| Definition | Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009707 |
| Length | 1,845,106 |
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The map label for this gene is traG [C]
Identifier: 153951746
GI number: 153951746
Start: 840803
End: 843571
Strand: Direct
Name: traG [C]
Synonym: JJD26997_0941
Alternate gene names: 153951746
Gene position: 840803-843571 (Clockwise)
Preceding gene: 153952515
Following gene: 153951324
Centisome position: 45.57
GC content: 35.64
Gene sequence:
>2769_bases ATGAAAAGATTTTACTTTTTATTCTTTAGCACTTTGTTTTTTGCACCTTCATTTTTATTTGGTGCAACTGAAATAGCTAA TAGCAATTTAATTTATACTTGGGGTTATGGTGATGTGATGAATGAAATCATGCAAGCGGTTAAAGGTCTAACCACTGAAA CAGGTTATATCGTTAATGCAGCCTTGGCTATTTCATTATTACTTTTTAGTATTAAAAAAGCAATAGATGGACAAACAAGT CCTGTGTTTGAACTTGGAAAAATGTTTATGCTTTTTGCTGTAGTGTGGCACATGTTTTTAAAAGCACCAAATGATAATAA TCACCGCTTCATGATTCACGATGAAGTCACTAGTAAAGATTATGTCATTTCTCAAATTCCTATAGGTATAGGAAAAAGTT TTGCATTAATGACACAATTTGAGAAGGTTATCCTAGGAGCTATGGAAAAACATTTTTCAACTCCACAATCTACAAATTTT TCTAATGCAGGTTTAGGTTTTTCACTTCAAGTGATGAGTACTTTACCAAGCGTAAAGCTTTCGGCTATTGATGCAACTTT GCAAAAAAATATTGATTTTTATTTTAGAAATTGCGTTTCAGTGGGTATATTACTTAATAAACAAGGCAGAAATCTCTTTT CAAATTCTGATAATTTAATGCGAGATCTCTTTACAAATATAGGTAATGGCTCACAGTTTACTCCTTTATTTACAAGCGAT AATAATATTGAAAATAAAAGCATAGTTCCTTGTTCTGAAGCAGGTCCTCAAATCGTTGAAATGATTGAAAACAATACAGA TGAAGCTATGAAGATTCATGCTGCTTTGCTTAGCATGGCAGATGATATGGAAAATTATGAGCACAAGTTTTTCGGTGCTG CACAAATCTATAACGAACAAGCTGTAAGTGCAAGATCTTATTTTCAACAAGCTATGGTGATGTTTGCTTCTCAAGACGCA ATCATTAATACCGCTAAATCAGTAGGTTTAAATCCTGCTTCTGTGGCTTCAAATACTGCTTATGCGGATCAGCAATTTTA CGCAAGTATGCAAGCACAAGGACACTTGGCACAAACTTATTTGCCTTTAGCTAAAGCTTATTTAACAGCTATTATCATAG GTTTATCTTGGGTTGTTGCTTTGCTTTCTATTGTATTTGGATCTTACGCGTATATTAAGATGTATTTTACTCTATGTATT TGGATAGCGCTTTGGACTCCTATACTTTGTATTATCAATTATCTAAATGATTATAATCTCATGAAAGTTACTCAAGTGAT AACAGGTGGAAAAGAAGCTTTAAGTTTAAGGGATAATATTCTTATATTCAAAGAAGTAGCAAGTAGATCCAATTTCATGA ATTATCTTGTAATGAGTACTCCTGTTTTAGCTTATGCAATTGCTAAGGCAAGTGAGCACGGGTTTGTAACTTTTGCTTCA GGATTATCTCAAACTCTAGCAGGTGCTTCAAGAGCTGCAGGAAGCTTTGCAAATCAGCAAGCCTTATCTACACAAACAAG TATGGCTGCTCCTAGAGGAGATGAAGTGATTGCGTATAATACAGGTATAATGAGTTTGCAAGGTGCTACTAGTGTAGGAA GCAGTAGATATTCTACTACTAGCATAGCAGGGGGTGGAACAACTGTAACTGATGTAAATACAGGTTCTAAAGTAAGTGGT GATATGCAAGGTGTTACTGCTGCTAACATTGCAGGGCTTAGTGCTAGTGATATGAAATCAAAACAAGCTTCTTTAGCAGG TGAAGTTTCTCAAGGTATTAGCGATGCTTTAAAAACAGGACAAACTTCTCAATCTGTTGCGAATATGGCATTTGATCATT CTGCCTCTCATGGTATTAATGCTCAAGCACAAGAAATCTTTAAAGCAAGTTCTACTATGGCATTTGATAAGATGGCTCAA GCAGGAGATCAAAGAGCACAAGAACTTATGTCAGCACTCAAGGCAGGTGGCAGTATAGCAAGTGTAGTAGATGGCAGTGT AAATATTACAGAAAAAGATGGCACAAGTAGAACCTTTACATTTACAGATAAAGAAATGCAACAATGGAGTAAAGACTTTG GGGATAATGTGGCTTCTACTTATGCTCGTGATGATTCAGCTAGAGCTTCTCTTAATAATGCTTTCTCAACCTTTACAGGT AAAGAATTCTCTCAAGTGCATTCAGCTATTAATAAATATAGCTCGGTTGAATCGTTTGCAAGCAATGTTAACTCTGATTC TGTGCCTAAAGCACTTAATAATTACATTCGTTCAGGCGATGATGCAGCAATTACAAATGCTTGGAATAGTGGTAATATCG GAAAAGCTATGGCAATGGCTTCTGATGATTTCCAAAGATGGAGTGTCAATAATCCACAACAACTCTCTAAATACTTTAAC GCAGGAGATTTTAGTAGTCCGCAAAACACTATAGGTTCTGTAGGTATGCAAAATTATTATAGTCCTTCCACAGCTTCTGC AATCCATAAAGGCAATTATGGCACAGTAGATTCAGCAACCGTAGGATTTGGAAATAGTTATGAAGCTGATAAGAAATCTA TGAAAGAAGGACATTTTAAGACTACAGGACAAAACACAGCTTGGGGACAAGGTAATTCACAAGGAACAGTGCAACAAGAA GTTCAAGGACAAGTTAATAATGCGGTAAATCAATTTAGCAAAGGTGCTCCTGCAAGAACAGTTGACGATGGTGTTAAGGT TGCAGAAATGGCTGCTGATGGAGCAAAAGGTTCATTTACAATACTGTAA
Upstream 100 bases:
>100_bases CACCGCCTTTCTAGGTTATGATTAATGCCAAAGGTAGCCGCCTTTGGCATCTACCTTTTATAATTATACCAAATAAATTC TTTAACTTCTTAAAACAGTC
Downstream 100 bases:
>100_bases ATGCTTTAGGAACTGTAACTCAAACAGCCCTAAATAATCCTTCTCAACTTTTTGATTCTAAGTTTTGGACAGGTGCGAGA GATGCGAATGGTAATTTAAT
Product: Cju26
Products: NA
Alternate protein names: None
Number of amino acids: Translated: 922; Mature: 922
Protein sequence:
>922_residues MKRFYFLFFSTLFFAPSFLFGATEIANSNLIYTWGYGDVMNEIMQAVKGLTTETGYIVNAALAISLLLFSIKKAIDGQTS PVFELGKMFMLFAVVWHMFLKAPNDNNHRFMIHDEVTSKDYVISQIPIGIGKSFALMTQFEKVILGAMEKHFSTPQSTNF SNAGLGFSLQVMSTLPSVKLSAIDATLQKNIDFYFRNCVSVGILLNKQGRNLFSNSDNLMRDLFTNIGNGSQFTPLFTSD NNIENKSIVPCSEAGPQIVEMIENNTDEAMKIHAALLSMADDMENYEHKFFGAAQIYNEQAVSARSYFQQAMVMFASQDA IINTAKSVGLNPASVASNTAYADQQFYASMQAQGHLAQTYLPLAKAYLTAIIIGLSWVVALLSIVFGSYAYIKMYFTLCI WIALWTPILCIINYLNDYNLMKVTQVITGGKEALSLRDNILIFKEVASRSNFMNYLVMSTPVLAYAIAKASEHGFVTFAS GLSQTLAGASRAAGSFANQQALSTQTSMAAPRGDEVIAYNTGIMSLQGATSVGSSRYSTTSIAGGGTTVTDVNTGSKVSG DMQGVTAANIAGLSASDMKSKQASLAGEVSQGISDALKTGQTSQSVANMAFDHSASHGINAQAQEIFKASSTMAFDKMAQ AGDQRAQELMSALKAGGSIASVVDGSVNITEKDGTSRTFTFTDKEMQQWSKDFGDNVASTYARDDSARASLNNAFSTFTG KEFSQVHSAINKYSSVESFASNVNSDSVPKALNNYIRSGDDAAITNAWNSGNIGKAMAMASDDFQRWSVNNPQQLSKYFN AGDFSSPQNTIGSVGMQNYYSPSTASAIHKGNYGTVDSATVGFGNSYEADKKSMKEGHFKTTGQNTAWGQGNSQGTVQQE VQGQVNNAVNQFSKGAPARTVDDGVKVAEMAADGAKGSFTIL
Sequences:
>Translated_922_residues MKRFYFLFFSTLFFAPSFLFGATEIANSNLIYTWGYGDVMNEIMQAVKGLTTETGYIVNAALAISLLLFSIKKAIDGQTS PVFELGKMFMLFAVVWHMFLKAPNDNNHRFMIHDEVTSKDYVISQIPIGIGKSFALMTQFEKVILGAMEKHFSTPQSTNF SNAGLGFSLQVMSTLPSVKLSAIDATLQKNIDFYFRNCVSVGILLNKQGRNLFSNSDNLMRDLFTNIGNGSQFTPLFTSD NNIENKSIVPCSEAGPQIVEMIENNTDEAMKIHAALLSMADDMENYEHKFFGAAQIYNEQAVSARSYFQQAMVMFASQDA IINTAKSVGLNPASVASNTAYADQQFYASMQAQGHLAQTYLPLAKAYLTAIIIGLSWVVALLSIVFGSYAYIKMYFTLCI WIALWTPILCIINYLNDYNLMKVTQVITGGKEALSLRDNILIFKEVASRSNFMNYLVMSTPVLAYAIAKASEHGFVTFAS GLSQTLAGASRAAGSFANQQALSTQTSMAAPRGDEVIAYNTGIMSLQGATSVGSSRYSTTSIAGGGTTVTDVNTGSKVSG DMQGVTAANIAGLSASDMKSKQASLAGEVSQGISDALKTGQTSQSVANMAFDHSASHGINAQAQEIFKASSTMAFDKMAQ AGDQRAQELMSALKAGGSIASVVDGSVNITEKDGTSRTFTFTDKEMQQWSKDFGDNVASTYARDDSARASLNNAFSTFTG KEFSQVHSAINKYSSVESFASNVNSDSVPKALNNYIRSGDDAAITNAWNSGNIGKAMAMASDDFQRWSVNNPQQLSKYFN AGDFSSPQNTIGSVGMQNYYSPSTASAIHKGNYGTVDSATVGFGNSYEADKKSMKEGHFKTTGQNTAWGQGNSQGTVQQE VQGQVNNAVNQFSKGAPARTVDDGVKVAEMAADGAKGSFTIL >Mature_922_residues MKRFYFLFFSTLFFAPSFLFGATEIANSNLIYTWGYGDVMNEIMQAVKGLTTETGYIVNAALAISLLLFSIKKAIDGQTS PVFELGKMFMLFAVVWHMFLKAPNDNNHRFMIHDEVTSKDYVISQIPIGIGKSFALMTQFEKVILGAMEKHFSTPQSTNF SNAGLGFSLQVMSTLPSVKLSAIDATLQKNIDFYFRNCVSVGILLNKQGRNLFSNSDNLMRDLFTNIGNGSQFTPLFTSD NNIENKSIVPCSEAGPQIVEMIENNTDEAMKIHAALLSMADDMENYEHKFFGAAQIYNEQAVSARSYFQQAMVMFASQDA IINTAKSVGLNPASVASNTAYADQQFYASMQAQGHLAQTYLPLAKAYLTAIIIGLSWVVALLSIVFGSYAYIKMYFTLCI WIALWTPILCIINYLNDYNLMKVTQVITGGKEALSLRDNILIFKEVASRSNFMNYLVMSTPVLAYAIAKASEHGFVTFAS GLSQTLAGASRAAGSFANQQALSTQTSMAAPRGDEVIAYNTGIMSLQGATSVGSSRYSTTSIAGGGTTVTDVNTGSKVSG DMQGVTAANIAGLSASDMKSKQASLAGEVSQGISDALKTGQTSQSVANMAFDHSASHGINAQAQEIFKASSTMAFDKMAQ AGDQRAQELMSALKAGGSIASVVDGSVNITEKDGTSRTFTFTDKEMQQWSKDFGDNVASTYARDDSARASLNNAFSTFTG KEFSQVHSAINKYSSVESFASNVNSDSVPKALNNYIRSGDDAAITNAWNSGNIGKAMAMASDDFQRWSVNNPQQLSKYFN AGDFSSPQNTIGSVGMQNYYSPSTASAIHKGNYGTVDSATVGFGNSYEADKKSMKEGHFKTTGQNTAWGQGNSQGTVQQE VQGQVNNAVNQFSKGAPARTVDDGVKVAEMAADGAKGSFTIL
Specific function: Plays A Crucial Role In Donor-Recipient Cell Interactions. Required For Two Stages Of The Conjugation Process: Pilus Biosynthesis And Mating Aggregate Stabilization. May Interact With Tran. [C]
COG id: NA
COG function: NA
Gene ontology:
Cell location: Integral Membrane Protein. Inner Membrane [C]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
NA
Pfam domain/function: NA
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 99325; Mature: 99325
Theoretical pI: Translated: 6.21; Mature: 6.21
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.4 %Cys (Translated Protein) 3.9 %Met (Translated Protein) 4.3 %Cys+Met (Translated Protein) 0.4 %Cys (Mature Protein) 3.9 %Met (Mature Protein) 4.3 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKRFYFLFFSTLFFAPSFLFGATEIANSNLIYTWGYGDVMNEIMQAVKGLTTETGYIVNA CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH ALAISLLLFSIKKAIDGQTSPVFELGKMFMLFAVVWHMFLKAPNDNNHRFMIHDEVTSKD HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCC YVISQIPIGIGKSFALMTQFEKVILGAMEKHFSTPQSTNFSNAGLGFSLQVMSTLPSVKL EEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCCHH SAIDATLQKNIDFYFRNCVSVGILLNKQGRNLFSNSDNLMRDLFTNIGNGSQFTPLFTSD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCEECEEEECC NNIENKSIVPCSEAGPQIVEMIENNTDEAMKIHAALLSMADDMENYEHKFFGAAQIYNEQ CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVSARSYFQQAMVMFASQDAIINTAKSVGLNPASVASNTAYADQQFYASMQAQGHLAQTY HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH LPLAKAYLTAIIIGLSWVVALLSIVFGSYAYIKMYFTLCIWIALWTPILCIINYLNDYNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH MKVTQVITGGKEALSLRDNILIFKEVASRSNFMNYLVMSTPVLAYAIAKASEHGFVTFAS HHHHHHHHCCHHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHH GLSQTLAGASRAAGSFANQQALSTQTSMAAPRGDEVIAYNTGIMSLQGATSVGSSRYSTT HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEEECCCCCCCCCCCCCE SIAGGGTTVTDVNTGSKVSGDMQGVTAANIAGLSASDMKSKQASLAGEVSQGISDALKTG EECCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC QTSQSVANMAFDHSASHGINAQAQEIFKASSTMAFDKMAQAGDQRAQELMSALKAGGSIA CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE SVVDGSVNITEKDGTSRTFTFTDKEMQQWSKDFGDNVASTYARDDSARASLNNAFSTFTG ECCCCCEEEEECCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCC KEFSQVHSAINKYSSVESFASNVNSDSVPKALNNYIRSGDDAAITNAWNSGNIGKAMAMA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHC SDDFQRWSVNNPQQLSKYFNAGDFSSPQNTIGSVGMQNYYSPSTASAIHKGNYGTVDSAT CCCHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCE VGFGNSYEADKKSMKEGHFKTTGQNTAWGQGNSQGTVQQEVQGQVNNAVNQFSKGAPART ECCCCCCCHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC VDDGVKVAEMAADGAKGSFTIL HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEC >Mature Secondary Structure MKRFYFLFFSTLFFAPSFLFGATEIANSNLIYTWGYGDVMNEIMQAVKGLTTETGYIVNA CCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHH ALAISLLLFSIKKAIDGQTSPVFELGKMFMLFAVVWHMFLKAPNDNNHRFMIHDEVTSKD HHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCEEEEEECCCCCC YVISQIPIGIGKSFALMTQFEKVILGAMEKHFSTPQSTNFSNAGLGFSLQVMSTLPSVKL EEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCEEEHHHHHCCCCHH SAIDATLQKNIDFYFRNCVSVGILLNKQGRNLFSNSDNLMRDLFTNIGNGSQFTPLFTSD HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCCCCHHCCCHHHHHHHHHHCCCCCEECEEEECC NNIENKSIVPCSEAGPQIVEMIENNTDEAMKIHAALLSMADDMENYEHKFFGAAQIYNEQ CCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH AVSARSYFQQAMVMFASQDAIINTAKSVGLNPASVASNTAYADQQFYASMQAQGHLAQTY HHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH LPLAKAYLTAIIIGLSWVVALLSIVFGSYAYIKMYFTLCIWIALWTPILCIINYLNDYNL HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCH MKVTQVITGGKEALSLRDNILIFKEVASRSNFMNYLVMSTPVLAYAIAKASEHGFVTFAS HHHHHHHHCCHHHHHHHCCEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEEEHH GLSQTLAGASRAAGSFANQQALSTQTSMAAPRGDEVIAYNTGIMSLQGATSVGSSRYSTT HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCEEEEEECCEEEECCCCCCCCCCCCCE SIAGGGTTVTDVNTGSKVSGDMQGVTAANIAGLSASDMKSKQASLAGEVSQGISDALKTG EECCCCCEEEECCCCCCCCCCCCCCHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC QTSQSVANMAFDHSASHGINAQAQEIFKASSTMAFDKMAQAGDQRAQELMSALKAGGSIA CCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEE SVVDGSVNITEKDGTSRTFTFTDKEMQQWSKDFGDNVASTYARDDSARASLNNAFSTFTG ECCCCCEEEEECCCCCCEEEECHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCC KEFSQVHSAINKYSSVESFASNVNSDSVPKALNNYIRSGDDAAITNAWNSGNIGKAMAMA HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCCCCCCHHHHHC SDDFQRWSVNNPQQLSKYFNAGDFSSPQNTIGSVGMQNYYSPSTASAIHKGNYGTVDSAT CCCHHHCCCCCHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCCCCE VGFGNSYEADKKSMKEGHFKTTGQNTAWGQGNSQGTVQQEVQGQVNNAVNQFSKGAPART ECCCCCCCHHHHHHHCCCCEECCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC VDDGVKVAEMAADGAKGSFTIL HHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Unstructured
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: NA