| Definition | Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009972 |
| Length | 6,346,587 |
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The map label for this gene is 159896612
Identifier: 159896612
GI number: 159896612
Start: 102430
End: 104334
Strand: Reverse
Name: 159896612
Synonym: Haur_0079
Alternate gene names: NA
Gene position: 104334-102430 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159896618
Following gene: 159896611
Centisome position: 1.64
GC content: 51.71
Gene sequence:
>1905_bases ATGGCCTTCGCCACACCCGAACAGGTGCATCGTTACCCTCGTCGGTTCAAATGGATTTTTGAGGTGCTTTGTACTGTCCT CATTGTAGTTGCTGTGGTGCGTTGGGGACGTGCCGTTTTGCAGTATCTCTGGGATAGCCGCAACATCAATGCAGCCTTTG CTGCCCGCGACACGTTTTATGAACCCTTGGTCAACTGGTTTAACCAAACCGGAACGACCCGCCCACGCCTGCGCGACTTG GCGGATCTTGCGCCTTATTTTGGCTGGTTGGGCTTAACCTTGCTCGTGGTTGTTTTTGTTCGTAATTTCTTCCCCACCAT TCGCACGAGCAGCCGTGGTATTTTAATTGAATGGGGCAATGGTTGGTTGCCAGTCGGTTGGGAGCAAGTCAGCGGGCTGC GGGTTACCGAAGACCTTTCTGGCGAACGCTTTGTGGTGTTGCTGCAAACCAACAATAAGGCCTTGACCGGTTGGCATCGC TTTTATAGTGTGCTGTATCGGTTTAGCCTACGCCGAGGTATCCTCATTACCTCGGGCATTTCCGATTTTCTACCGTTGGT GCGCATGCTCACCAGTGAGCTGGAACAGGTGGCTCGCCAAACTAAACAGCCAGCAGTTAAGCTTGATGAAAAGGCTTCCT CGCCGTTGTTTCAATTGTTGCTCAGCCCAGCGGGTTTCTTCAGCCGCCGCTCTAAAAGCGATAAAGATTATGTTGAGTAT GCAACCCAAGCTGGCTTAACGGCCCAACCTGGTCGGGTCGCTAGCATTATGGCGACCTATCCCAAACGCATCAGTAGCTT GCTGGTAATCGGCACGGCAGTGATGGCGGTGCTGGGGCTGCTGCGCGTGCTTGAAATGCTGCGCCAATGGATTGGCCTGA GTTTTGGCGTGGGCGGCATTTTCAAAAGTGCCCCTTTACCGCTTGATCAAAGTGCTTGGTGGCTACCCGTCGCCGCTGTA CTCCTACTCGTGGTGTTAATTCCCATTCTGGTGGTTATTCGCAACATTCTGCCCGATATTGAATCGCGCCAAGAGGGCTT GATGGTGCGCTATTTCAACCGTTGGCTGCTCGTGCGCTGGGAAGAAATTATCGCAGTCAAAACCGCCAGCCTCTCGGAAA ATAACCATGTGATGCTGATTCAAACGACGAATCAGAGTTTGAAGATGATGCACCACATTTCATCGTTGCTGTTCGATGGC TCGAATGCACGAGGGGTGCTGTTAACGTCAGCATTGAGCGTCTATGATCCATTGGTGCAGCAAATTGTGCTCGAAGTTTC ACGTCGCCAACGACCTAGTGAGCAAGATGAAGGCATTTTGACCGAAGATGCCCCAGCTTGGTTGTTGCGCTTGATGTTCA AGCCCAGCGATGCGATCGATCGCATGGTTTCGAATATTTTGCGCCGCGAAGATAGCACCAAAATTAAATTTGATACGATG ATGATTCTCGGGCGGCCAATGGTCTGGCTGACGGCAATTCCGACATTAATGCTGCTGGTTGAGCGCCATATTAACGGCGT GCACTATCCAACCGTCAGCTCAATTATCAATGTGTTGGTATTTGTTTTCATCTGTTTGTTGGAATACCCAATTGCGGCGG CGGTGGCCCAGTTCAGCGAACGCAATCTGGATGGTGATGCCCATCTGGCCCGTCCGTTTTACCTCTACCCTACCGCCCAA TTGCCACGAATTGTGGTGATGTTGGGGGCATTGTTGCTGCTGGTATTGAACGTGCCTCTGCTGCCAGTGCTGCTCTGGAT TGGCGCAGCAATTTGGTCATTCCTCTTGACCGCTGGTTTGTGGGAAGGGCTCTATGGCTGGAGTGGTGGTAAATTATTAG GTATCGGCGCAATTCCGGCGATTATTCAGGTGCTGGCGTTGATGATGTGGGCTTCGATGAGTTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CGATCTTGCCGACCCACCGTAGCGCTAGAGAAGCGTGAGAAGCTGACAAATTCCTGAGACAGTTCCGCCCCTATGCGGTT TGTTAACTGGAGGACTGCCC
Downstream 100 bases:
>100_bases TTGATCCTGTTGGCACCGCAGAGGGCGCTCAATCCTAGCGCTCTCTGCGGTTTTTTGTTCTGAGGAGCAGTTATGCAATC CTACGATGTGATTATTATTG
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 634; Mature: 633
Protein sequence:
>634_residues MAFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFYEPLVNWFNQTGTTRPRLRDL ADLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGNGWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHR FYSVLYRFSLRRGILITSGISDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEY ATQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGIFKSAPLPLDQSAWWLPVAAV LLLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRWEEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDG SNARGVLLTSALSVYDPLVQQIVLEVSRRQRPSEQDEGILTEDAPAWLLRLMFKPSDAIDRMVSNILRREDSTKIKFDTM MILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSERNLDGDAHLARPFYLYPTAQ LPRIVVMLGALLLLVLNVPLLPVLLWIGAAIWSFLLTAGLWEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS
Sequences:
>Translated_634_residues MAFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFYEPLVNWFNQTGTTRPRLRDL ADLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGNGWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHR FYSVLYRFSLRRGILITSGISDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEY ATQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGIFKSAPLPLDQSAWWLPVAAV LLLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRWEEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDG SNARGVLLTSALSVYDPLVQQIVLEVSRRQRPSEQDEGILTEDAPAWLLRLMFKPSDAIDRMVSNILRREDSTKIKFDTM MILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSERNLDGDAHLARPFYLYPTAQ LPRIVVMLGALLLLVLNVPLLPVLLWIGAAIWSFLLTAGLWEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS >Mature_633_residues AFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFYEPLVNWFNQTGTTRPRLRDLA DLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGNGWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHRF YSVLYRFSLRRGILITSGISDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEYA TQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGIFKSAPLPLDQSAWWLPVAAVL LLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRWEEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDGS NARGVLLTSALSVYDPLVQQIVLEVSRRQRPSEQDEGILTEDAPAWLLRLMFKPSDAIDRMVSNILRREDSTKIKFDTMM ILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSERNLDGDAHLARPFYLYPTAQL PRIVVMLGALLLLVLNVPLLPVLLWIGAAIWSFLLTAGLWEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 71512; Mature: 71381
Theoretical pI: Translated: 10.06; Mature: 10.06
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.3 %Cys (Translated Protein) 3.0 %Met (Translated Protein) 3.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.3 %Cys (Mature Protein) 2.8 %Met (Mature Protein) 3.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MAFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFY CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH EPLVNWFNQTGTTRPRLRDLADLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGN HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECC GWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHRFYSVLYRFSLRRGILITSGI CCCCCCHHHHCCCEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCH SDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCHHHHHH ATQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGI HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH FKSAPLPLDQSAWWLPVAAVLLLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRW HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHH EEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDGSNARGVLLTSALSVYDPLVQ HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH QIVLEVSRRQRPSEQDEGILTEDAPAWLLRLMFKPSDAIDRMVSNILRREDSTKIKFDTM HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHH MILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSE HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RNLDGDAHLARPFYLYPTAQLPRIVVMLGALLLLVLNVPLLPVLLWIGAAIWSFLLTAGL CCCCCCCHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS HHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure AFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFY CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH EPLVNWFNQTGTTRPRLRDLADLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGN HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECC GWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHRFYSVLYRFSLRRGILITSGI CCCCCCHHHHCCCEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCH SDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCHHHHHH ATQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGI HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH FKSAPLPLDQSAWWLPVAAVLLLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRW HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHH EEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDGSNARGVLLTSALSVYDPLVQ HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH QIVLEVSRRQRPSEQDEGILTEDAPAWLLRLMFKPSDAIDRMVSNILRREDSTKIKFDTM HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHH MILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSE HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RNLDGDAHLARPFYLYPTAQLPRIVVMLGALLLLVLNVPLLPVLLWIGAAIWSFLLTAGL CCCCCCCHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS HHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA