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The map label for this gene is 167624023

Identifier: 167624023

GI number: 167624023

Start: 2528885

End: 2531323

Strand: Reverse

Name: 167624023

Synonym: Shal_2099

Alternate gene names: NA

Gene position: 2531323-2528885 (Counterclockwise)

Preceding gene: 167624024

Following gene: 167624018

Centisome position: 48.43

GC content: 41.98

Gene sequence:

>2439_bases
ATGTCGCAACCTCAATCAATTCCCACTCAACCAAGGCAGAAAGATATTAGTTTAGTTAAACGTTTTGTAGACTTTACCGC
CAATCAGCTGATCCTTAAAAGGAAACCTTTAGGGCTATTGTTTCTATTAATCACATTATTGTTAAGTTACTCAGCCCTCG
ATACACGCTTTGATCCCGGATTTACCAAACTGGTTCCTATTCAGCATCCGTATATGCAGGCTTTTTTAAAGCATTCAAAT
ACATTTACCGGAAGTAACCGCATCATGGTTAGCATGACTTGGACCGGTGAAGGTGATATTTATAACGCTGAATTTCTTGC
TCGCTTAAGAAAAGTCCATGATGAAGTTATATTTACGCCAGGGATCAATAGAACAACAGTAAGATCCTTGTTCGCTCCTG
AAGTCCGGTATATGGAAGTCACTGAATTCGGTTTTATGGGAGATGTCGTTATCCCCTCTCGTTTTACCGCTGATGAGGCT
GGACTTAATTGGGTACGCACTAATGTGACTAAATCTGGTCAAGTGGGAAATCTCGTTTCTAATGATTTGAAATCAGCGAT
GGTTCAAGCAGATTTAATGGAAATGGATCCTGAAACGGGTTTAGCCACCGATTACGCGCAGGTAGCTGCACACTTAGAAC
AAATTCGCAGTGAGTTGGCCGGAGCTGGAATTGAGATCCAGATCATCGGTTTTGCTAAGGTGATGGGCGATGTGATGGAC
GGTTTATCAACTGTGCTGTTGTTTTTTGTCATCGCATTTTTTATCACTTTGCTGCTACTTTGGCATTATACTTTATCAAT
AAAGCTCACCTTATTAGCAATCGCTGTTGCGTTGCTGCCTGTTGTTTGGTTACTCGGTATATTACCTTTACTCGGTTACG
GCATCGACCCTATGTCGGTTCTGGTACCATTTCTCATTTTTTCAATCGGTGTTTCCCATGCTGTACAGATGACTAATGTG
TGGAAACAAGACGTACTTGATGGCAATAGTTCGCCCGAGGCGGCGGTGAATGCTATTCGAAAATTGGCTATACCAGGAAC
TGTTGCCTTACTGGCAAATGCCCTTGGCTTCATGGTCATCATGGTTATTGATATCCCCATGGTACAAGAGCTTGGTATGA
CAGCCTGTTTAGGCGTGGCATTGATGATCATTACCAACAAAATGTTCATGCCTGTAATATTATCTTATCTCACACTCGAG
AAAATGGCGCTCCGCAAAAACGATGAAGTAATTGATAAACAAAAACAGATTTGGTGGAAAGTCTCCGCTTTAGCGACACC
TAAGCCTGCTATAGCATCTGTTACTGTAATGATGATTTTATTAGCCTTAGGGACCTGGCAGTCTCGCTCGTTACTCACTG
GCGATATTGGCAGTGGCGTACCAGAACTCAGAGAAGACTCCCAATACAATCTAGATAATGCACAAATCATCAAGGATTAC
TCTATTGGTATGGACGTATTGTCTGTGTACTTAGAGACTTATAATCGAGAAGAGTCTTGCCTCGACTGGGAAATTATGAA
CGCCATAGACCGTTTTGATTTGCATATGAGAGGAGTCGATGGTGTACGCTCTGTTAAGACAACAGCAGGTTTAGCTAAGC
TTTATGTTTCAGGCAACAATGAGGGTAATCCTTTATGGCGAACGCTACAGCGAGACTCTAATGCACTACTAGCCGGTGCC
AGTGCTGCCAACCCTTTGCACGCACTTAACGATAATGGCTGTAAAACCATTAACATGCAGGTTTATTTAGCTGATCACCA
AGATGCGACATTAAAGCATGTCGTTAACGAGATTAGGAGTTTTACCGACCAACAACAACTAAATAACGCGGAATTTAGAC
TATTAGGCGGTAATGCTGGTGTGGCATCAGCTACCAATGAAGCCGTTGAAAAGGCAGAAGTACAGATGCTAATCTCTATC
TTTAGCGCTATTAGTTTGCTTTGCTGGATAACGTTTAGATCTGCTCGAGGTGTTCTATGTGTGATCCTGCCACTAATGCT
GGTTTGTATTCTTTGTAATGCATTAATGGCATTGCTTGGAATTGGTCTGAAGGTATCAACGTTACCCGTAATAGCCTTAG
GTATAGGCGTGGGTGTTGATTACGGGATCTATATTTATGAAAAGATGCAGCACGCACTTTATCAAGGCCATGATCTACGA
AATTCATTCTACCAAGCAATGAAAAGCCGTGGAACAGCCGCAGTATTTACTGCTGTTACAATGTCGATAGGTGTAGGAAC
TTGGGCATTTTCAGCTCTAAAATTCCAGGCTGACATGGGGATTTTACTCGCGTTTATGTTTTTAGTTAACGTATTTGGAG
CAATCTTTTTATTGCCTGCTCTTGCCTGTTTACTTGGTGTTAAGCCAGCTAAAATCTCGCAAAGCGATATCTCAGAGTCA
TCAGTTAACGACAATAACCTAAAGCCAGTTAAACTTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CACTCTTTAAAACAACAAAAAACGGCTAAAACAGAAACCAGAAAAATCGTAAAACCAAATACTAATTCGAATACATAACC
GGCACCCCTTGGAGTTTTCT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTCATACAGGAAAAGTGAAAAGCTTGTATTCACTTTTCCTTCATTCCCTTATCCTTCACTACTAAGCTCTCATTGAAGCT
CTCACTGTAGTTTAATCCAT

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: RND Superfamily Exporter; Patched Family Protein; Exporter Of RND Superfamily Protein; Efflux Transporter Hydrophobe/Amphiphile Efflux-3 Family; Transporter Protein; Polyketide Cyclase/Dehydrase; Exporters Of RND Superfamily; Exporter Of RND Superfamily; RND Family Multidrug Efflux Transporter; RND Superfamily Transporter; RND Family Transporter; RND Family Efflux Transporter

Number of amino acids: Translated: 812; Mature: 811

Protein sequence:

>812_residues
MSQPQSIPTQPRQKDISLVKRFVDFTANQLILKRKPLGLLFLLITLLLSYSALDTRFDPGFTKLVPIQHPYMQAFLKHSN
TFTGSNRIMVSMTWTGEGDIYNAEFLARLRKVHDEVIFTPGINRTTVRSLFAPEVRYMEVTEFGFMGDVVIPSRFTADEA
GLNWVRTNVTKSGQVGNLVSNDLKSAMVQADLMEMDPETGLATDYAQVAAHLEQIRSELAGAGIEIQIIGFAKVMGDVMD
GLSTVLLFFVIAFFITLLLLWHYTLSIKLTLLAIAVALLPVVWLLGILPLLGYGIDPMSVLVPFLIFSIGVSHAVQMTNV
WKQDVLDGNSSPEAAVNAIRKLAIPGTVALLANALGFMVIMVIDIPMVQELGMTACLGVALMIITNKMFMPVILSYLTLE
KMALRKNDEVIDKQKQIWWKVSALATPKPAIASVTVMMILLALGTWQSRSLLTGDIGSGVPELREDSQYNLDNAQIIKDY
SIGMDVLSVYLETYNREESCLDWEIMNAIDRFDLHMRGVDGVRSVKTTAGLAKLYVSGNNEGNPLWRTLQRDSNALLAGA
SAANPLHALNDNGCKTINMQVYLADHQDATLKHVVNEIRSFTDQQQLNNAEFRLLGGNAGVASATNEAVEKAEVQMLISI
FSAISLLCWITFRSARGVLCVILPLMLVCILCNALMALLGIGLKVSTLPVIALGIGVGVDYGIYIYEKMQHALYQGHDLR
NSFYQAMKSRGTAAVFTAVTMSIGVGTWAFSALKFQADMGILLAFMFLVNVFGAIFLLPALACLLGVKPAKISQSDISES
SVNDNNLKPVKL

Sequences:

>Translated_812_residues
MSQPQSIPTQPRQKDISLVKRFVDFTANQLILKRKPLGLLFLLITLLLSYSALDTRFDPGFTKLVPIQHPYMQAFLKHSN
TFTGSNRIMVSMTWTGEGDIYNAEFLARLRKVHDEVIFTPGINRTTVRSLFAPEVRYMEVTEFGFMGDVVIPSRFTADEA
GLNWVRTNVTKSGQVGNLVSNDLKSAMVQADLMEMDPETGLATDYAQVAAHLEQIRSELAGAGIEIQIIGFAKVMGDVMD
GLSTVLLFFVIAFFITLLLLWHYTLSIKLTLLAIAVALLPVVWLLGILPLLGYGIDPMSVLVPFLIFSIGVSHAVQMTNV
WKQDVLDGNSSPEAAVNAIRKLAIPGTVALLANALGFMVIMVIDIPMVQELGMTACLGVALMIITNKMFMPVILSYLTLE
KMALRKNDEVIDKQKQIWWKVSALATPKPAIASVTVMMILLALGTWQSRSLLTGDIGSGVPELREDSQYNLDNAQIIKDY
SIGMDVLSVYLETYNREESCLDWEIMNAIDRFDLHMRGVDGVRSVKTTAGLAKLYVSGNNEGNPLWRTLQRDSNALLAGA
SAANPLHALNDNGCKTINMQVYLADHQDATLKHVVNEIRSFTDQQQLNNAEFRLLGGNAGVASATNEAVEKAEVQMLISI
FSAISLLCWITFRSARGVLCVILPLMLVCILCNALMALLGIGLKVSTLPVIALGIGVGVDYGIYIYEKMQHALYQGHDLR
NSFYQAMKSRGTAAVFTAVTMSIGVGTWAFSALKFQADMGILLAFMFLVNVFGAIFLLPALACLLGVKPAKISQSDISES
SVNDNNLKPVKL
>Mature_811_residues
SQPQSIPTQPRQKDISLVKRFVDFTANQLILKRKPLGLLFLLITLLLSYSALDTRFDPGFTKLVPIQHPYMQAFLKHSNT
FTGSNRIMVSMTWTGEGDIYNAEFLARLRKVHDEVIFTPGINRTTVRSLFAPEVRYMEVTEFGFMGDVVIPSRFTADEAG
LNWVRTNVTKSGQVGNLVSNDLKSAMVQADLMEMDPETGLATDYAQVAAHLEQIRSELAGAGIEIQIIGFAKVMGDVMDG
LSTVLLFFVIAFFITLLLLWHYTLSIKLTLLAIAVALLPVVWLLGILPLLGYGIDPMSVLVPFLIFSIGVSHAVQMTNVW
KQDVLDGNSSPEAAVNAIRKLAIPGTVALLANALGFMVIMVIDIPMVQELGMTACLGVALMIITNKMFMPVILSYLTLEK
MALRKNDEVIDKQKQIWWKVSALATPKPAIASVTVMMILLALGTWQSRSLLTGDIGSGVPELREDSQYNLDNAQIIKDYS
IGMDVLSVYLETYNREESCLDWEIMNAIDRFDLHMRGVDGVRSVKTTAGLAKLYVSGNNEGNPLWRTLQRDSNALLAGAS
AANPLHALNDNGCKTINMQVYLADHQDATLKHVVNEIRSFTDQQQLNNAEFRLLGGNAGVASATNEAVEKAEVQMLISIF
SAISLLCWITFRSARGVLCVILPLMLVCILCNALMALLGIGLKVSTLPVIALGIGVGVDYGIYIYEKMQHALYQGHDLRN
SFYQAMKSRGTAAVFTAVTMSIGVGTWAFSALKFQADMGILLAFMFLVNVFGAIFLLPALACLLGVKPAKISQSDISESS
VNDNNLKPVKL

Specific function: Unknown

COG id: COG1033

COG function: function code R; Predicted exporters of the RND superfamily

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 89125; Mature: 88994

Theoretical pI: Translated: 6.52; Mature: 6.52

Prosite motif: PS50156 SSD

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
4.3 %Met     (Translated Protein)
5.3 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
4.2 %Met     (Mature Protein)
5.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSQPQSIPTQPRQKDISLVKRFVDFTANQLILKRKPLGLLFLLITLLLSYSALDTRFDPG
CCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
FTKLVPIQHPYMQAFLKHSNTFTGSNRIMVSMTWTGEGDIYNAEFLARLRKVHDEVIFTP
CCEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECC
GINRTTVRSLFAPEVRYMEVTEFGFMGDVVIPSRFTADEAGLNWVRTNVTKSGQVGNLVS
CCCHHHHHHHHCCCCCEEEEHHCCCCCCEECCCCCCCCHHCCCHHHHCCCCCCCCCHHHH
NDLKSAMVQADLMEMDPETGLATDYAQVAAHLEQIRSELAGAGIEIQIIGFAKVMGDVMD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHH
GLSTVLLFFVIAFFITLLLLWHYTLSIKLTLLAIAVALLPVVWLLGILPLLGYGIDPMSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
LVPFLIFSIGVSHAVQMTNVWKQDVLDGNSSPEAAVNAIRKLAIPGTVALLANALGFMVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
MVIDIPMVQELGMTACLGVALMIITNKMFMPVILSYLTLEKMALRKNDEVIDKQKQIWWK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
VSALATPKPAIASVTVMMILLALGTWQSRSLLTGDIGSGVPELREDSQYNLDNAQIIKDY
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHCCCCCCCCCHHEEHHH
SIGMDVLSVYLETYNREESCLDWEIMNAIDRFDLHMRGVDGVRSVKTTAGLAKLYVSGNN
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCC
EGNPLWRTLQRDSNALLAGASAANPLHALNDNGCKTINMQVYLADHQDATLKHVVNEIRS
CCCHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
FTDQQQLNNAEFRLLGGNAGVASATNEAVEKAEVQMLISIFSAISLLCWITFRSARGVLC
HHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
VILPLMLVCILCNALMALLGIGLKVSTLPVIALGIGVGVDYGIYIYEKMQHALYQGHDLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
NSFYQAMKSRGTAAVFTAVTMSIGVGTWAFSALKFQADMGILLAFMFLVNVFGAIFLLPA
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LACLLGVKPAKISQSDISESSVNDNNLKPVKL
HHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCC
>Mature Secondary Structure 
SQPQSIPTQPRQKDISLVKRFVDFTANQLILKRKPLGLLFLLITLLLSYSALDTRFDPG
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC
FTKLVPIQHPYMQAFLKHSNTFTGSNRIMVSMTWTGEGDIYNAEFLARLRKVHDEVIFTP
CCEEECCCCHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHEEECC
GINRTTVRSLFAPEVRYMEVTEFGFMGDVVIPSRFTADEAGLNWVRTNVTKSGQVGNLVS
CCCHHHHHHHHCCCCCEEEEHHCCCCCCEECCCCCCCCHHCCCHHHHCCCCCCCCCHHHH
NDLKSAMVQADLMEMDPETGLATDYAQVAAHLEQIRSELAGAGIEIQIIGFAKVMGDVMD
HHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHH
GLSTVLLFFVIAFFITLLLLWHYTLSIKLTLLAIAVALLPVVWLLGILPLLGYGIDPMSV
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHH
LVPFLIFSIGVSHAVQMTNVWKQDVLDGNSSPEAAVNAIRKLAIPGTVALLANALGFMVI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHH
MVIDIPMVQELGMTACLGVALMIITNKMFMPVILSYLTLEKMALRKNDEVIDKQKQIWWK
HHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
VSALATPKPAIASVTVMMILLALGTWQSRSLLTGDIGSGVPELREDSQYNLDNAQIIKDY
HHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEECCCCCCCCHHHCCCCCCCCCHHEEHHH
SIGMDVLSVYLETYNREESCLDWEIMNAIDRFDLHMRGVDGVRSVKTTAGLAKLYVSGNN
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHEEEEEECCC
EGNPLWRTLQRDSNALLAGASAANPLHALNDNGCKTINMQVYLADHQDATLKHVVNEIRS
CCCHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCHHCCCCCCEEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHH
FTDQQQLNNAEFRLLGGNAGVASATNEAVEKAEVQMLISIFSAISLLCWITFRSARGVLC
HHHHHHCCCCCEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHH
VILPLMLVCILCNALMALLGIGLKVSTLPVIALGIGVGVDYGIYIYEKMQHALYQGHDLR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
NSFYQAMKSRGTAAVFTAVTMSIGVGTWAFSALKFQADMGILLAFMFLVNVFGAIFLLPA
HHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LACLLGVKPAKISQSDISESSVNDNNLKPVKL
HHHHHCCCCCCCCHHHCCCCCCCCCCCCCCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA