| Definition | Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009635 |
| Length | 1,569,500 |
Click here to switch to the map view.
The map label for this gene is 150401929
Identifier: 150401929
GI number: 150401929
Start: 1568372
End: 1569478
Strand: Direct
Name: 150401929
Synonym: Maeo_1507
Alternate gene names: NA
Gene position: 1568372-1569478 (Clockwise)
Preceding gene: 150401928
Following gene: NA
Centisome position: 99.93
GC content: 25.84
Gene sequence:
>1107_bases ATGGAGCTCCCTACTATAAACACAATAAAAGAAAAAATAAAAATACATCATTTATTTTTAATGGTGGGTTGCATATATAT TTCACTATCTAGCGTTTCCTATTATTCTGGATTTTTAGCTTTTTTTAGCTTAATTTTCTTTTATTTATCCTATATTGTAG GGGAAAAATTATATTATAATTTAAAATTAGATAATTTAATTGATAATGCAAATATAACAGGCAAATATAAAATAAATTAT TCAAAACATTACAAATTTGGATTAATATTATTATTTATAGGAATATTGTTTATATTTTTTAATTTATTGTGGGTAAGGGG TGTGCCATTATTTGACCCAGATTCAAGAAGATTTTTAAATGTGCCATTTACAGCATTATCTCGGTTATTATTAATTGGCT GGGCAATAACTGTTGCATCTAATTTAAATTTAAATAGGTTAAAAATATTAATTTATTCGTTGGTTTTTTCATCGTTAATT ATGCTGTTGGGATATAGGACAAATGGTATGATATTGTTATTGTCCATATTGTTTGTGGCATATTATTCAAATAGAATAAA AACAAAAGAATTAATATATTCCTCAGGAGGATTGTTTTTAATATTAATTGCAATGTCATTACAGAGACTTTATACAATGG GCATTGGCGGAATTCCGTTAATTTCAAGAATTGACTTAACTATGAGTGTTTTTGACATTATTGTTAAAGATTTTAATGGG GCATTTCTTGGATTATTGCATTATAGTGCCATATTTTCGTATTTTGGAATGGCATCAGGTGCAAGAAACATTATTGCAAA TAATATAGGCGTTACTTCTGTTTCAATAACTCCCACCATATTTGGAGCTGTAATTGGAGATTATGGAATACTTGGGATTA TTCCATATTTTGGGATATTGGGTATATTTTTAGGACTATTTTATAAAATAGCTGAAAAATTAAAAGGGGTTTATTTGGGT GTTTTTGCTATTGTAGTATCATATTTGATAGTATCAATTGAAACAGGTTTGTTGGATTTTGATGTGCTTCTATATTATTT ATTTGGGTTTATTTTATGTATTTATGCTTCTATTAAATATATATTAATTGACAAATTTAAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCATTGAGAAATACGACCCAACCATTACAAAATTGTAAATCTTATACCTTATATAATGTGTAATATATAATATATTAATT AATATAGAGATGGTTATATA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATATTTTTATCCCATTTATAATATAATCAAATATATGGCATACTAAGAACTTTTTGCAATATTATAGAACAAATTAAATA AATATCCCTTTGGGATTTTT
Product: hypothetical protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 368; Mature: 368
Protein sequence:
>368_residues MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYNLKLDNLIDNANITGKYKINY SKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLNVPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLI MLLGYRTNGMILLLSILFVAYYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGILGIFLGLFYKIAEKLKGVYLG VFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKYILIDKFKK
Sequences:
>Translated_368_residues MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYNLKLDNLIDNANITGKYKINY SKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLNVPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLI MLLGYRTNGMILLLSILFVAYYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGILGIFLGLFYKIAEKLKGVYLG VFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKYILIDKFKK >Mature_368_residues MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYNLKLDNLIDNANITGKYKINY SKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLNVPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLI MLLGYRTNGMILLLSILFVAYYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGILGIFLGLFYKIAEKLKGVYLG VFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKYILIDKFKK
Specific function: Unknown
COG id: COG1822
COG function: function code S; Predicted archaeal membrane protein
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: NA
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002760 [H]
Pfam domain/function: PF01901 DUF70 [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 41593; Mature: 41593
Theoretical pI: Translated: 9.76; Mature: 9.76
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.5 %Cys (Translated Protein) 2.2 %Met (Translated Protein) 2.7 %Cys+Met (Translated Protein) 0.5 %Cys (Mature Protein) 2.2 %Met (Mature Protein) 2.7 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYN CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEE LKLDNLIDNANITGKYKINYSKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLN EEHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE VPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLIMLLGYRTNGMILLLSILFVA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH YYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG HHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGIL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH GIFLGLFYKIAEKLKGVYLGVFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILIDKFKK HHHHCCCC >Mature Secondary Structure MELPTINTIKEKIKIHHLFLMVGCIYISLSSVSYYSGFLAFFSLIFFYLSYIVGEKLYYN CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHEEE LKLDNLIDNANITGKYKINYSKHYKFGLILLFIGILFIFFNLLWVRGVPLFDPDSRRFLN EEHHHHHCCCCCCEEEEECCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCEEE VPFTALSRLLLIGWAITVASNLNLNRLKILIYSLVFSSLIMLLGYRTNGMILLLSILFVA CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH YYSNRIKTKELIYSSGGLFLILIAMSLQRLYTMGIGGIPLISRIDLTMSVFDIIVKDFNG HHHCCCCHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC AFLGLLHYSAIFSYFGMASGARNIIANNIGVTSVSITPTIFGAVIGDYGILGIIPYFGIL HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHCCCCCEEEEEHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHH GIFLGLFYKIAEKLKGVYLGVFAIVVSYLIVSIETGLLDFDVLLYYLFGFILCIYASIKY HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH ILIDKFKK HHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]