Definition Methanococcus aeolicus Nankai-3, complete genome.
Accession NC_009635
Length 1,569,500

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The map label for this gene is 150400848

Identifier: 150400848

GI number: 150400848

Start: 435521

End: 437041

Strand: Direct

Name: 150400848

Synonym: Maeo_0416

Alternate gene names: NA

Gene position: 435521-437041 (Clockwise)

Preceding gene: 150400847

Following gene: 150400849

Centisome position: 27.75

GC content: 28.4

Gene sequence:

>1521_bases
ATGGACTATAAAGAAAGGGCAATAAAAGGTATTAGTTGGAATTTTCTATTATTAATATTGGCGGCTCCCATTGGCTATTT
AGTCAGGATGTTATATGCAAATGAAATTCCTAAATTGGAAGTTGGTCTATTTTATGCTGTTTTGGATTTTTGTTGTATGG
TTGCTATTTTTAAAGATTTGGGTTTAAGTGCTGCATTAGTTAGGTTTATTCCAAAATTTATACATGAAAAAAGAAATGAT
TTAGTCAAATCAGCGATAGTAAGTGTTGGTATTTTACAGAGCTCTGTATCGTTGTTAATAACCATTGGAATTATTTTACT
TTCTCCTTTAATAGCGAAATATTATATAAACAATCAGGGGCAATTTATAGGGCATTTAGATTTGGTTATTAATGTTTTAA
TTATTTTGAGTATAGGATATTGGTTTCAGAGTATAATGGATGTCATTAGAAATGCCATACAGGGCTTTCAAAATCAGAAG
TATTTTGGAACTAGTAATTTTGTTAAGATTTCTTTAGTTTTGATTTCATCAGTAATATTCATCTATATTTTAGATATACA
CAATGTTTTTGCTCCAAGTTATGCATACACCATAACCCCAATATTAATGATATTAATCTATGCTTCCATATTTATTAAAA
AGATTTTTCCAGAGTTTTTTAAGGGGAGATTTATTTTCTCAAAAAAACTAATTAAAGATTTATTTTCTTATGGGCTACCT
GTTATGATGGGTAGTGCAGGGAGTTTAATTTTAGGCTATGTTGATGGAATTTGTTTAACTTACTTTACAGGTTTAAATGC
AGTTGCTGATTATAGAAATGTGGCAATGCCTACGGTTAGTATTTTAGGTTATTTTGCAAGTGCTGTTGGTGCAGTCTTAT
TTCCAATGAGTTCCGAGTTATGGGAAAAGGGGCATAAAGAAGCATTAAGGTATGGAGTTGAAAGGATTTGTTTGTATTCT
TTTGTTTTAGTTTTACCGATGGCAATATTGATGGCATATTTTCCAACAGTTGTTGTTAATTTACTATTTAACGCTCAATA
TTTGCCCGCAGCAGACGCCATAAGAATATTAAGTTTAGGAACCGTTTTTATGACTTTAAATGGGATTGGATTTACAGTAT
TAAATGGTATTGGAAAGCCTTCATTATCAACTAAAATTTTATATTTTGGGGCGACATTTAACTTAATTTTCAATCTTTTA
TTAATTCCAAAATTTGGAATTATTGGAGCATCTATAACCACCGTCTTAGGATACTTCATAATGTGGATTTTTCAGATGAA
ATATTTATCTAAATTTTTAGAGCATAAATTTTTAAATAAAAATTGGATATTAATTATATTCATTGGAATTTTTAGTTTAA
TTCCAATTATATTCATCAAAGATTTAATCAATAATATGTTTTTAGAGTTGGCTGTTTGCGGAATTGTTTATTTTGGAATA
TATATGTTGGGAATATTTGGACTAAAAATAATAAATATAAATGAGATTAATGATATTATTGGCAAAATTATAAAGAGGTA
A

Upstream 100 bases:

>100_bases
AATTATTAAATTATAATCCAAAGGTTTCTATTGAAGAAGGGCTGAAAAGGTTTTGTAATTGGTTTTTAGAGAATAAGGAG
TGGCTATTGGTGTTGTAAAT

Downstream 100 bases:

>100_bases
GCAATCATGAAAAATAAAATCCTTGCATTAATCCCCGCAAGAGGGGGAAGTAAAGGACTTCCAAGAAAAAATATAAAACC
ACTGTTGGGAAAGCCTTTAA

Product: polysaccharide biosynthesis protein

Products: NA

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 506; Mature: 506

Protein sequence:

>506_residues
MDYKERAIKGISWNFLLLILAAPIGYLVRMLYANEIPKLEVGLFYAVLDFCCMVAIFKDLGLSAALVRFIPKFIHEKRND
LVKSAIVSVGILQSSVSLLITIGIILLSPLIAKYYINNQGQFIGHLDLVINVLIILSIGYWFQSIMDVIRNAIQGFQNQK
YFGTSNFVKISLVLISSVIFIYILDIHNVFAPSYAYTITPILMILIYASIFIKKIFPEFFKGRFIFSKKLIKDLFSYGLP
VMMGSAGSLILGYVDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVSILGYFASAVGAVLFPMSSELWEKGHKEALRYGVERICLYS
FVLVLPMAILMAYFPTVVVNLLFNAQYLPAADAIRILSLGTVFMTLNGIGFTVLNGIGKPSLSTKILYFGATFNLIFNLL
LIPKFGIIGASITTVLGYFIMWIFQMKYLSKFLEHKFLNKNWILIIFIGIFSLIPIIFIKDLINNMFLELAVCGIVYFGI
YMLGIFGLKIININEINDIIGKIIKR

Sequences:

>Translated_506_residues
MDYKERAIKGISWNFLLLILAAPIGYLVRMLYANEIPKLEVGLFYAVLDFCCMVAIFKDLGLSAALVRFIPKFIHEKRND
LVKSAIVSVGILQSSVSLLITIGIILLSPLIAKYYINNQGQFIGHLDLVINVLIILSIGYWFQSIMDVIRNAIQGFQNQK
YFGTSNFVKISLVLISSVIFIYILDIHNVFAPSYAYTITPILMILIYASIFIKKIFPEFFKGRFIFSKKLIKDLFSYGLP
VMMGSAGSLILGYVDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVSILGYFASAVGAVLFPMSSELWEKGHKEALRYGVERICLYS
FVLVLPMAILMAYFPTVVVNLLFNAQYLPAADAIRILSLGTVFMTLNGIGFTVLNGIGKPSLSTKILYFGATFNLIFNLL
LIPKFGIIGASITTVLGYFIMWIFQMKYLSKFLEHKFLNKNWILIIFIGIFSLIPIIFIKDLINNMFLELAVCGIVYFGI
YMLGIFGLKIININEINDIIGKIIKR
>Mature_506_residues
MDYKERAIKGISWNFLLLILAAPIGYLVRMLYANEIPKLEVGLFYAVLDFCCMVAIFKDLGLSAALVRFIPKFIHEKRND
LVKSAIVSVGILQSSVSLLITIGIILLSPLIAKYYINNQGQFIGHLDLVINVLIILSIGYWFQSIMDVIRNAIQGFQNQK
YFGTSNFVKISLVLISSVIFIYILDIHNVFAPSYAYTITPILMILIYASIFIKKIFPEFFKGRFIFSKKLIKDLFSYGLP
VMMGSAGSLILGYVDGICLTYFTGLNAVADYRNVAMPTVSILGYFASAVGAVLFPMSSELWEKGHKEALRYGVERICLYS
FVLVLPMAILMAYFPTVVVNLLFNAQYLPAADAIRILSLGTVFMTLNGIGFTVLNGIGKPSLSTKILYFGATFNLIFNLL
LIPKFGIIGASITTVLGYFIMWIFQMKYLSKFLEHKFLNKNWILIIFIGIFSLIPIIFIKDLINNMFLELAVCGIVYFGI
YMLGIFGLKIININEINDIIGKIIKR

Specific function: Unknown

COG id: COG2244

COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid

Gene ontology:

Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR002797 [H]

Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 56911; Mature: 56911

Theoretical pI: Translated: 9.69; Mature: 9.69

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

1.0 %Cys     (Translated Protein)
3.2 %Met     (Translated Protein)
4.2 %Cys+Met (Translated Protein)
1.0 %Cys     (Mature Protein)
3.2 %Met     (Mature Protein)
4.2 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure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HHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHCC
>Mature Secondary Structure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EEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHH
WEKGHKEALRYGVERICLYSFVLVLPMAILMAYFPTVVVNLLFNAQYLPAADAIRILSLG
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHH
TVFMTLNGIGFTVLNGIGKPSLSTKILYFGATFNLIFNLLLIPKFGIIGASITTVLGYFI
HHHHHHCCCHHHHHHCCCCCCCCCEEEEECHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHH
MWIFQMKYLSKFLEHKFLNKNWILIIFIGIFSLIPIIFIKDLINNMFLELAVCGIVYFGI
HHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
YMLGIFGLKIININEINDIIGKIIKR
HHHHHHHHHEEEHHHHHHHHHHHHCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 8688087 [H]