| Definition | Caldivirga maquilingensis IC-167 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009954 |
| Length | 2,077,567 |
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The map label for this gene is 159040899
Identifier: 159040899
GI number: 159040899
Start: 350546
End: 351715
Strand: Reverse
Name: 159040899
Synonym: Cmaq_0313
Alternate gene names: NA
Gene position: 351715-350546 (Counterclockwise)
Preceding gene: 159040901
Following gene: 159040897
Centisome position: 16.93
GC content: 44.27
Gene sequence:
>1170_bases GTGGATAAACTGAGATTATACGTACTAATTCAGAACCTGGCTAATGGTTTAACGCAACCATTCATGAGCTTTCTGGCGGT TGCCAGCGGGGTACCTAATATTGGCTTAGGCTTAATTTCATCAGCCAACGGCTTCTTCGCAGGGGTGACTCAGCTACCAT TAAGGAAACTCAGTGAACCTGTTAAGCTACTTAAGCTATCAACTGCATCATTAATCATCCTATGGTTATTAATGGCGTTC ATCTCATACACTAATCCCATACTCTACGTGGTTACTTACCTATCCATTGCCGCCACTGGTGGTGTTTCCTCATACGCATG GGCATTATTACTAGAGAGGGCAAGCAGAGGCTCTAGGGGTAGGGTTCTTGCTGAATACGGCTTCTTTGGGTCAATAGGTG GTTTACTGGCTACGTTAACCGCTGGACTAGTGGTTAGGGGTAATTACGCCTTAGCTAAGTATGTTTTCATAACAGCTGCA TTACTCATTGCCAGTAACTTCACTGTGGTGATGAGGCTGGATAACGTTAAGTATGATGGAGTGAATTCAAGTAACCTTAG GCAGAGCATTAAGGGTATTGAGAATTTCCTGGGTGCAACATTCATATTCGCTGTTGTCTGGTCCTTCGCATGGCCAATAT TCCCAGTGGCTCAATACTACGTATTCAGTATGACTACTGAGCAAGTCGCCATACTAAGCATAGTGGGTGGCGCATCAACG TTAATACTACAGAGGCCTGTGGGTTCACTTGTGGATAAGCATAGGAGGATAATGATGTTCCTAGGTAGATTCCTCCTTAT AACGTTCCCATTAATGTACGTGTTCAGCACCAGTGTCTATCAATTATTCATAATAAACGTGGTGTCTGGGTTCACTAACT CAGTATCAAACACAGCCTACATGGCTTACCTCTTCGATAATTCAAGGGATAAGAAAAGCGCAATAACTATATATAATGCA GTCTACGGTACTGGGACACTGGTTGGTTCACTCATAGGTAGTGCATCATTATCAGCAGTTGAATTAATGGTTGGGGTTAA GGAGGCTGTGAAGTACCTCCTGTTGATTGATGCAGCCGCTAGGGCTGGAGCCGCTGTGGCTTACTTGAAGCTACCTGAGT TTAAGCCAGCCAGTAGGGGTACTTTAACGGTCTCCGCTAGGACTAATTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases AAGGTGTGAAATATGTGCGTAAATACCGTGAATGCTAGTATCATTCTTTAATTTAATGTATAGATAGGTTTAAATATTCA ATGGTTAATACGGTTTAACC
Downstream 100 bases:
>100_bases GCCATATTAAGTATAGTCCTCAGGTAGTTAAGCACCTCATCAACCGCAGCATCCCTATTAACGTAGCTTAACCTAATTAA GCTACCTAGGTTTAAGTGTG
Product: major facilitator transporter
Products: NA
Alternate protein names: Facilitator Superfamily Protein; Facilitator Superfamily Permease
Number of amino acids: Translated: 389; Mature: 389
Protein sequence:
>389_residues MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEPVKLLKLSTASLIILWLLMAF ISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRGRVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAA LLIASNFTVVMRLDNVKYDGVNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAYMAYLFDNSRDKKSAITIYNA VYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAARAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN
Sequences:
>Translated_389_residues MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEPVKLLKLSTASLIILWLLMAF ISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRGRVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAA LLIASNFTVVMRLDNVKYDGVNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAYMAYLFDNSRDKKSAITIYNA VYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAARAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN >Mature_389_residues MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEPVKLLKLSTASLIILWLLMAF ISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRGRVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAA LLIASNFTVVMRLDNVKYDGVNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAYMAYLFDNSRDKKSAITIYNA VYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAARAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN
Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 42055; Mature: 42055
Theoretical pI: Translated: 10.29; Mature: 10.29
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.0 %Cys (Translated Protein) 2.6 %Met (Translated Protein) 2.6 %Cys+Met (Translated Protein) 0.0 %Cys (Mature Protein) 2.6 %Met (Mature Protein) 2.6 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH VKLLKLSTASLIILWLLMAFISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC RVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAALLIASNFTVVMRLDNVKYDG CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEECC VNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEEECCCHH LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAY EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE MAYLFDNSRDKKSAITIYNAVYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAA EEEEECCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN HCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCC >Mature Secondary Structure MDKLRLYVLIQNLANGLTQPFMSFLAVASGVPNIGLGLISSANGFFAGVTQLPLRKLSEP CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH VKLLKLSTASLIILWLLMAFISYTNPILYVVTYLSIAATGGVSSYAWALLLERASRGSRG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCC RVLAEYGFFGSIGGLLATLTAGLVVRGNYALAKYVFITAALLIASNFTVVMRLDNVKYDG CEEEECCCHHHHHHHHHHHHHCEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCEEEEEECCEEECC VNSSNLRQSIKGIENFLGATFIFAVVWSFAWPIFPVAQYYVFSMTTEQVAILSIVGGAST CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEEEECCCHH LILQRPVGSLVDKHRRIMMFLGRFLLITFPLMYVFSTSVYQLFIINVVSGFTNSVSNTAY EEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEE MAYLFDNSRDKKSAITIYNAVYGTGTLVGSLIGSASLSAVELMVGVKEAVKYLLLIDAAA EEEEECCCCCCCHHEEEEHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH RAGAAVAYLKLPEFKPASRGTLTVSARTN HCCCEEEEEECCCCCCCCCCEEEEEECCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 9.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA