Definition Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome.
Accession NC_009954
Length 2,077,567

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The map label for this gene is 159040961

Identifier: 159040961

GI number: 159040961

Start: 411222

End: 412619

Strand: Reverse

Name: 159040961

Synonym: Cmaq_0377

Alternate gene names: NA

Gene position: 412619-411222 (Counterclockwise)

Preceding gene: 159040967

Following gene: 159040960

Centisome position: 19.86

GC content: 46.42

Gene sequence:

>1398_bases
ATGTCACTATTCGGTGGTAGAAAGGATCAGGTGAGTGGTGTTGTGCAGAGGATTGAGCAGATTGCCTTAACTGTTGATAA
CCTTAATAAGCAGCAGCAGGCGTTGATGAATGAGGTTAGTAACGTTAGAGGTATGCTTCAGGGTATTGGGGGTGAGGTGA
GTAGGCTTAGTAAGATTGTTCAGGATTTAAGCGGTATTATTAGGGATATTGTCTCGGTTCAGGATAAGAGGATAAATGAC
ATAAGTGAATTATACCAGAGGTTCTCACAGGCCACGGACAGTTACCTAAACGCCCTCTCAGCGCTACTCGGTAGAGTTGA
GCAGTTGAGTAAGGTGATGGAGGATGCTGCCAATGGGTTAACAGCTAGGATTAATGAATTGAGTAAGGGTCTTGAAGGTG
GCTTAAACATGATGAGTGTAATAGATGGTAAGTTGAGTGACGTCTCCCAGAGGTCAAGTCAACTCCTTGATCAATTCTCT
AAAATAGAGCAGGTTGCCACTAGGCTTCAGGCAGCCAGTGATGAGGCCATTAGTAGGCAGAGGGAGCTTGAAAGTAGGAT
AATTGAGTTAGCTAATAAGGAGAGTGAGCTTAAGGTTAGGGAGGAGAGTCTTAAGAGGAGGGAGGAGGAGTTAAGTAGGA
TTGAGGCTACCCTGGAGGAGGAGAAGCGTAGAGTTGATGCTGCTTCAAAACTCATGAATGACTTATCCAGTTTATCCAAC
AACATGGGAAGCGTCATAAGTGAGTTGGTTAATAGGTTGAGTAACTACGAGAAGACCCTTAAGGACCTTCAGGAGAGGGA
GGCTAGGCTCAGGGAGCAGGAAATTAACCTAAAGAACCTTGAGGCTAGGCTACAACTTGAGGCAGCGAGGATTGAGGCTA
ATTCAGAGAGGCTTAAGGAGCTTGAGAAGAAGGAGGAGGAGATTAAGGCTAGGCTCCAGGAATTAGCCAATAGGGAGAGC
CAGATTAAGGCTAGGGAGGAGCAGGTTAATAAGTTGGCTGCTGAGTGGGAGAGGAAGGCTAAGGAACTCAGTGAGCTTGA
GGCTAAGTTGAATAATTATAGGGATGAGTTAAATAAGAGGGAGAAGGAACTTGAGTCCATTAAGAATGAACTCGACGCCA
GGAGAAGGGAGCTTGAGGGTAAGTTGGAGCCTCTAGTAACTAGGTTAACTGAGGAGGAGAGGAGGTTGGCTGAATGGGAG
AGGAAGCTACTGGAGAGGGAGAGGGAGTTGATTAATTACCAGAGGACCCTTGTGGTTAGGGAGAGTATGCTCGTGGAGCT
TAAGGAGAAGCTTGATGAGGAAGCTGAGCACTTAAAGAGGCAGCAGGCCGAGTTCGAGGAGATTAAAAGGAAGTACGAGG
AATTGGTTAAACAGTGTCAGAGCCAGCAGAGGCAGTGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATAAAGGTAAGTAACCCCAAGGCTCAGGGAACGTTCACCCTCAGGGTGGGAAGAGTTAATACGCGATAAGTTTAAAATA
ATTAACAAGGCTTATAAAGT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGCTTGGTGGTGTTGACTTATCAGTGAAGAGGGTGAGTGGGGTAGCTGAGGTTAATGATGGGGTACTGGTTAGTAGGCTT
GTTGAGAGTGATGATGAGGT

Product: chromosome segregation ATPase-like protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 465; Mature: 464

Protein sequence:

>465_residues
MSLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIVQDLSGIIRDIVSVQDKRIND
ISELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGLTARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFS
KIEQVATRLQAASDEAISRQRELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSN
NMGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKELEKKEEEIKARLQELANRES
QIKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKREKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWE
RKLLERERELINYQRTLVVRESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ

Sequences:

>Translated_465_residues
MSLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIVQDLSGIIRDIVSVQDKRIND
ISELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGLTARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFS
KIEQVATRLQAASDEAISRQRELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSN
NMGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKELEKKEEEIKARLQELANRES
QIKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKREKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWE
RKLLERERELINYQRTLVVRESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ
>Mature_464_residues
SLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIVQDLSGIIRDIVSVQDKRINDI
SELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGLTARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFSK
IEQVATRLQAASDEAISRQRELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSNN
MGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKELEKKEEEIKARLQELANRESQ
IKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKREKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWER
KLLERERELINYQRTLVVRESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 53983; Mature: 53852

Theoretical pI: Translated: 5.04; Mature: 5.04

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.2 %Cys     (Translated Protein)
1.9 %Met     (Translated Protein)
2.2 %Cys+Met (Translated Protein)
0.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
1.9 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MSLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIV
CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
QDLSGIIRDIVSVQDKRINDISELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
TARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFSKIEQVATRLQAASDEAISRQ
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSN
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NMGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
LEKKEEEIKARLQELANRESQIKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKR
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWERKLLERERELINYQRTLVVR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure 
SLFGGRKDQVSGVVQRIEQIALTVDNLNKQQQALMNEVSNVRGMLQGIGGEVSRLSKIV
CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHH
QDLSGIIRDIVSVQDKRINDISELYQRFSQATDSYLNALSALLGRVEQLSKVMEDAANGL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCH
TARINELSKGLEGGLNMMSVIDGKLSDVSQRSSQLLDQFSKIEQVATRLQAASDEAISRQ
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
RELESRIIELANKESELKVREESLKRREEELSRIEATLEEEKRRVDAASKLMNDLSSLSN
HHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
NMGSVISELVNRLSNYEKTLKDLQEREARLREQEINLKNLEARLQLEAARIEANSERLKE
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
LEKKEEEIKARLQELANRESQIKAREEQVNKLAAEWERKAKELSELEAKLNNYRDELNKR
HHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
EKELESIKNELDARRRELEGKLEPLVTRLTEEERRLAEWERKLLERERELINYQRTLVVR
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
ESMLVELKEKLDEEAEHLKRQQAEFEEIKRKYEELVKQCQSQQRQ
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA