNNTAVVASLIGVVRRNQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVEN
AGLVPLGFFEFSIIGIVIVISGVGLLVLLANWLPDRREESADETLPYLLEARVAKESQLIGQSVQDNRLRALKKLYLVEL
ERSGIRICPVPPHLVLQSEDVLRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAPSSTLVGRSLKESTFREKFDG
AVLAIRRGHHPLKGGLGDIALQAGDVLLITPGDSFISNTKLASEFAAVSGLDLSVRLDSRRSHWVLAGFLITILASLTGV
LPLVKGLLLLLLSYIAIGAVSLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYLMT
LLLTELITNNAAAALSFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYNAGNYRFSDFVRLGLPLSLLY
SAIVVLLVPLFFPF
>Mature_573_residues
ADLWVLSCILFALVAALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALASFTNASLVTLVLLIMSTAALEKTSLLGKLSQV
VGRGSLASTMAKLGFSTAILSSFTNNTAVVASLIGVVRRNQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVENA
GLVPLGFFEFSIIGIVIVISGVGLLVLLANWLPDRREESADETLPYLLEARVAKESQLIGQSVQDNRLRALKKLYLVELE
RSGIRICPVPPHLVLQSEDVLRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAPSSTLVGRSLKESTFREKFDGA
VLAIRRGHHPLKGGLGDIALQAGDVLLITPGDSFISNTKLASEFAAVSGLDLSVRLDSRRSHWVLAGFLITILASLTGVL
PLVKGLLLLLLSYIAIGAVSLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYLMTL
LLTELITNNAAAALSFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYNAGNYRFSDFVRLGLPLSLLYS
AIVVLLVPLFFPF

Specific function: Unknown

COG id: COG0471

COG function: function code P; Di- and tricarboxylate transporters

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 2 RCK C-terminal domains [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1788629, Length=610, Percent_Identity=26.5573770491803, Blast_Score=152, Evalue=5e-38,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001898
- InterPro:   IPR006037 [H]

Pfam domain/function: PF00939 Na_sulph_symp; PF02080 TrkA_C [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 61300; Mature: 61169

Theoretical pI: Translated: 7.15; Mature: 7.15

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.4 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.2 %Met     (Mature Protein)
1.6 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MADLWVLSCILFALVAALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALASFTNASLVTLV
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LLIMSTAALEKTSLLGKLSQVVGRGSLASTMAKLGFSTAILSSFTNNTAVVASLIGVVRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
NQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVENAGLVPLGFFEFSIIGIVIVI
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
SGVGLLVLLANWLPDRREESADETLPYLLEARVAKESQLIGQSVQDNRLRALKKLYLVEL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERSGIRICPVPPHLVLQSEDVLRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAP
HCCCEEECCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHCCHHHHHHHHHCC
SSTLVGRSLKESTFREKFDGAVLAIRRGHHPLKGGLGDIALQAGDVLLITPGDSFISNTK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHEEECCCEEEECCCCHHHHHHH
LASEFAAVSGLDLSVRLDSRRSHWVLAGFLITILASLTGVLPLVKGLLLLLLSYIAIGAV
HHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYLMT
HHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LLLTELITNNAAAALSFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYN
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE
AGNYRFSDFVRLGLPLSLLYSAIVVLLVPLFFPF
CCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
ADLWVLSCILFALVAALMAGLWTPAALFFIASLTTYLLGMVELETALASFTNASLVTLV
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHH
LLIMSTAALEKTSLLGKLSQVVGRGSLASTMAKLGFSTAILSSFTNNTAVVASLIGVVRR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHC
NQAHAPAKLLLPLSYAAILGGTLTLIGTSTNLIVNSFVENAGLVPLGFFEFSIIGIVIVI
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCHHHHHHHHHHCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHH
SGVGLLVLLANWLPDRREESADETLPYLLEARVAKESQLIGQSVQDNRLRALKKLYLVEL
HHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHH
ERSGIRICPVPPHLVLQSEDVLRFSGAVESVELLHQFDGLEWFGKQQAKGQNLIEAVLAP
HCCCEEECCCCCCEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHCCHHCCHHHHHHHHHCC
SSTLVGRSLKESTFREKFDGAVLAIRRGHHPLKGGLGDIALQAGDVLLITPGDSFISNTK
CHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCCCCCCHHHEEECCCEEEECCCCHHHHHHH
LASEFAAVSGLDLSVRLDSRRSHWVLAGFLITILASLTGVLPLVKGLLLLLLSYIAIGAV
HHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SLSELKRRFPFELVVIVGSALSLANLMLSTGLADDIASFILGAINGYGVFAAFVAVYLMT
HHHHHHHHCCEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHH
LLLTELITNNAAAALSFPVAYAIALSYGVDTRPFILAVVFGASASFISPYGYQTNLMVYN
HHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEEEEEEE
AGNYRFSDFVRLGLPLSLLYSAIVVLLVPLFFPF
CCCCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8905231 [H]