| Definition | Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009635 |
| Length | 1,569,500 |
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The map label for this gene is 150400848
Identifier: 150400848
GI number: 150400848
Start: 435521
End: 437041
Strand: Direct
Name: 150400848
Synonym: Maeo_0416
Alternate gene names: NA
Gene position: 435521-437041 (Clockwise)
Preceding gene: 150400847
Following gene: 150400849
Centisome position: 27.75
GC content: 28.4
Gene sequence:
>1521_bases ATGGACTATAAAGAAAGGGCAATAAAAGGTATTAGTTGGAATTTTCTATTATTAATATTGGCGGCTCCCATTGGCTATTT AGTCAGGATGTTATATGCAAATGAAATTCCTAAATTGGAAGTTGGTCTATTTTATGCTGTTTTGGATTTTTGTTGTATGG TTGCTATTTTTAAAGATTTGGGTTTAAGTGCTGCATTAGTTAGGTTTATTCCAAAATTTATACATGAAAAAAGAAATGAT TTAGTCAAATCAGCGATAGTAAGTGTTGGTATTTTACAGAGCTCTGTATCGTTGTTAATAACCATTGGAATTATTTTACT TTCTCCTTTAATAGCGAAATATTATATAAACAATCAGGGGCAATTTATAGGGCATTTAGATTTGGTTATTAATGTTTTAA TTATTTTGAGTATAGGATATTGGTTTCAGAGTATAATGGATGTCATTAGAAATGCCATACAGGGCTTTCAAAATCAGAAG TATTTTGGAACTAGTAATTTTGTTAAGATTTCTTTAGTTTTGATTTCATCAGTAATATTCATCTATATTTTAGATATACA CAATGTTTTTGCTCCAAGTTATGCATACACCATAACCCCAATATTAATGATATTAATCTATGCTTCCATATTTATTAAAA AGATTTTTCCAGAGTTTTTTAAGGGGAGATTTATTTTCTCAAAAAAACTAATTAAAGATTTATTTTCTTATGGGCTACCT GTTATGATGGGTAGTGCAGGGAGTTTAATTTTAGGCTATGTTGATGGAATTTGTTTAACTTACTTTACAGGTTTAAATGC AGTTGCTGATTATAGAAATGTGGCAATGCCTACGGTTAGTATTTTAGGTTATTTTGCAAGTGCTGTTGGTGCAGTCTTAT TTCCAATGAGTTCCGAGTTATGGGAAAAGGGGCATAAAGAAGCATTAAGGTATGGAGTTGAAAGGATTTGTTTGTATTCT TTTGTTTTAGTTTTACCGATGGCAATATTGATGGCATATTTTCCAACAGTTGTTGTTAATTTACTATTTAACGCTCAATA TTTGCCCGCAGCAGACGCCATAAGAATATTAAGTTTAGGAACCGTTTTTATGACTTTAAATGGGATTGGATTTACAGTAT TAAATGGTATTGGAAAGCCTTCATTATCAACTAAAATTTTATATTTTGGGGCGACATTTAACTTAATTTTCAATCTTTTA TTAATTCCAAAATTTGGAATTATTGGAGCATCTATAACCACCGTCTTAGGATACTTCATAATGTGGATTTTTCAGATGAA ATATTTATCTAAATTTTTAGAGCATAAATTTTTAAATAAAAATTGGATATTAATTATATTCATTGGAATTTTTAGTTTAA TTCCAATTATATTCATCAAAGATTTAATCAATAATATGTTTTTAGAGTTGGCTGTTTGCGGAATTGTTTATTTTGGAATA TATATGTTGGGAATATTTGGACTAAAAATAATAAATATAAATGAGATTAATGATATTATTGGCAAAATTATAAAGAGGTA A
Upstream 100 bases:
>100_bases AATTATTAAATTATAATCCAAAGGTTTCTATTGAAGAAGGGCTGAAAAGGTTTTGTAATTGGTTTTTAGAGAATAAGGAG TGGCTATTGGTGTTGTAAAT
Downstream 100 bases:
>100_bases GCAATCATGAAAAATAAAATCCTTGCATTAATCCCCGCAAGAGGGGGAAGTAAAGGACTTCCAAGAAAAAATATAAAACC ACTGTTGGGAAAGCCTTTAA
Product: polysaccharide biosynthesis protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 506; Mature: 506
Protein sequence:
>506_residues MDYKERAIKGISWNFLLLILAAPIGYLVRMLYANEIPKLEVGLFYAVLDFCCMVAIFKDLGLSAALVRFIPKFIHEKRND LVKSAIVSVGILQSSVSLLITIGIILLSPLIAKYYINNQGQFIGHLDLVINVLIILSIGYWFQSIMDVIRNAIQGFQNQK YFGTSNFVKISLVLISSVIFIYILDIHNVFAPSYAYTITPILMILIYASIFIKKIFPEFFKGRFIFSKKLIKDLFSYGLP VMMGSAGSLILGYVDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVSILGYFASAVGAVLFPMSSELWEKGHKEALRYGVERICLYS FVLVLPMAILMAYFPTVVVNLLFNAQYLPAADAIRILSLGTVFMTLNGIGFTVLNGIGKPSLSTKILYFGATFNLIFNLL LIPKFGIIGASITTVLGYFIMWIFQMKYLSKFLEHKFLNKNWILIIFIGIFSLIPIIFIKDLINNMFLELAVCGIVYFGI YMLGIFGLKIININEINDIIGKIIKR
Sequences:
>Translated_506_residues MDYKERAIKGISWNFLLLILAAPIGYLVRMLYANEIPKLEVGLFYAVLDFCCMVAIFKDLGLSAALVRFIPKFIHEKRND LVKSAIVSVGILQSSVSLLITIGIILLSPLIAKYYINNQGQFIGHLDLVINVLIILSIGYWFQSIMDVIRNAIQGFQNQK YFGTSNFVKISLVLISSVIFIYILDIHNVFAPSYAYTITPILMILIYASIFIKKIFPEFFKGRFIFSKKLIKDLFSYGLP VMMGSAGSLILGYVDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVSILGYFASAVGAVLFPMSSELWEKGHKEALRYGVERICLYS FVLVLPMAILMAYFPTVVVNLLFNAQYLPAADAIRILSLGTVFMTLNGIGFTVLNGIGKPSLSTKILYFGATFNLIFNLL LIPKFGIIGASITTVLGYFIMWIFQMKYLSKFLEHKFLNKNWILIIFIGIFSLIPIIFIKDLINNMFLELAVCGIVYFGI YMLGIFGLKIININEINDIIGKIIKR >Mature_506_residues MDYKERAIKGISWNFLLLILAAPIGYLVRMLYANEIPKLEVGLFYAVLDFCCMVAIFKDLGLSAALVRFIPKFIHEKRND LVKSAIVSVGILQSSVSLLITIGIILLSPLIAKYYINNQGQFIGHLDLVINVLIILSIGYWFQSIMDVIRNAIQGFQNQK YFGTSNFVKISLVLISSVIFIYILDIHNVFAPSYAYTITPILMILIYASIFIKKIFPEFFKGRFIFSKKLIKDLFSYGLP VMMGSAGSLILGYVDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVSILGYFASAVGAVLFPMSSELWEKGHKEALRYGVERICLYS FVLVLPMAILMAYFPTVVVNLLFNAQYLPAADAIRILSLGTVFMTLNGIGFTVLNGIGKPSLSTKILYFGATFNLIFNLL LIPKFGIIGASITTVLGYFIMWIFQMKYLSKFLEHKFLNKNWILIIFIGIFSLIPIIFIKDLINNMFLELAVCGIVYFGI YMLGIFGLKIININEINDIIGKIIKR
Specific function: Unknown
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002797 [H]
Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56911; Mature: 56911
Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
1.0 %Cys (Translated Protein) 3.2 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 1.0 %Cys (Mature Protein) 3.2 %Met (Mature Protein) 4.2 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MDYKERAIKGISWNFLLLILAAPIGYLVRMLYANEIPKLEVGLFYAVLDFCCMVAIFKDL CCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLSAALVRFIPKFIHEKRNDLVKSAIVSVGILQSSVSLLITIGIILLSPLIAKYYINNQG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC QFIGHLDLVINVLIILSIGYWFQSIMDVIRNAIQGFQNQKYFGTSNFVKISLVLISSVIF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH IYILDIHNVFAPSYAYTITPILMILIYASIFIKKIFPEFFKGRFIFSKKLIKDLFSYGLP HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC VMMGSAGSLILGYVDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVSILGYFASAVGAVLFPMSSEL EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH WEKGHKEALRYGVERICLYSFVLVLPMAILMAYFPTVVVNLLFNAQYLPAADAIRILSLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH TVFMTLNGIGFTVLNGIGKPSLSTKILYFGATFNLIFNLLLIPKFGIIGASITTVLGYFI HHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH MWIFQMKYLSKFLEHKFLNKNWILIIFIGIFSLIPIIFIKDLINNMFLELAVCGIVYFGI HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YMLGIFGLKIININEINDIIGKIIKR HHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHCC >Mature Secondary Structure MDYKERAIKGISWNFLLLILAAPIGYLVRMLYANEIPKLEVGLFYAVLDFCCMVAIFKDL CCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH GLSAALVRFIPKFIHEKRNDLVKSAIVSVGILQSSVSLLITIGIILLSPLIAKYYINNQG CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCC QFIGHLDLVINVLIILSIGYWFQSIMDVIRNAIQGFQNQKYFGTSNFVKISLVLISSVIF CHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHH IYILDIHNVFAPSYAYTITPILMILIYASIFIKKIFPEFFKGRFIFSKKLIKDLFSYGLP HHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHCCCC VMMGSAGSLILGYVDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVSILGYFASAVGAVLFPMSSEL EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH WEKGHKEALRYGVERICLYSFVLVLPMAILMAYFPTVVVNLLFNAQYLPAADAIRILSLG HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH TVFMTLNGIGFTVLNGIGKPSLSTKILYFGATFNLIFNLLLIPKFGIIGASITTVLGYFI HHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH MWIFQMKYLSKFLEHKFLNKNWILIIFIGIFSLIPIIFIKDLINNMFLELAVCGIVYFGI HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH YMLGIFGLKIININEINDIIGKIIKR HHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]