| Definition | Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009954 |
| Length | 2,077,567 |
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The map label for this gene is 159041021
Identifier: 159041021
GI number: 159041021
Start: 471342
End: 473822
Strand: Reverse
Name: 159041021
Synonym: Cmaq_0438
Alternate gene names: NA
Gene position: 473822-471342 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159041022
Following gene: 159041016
Centisome position: 22.81
GC content: 47.4
Gene sequence:
>2481_bases ATGGTTAAGGCAGGGGGAGGGAAGAGAGGTAGTGCCGCTAAGGCGCCAACTAAGACTAGGGTAAGCCTCACTGATGCCGA GTTGAGGGAATTAAGGTCAACTCAGTGGTTTGGCTTATTGGCAGCATTAGCCGCAGCCTTCACTGCTGGGCTTTACATTA GGCTTTACCCAGCATTCCTATGGGGTAATTACATTAATGAGTTTGACCCATACATTAGATACTACTTAACGGAATTCATG CTTAAAATGGGGGTGGTTAAGGGTATTGAATGGTGGCTCAGCGGGGGTTTAATTAATGGTAACCTTTACATAAACACCCA TTTCTGGTACCCATGGGGGATTAATTGGGCTACAACCCTATCCCCAGGCGTATCCTTCACTGGACTAATACTTTACGATA TCTTGGTTAAGCACCTACACCTTCACTTAACCCTACTATCAATAGCCGTCTACACACCGGGTATAGTGAATGCCTTATCC GTCTTATCCATGTATTACCTGGGTTCAAGGTTCGGAGGCAGGTACGTGGGTCTTTTAACCGCATTAATGACTGCCTTCTC CCTAATATTCCTACAGAGGGGTGAGGCCAGTTGGTACGCTGATGCAACCCTGTTTCAATTCATAGCACCACTGGGCATGG CTCTATTCATTGAGGCACTTAGGCAGAGGAATTGGATACCCTACGCGGTCTTAGCCGCTGTGGTGAATGGTTCACTAGTA TGGTTCTGGGGTTCATTCACCTTCGTGTTGAACGCATATGGTGCATACGCCATACTACTCTCCATATATGTGCTTTACAG GCTTTATAGAGGTAGGGTTATTCCACTCCGCATTACTGACGGTATCTCAGTTGACCCAGTGAATGCACTAGGCACCTACA CGTTAACTTACCTTGGCTTCGCAGCCTTCCTAGCCATGACGCCGAGGTATAAGTTGCATGCAGTACTTAGTCTTGGTGCA TTAGGTACTTTAGCGGCTTTACTGGCTGTTGTGGCGATTATAGTTGTTCTGCTGGAGAGGTTTGGTGCACGTAAACTAGT TACCGCATCCAAGTACATTATAGCTGCCGCAGTGGTGTTCCTTGTGATTATTCTTGCCTTAGCCCTATCCGGTGTTTCAG TCCTCATACATATACCTGGTGGTAAGTACTTGGCTGCCTTATTCCCAACAGCCCGCAGTGCCTTGGTTCAAAGCGTCGCT GAGCATTCCCCATCAACGGCTCATCAATTACTCTCAACAACAGGTTATACCCTTCCCTTCGAGATTGCTGGCTTAACGTA CGCCTTATCCACGGTTGACGTGGCTGGCTTACTGTTATCCATTACGTCAGTCTTATCAGTATACTTCGCCTCCAGTGAGG CTTGGTTAACAATGCTCATGTTTGCCTGGCTCCCCGTGGCCGCCTACGGCCTCTACCTGGTAATTAGGTTCGTGGCTAGA CGTGGTATTGATGTTATTGGGCTACTGACCGTGGCCGTTGTGACTGCGTTATTCGCAATATCGGTTGTAGTTATTGCTCA ATCAGGTGTACCTATTGCTGCTGCGCCTCAGCAGATTGTCTCAACCACTGAGCCTGCAATACCATCCAGTGACTGGCTTG ATGCACTCTACTGGATTCAATACAATACTCCTCATAATTCAGTCCTAGCCTCCTGGTGGGATTACGGTTACTGGTTGGCG ATAATGGGTAATAGGACTAGCTTGGCCGATAACTCAACGGTTAATGGTACTCAGATTAAGCTCATAGCCACCGCCTTCAC GTCAACTAATGTAACCGAATCCCTTAAGTTACTGCGTAGTGTTGGTGCTGATTACGTTGTTGTCTTCCTACCATACTACC CATTCCCCATAACCGTCCCCTCACCCATGTCAGCGTTAAGCGTTGGCTCATCATCCCAAAGCATGTTAGCCCTCTGCGCC CTCTACCCAGAGTACCCTACTGGTGGTGATTTCGTTAAGAGCTACTGGATGAGCACAATATCCGGTAATTCACCAGAATA CACCAACACCCACATACTCAGTGCCGCTGAGATAATCAGTAGTACACCCAGTGGTGGAACAGCTACATATAACCTGTACG TACCCTTAACCAACACCACGCTTTACCGTCTCCTCTTTGACTTAGAGGCCCCAGCATACTCAATTACCGTTGACCAGTGC TTGACTCAGATAAGGACAACCACGTCGGCGACACCATTAACACTACCCCTGTGGTTATTCAATACTTGGCCAACCTACTC TCAGTCATCATCCTCATCCTCTGCAGTTCACCTAGTATTGACATTCCAGCCGATACTAGGTCAAAGCCTAGTACCGCCTC CGTTTGTTGGCACTAACACTACTCTGTTGAATCAGCTTTACTTCACATGGTTCTACGGTAATTGGTTAATTTCACCGCCA GGCTTCCAGTTGGTTTACGTTTCAAGGCCATATGGATGGGTATTGGTGTATAAGATCAATTACTCAGTGCTTAAAAGCTA A
Upstream 100 bases:
>100_bases TCCCAGTCTTAACAAGGAAGATTAGGGAGAGGAGGCGTTGACACTGCCTCAACTGCATCGTTTGGGAAATCTTTATTAAA ATGCGCCGTAGACCGTCCAC
Downstream 100 bases:
>100_bases GTGCGTTATTTACTCTTTTCCTTAATGTTAATTGTAATAATCTTAGTGTTCTTCACGTGTTTCCTTAATGCTTTTATGAG GCCTACATCATCAGTTACTA
Product: dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycotransferase
Products: NA
Alternate protein names: Dolichyl-Diphosphooligosaccharide-Protein Glycotransferase; Oligosaccharyl Transferase; Oligosaccharyl Transferase STT3 Like-Protein; Oligosaccharyl Transferase STT3-Like Protein
Number of amino acids: Translated: 826; Mature: 826
Protein sequence:
>826_residues MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFLWGNYINEFDPYIRYYLTEFM LKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTLSPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALS VLSMYYLGSRFGGRYVGLLTALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGFAAFLAMTPRYKLHAVLSLGA LGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVFLVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVA EHSPSTAHQLLSTTGYTLPFEIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQYNTPHNSVLASWWDYGYWLA IMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRSVGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCA LYPEYPTGGDFVKSYWMSTISGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNTTLLNQLYFTWFYGNWLISPP GFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS
Sequences:
>Translated_826_residues MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFLWGNYINEFDPYIRYYLTEFM LKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTLSPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALS VLSMYYLGSRFGGRYVGLLTALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGFAAFLAMTPRYKLHAVLSLGA LGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVFLVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVA EHSPSTAHQLLSTTGYTLPFEIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQYNTPHNSVLASWWDYGYWLA IMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRSVGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCA LYPEYPTGGDFVKSYWMSTISGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNTTLLNQLYFTWFYGNWLISPP GFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS >Mature_826_residues MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFLWGNYINEFDPYIRYYLTEFM LKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTLSPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALS VLSMYYLGSRFGGRYVGLLTALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGFAAFLAMTPRYKLHAVLSLGA LGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVFLVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVA EHSPSTAHQLLSTTGYTLPFEIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQYNTPHNSVLASWWDYGYWLA IMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRSVGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCA LYPEYPTGGDFVKSYWMSTISGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNTTLLNQLYFTWFYGNWLISPP GFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS
Specific function: Unknown
COG id: COG1287
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, required for N-linked glycosylation
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
Organism=Homo sapiens, GI22749415, Length=595, Percent_Identity=24.7058823529412, Blast_Score=114, Evalue=3e-25, Organism=Homo sapiens, GI30578410, Length=79, Percent_Identity=43.0379746835443, Blast_Score=77, Evalue=7e-14, Organism=Caenorhabditis elegans, GI17555006, Length=624, Percent_Identity=22.9166666666667, Blast_Score=103, Evalue=3e-22, Organism=Saccharomyces cerevisiae, GI6321416, Length=592, Percent_Identity=23.4797297297297, Blast_Score=109, Evalue=2e-24, Organism=Drosophila melanogaster, GI20129103, Length=608, Percent_Identity=24.5065789473684, Blast_Score=119, Evalue=7e-27, Organism=Drosophila melanogaster, GI17738187, Length=79, Percent_Identity=43.0379746835443, Blast_Score=74, Evalue=3e-13,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 90424; Mature: 90424
Theoretical pI: Translated: 9.29; Mature: 9.29
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 1.6 %Met (Translated Protein) 1.8 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 1.6 %Met (Mature Protein) 1.8 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFL CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WGNYINEFDPYIRYYLTEFMLKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEEEEEEEECCCCCEEEEC SPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALSVLSMYYLGSRFGGRYVGLLT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH ALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCEE WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGF EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH AAFLAMTPRYKLHAVLSLGALGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVF HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVAEHSPSTAHQLLSTTGYTLPF HHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEE EIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHCEEEEEE YNTPHNSVLASWWDYGYWLAIMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRS ECCCCCHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH VGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCALYPEYPTGGDFVKSYWMSTI CCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH SGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHH LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNT HHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHCCCCCCCCCCCCCH TLLNQLYFTWFYGNWLISPPGFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS HHHHHHHHHEEECCEEECCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECHHHHCC >Mature Secondary Structure MVKAGGGKRGSAAKAPTKTRVSLTDAELRELRSTQWFGLLAALAAAFTAGLYIRLYPAFL CCCCCCCCCCCCCCCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH WGNYINEFDPYIRYYLTEFMLKMGVVKGIEWWLSGGLINGNLYINTHFWYPWGINWATTL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEECEEEEEEEEEECCCCCEEEEC SPGVSFTGLILYDILVKHLHLHLTLLSIAVYTPGIVNALSVLSMYYLGSRFGGRYVGLLT CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH ALMTAFSLIFLQRGEASWYADATLFQFIAPLGMALFIEALRQRNWIPYAVLAAVVNGSLV HHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHCCCEE WFWGSFTFVLNAYGAYAILLSIYVLYRLYRGRVIPLRITDGISVDPVNALGTYTLTYLGF EEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH AAFLAMTPRYKLHAVLSLGALGTLAALLAVVAIIVVLLERFGARKLVTASKYIIAAAVVF HHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHH LVIILALALSGVSVLIHIPGGKYLAALFPTARSALVQSVAEHSPSTAHQLLSTTGYTLPF HHHHHHHHHCCCEEEEECCCCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHCCCCCEE EIAGLTYALSTVDVAGLLLSITSVLSVYFASSEAWLTMLMFAWLPVAAYGLYLVIRFVAR EHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RGIDVIGLLTVAVVTALFAISVVVIAQSGVPIAAAPQQIVSTTEPAIPSSDWLDALYWIQ CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCCCCCHHHCEEEEEE YNTPHNSVLASWWDYGYWLAIMGNRTSLADNSTVNGTQIKLIATAFTSTNVTESLKLLRS ECCCCCHHHHHHHCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHH VGADYVVVFLPYYPFPITVPSPMSALSVGSSSQSMLALCALYPEYPTGGDFVKSYWMSTI CCCCEEEEEECCCCCCCCCCCCHHHHHCCCCCHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHH SGNSPEYTNTHILSAAEIISSTPSGGTATYNLYVPLTNTTLYRLLFDLEAPAYSITVDQC CCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEEEEEECCHHHHHHHHHCCCCCEEEEHHHH LTQIRTTTSATPLTLPLWLFNTWPTYSQSSSSSSAVHLVLTFQPILGQSLVPPPFVGTNT HHHHHHCCCCCCEEEEEEEECCCCCCCCCCCCCCEEEEEEEECHHHCCCCCCCCCCCCCH TLLNQLYFTWFYGNWLISPPGFQLVYVSRPYGWVLVYKINYSVLKS HHHHHHHHHEEECCEEECCCCEEEEEEECCCCEEEEEEECHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA