Definition Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779 chromosome, complete genome.
Accession NC_009972
Length 6,346,587

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The map label for this gene is 159896612

Identifier: 159896612

GI number: 159896612

Start: 102430

End: 104334

Strand: Reverse

Name: 159896612

Synonym: Haur_0079

Alternate gene names: NA

Gene position: 104334-102430 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159896618

Following gene: 159896611

Centisome position: 1.64

GC content: 51.71

Gene sequence:

>1905_bases
ATGGCCTTCGCCACACCCGAACAGGTGCATCGTTACCCTCGTCGGTTCAAATGGATTTTTGAGGTGCTTTGTACTGTCCT
CATTGTAGTTGCTGTGGTGCGTTGGGGACGTGCCGTTTTGCAGTATCTCTGGGATAGCCGCAACATCAATGCAGCCTTTG
CTGCCCGCGACACGTTTTATGAACCCTTGGTCAACTGGTTTAACCAAACCGGAACGACCCGCCCACGCCTGCGCGACTTG
GCGGATCTTGCGCCTTATTTTGGCTGGTTGGGCTTAACCTTGCTCGTGGTTGTTTTTGTTCGTAATTTCTTCCCCACCAT
TCGCACGAGCAGCCGTGGTATTTTAATTGAATGGGGCAATGGTTGGTTGCCAGTCGGTTGGGAGCAAGTCAGCGGGCTGC
GGGTTACCGAAGACCTTTCTGGCGAACGCTTTGTGGTGTTGCTGCAAACCAACAATAAGGCCTTGACCGGTTGGCATCGC
TTTTATAGTGTGCTGTATCGGTTTAGCCTACGCCGAGGTATCCTCATTACCTCGGGCATTTCCGATTTTCTACCGTTGGT
GCGCATGCTCACCAGTGAGCTGGAACAGGTGGCTCGCCAAACTAAACAGCCAGCAGTTAAGCTTGATGAAAAGGCTTCCT
CGCCGTTGTTTCAATTGTTGCTCAGCCCAGCGGGTTTCTTCAGCCGCCGCTCTAAAAGCGATAAAGATTATGTTGAGTAT
GCAACCCAAGCTGGCTTAACGGCCCAACCTGGTCGGGTCGCTAGCATTATGGCGACCTATCCCAAACGCATCAGTAGCTT
GCTGGTAATCGGCACGGCAGTGATGGCGGTGCTGGGGCTGCTGCGCGTGCTTGAAATGCTGCGCCAATGGATTGGCCTGA
GTTTTGGCGTGGGCGGCATTTTCAAAAGTGCCCCTTTACCGCTTGATCAAAGTGCTTGGTGGCTACCCGTCGCCGCTGTA
CTCCTACTCGTGGTGTTAATTCCCATTCTGGTGGTTATTCGCAACATTCTGCCCGATATTGAATCGCGCCAAGAGGGCTT
GATGGTGCGCTATTTCAACCGTTGGCTGCTCGTGCGCTGGGAAGAAATTATCGCAGTCAAAACCGCCAGCCTCTCGGAAA
ATAACCATGTGATGCTGATTCAAACGACGAATCAGAGTTTGAAGATGATGCACCACATTTCATCGTTGCTGTTCGATGGC
TCGAATGCACGAGGGGTGCTGTTAACGTCAGCATTGAGCGTCTATGATCCATTGGTGCAGCAAATTGTGCTCGAAGTTTC
ACGTCGCCAACGACCTAGTGAGCAAGATGAAGGCATTTTGACCGAAGATGCCCCAGCTTGGTTGTTGCGCTTGATGTTCA
AGCCCAGCGATGCGATCGATCGCATGGTTTCGAATATTTTGCGCCGCGAAGATAGCACCAAAATTAAATTTGATACGATG
ATGATTCTCGGGCGGCCAATGGTCTGGCTGACGGCAATTCCGACATTAATGCTGCTGGTTGAGCGCCATATTAACGGCGT
GCACTATCCAACCGTCAGCTCAATTATCAATGTGTTGGTATTTGTTTTCATCTGTTTGTTGGAATACCCAATTGCGGCGG
CGGTGGCCCAGTTCAGCGAACGCAATCTGGATGGTGATGCCCATCTGGCCCGTCCGTTTTACCTCTACCCTACCGCCCAA
TTGCCACGAATTGTGGTGATGTTGGGGGCATTGTTGCTGCTGGTATTGAACGTGCCTCTGCTGCCAGTGCTGCTCTGGAT
TGGCGCAGCAATTTGGTCATTCCTCTTGACCGCTGGTTTGTGGGAAGGGCTCTATGGCTGGAGTGGTGGTAAATTATTAG
GTATCGGCGCAATTCCGGCGATTATTCAGGTGCTGGCGTTGATGATGTGGGCTTCGATGAGTTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CGATCTTGCCGACCCACCGTAGCGCTAGAGAAGCGTGAGAAGCTGACAAATTCCTGAGACAGTTCCGCCCCTATGCGGTT
TGTTAACTGGAGGACTGCCC

Downstream 100 bases:

>100_bases
TTGATCCTGTTGGCACCGCAGAGGGCGCTCAATCCTAGCGCTCTCTGCGGTTTTTTGTTCTGAGGAGCAGTTATGCAATC
CTACGATGTGATTATTATTG

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 634; Mature: 633

Protein sequence:

>634_residues
MAFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFYEPLVNWFNQTGTTRPRLRDL
ADLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGNGWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHR
FYSVLYRFSLRRGILITSGISDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEY
ATQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGIFKSAPLPLDQSAWWLPVAAV
LLLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRWEEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDG
SNARGVLLTSALSVYDPLVQQIVLEVSRRQRPSEQDEGILTEDAPAWLLRLMFKPSDAIDRMVSNILRREDSTKIKFDTM
MILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSERNLDGDAHLARPFYLYPTAQ
LPRIVVMLGALLLLVLNVPLLPVLLWIGAAIWSFLLTAGLWEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS

Sequences:

>Translated_634_residues
MAFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFYEPLVNWFNQTGTTRPRLRDL
ADLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGNGWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHR
FYSVLYRFSLRRGILITSGISDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEY
ATQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGIFKSAPLPLDQSAWWLPVAAV
LLLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRWEEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDG
SNARGVLLTSALSVYDPLVQQIVLEVSRRQRPSEQDEGILTEDAPAWLLRLMFKPSDAIDRMVSNILRREDSTKIKFDTM
MILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSERNLDGDAHLARPFYLYPTAQ
LPRIVVMLGALLLLVLNVPLLPVLLWIGAAIWSFLLTAGLWEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS
>Mature_633_residues
AFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFYEPLVNWFNQTGTTRPRLRDLA
DLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGNGWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHRF
YSVLYRFSLRRGILITSGISDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEYA
TQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGIFKSAPLPLDQSAWWLPVAAVL
LLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRWEEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDGS
NARGVLLTSALSVYDPLVQQIVLEVSRRQRPSEQDEGILTEDAPAWLLRLMFKPSDAIDRMVSNILRREDSTKIKFDTMM
ILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSERNLDGDAHLARPFYLYPTAQL
PRIVVMLGALLLLVLNVPLLPVLLWIGAAIWSFLLTAGLWEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 71512; Mature: 71381

Theoretical pI: Translated: 10.06; Mature: 10.06

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.3 %Cys     (Translated Protein)
3.0 %Met     (Translated Protein)
3.3 %Cys+Met (Translated Protein)
0.3 %Cys     (Mature Protein)
2.8 %Met     (Mature Protein)
3.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MAFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFY
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
EPLVNWFNQTGTTRPRLRDLADLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGN
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECC
GWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHRFYSVLYRFSLRRGILITSGI
CCCCCCHHHHCCCEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCH
SDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEY
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHCCCHHHHHHHCHHHHHHHCCCCCHHHHHH
ATQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGI
HHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHH
FKSAPLPLDQSAWWLPVAAVLLLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRW
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHH
EEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDGSNARGVLLTSALSVYDPLVQ
HHHHHHHHHCCCCCCCEEEEEECCHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH
QIVLEVSRRQRPSEQDEGILTEDAPAWLLRLMFKPSDAIDRMVSNILRREDSTKIKFDTM
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHH
MILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSE
HHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RNLDGDAHLARPFYLYPTAQLPRIVVMLGALLLLVLNVPLLPVLLWIGAAIWSFLLTAGL
CCCCCCCHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS
HHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
AFATPEQVHRYPRRFKWIFEVLCTVLIVVAVVRWGRAVLQYLWDSRNINAAFAARDTFY
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHH
EPLVNWFNQTGTTRPRLRDLADLAPYFGWLGLTLLVVVFVRNFFPTIRTSSRGILIEWGN
HHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEEECC
GWLPVGWEQVSGLRVTEDLSGERFVVLLQTNNKALTGWHRFYSVLYRFSLRRGILITSGI
CCCCCCHHHHCCCEEECCCCCCEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCEEEECCH
SDFLPLVRMLTSELEQVARQTKQPAVKLDEKASSPLFQLLLSPAGFFSRRSKSDKDYVEY
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ATQAGLTAQPGRVASIMATYPKRISSLLVIGTAVMAVLGLLRVLEMLRQWIGLSFGVGGI
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FKSAPLPLDQSAWWLPVAAVLLLVVLIPILVVIRNILPDIESRQEGLMVRYFNRWLLVRW
HHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHCCHHHHHHHHHHHHHH
EEIIAVKTASLSENNHVMLIQTTNQSLKMMHHISSLLFDGSNARGVLLTSALSVYDPLVQ
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MILGRPMVWLTAIPTLMLLVERHINGVHYPTVSSIINVLVFVFICLLEYPIAAAVAQFSE
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CCCCCCCHHCCCEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
WEGLYGWSGGKLLGIGAIPAIIQVLALMMWASMS
HHHHCCCCCCCEEECCHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA