| Definition | Methanococcus vannielii SB chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009634 |
| Length | 1,720,048 |
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The map label for this gene is 150399167
Identifier: 150399167
GI number: 150399167
Start: 467505
End: 469007
Strand: Reverse
Name: 150399167
Synonym: Mevan_0414
Alternate gene names: NA
Gene position: 469007-467505 (Counterclockwise)
Preceding gene: 150399168
Following gene: 150399166
Centisome position: 27.27
GC content: 24.42
Gene sequence:
>1503_bases TTGAGTTATAAAGATAGAATGATTAAGGGTGCTGCATGGAATTTTTTATTCTTAATGTTAGCAGCCCCTATTGGTTATTT TGTAAGAATATTATATGCAAATTCACTTTCAAAAGTTGAAGTAGGCCTTTTCTATGCAATTTTAGATTTAATCAGCATGA TTGCAATTTTTAGAGGTTTAGGATTAGGTAATGCAGTAATATACTTTATTCCAAAATTTTTAGTTCAAAATAGGTATGAT TTAATAAAATCAACACTATTATACGTTTTAATAATTCAAACAGGAATGGCAGTTTTAATTGCATTTTTAATGTATTCAAT GTCCCCTTTAATTATAAAATACTATATAAATAGTCAAGGCCAGTTTGGAAATCTTGAAGCTATTTCTACGGTATTTATAA TAATGGTTTTTGGATTTTATATATTTGATGGGATAAAAAACTTAACTGTTAACTCATTACTTGGATTTCAAAGTCAAAAA ATATATAGTACATATACTTTTTTAAATATATCAAGTGTTTTAGTTTTATCTTTTATTTTTATTTACTTTGGATTTGGCGT TTATTCTCCGCCCTTAGCATATACAATTGCTCCAATTTTAATGATTCTAATCTATGGGACAATTTTTTTAAAAAAGATAT TTCCAGAATTTTTTATTGAAAAGTTTTCTTTTTCAAAAAAACTTTTAAAAGATATTTTTACATACAGTATGCCGATAATG TTTGGAAGTGCCGGGTTTATCATAATGGGATACCTTGATTCAATATGTTTGACATACTTTACAGGACTTGATTCGGTTGC AGATTATAGGAACGTTGCAATGCCGACAGTTTTAGTATTAAGTTATTTTGCATCTTCAATATGTTCTGTAATACTTCCAA TGAGTACCGAAATGTGGGAAAAAGGTGAAAAAAAGAATCTTTCAGAGGGTTTAAAAAAGGTATTAACATATTCATTTATA ATTTCAATTCCTTTTTCAGTACTTTTATCATATTTTCCAACTGTTTTAATAAATCTATTTTTCAATGAAAATTATTTAAC TGCAGCTCTTCCAATGTCAATTTTAAGTTTTGGAATAGTCTTTTTATCAATGAATAATATTGTATTTAATGTCTTTAATG GAATTGGAAAACCATACCTTTCAACTAAAATATTATATATTGGGGCAATTTTTAATTTAATTTTTAATTTAATTTTAATT CCAAAATTTGGAACGAGTGGTGCAGCATTTACTACCACATTAAGTTATATTTTAATTCAAATTTTACAAGTTAATTACTT AAATAAATTTTTAGATTATAAATTTCCAATTAAAAAATTTATATTATGTATTTTTTCCTCAATATTGGCATTTATTCCTT TAATATTTATAAAAGGAATGAGTTTTAATGAATATATATTAATTTTATTATTCGGCATAGTCTATTTAATTGTGTATTTT TTGAGCATAATTTTACTAAATATTATTAAGATATCTGAATTAAAAACTTTTAAATTCTGGTGA
Upstream 100 bases:
>100_bases TTATAATTATGCTAAAAGTTTAGGATGGATTCCAGAAGTTGAAATGGATAATGGAATTAAAGATATTTAATTAAATTTTT TATTTTTAAGGGGATAATTT
Downstream 100 bases:
>100_bases CTTAAATGAAAATTTCAGTAATTGGGACAGGTTATGTTGGATTAATTCAAGCAGTGGGCTTAGCAAATTTTGGTTTTAAA GTTATAGGGATAGATATTGA
Product: polysaccharide biosynthesis protein
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 500; Mature: 499
Protein sequence:
>500_residues MSYKDRMIKGAAWNFLFLMLAAPIGYFVRILYANSLSKVEVGLFYAILDLISMIAIFRGLGLGNAVIYFIPKFLVQNRYD LIKSTLLYVLIIQTGMAVLIAFLMYSMSPLIIKYYINSQGQFGNLEAISTVFIIMVFGFYIFDGIKNLTVNSLLGFQSQK IYSTYTFLNISSVLVLSFIFIYFGFGVYSPPLAYTIAPILMILIYGTIFLKKIFPEFFIEKFSFSKKLLKDIFTYSMPIM FGSAGFIIMGYLDSICLTYFTGLDSVADYRNVAMPTVLVLSYFASSICSVILPMSTEMWEKGEKKNLSEGLKKVLTYSFI ISIPFSVLLSYFPTVLINLFFNENYLTAALPMSILSFGIVFLSMNNIVFNVFNGIGKPYLSTKILYIGAIFNLIFNLILI PKFGTSGAAFTTTLSYILIQILQVNYLNKFLDYKFPIKKFILCIFSSILAFIPLIFIKGMSFNEYILILLFGIVYLIVYF LSIILLNIIKISELKTFKFW
Sequences:
>Translated_500_residues MSYKDRMIKGAAWNFLFLMLAAPIGYFVRILYANSLSKVEVGLFYAILDLISMIAIFRGLGLGNAVIYFIPKFLVQNRYD LIKSTLLYVLIIQTGMAVLIAFLMYSMSPLIIKYYINSQGQFGNLEAISTVFIIMVFGFYIFDGIKNLTVNSLLGFQSQK IYSTYTFLNISSVLVLSFIFIYFGFGVYSPPLAYTIAPILMILIYGTIFLKKIFPEFFIEKFSFSKKLLKDIFTYSMPIM FGSAGFIIMGYLDSICLTYFTGLDSVADYRNVAMPTVLVLSYFASSICSVILPMSTEMWEKGEKKNLSEGLKKVLTYSFI ISIPFSVLLSYFPTVLINLFFNENYLTAALPMSILSFGIVFLSMNNIVFNVFNGIGKPYLSTKILYIGAIFNLIFNLILI PKFGTSGAAFTTTLSYILIQILQVNYLNKFLDYKFPIKKFILCIFSSILAFIPLIFIKGMSFNEYILILLFGIVYLIVYF LSIILLNIIKISELKTFKFW >Mature_499_residues SYKDRMIKGAAWNFLFLMLAAPIGYFVRILYANSLSKVEVGLFYAILDLISMIAIFRGLGLGNAVIYFIPKFLVQNRYDL IKSTLLYVLIIQTGMAVLIAFLMYSMSPLIIKYYINSQGQFGNLEAISTVFIIMVFGFYIFDGIKNLTVNSLLGFQSQKI YSTYTFLNISSVLVLSFIFIYFGFGVYSPPLAYTIAPILMILIYGTIFLKKIFPEFFIEKFSFSKKLLKDIFTYSMPIMF GSAGFIIMGYLDSICLTYFTGLDSVADYRNVAMPTVLVLSYFASSICSVILPMSTEMWEKGEKKNLSEGLKKVLTYSFII SIPFSVLLSYFPTVLINLFFNENYLTAALPMSILSFGIVFLSMNNIVFNVFNGIGKPYLSTKILYIGAIFNLIFNLILIP KFGTSGAAFTTTLSYILIQILQVNYLNKFLDYKFPIKKFILCIFSSILAFIPLIFIKGMSFNEYILILLFGIVYLIVYFL SIILLNIIKISELKTFKFW
Specific function: Unknown
COG id: COG2244
COG function: function code R; Membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: NA
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the polysaccharide synthase family [H]
Homologues:
None
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR002797 [H]
Pfam domain/function: PF01943 Polysacc_synt [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 56968; Mature: 56836
Theoretical pI: Translated: 9.68; Mature: 9.68
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 3.6 %Met (Translated Protein) 4.2 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 3.4 %Met (Mature Protein) 4.0 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MSYKDRMIKGAAWNFLFLMLAAPIGYFVRILYANSLSKVEVGLFYAILDLISMIAIFRGL CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GLGNAVIYFIPKFLVQNRYDLIKSTLLYVLIIQTGMAVLIAFLMYSMSPLIIKYYINSQG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEECCCC QFGNLEAISTVFIIMVFGFYIFDGIKNLTVNSLLGFQSQKIYSTYTFLNISSVLVLSFIF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IYFGFGVYSPPLAYTIAPILMILIYGTIFLKKIFPEFFIEKFSFSKKLLKDIFTYSMPIM HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGSAGFIIMGYLDSICLTYFTGLDSVADYRNVAMPTVLVLSYFASSICSVILPMSTEMWE CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH KGEKKNLSEGLKKVLTYSFIISIPFSVLLSYFPTVLINLFFNENYLTAALPMSILSFGIV CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH FLSMNNIVFNVFNGIGKPYLSTKILYIGAIFNLIFNLILIPKFGTSGAAFTTTLSYILIQ HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ILQVNYLNKFLDYKFPIKKFILCIFSSILAFIPLIFIKGMSFNEYILILLFGIVYLIVYF HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSIILLNIIKISELKTFKFW HHHHHHHHHHHHHHHHCCCC >Mature Secondary Structure SYKDRMIKGAAWNFLFLMLAAPIGYFVRILYANSLSKVEVGLFYAILDLISMIAIFRGL CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC GLGNAVIYFIPKFLVQNRYDLIKSTLLYVLIIQTGMAVLIAFLMYSMSPLIIKYYINSQG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHEEEEECCCC QFGNLEAISTVFIIMVFGFYIFDGIKNLTVNSLLGFQSQKIYSTYTFLNISSVLVLSFIF CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH IYFGFGVYSPPLAYTIAPILMILIYGTIFLKKIFPEFFIEKFSFSKKLLKDIFTYSMPIM HHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH FGSAGFIIMGYLDSICLTYFTGLDSVADYRNVAMPTVLVLSYFASSICSVILPMSTEMWE CCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHH KGEKKNLSEGLKKVLTYSFIISIPFSVLLSYFPTVLINLFFNENYLTAALPMSILSFGIV CCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHH FLSMNNIVFNVFNGIGKPYLSTKILYIGAIFNLIFNLILIPKFGTSGAAFTTTLSYILIQ HHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHH ILQVNYLNKFLDYKFPIKKFILCIFSSILAFIPLIFIKGMSFNEYILILLFGIVYLIVYF HHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH LSIILLNIIKISELKTFKFW HHHHHHHHHHHHHHHHCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8688087 [H]