| Definition | Acaryochloris marina MBIC11017 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009925 |
| Length | 6,503,724 |
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The map label for this gene is 158338111
Identifier: 158338111
GI number: 158338111
Start: 5047983
End: 5050766
Strand: Reverse
Name: 158338111
Synonym: AM1_5001
Alternate gene names: NA
Gene position: 5050766-5047983 (Counterclockwise)
Preceding gene: 158338112
Following gene: 158338105
Centisome position: 77.66
GC content: 48.38
Gene sequence:
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Upstream 100 bases:
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Downstream 100 bases:
>100_bases GCTTACTGCAGTAGCGCTGCAGGAATCGGTTGCCATCGGGCTGGGAGTTGCTGTTGTCGATTAACCACAGCTTGTTTACA AGTCGCTAGCATCCGTTGGT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 927; Mature: 927
Protein sequence:
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Sequences:
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Specific function: Unknown
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Cytoplasmic
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
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Paralogues:
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Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 103716; Mature: 103716
Theoretical pI: Translated: 4.60; Mature: 4.60
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Signals:
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Transmembrane regions:
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Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 0.9 %Met (Translated Protein) 1.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 0.9 %Met (Mature Protein) 1.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MISTVNRALLNSRLDSATILSGGQIIVVVLAGLLFGLAFQLLLANFGIAIGLSIFNLKPN CCCHHHHHHHHHCCCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC PPTSDKPPEPEDASFGSVALIGVAAGLAIMLSIDGVLFAACYLAVKLSQVSDPWLGAILG CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH GLVWAVYLILLTWLSTSAVGTIADTVLGFTRAGLRRLFAAVGQLFNPTSSDTSSADEDPD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCH VIGHSKLIQALEDMDFSPVFESTLAKLKSETPSKATHLSQIAEEVIANTTENHTIDLGQI HCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH VEELQNRLNLPQPILEELQQQLQKLTQEVGNDPHPVPEHPQQSAPVTDLKNFLQTADPSD HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCH LQSESLSTQLAPLETSHSWSTLQDIDFKGLLRTALRRVDLSDWDVQRIWQVLQSTQQKLT HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC GSSESKQPINIIQLDVEDYLLNTPPWNLQPDIIEVDFKDILYDPAADPSLVHQQLILLTP CCCCCCCCCEEEEEEHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCH DQIQEFLQQRQDLPDHQLAKIANVLNRVRLNILDQVQPSSDLKPPEREHLHQIQQKLESY HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH CRYTTLSKLSPEGIEQKLKSLIEEIPIPTPMLASYPPDLDALQKILKRRKGLQPKKRKAL HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LAAISENWQHLLPDSIQPAPPSIHKRLKTIIAEQLQGPDVQSITLEDLKPQLMQLIDQPT HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC SGLTVFNQYLGQLDWMSLAQELQDEYDLTPQNLNSILATLQEEWQQIAKFPRRWARRTQR CHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAQDWQGQLQRYLKYQDRAALTKIESIEQDLKCLLEEVNMGSSSPNPFPQLPCQSEIIAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH LQERKDLTAAEMEQISLQLALTWEKLGEEAQSLQKQAQSSLDTVATKVREILSSLPYAGS HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC IQLQETLSDALPHIEVSQIGDSLQDFARKAPTELLTESSWQQIRDRISVLTQSTYQQIIH CHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRDDLEDTVKHQLSEQAEALQQQLLDQVDQLQTELQQQARELKQDTQRQADKVRQSAAIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AWWLFAIALTSGITSALSGYWAVRGFR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure MISTVNRALLNSRLDSATILSGGQIIVVVLAGLLFGLAFQLLLANFGIAIGLSIFNLKPN CCCHHHHHHHHHCCCCHHEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCC PPTSDKPPEPEDASFGSVALIGVAAGLAIMLSIDGVLFAACYLAVKLSQVSDPWLGAILG CCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHH GLVWAVYLILLTWLSTSAVGTIADTVLGFTRAGLRRLFAAVGQLFNPTSSDTSSADEDPD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCH VIGHSKLIQALEDMDFSPVFESTLAKLKSETPSKATHLSQIAEEVIANTTENHTIDLGQI HCCHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHH VEELQNRLNLPQPILEELQQQLQKLTQEVGNDPHPVPEHPQQSAPVTDLKNFLQTADPSD HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHCCCCCH LQSESLSTQLAPLETSHSWSTLQDIDFKGLLRTALRRVDLSDWDVQRIWQVLQSTQQKLT HHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHC GSSESKQPINIIQLDVEDYLLNTPPWNLQPDIIEVDFKDILYDPAADPSLVHQQLILLTP CCCCCCCCCEEEEEEHHHHHCCCCCCCCCCCCEEECHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHCCH DQIQEFLQQRQDLPDHQLAKIANVLNRVRLNILDQVQPSSDLKPPEREHLHQIQQKLESY HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHH CRYTTLSKLSPEGIEQKLKSLIEEIPIPTPMLASYPPDLDALQKILKRRKGLQPKKRKAL HHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH LAAISENWQHLLPDSIQPAPPSIHKRLKTIIAEQLQGPDVQSITLEDLKPQLMQLIDQPT HHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCC SGLTVFNQYLGQLDWMSLAQELQDEYDLTPQNLNSILATLQEEWQQIAKFPRRWARRTQR CHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TAQDWQGQLQRYLKYQDRAALTKIESIEQDLKCLLEEVNMGSSSPNPFPQLPCQSEIIAL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHH LQERKDLTAAEMEQISLQLALTWEKLGEEAQSLQKQAQSSLDTVATKVREILSSLPYAGS HHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCC IQLQETLSDALPHIEVSQIGDSLQDFARKAPTELLTESSWQQIRDRISVLTQSTYQQIIH CHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH TRDDLEDTVKHQLSEQAEALQQQLLDQVDQLQTELQQQARELKQDTQRQADKVRQSAAIA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AWWLFAIALTSGITSALSGYWAVRGFR HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
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Inhibitor: NA
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References: NA