Definition Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97, complete genome.
Accession NC_009707
Length 1,845,106

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The map label for this gene is 153951333

Identifier: 153951333

GI number: 153951333

Start: 259599

End: 261947

Strand: Direct

Name: 153951333

Synonym: JJD26997_0283

Alternate gene names: NA

Gene position: 259599-261947 (Clockwise)

Preceding gene: 153951403

Following gene: 153951976

Centisome position: 14.07

GC content: 24.99

Gene sequence:

>2349_bases
TTGTTAAATAAAGAATTAGAAATTTTTAAAAAAAATCTTAGTTCCTATACTCAAAGTTGTAGAAAGTTTTTTCTTAAGCA
AGGGGCGTTTAGCTTATATCATTCTAAAAATATGGATAATTTCATAAAAAAAGCTTATGATATAGTTCTTAAAGATTATT
TTGATGATTTTTCACCTCCAAGTGATAATATCCCTTTTTGTGTTTTGGCAAGCAAAGCATATGCAAACAATAGTCTTTGT
TTTAATGAAAGTATTTCTTTGATTTTTGTTTATAAAGATATTAAGGCTTTTCATTTAAAACCTATGATTAAGGCTTTTAT
CGAAATTTTAAATGATGCGCATTTGCAAATAGACTCTGTTATCTTAGAATTTAATGGACTTTATAATGCTAGCAATGAGC
TTAAGACTTCTATAATACAAACTCGTTTTATATGTGGTTCTAGGATTTTATTTAAAGGGATTAAGACAAAATTTGAGAGT
ATTTTAAAAGAAAATAAAAATGATTTTGCCAAGCTTTTATTAGAAAATTTTAAAGAATTTGATATTCCATTTATAAAGCA
AGAATTTAATATCTTAAAAGATTTTGGCGGATTAAATCATTTAAGATCCTTAGAGAGTTTGCTTGTTCTTTTTAAGACTT
CTCCAAAAAATTATGCTTTAAATTTTATAGATGAGAAAAATTTAAGTGAGTTGCGTTTAGCTGGAGATTTTTTACTTTCT
TTAAAATCAGCGATGAATTTATTAAGTGCTAAGGATGAGGATGAGTTTTTACTTATTAATGTTCATGATTTGAGTGAATT
AATGTATAAAAAAGCTAAAAAACATTTTGGAGCAAATGAGTTGTTGGTTCAAAAAGCTTTGCAAAGTATGCATACTATAG
GTTTTTATACGCACTTTTTAGCAAAGCAAATTCAAGATGGGTTAAATCATACTCTTAAACAAGAATATAAATTTAAAACT
CTTGTGGAAGTTTTAGAATACTTATTAAAACTTGAAGATAAACAGGTTATTTTCGATCTTCACTTGGTTTTTTCCCTAAG
AAGATTAAAATACGGTAAAAAAGATATAGAAAAAGCTTTAATACTTTTTGAGAAAATTTTTTATAAAAGGCATAGTTTTT
GTGTTTTAAAACTTTTGCTTGATAGTGGAATTTTAAAAGATTTATGCAAGCCTTTTTGGACAGTTCGTTTTTTAAGTGAT
GAAGAAGGAAATTATAGTTTTGATGAGCAAGTTTTTCTTATGTTAAGTGAATTTGAAAAATACGAAGATGAGCTTGAGAT
ACTCCAAAAACTTAAAACCGATGAAAAAATGATTTTAAAGCTCGTAATACTTTTAAGTGCTATAGAAAGTGAAAATGAAA
TTTCTTTAGCAGGCATATATAGAGCGTATTGTTCCAAATTTGATTTAAAGAATGAAATTTTAGAATGGGGTCTTAAAATA
TTTAAAAACAATAATGCCTTAAAAGATCTTGTAGAAAAAGAAGATATATATAATCCTATTGTTGTAAGTAGTTTGGTTTC
TAAACTAGAAAATTTAGAAAATTTAGAGCTTTTATATACTTTAACTTGGCTAAAGGCTAAGGCTTTAAATTACAATGCTT
TTTATTTTAGGGTTCTTGATAAACTTTTAGAAAATGCAAAACAAGGTTTTGAAGATGAAAATCTACTTGAAGAAAGTGCA
AGAAGGGTAAAAAAAGAATTAACACTTAAAAGAAGTAAGATTTTTTTAGAGCAAGATGAAATTTTGCAAGATAAAATCAT
ACATATCAAATCAAATCTTTTTATTATAAAAAATACTTTTGAAGATATTGTTATGATTTCTAAATTAGCTAAAGAAAATG
ATTTTAAATTTTGGTTTAGCAATGAAACAAATCTTAGTTTGCAAATTGTTGCGCCACTTCATTTTAATATTGCCATTATT
TTAAGTTCTTTAACAAATTTAAATCTTATTTTTATGAATTTTTTTGAACTTTTTGATGATAAAATTTATTTAAGGTTTGA
ATATGATAATATTATCAGTGATGAGCAAAAACTAAAACTTTGTGAGCTTTTAAATTCAAATCTTTCTGGTTTTAATTTGA
AAAAAATTAAAAAGCCAATCATTAAAAAAGATGAGTTAAAATTAGACTTAAATTATTCTAAAATGTATGCCAAATTAGGT
CTTAATACCAAAGATCAGCAAGGTTTAATGGCGTATTTGATGAATGTTTTTAATGAACTTGAACTTGTTTTATGTGCAGC
AAAAATTCAAACCATAAGACAAAGGACGCGTAATATTTTTATTTTTCAAAAGAATGAAAAATTAGAACATAGCGAGCAAA
AGTTAGTTAATTTATTAATAAGTGAGTAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
CATTATAATTTTTGCTTACTGAAAAAGAGTTTATAGAAAAAGCCAAAATAAAAGATATTTTTGTTAAGATTATTATTAAA
ATTTAAAGAGAGTAGAAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AAAATGTGTGGAATTGTAGGCTATATAGGAAATAATGAAAAAAAACAAATTATACTAAATGGACTTAAAGAATTAGAATA
CCGTGGCTATGATAGTGCGG

Product: GlnD family protein

Products: NA

Alternate protein names: Nucleotidyltransferase; GlnD Family Protein; Protein-P-II Uridylyltransferase; (Protein-PII) Uridylyltransferase; GlnD PII-Uridylyltransferase Family; Nucleotidyltransferase GlnD Family; ATP-Dependent DNA Helicase UvrD

Number of amino acids: Translated: 782; Mature: 782

Protein sequence:

>782_residues
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC
FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFES
ILKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT
LVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD
EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA
RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAII
LSSLTNLNLIFMNFFELFDDKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE

Sequences:

>Translated_782_residues
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC
FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFES
ILKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT
LVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD
EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA
RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAII
LSSLTNLNLIFMNFFELFDDKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE
>Mature_782_residues
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPPSDNIPFCVLASKAYANNSLC
FNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSVILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFES
ILKENKNDFAKLLLENFKEFDIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFLAKQIQDGLNHTLKQEYKFKT
LVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKALILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSD
EEGNYSFDEQVFLMLSEFEKYEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLDKLLENAKQGFEDENLLEESA
RRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTFEDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAII
LSSLTNLNLIFMNFFELFDDKIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLISE

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 91735; Mature: 91735

Theoretical pI: Translated: 7.95; Mature: 7.95

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.2 %Cys     (Translated Protein)
1.7 %Met     (Translated Protein)
2.8 %Cys+Met (Translated Protein)
1.2 %Cys     (Mature Protein)
1.7 %Met     (Mature Protein)
2.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SDNIPFCVLASKAYANNSLCFNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSV
CCCCCEEEEECHHHCCCCEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
ILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFESILKENKNDFAKLLLENFKEF
HEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC
DIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
CCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFL
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKQIQDGLNHTLKQEYKFKTLVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
ILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSDEEGNYSFDEQVFLMLSEFEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
YEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
HHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH
FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLD
HCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
KLLENAKQGFEDENLLEESARRVKKELTLKRSKIFLEQDEILQDKIIHIKSNLFIIKNTF
HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCH
EDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAIILSSLTNLNLIFMNFFELFDD
HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC
KIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
CEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHC
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
SE
CC
>Mature Secondary Structure
MLNKELEIFKKNLSSYTQSCRKFFLKQGAFSLYHSKNMDNFIKKAYDIVLKDYFDDFSPP
CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC
SDNIPFCVLASKAYANNSLCFNESISLIFVYKDIKAFHLKPMIKAFIEILNDAHLQIDSV
CCCCCEEEEECHHHCCCCEEECCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHH
ILEFNGLYNASNELKTSIIQTRFICGSRILFKGIKTKFESILKENKNDFAKLLLENFKEF
HEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHC
DIPFIKQEFNILKDFGGLNHLRSLESLLVLFKTSPKNYALNFIDEKNLSELRLAGDFLLS
CCCHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHH
LKSAMNLLSAKDEDEFLLINVHDLSELMYKKAKKHFGANELLVQKALQSMHTIGFYTHFL
HHHHHHHHCCCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AKQIQDGLNHTLKQEYKFKTLVEVLEYLLKLEDKQVIFDLHLVFSLRRLKYGKKDIEKAL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHH
ILFEKIFYKRHSFCVLKLLLDSGILKDLCKPFWTVRFLSDEEGNYSFDEQVFLMLSEFEK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH
YEDELEILQKLKTDEKMILKLVILLSAIESENEISLAGIYRAYCSKFDLKNEILEWGLKI
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FKNNNALKDLVEKEDIYNPIVVSSLVSKLENLENLELLYTLTWLKAKALNYNAFYFRVLD
HCCCCHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHH
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HHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEEECCEEEEECCH
EDIVMISKLAKENDFKFWFSNETNLSLQIVAPLHFNIAIILSSLTNLNLIFMNFFELFDD
HHHHHHHHHHCCCCCEEEECCCCCEEEEEEECCHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCC
KIYLRFEYDNIISDEQKLKLCELLNSNLSGFNLKKIKKPIIKKDELKLDLNYSKMYAKLG
CEEEEEECCCCCCCHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHHHHCCCCCCCEEEECCHHHHHHHHC
LNTKDQQGLMAYLMNVFNELELVLCAAKIQTIRQRTRNIFIFQKNEKLEHSEQKLVNLLI
CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCEEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHH
SE
CC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA