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The map label for this gene is pqqL

Identifier: 16273278

GI number: 16273278

Start: 1456539

End: 1459319

Strand: Reverse

Name: pqqL

Synonym: HI1368

Alternate gene names: 16273278

Gene position: 1459319-1456539 (Counterclockwise)

Preceding gene: 16273279

Following gene: 16273276

Centisome position: 79.74

GC content: 32.79

Gene sequence:

>2781_bases
ATGAAAAAAACAACCGCACTTTTTTTACTTATCTTTTCACTAATTGCTTGTCAATCATTGGAACTATCGCCCAATAATAA
TTTACCTTTTGATCCAAATATTCAGCACGGTAAACTATCAAATGGTCTGCAATATTTTGTATTAAAAAATACTGAACCCA
AAGAACGCGTTTATATTCGATTAGTGATCAATGCTGGATCTATGCACGAAGATGACGATCAAAAAGGCATTGCTCATTTA
GTTGAACATATGGCATTTAATGGCTCAAAGAAATATCCAGAAAATCAAATTATTAATGCGTTAGAAAAACTTGGAATGAA
GTTTGCACGAGATATTAATGCTTTCACCGATTTTGAAAATACAGTCTATACTTTAAATTTAGATAGCAACAATCAGCAAA
AATTAGAATTGGCTTTTGATGTCATCAATGAATGGATGAATAATATTACTTTTTTGCCTAAAGATGTGGATGGCGAACGT
GGCGTAGTACAAGAAGAATGGCGGAGACGTTTAAGCCCAATGCTACGTATTGGCAATAAGAAAAGTGCTATTGAAATGGC
GGGTTCTCGTTATGTGTTGCGTGATCCTATTGGAGATATGGATATTATTAAAACAATTTCAGCTAAACGCGTCGCTGATT
TTTACCACAAATGGTATCGACCAGATAATATGTCAGTAATTATTGTAGGCGATATTGATACAAAACAAGTAGTAAAACTA
TTAAAACAAAATCTATCTCAAGAAAACCCAATTACTAAAACAACATTGGAAAAAATTGATTTTAATATTCCTCTTATCAA
CAAATGGCGATTAGATTCTATTTCTGAACAAGGCACAACAATTCCGAGTATTGAATTAAGTTTTTTTGAAAATACAATTG
AAACCAATACATTAGCGAGTTATAAACAGGAATTAATTCAGCAAATTACCACTCGATTGCTTAACTTACGTTTACAGCAA
TGGGAAAAGGAAACAGAAAATGGCGTAGATTCTGCAAATTTTTATCGCACTCATTTAGGTAAAGAAACACTACAAAGCAT
TTTTTCTCTCCAGCTTATAGATACACAATATTCAAAAACGATAGATAAATTATTTGCCTTTATTGCCAGTATAAAACAAC
AAGGTTTTACTCAAAATGAATTAAGCGGTGAGATTAAACGCTTAACTCAACTCAATGAAAAACAATTAAATATTCGTTCT
GGTAGTTTAAAAATTGCCGATGATCTCATTACTTCTGTGGCAAATAAGCAAGTGGTATTGAGCGTAAATGATCGTTATGA
ACTCAATAAACGTTTTTTATCTCAAATTACATTAGCTGATTTACAACGCACGTTAAATCAAACCTTAGCATTAAAAGCAA
AATTATTATTAATCACTCAACCTTTGCCACAAAAAGCCTTGCCTTTTGATGTTGCAGAAATAGAAACTCGTTGGAACAAT
GTAATGGAAATGCAACAACACCAATGGGATGAAAAAAAACAAATCGAAAAATTACCGCACTTAACATTTAACACAGGCTC
ACTTTCTCAAGAAAAATACTGGGATCGCGGCGATATTTATGAATTTCGTTTAAGTAATGGAAGTAAATTGATCTACCACT
ATAGTGACAAAACTCCAAATCAAGTACATTTTCGTGCTGTTACTCAAGGTGGTTTACGTTCTATCCCAAATAAGGACTAT
CACTTATTACGTGCTGCCGTTAGTGTAGTTGATGAAACAGGTGTTGGAGAACTTTCTCTTTCTGCGGTTAATCAAATTTT
TTCGCGCGATCCATTGGTGATTGCAACTGTGATTGATGATGATAAACAAGGTTTTACTGGTGTATCTAAACCTAAGGATT
TGGAAAATTTACTGACATTGTTCCGCTTAAAATTACGTTCTTCTCCTATATCCGATCTTGCCTTAGAAAAATATCGACGT
GAAACCCGTGATTATTTCAAACAGATTGATTTAGAAACACAATTTATGCAAGCCGTTTCAAAACTACGTTTTCCAAATAT
TGAAACCGTCTATACTCAAAAACAAGCACAACAATTATCATTTGATAAAAACCAATTAAATAACGCTTATCAACATTATA
TTTTAGATAAAACAGATTTTACCTATTTTATTATTGGCGATATTGAACTTAATCAAGTAAAGAAATTGGCAGAACGTTAT
TTAGCTTCTATTGAATCAAAAACTCAGATCCGCCATTTTGTCCCGACTATTATTCATACACCAACTCAATCATTTATTAT
GAATGGTTTGAAAGAACCGAGAGCTGATGTAGAAATATACCTTACCGCAGATAATACTTGGCGAACAGAACAAAAATATT
TATTCAATATTCTTGCGGATATTGTGCAAGAAAAATTACGCTTAATTCTACGTGAAAAAGTTTCTGGTATTTATTCTGTA
AATAGTTGGTTTATGCAAGATGTTTATGCACCACAAATTGAGGGGAAAATTGAATTTAGTTGCGACCCTAAGCGCGTGGA
GGAACTTACGTATCTTACAAATCAGGTACTAGATGACATTATAAAAAATGGCATTGATGAAAACTTATTACGTAAAAAAC
TAGCGGAACAACATACTCAGATTCGACGTGAATTTGATTCTTTAGTTTCAATTGCTTCAATTATTGAAGAAAGTTACTGG
CAACAAGATAATCCAGATGCCATTTATACCTATCAACATTTAGATCAGTTAGCGACAAAAGCCACAATAGATGCGTTGGC
GCAAAAAGCTCTAAAAAAATCAGGCAGATTTGTCAGCATATTAAAAGCAGCTTCTTATTAG

Upstream 100 bases:

>100_bases
TCTTCAATGTATAGGGCTTGTGGGCTTTTGAAACATCCACTAGCCCTACTCTACGCTTATTTTTACTTAGCGTAGAGTTT
TCTTTTTTCTAGGTAAAATA

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATAAATTAAATCTCAATAGATATGAAATAGATAAAAAGGGCGGTGATCGCTTAAACGATCACCGTTTGAACTCACTA
TTTAAACAGTAAATTATATT

Product: putative zinc protease

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 926; Mature: 926

Protein sequence:

>926_residues
MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIRLVINAGSMHEDDDQKGIAHL
VEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGER
GVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL
LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITTRLLNLRLQQ
WEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRS
GSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN
VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGGLRSIPNKDY
HLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRR
ETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY
LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILREKVSGIYSV
NSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDIIKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYW
QQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY

Sequences:

>Translated_926_residues
MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIRLVINAGSMHEDDDQKGIAHL
VEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGER
GVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL
LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITTRLLNLRLQQ
WEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRS
GSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN
VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGGLRSIPNKDY
HLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRR
ETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY
LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILREKVSGIYSV
NSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDIIKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYW
QQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY
>Mature_926_residues
MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIRLVINAGSMHEDDDQKGIAHL
VEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFENTVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGER
GVVQEEWRRRLSPMLRIGNKKSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL
LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLASYKQELIQQITTRLLNLRLQQ
WEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKTIDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRS
GSLKIADDLITSVANKQVVLSVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN
VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPNQVHFRAVTQGGLRSIPNKDY
HLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDDDKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRR
ETRDYFKQIDLETQFMQAVSKLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY
LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILADIVQEKLRLILREKVSGIYSV
NSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDIIKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYW
QQDNPDAIYTYQHLDQLATKATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY

Specific function: Unknown

COG id: COG0612

COG function: function code R; Predicted Zn-dependent peptidases

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasm [C]

Metaboloic importance: Non_Essential [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the peptidase M16 family

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1787770, Length=907, Percent_Identity=28.0044101433297, Blast_Score=305, Evalue=1e-83,
Organism=Escherichia coli, GI1789946, Length=498, Percent_Identity=21.285140562249, Blast_Score=96, Evalue=1e-20,
Organism=Caenorhabditis elegans, GI71999683, Length=200, Percent_Identity=24.5, Blast_Score=67, Evalue=6e-11,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): PQQL_HAEIN (P45181)

Other databases:

- EMBL:   L42023
- PIR:   E64171
- RefSeq:   NP_439519.1
- ProteinModelPortal:   P45181
- GeneID:   950673
- GenomeReviews:   L42023_GR
- KEGG:   hin:HI1368
- NMPDR:   fig|71421.1.peg.1304
- TIGR:   HI_1368
- HOGENOM:   HBG495118
- OMA:   NILADIV
- ProtClustDB:   CLSK789566
- BioCyc:   HINF71421:HI_1368-MONOMER
- GO:   GO:0006508
- InterPro:   IPR011249
- InterPro:   IPR011237
- InterPro:   IPR011765
- InterPro:   IPR001431
- InterPro:   IPR007863
- Gene3D:   G3DSA:3.30.830.10

Pfam domain/function: PF00675 Peptidase_M16; PF05193 Peptidase_M16_C; SSF63411 Metalloenz_metal-bd

EC number: 3.4.99.- [C]

Molecular weight: Translated: 107026; Mature: 107026

Theoretical pI: Translated: 7.30; Mature: 7.30

Prosite motif: PS00143 INSULINASE; PS00013 PROKAR_LIPOPROTEIN

Important sites: ACT_SITE 82-82

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.5 %Met     (Translated Protein)
1.7 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.7 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIR
CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEE
LVINAGSMHEDDDQKGIAHLVEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFEN
EEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGERGVVQEEWRRRLSPMLRIGNK
EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL
HHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH
LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLAS
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHH
YKQELIQQITTRLLNLRLQQWEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRSGSLKIADDLITSVANKQVVL
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCEEHHHHHHHHHCCCEEEE
SVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPN
HHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCC
QVHFRAVTQGGLRSIPNKDYHLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDD
EEEEEEECCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEC
DKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRRETRDYFKQIDLETQFMQAVS
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
KLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHH
LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILAD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHH
IVQEKLRLILREKVSGIYSVNSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYWQQDNPDAIYTYQHLDQLATK
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHH
ATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MKKTTALFLLIFSLIACQSLELSPNNNLPFDPNIQHGKLSNGLQYFVLKNTEPKERVYIR
CCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEEECCCCCCCEEEEE
LVINAGSMHEDDDQKGIAHLVEHMAFNGSKKYPENQIINALEKLGMKFARDINAFTDFEN
EEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
TVYTLNLDSNNQQKLELAFDVINEWMNNITFLPKDVDGERGVVQEEWRRRLSPMLRIGNK
EEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC
KSAIEMAGSRYVLRDPIGDMDIIKTISAKRVADFYHKWYRPDNMSVIIVGDIDTKQVVKL
HHHHHHCCCEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCCHHHHHHH
LKQNLSQENPITKTTLEKIDFNIPLINKWRLDSISEQGTTIPSIELSFFENTIETNTLAS
HHHHCCCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHH
YKQELIQQITTRLLNLRLQQWEKETENGVDSANFYRTHLGKETLQSIFSLQLIDTQYSKT
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IDKLFAFIASIKQQGFTQNELSGEIKRLTQLNEKQLNIRSGSLKIADDLITSVANKQVVL
HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHEEEECCCEEHHHHHHHHHCCCEEEE
SVNDRYELNKRFLSQITLADLQRTLNQTLALKAKLLLITQPLPQKALPFDVAEIETRWNN
EECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCCCCHHHHHHHHHH
VMEMQQHQWDEKKQIEKLPHLTFNTGSLSQEKYWDRGDIYEFRLSNGSKLIYHYSDKTPN
HHHHHHHCCCHHHHHHHCCCCEECCCCCCHHHCCCCCCEEEEEECCCCEEEEEECCCCCC
QVHFRAVTQGGLRSIPNKDYHLLRAAVSVVDETGVGELSLSAVNQIFSRDPLVIATVIDD
EEEEEEECCCHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCEEEEEEEEC
DKQGFTGVSKPKDLENLLTLFRLKLRSSPISDLALEKYRRETRDYFKQIDLETQFMQAVS
CCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHH
KLRFPNIETVYTQKQAQQLSFDKNQLNNAYQHYILDKTDFTYFIIGDIELNQVKKLAERY
HHCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHEECCCCCEEEEEECCCHHHHHHHHHHH
LASIESKTQIRHFVPTIIHTPTQSFIMNGLKEPRADVEIYLTADNTWRTEQKYLFNILAD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCCCEEEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHH
IVQEKLRLILREKVSGIYSVNSWFMQDVYAPQIEGKIEFSCDPKRVEELTYLTNQVLDDI
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IKNGIDENLLRKKLAEQHTQIRREFDSLVSIASIIEESYWQQDNPDAIYTYQHLDQLATK
HHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHH
ATIDALAQKALKKSGRFVSILKAASY
HHHHHHHHHHHHHCCCEEEHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: Zn [C]

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: Hydrolase; Acting on peptide bonds (Peptidases); Endopeptidases of unknown catalytic mechanism [C]

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800