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The map label for this gene is 159898121

Identifier: 159898121

GI number: 159898121

Start: 1850567

End: 1852960

Strand: Direct

Name: 159898121

Synonym: Haur_1597

Alternate gene names: NA

Gene position: 1850567-1852960 (Clockwise)

Preceding gene: 159898119

Following gene: 159898122

Centisome position: 29.16

GC content: 47.33

Gene sequence:

>2394_bases
ATGCCATTATTACCATCACAACTCCCCCAATATGCCACGCGCCTGATTGGTCGCACCCGTGCCCGCACGTTGGTAATCGA
CCTGTTGCTTGATGCTCAAGCGCGGTTGGTAACATTATATGGCCAAAGTGGTGCTGGCAAAACGCGCCTAAGTTTGGAAG
TTGCCGAGCAGGTGGGCGAAATTTTTCGTGATGGCCGCTATTTTGTAGCGCTCGCTCCTGTTTCGCAAGCCCAGTTTGTG
CTGCCAACAATTGCCGCAACGTTAGGCGTTGAAGAATCTCAGCACGAAGCAATTTTAGATTCGTTAATATTGGCCTTGGC
CGATAAGCAAATTTTATTAATTCTTGATAATTTTGAGCAAGTTGCTGGAGCCGCCAGCGAACTATTGGAGTTAATCCGAC
GTGCACCGAACCTAACATGTTTAATCACGAGTCGTCAAGCGCTCGAAGTTGCTGGCGAAACCGCGATTATGGTTCCAGCC
TTGCAATATCCTGAGCTTGGTGAAGACTATCAGCTTGAAGATTTAGAGCAACATAGCGCAATTGGCTTATTTGTTGATCG
CATGCGCACACGTCAGCCACGGTTTCGCTTGAGCGCTGATAATGCTGGAGCTTTGGTCGATATTTGTCGTTTGGTGCAGG
GCTTGCCCTTGGCGATTGAGTTAATCGCGGCCCATAGTGCTTCGTTGACCCCCCAAGATTTGCTGTTTTTCGTGCGTAAT
CATCTTTCCATGGCGGCTTTGAATCCGAAACAATCGGCGCGGCAAGCGATTATCAAGCCAGTGCTGGCTTGGAGTGTGAG
CATGCTGCCAGCTGATGCCAAAGATATTTTTGCTCAATTAGGTGTTTTTGCTGGTGGTGCAACCGTCGAAACAATTAAAC
AGGTTGGTTTGGTTGAAACCATGCCCTTTGAATCCAGCCTAAATGCCTTGATTGATCGCCATTTATTGCAAACTGAACAA
TTGCCAGGCCAAAAAGCCCGTTTTATTATGATTGATGCGGTGCATGAATATGCTTTAGAGCAATTGCAAAAAACGGGCCG
CCTATATTATTTGCAAGAACGTCATGCCATCTATTATCAAATATTGAGCGAAACAGTGCATCAGAATATCCGGGGGGCTG
ATGGTGCTAAATGGATCGAACAATTGCGTGGTGAGATTCATAATATTCGCCAAGCGATGATTTGGTCGCTTGATAGTAGC
GATGGTTTGGTCGCTCAGCGAATTGCTGGCAATCTCTATTTTTATTGGTATCGCACGAGTGCTTATCGCGAGGCTGTGGC
ATGGCTCGAACAAACCTATCAACATTCCAATCGCAGCGATTTAAGTGCAATTGCCCGAATTGCAACAGGATTAGGTGGTT
TATTAATTAGTTTGCTCCGTTTTGCCGAAGCTGAACGCTATTTAATTGAAGCTCGTCGTTTGTGGCAAGAGCTTGGCTTA
CCGCACGATGAAATTAGCGCAATTGGTAATTTAGCAGTATTGTATGGCACGCTTGGCCGTTTGCATGATTCGCAATTGGC
GTTTGAAGCAGCCTTGGCTTTAGCCCGCAAGGTAGGTAATCAACAGCGCGAAATTTTGATGCTGCATAATCTTGGCACAG
TAGCCCAAGAACGGAATCAATTAGCGACCGCCCAAGCCTATTTTGAGCAAGCTTTAGCGCTCAAACAACAGGTTAATCAA
ACCTGGGATATGTTTCTAACCCAAATTAATCTCGGCTTAGTAGCGGTTGATCAAGGGCGTTATGCTGAAGCTGAGCAATG
GTTTGAGCAAGCGTTTATCAATGCCTATGCAATCGGTGATCACGATAGTTTGGCCTATATTCGTTATGCACGCGGGATAT
CCGCAGCTGAGCAAGCTGATTATGTCCAAGCTGAGTTGCATTTTCGCGAGTCAGAGCGAGGGTGGCATACCGTTGGCAAT
CTGGAAGGAGTTCAGCGTAGTTGGCTTGAGCAAGCAGCACTTTTAATTGCCACTGCCAATTATGCCCAAGCTGCTGAATA
TTTGCATAAGGTTGAGCCAATTGAGGCACTAAGCCAAGAATTACAATTACGCCATATCATTTTGGCAACTCGTTTAGCAA
TCGCAATCGATGATCAGGCTGCGATGCAACACCAAGCTCAACGAATGCTCGCAACTGCTTTGGCCAGCGAGCTACGCCGG
TTTGATCTGACGATGTTGCAGCATAGTGCGGCAGTCCTAGTCGCAACCCAACCAACACTGGCGGCTCAACTTTTAGCAAC
CGCCGAGCAGCTTCGGGTTGAACGTAACTTGCACCAAAGTGTTGCTGAGCAACAATGGCTGGCCCAAACCAATGTAGCTC
GGCTTGTACCAACCATAGCTTTGGATTTAACCGCTGCTTTGCAAGCGGCTCAGGCTAGCTTAGCTGCGCAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
AAAATAGCCCGATTGAGGGACATGAATCAACCTTGCTAACACGCGAATGAATCATTACAGTAAAGCTTTACTGCACTTTT
CGCGGTGATGAGGTTTTGTT

Downstream 100 bases:

>100_bases
CTCCCACGGCCAACCATTCCAAACCCGCCAATGGCGGGTTTTTCTTTTGTCAATGGAAAAAGAAACTGCTAGTTGACGTA
AAATAATGTCTATTTTAATA

Product: tetratricopeptide domain-containing protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 797; Mature: 796

Protein sequence:

>797_residues
MPLLPSQLPQYATRLIGRTRARTLVIDLLLDAQARLVTLYGQSGAGKTRLSLEVAEQVGEIFRDGRYFVALAPVSQAQFV
LPTIAATLGVEESQHEAILDSLILALADKQILLILDNFEQVAGAASELLELIRRAPNLTCLITSRQALEVAGETAIMVPA
LQYPELGEDYQLEDLEQHSAIGLFVDRMRTRQPRFRLSADNAGALVDICRLVQGLPLAIELIAAHSASLTPQDLLFFVRN
HLSMAALNPKQSARQAIIKPVLAWSVSMLPADAKDIFAQLGVFAGGATVETIKQVGLVETMPFESSLNALIDRHLLQTEQ
LPGQKARFIMIDAVHEYALEQLQKTGRLYYLQERHAIYYQILSETVHQNIRGADGAKWIEQLRGEIHNIRQAMIWSLDSS
DGLVAQRIAGNLYFYWYRTSAYREAVAWLEQTYQHSNRSDLSAIARIATGLGGLLISLLRFAEAERYLIEARRLWQELGL
PHDEISAIGNLAVLYGTLGRLHDSQLAFEAALALARKVGNQQREILMLHNLGTVAQERNQLATAQAYFEQALALKQQVNQ
TWDMFLTQINLGLVAVDQGRYAEAEQWFEQAFINAYAIGDHDSLAYIRYARGISAAEQADYVQAELHFRESERGWHTVGN
LEGVQRSWLEQAALLIATANYAQAAEYLHKVEPIEALSQELQLRHIILATRLAIAIDDQAAMQHQAQRMLATALASELRR
FDLTMLQHSAAVLVATQPTLAAQLLATAEQLRVERNLHQSVAEQQWLAQTNVARLVPTIALDLTAALQAAQASLAAQ

Sequences:

>Translated_797_residues
MPLLPSQLPQYATRLIGRTRARTLVIDLLLDAQARLVTLYGQSGAGKTRLSLEVAEQVGEIFRDGRYFVALAPVSQAQFV
LPTIAATLGVEESQHEAILDSLILALADKQILLILDNFEQVAGAASELLELIRRAPNLTCLITSRQALEVAGETAIMVPA
LQYPELGEDYQLEDLEQHSAIGLFVDRMRTRQPRFRLSADNAGALVDICRLVQGLPLAIELIAAHSASLTPQDLLFFVRN
HLSMAALNPKQSARQAIIKPVLAWSVSMLPADAKDIFAQLGVFAGGATVETIKQVGLVETMPFESSLNALIDRHLLQTEQ
LPGQKARFIMIDAVHEYALEQLQKTGRLYYLQERHAIYYQILSETVHQNIRGADGAKWIEQLRGEIHNIRQAMIWSLDSS
DGLVAQRIAGNLYFYWYRTSAYREAVAWLEQTYQHSNRSDLSAIARIATGLGGLLISLLRFAEAERYLIEARRLWQELGL
PHDEISAIGNLAVLYGTLGRLHDSQLAFEAALALARKVGNQQREILMLHNLGTVAQERNQLATAQAYFEQALALKQQVNQ
TWDMFLTQINLGLVAVDQGRYAEAEQWFEQAFINAYAIGDHDSLAYIRYARGISAAEQADYVQAELHFRESERGWHTVGN
LEGVQRSWLEQAALLIATANYAQAAEYLHKVEPIEALSQELQLRHIILATRLAIAIDDQAAMQHQAQRMLATALASELRR
FDLTMLQHSAAVLVATQPTLAAQLLATAEQLRVERNLHQSVAEQQWLAQTNVARLVPTIALDLTAALQAAQASLAAQ
>Mature_796_residues
PLLPSQLPQYATRLIGRTRARTLVIDLLLDAQARLVTLYGQSGAGKTRLSLEVAEQVGEIFRDGRYFVALAPVSQAQFVL
PTIAATLGVEESQHEAILDSLILALADKQILLILDNFEQVAGAASELLELIRRAPNLTCLITSRQALEVAGETAIMVPAL
QYPELGEDYQLEDLEQHSAIGLFVDRMRTRQPRFRLSADNAGALVDICRLVQGLPLAIELIAAHSASLTPQDLLFFVRNH
LSMAALNPKQSARQAIIKPVLAWSVSMLPADAKDIFAQLGVFAGGATVETIKQVGLVETMPFESSLNALIDRHLLQTEQL
PGQKARFIMIDAVHEYALEQLQKTGRLYYLQERHAIYYQILSETVHQNIRGADGAKWIEQLRGEIHNIRQAMIWSLDSSD
GLVAQRIAGNLYFYWYRTSAYREAVAWLEQTYQHSNRSDLSAIARIATGLGGLLISLLRFAEAERYLIEARRLWQELGLP
HDEISAIGNLAVLYGTLGRLHDSQLAFEAALALARKVGNQQREILMLHNLGTVAQERNQLATAQAYFEQALALKQQVNQT
WDMFLTQINLGLVAVDQGRYAEAEQWFEQAFINAYAIGDHDSLAYIRYARGISAAEQADYVQAELHFRESERGWHTVGNL
EGVQRSWLEQAALLIATANYAQAAEYLHKVEPIEALSQELQLRHIILATRLAIAIDDQAAMQHQAQRMLATALASELRRF
DLTMLQHSAAVLVATQPTLAAQLLATAEQLRVERNLHQSVAEQQWLAQTNVARLVPTIALDLTAALQAAQASLAAQ

Specific function: Unknown

COG id: COG3903

COG function: function code R; Predicted ATPase

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Contains 1 HTH luxR-type DNA-binding domain [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR000767
- InterPro:   IPR016032
- InterPro:   IPR011990
- InterPro:   IPR000792
- InterPro:   IPR011991 [H]

Pfam domain/function: PF00196 GerE [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 88574; Mature: 88442

Theoretical pI: Translated: 5.69; Mature: 5.69

Prosite motif: PS50293 TPR_REGION

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
1.6 %Met     (Translated Protein)
1.9 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
1.5 %Met     (Mature Protein)
1.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MPLLPSQLPQYATRLIGRTRARTLVIDLLLDAQARLVTLYGQSGAGKTRLSLEVAEQVGE
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
IFRDGRYFVALAPVSQAQFVLPTIAATLGVEESQHEAILDSLILALADKQILLILDNFEQ
HHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHH
VAGAASELLELIRRAPNLTCLITSRQALEVAGETAIMVPALQYPELGEDYQLEDLEQHSA
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
IGLFVDRMRTRQPRFRLSADNAGALVDICRLVQGLPLAIELIAAHSASLTPQDLLFFVRN
HHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
HLSMAALNPKQSARQAIIKPVLAWSVSMLPADAKDIFAQLGVFAGGATVETIKQVGLVET
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCC
MPFESSLNALIDRHLLQTEQLPGQKARFIMIDAVHEYALEQLQKTGRLYYLQERHAIYYQ
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHH
ILSETVHQNIRGADGAKWIEQLRGEIHNIRQAMIWSLDSSDGLVAQRIAGNLYFYWYRTS
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHCCEEEEEEEHH
AYREAVAWLEQTYQHSNRSDLSAIARIATGLGGLLISLLRFAEAERYLIEARRLWQELGL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PHDEISAIGNLAVLYGTLGRLHDSQLAFEAALALARKVGNQQREILMLHNLGTVAQERNQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEECCCCHHHHHHHH
LATAQAYFEQALALKQQVNQTWDMFLTQINLGLVAVDQGRYAEAEQWFEQAFINAYAIGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECC
HDSLAYIRYARGISAAEQADYVQAELHFRESERGWHTVGNLEGVQRSWLEQAALLIATAN
CCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YAQAAEYLHKVEPIEALSQELQLRHIILATRLAIAIDDQAAMQHQAQRMLATALASELRR
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDLTMLQHSAAVLVATQPTLAAQLLATAEQLRVERNLHQSVAEQQWLAQTNVARLVPTIA
HHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDLTAALQAAQASLAAQ
HHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
PLLPSQLPQYATRLIGRTRARTLVIDLLLDAQARLVTLYGQSGAGKTRLSLEVAEQVGE
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHH
IFRDGRYFVALAPVSQAQFVLPTIAATLGVEESQHEAILDSLILALADKQILLILDNFEQ
HHHCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEECCHHH
VAGAASELLELIRRAPNLTCLITSRQALEVAGETAIMVPALQYPELGEDYQLEDLEQHSA
HHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEEECCHHHHHCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHH
IGLFVDRMRTRQPRFRLSADNAGALVDICRLVQGLPLAIELIAAHSASLTPQDLLFFVRN
HHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHH
HLSMAALNPKQSARQAIIKPVLAWSVSMLPADAKDIFAQLGVFAGGATVETIKQVGLVET
HHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHCCCCCC
MPFESSLNALIDRHLLQTEQLPGQKARFIMIDAVHEYALEQLQKTGRLYYLQERHAIYYQ
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEHHHHHHHH
ILSETVHQNIRGADGAKWIEQLRGEIHNIRQAMIWSLDSSDGLVAQRIAGNLYFYWYRTS
HHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCHHHHHHHCCEEEEEEEHH
AYREAVAWLEQTYQHSNRSDLSAIARIATGLGGLLISLLRFAEAERYLIEARRLWQELGL
HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
PHDEISAIGNLAVLYGTLGRLHDSQLAFEAALALARKVGNQQREILMLHNLGTVAQERNQ
CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEECCCCHHHHHHHH
LATAQAYFEQALALKQQVNQTWDMFLTQINLGLVAVDQGRYAEAEQWFEQAFINAYAIGD
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHEEECC
HDSLAYIRYARGISAAEQADYVQAELHFRESERGWHTVGNLEGVQRSWLEQAALLIATAN
CCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
YAQAAEYLHKVEPIEALSQELQLRHIILATRLAIAIDDQAAMQHQAQRMLATALASELRR
HHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
FDLTMLQHSAAVLVATQPTLAAQLLATAEQLRVERNLHQSVAEQQWLAQTNVARLVPTIA
HHHHHHHCCCEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
LDLTAALQAAQASLAAQ
HHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 9634230; 12218036 [H]