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The map label for this gene is yaaJ [C]

Identifier: 148827322

GI number: 148827322

Start: 653798

End: 655237

Strand: Direct

Name: yaaJ [C]

Synonym: CGSHiGG_03515

Alternate gene names: 148827322

Gene position: 653798-655237 (Clockwise)

Preceding gene: 148827321

Following gene: 148827325

Centisome position: 34.64

GC content: 40.49

Gene sequence:

>1440_bases
ATGGAATTTGAATTTTCAAAAATGTTAGAAGAAGTGCTAACTTGGATAGTCGCACACCTTGATGGACCTTTATGGGATGC
CACCATTATTATTTTGCTTGGGACTGGTCTATTTTTTACCATTACAACAGGATTTGTGCAGTTCCGTTTATTCCCTGCAA
GCCTTCGTGAAATGTGGTTTGGTCGTTCGGTGGAGGGGAGTTCATTAACACCTTTCCAAGCGTTTACGACAGGTCTTGCG
AGCCGCGTTGGTGTGGGTAACATTGGTGGGGTTGCAACGGCAATAGCCTTAGGGGGCGAAGGCGCAGTGTTTTGGATGTG
GGTAACGGCATTTATTGGTATGTCGAGTGCTTTCGCTGAATCTACCCTTGCTCAATTATTTAAAATTCAAGATAAAGATG
GATCATTCCGTGGCGGCCCTGCTTATTATATTGTACAAGGTTTAAAATCACGTTGTATGGCAGTGGCTTTTGCGCTTGCA
TTAATTTTTACATTTGGTTTCGCATTTAATTCTGTGCAGGCGAACTCTATTGTTGAAGCGACGAGCAATGCGTGGAATTG
GAAAGGAGAATATGTCGGCATTTCATTAGTAATTTTGACCGCACTTATTATTTTCGGTGGCGTTAAGCGTATTGCGATTA
TTTCAAGCAACCTTGTACCAATGATGGCACTTTTCTATTTGATTATGGCGGTGATTATTCTTGGAATGCATATAGATATG
ATTCCTTCCGTGATTCATCGTATCGTTCAAAGTGCATTTAGTTTTGACGCAGCAGCTGGCGGAATGTTTGGTGCGCTGGT
ATCAAAAGCAATGATGATGGGGATTAAACGTGGTTTATTCTCAAACGAAGCGGGGATGGGGTCTGCGCCTAATTCGGCTG
CAGCAGCTCACGTGAAGCATCCAGTTAGCCAAGGTTTAGTGCAAATGCTCGGTGTTTTTGTTGATACTATGATCGTTTGT
ACTTGTACTGCCGTTATTATTTTGCTTTCGAATAATTATGGTAGCGAAACACTCAAAAGTATCTCACTTACGCAAAATGC
TTTGCAATACCACATAGGTGAATTTGGGGTGCATTTCCTAGCGTTTATCTTATTGTTATTCGCTTATTCTTCTATTATTG
GTAACTATGCTTATGCGGAAAGCAATATCCGTTTTATAAAAAATAAACCTTGGTTTGTATTTTTGTTCCGTTTAATGGTG
CTATTTTTCGTGTATTTCGGTGCGGTTCGCTCTGGCAATGTGGTGTGGAATTTTGCAGATACGGTGATGGCAGTCATGGC
AATCATTAACTTGATCGCAATTTTGATGTTGTCGCCAATCGTATGGAAATTGATGAAGGATTATCAACATCAGCTTAAAG
AAGGAAAAACGCCAGAGTTTAAAATTGATGAATACCCTGAATTACGTAAGAAAATATTTGATTCCCGCATTTGGAAATAA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TTCTTGTTTGTGTTTCTTTTCTCTAGAGAAATTATTAAAAAATCTCGCCTTTTCATTGAAAAGCCATACAATCAAATTAT
TTATCGCTTGAGGGATGATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
AGATAAAATGGCTAGAAAGAGATTATCTACCTTTCCAAAGAGTTAGATTATTATTTAAAGAAATTTTTTGATATTGTTTC
AGGCTTGGTTCTTCTAGTTC

Product: amino acid carrier protein

Products: Na (I) [Cytoplasm]; L-alanine [Cytoplasm] [C]

Alternate protein names: NA

Number of amino acids: Translated: 479; Mature: 479

Protein sequence:

>479_residues
MEFEFSKMLEEVLTWIVAHLDGPLWDATIIILLGTGLFFTITTGFVQFRLFPASLREMWFGRSVEGSSLTPFQAFTTGLA
SRVGVGNIGGVATAIALGGEGAVFWMWVTAFIGMSSAFAESTLAQLFKIQDKDGSFRGGPAYYIVQGLKSRCMAVAFALA
LIFTFGFAFNSVQANSIVEATSNAWNWKGEYVGISLVILTALIIFGGVKRIAIISSNLVPMMALFYLIMAVIILGMHIDM
IPSVIHRIVQSAFSFDAAAGGMFGALVSKAMMMGIKRGLFSNEAGMGSAPNSAAAAHVKHPVSQGLVQMLGVFVDTMIVC
TCTAVIILLSNNYGSETLKSISLTQNALQYHIGEFGVHFLAFILLLFAYSSIIGNYAYAESNIRFIKNKPWFVFLFRLMV
LFFVYFGAVRSGNVVWNFADTVMAVMAIINLIAILMLSPIVWKLMKDYQHQLKEGKTPEFKIDEYPELRKKIFDSRIWK

Sequences:

>Translated_479_residues
MEFEFSKMLEEVLTWIVAHLDGPLWDATIIILLGTGLFFTITTGFVQFRLFPASLREMWFGRSVEGSSLTPFQAFTTGLA
SRVGVGNIGGVATAIALGGEGAVFWMWVTAFIGMSSAFAESTLAQLFKIQDKDGSFRGGPAYYIVQGLKSRCMAVAFALA
LIFTFGFAFNSVQANSIVEATSNAWNWKGEYVGISLVILTALIIFGGVKRIAIISSNLVPMMALFYLIMAVIILGMHIDM
IPSVIHRIVQSAFSFDAAAGGMFGALVSKAMMMGIKRGLFSNEAGMGSAPNSAAAAHVKHPVSQGLVQMLGVFVDTMIVC
TCTAVIILLSNNYGSETLKSISLTQNALQYHIGEFGVHFLAFILLLFAYSSIIGNYAYAESNIRFIKNKPWFVFLFRLMV
LFFVYFGAVRSGNVVWNFADTVMAVMAIINLIAILMLSPIVWKLMKDYQHQLKEGKTPEFKIDEYPELRKKIFDSRIWK
>Mature_479_residues
MEFEFSKMLEEVLTWIVAHLDGPLWDATIIILLGTGLFFTITTGFVQFRLFPASLREMWFGRSVEGSSLTPFQAFTTGLA
SRVGVGNIGGVATAIALGGEGAVFWMWVTAFIGMSSAFAESTLAQLFKIQDKDGSFRGGPAYYIVQGLKSRCMAVAFALA
LIFTFGFAFNSVQANSIVEATSNAWNWKGEYVGISLVILTALIIFGGVKRIAIISSNLVPMMALFYLIMAVIILGMHIDM
IPSVIHRIVQSAFSFDAAAGGMFGALVSKAMMMGIKRGLFSNEAGMGSAPNSAAAAHVKHPVSQGLVQMLGVFVDTMIVC
TCTAVIILLSNNYGSETLKSISLTQNALQYHIGEFGVHFLAFILLLFAYSSIIGNYAYAESNIRFIKNKPWFVFLFRLMV
LFFVYFGAVRSGNVVWNFADTVMAVMAIINLIAILMLSPIVWKLMKDYQHQLKEGKTPEFKIDEYPELRKKIFDSRIWK

Specific function: Unknown

COG id: COG1115

COG function: function code E; Na+/alanine symporter

Gene ontology:

Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]

Metaboloic importance: Unknown [C]

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: Belongs to the sodium:alanine (SAF) symporter family [H]

Homologues:

Organism=Escherichia coli, GI1786188, Length=460, Percent_Identity=43.4782608695652, Blast_Score=348, Evalue=5e-97,

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

- InterPro:   IPR001463 [H]

Pfam domain/function: PF01235 Na_Ala_symp [H]

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 52753; Mature: 52753

Theoretical pI: Translated: 9.18; Mature: 9.18

Prosite motif: PS00873 NA_ALANINE_SYMP

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

0.6 %Cys     (Translated Protein)
4.8 %Met     (Translated Protein)
5.4 %Cys+Met (Translated Protein)
0.6 %Cys     (Mature Protein)
4.8 %Met     (Mature Protein)
5.4 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MEFEFSKMLEEVLTWIVAHLDGPLWDATIIILLGTGLFFTITTGFVQFRLFPASLREMWF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHC
GRSVEGSSLTPFQAFTTGLASRVGVGNIGGVATAIALGGEGAVFWMWVTAFIGMSSAFAE
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
STLAQLFKIQDKDGSFRGGPAYYIVQGLKSRCMAVAFALALIFTFGFAFNSVQANSIVEA
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
TSNAWNWKGEYVGISLVILTALIIFGGVKRIAIISSNLVPMMALFYLIMAVIILGMHIDM
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPSVIHRIVQSAFSFDAAAGGMFGALVSKAMMMGIKRGLFSNEAGMGSAPNSAAAAHVKH
HHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
PVSQGLVQMLGVFVDTMIVCTCTAVIILLSNNYGSETLKSISLTQNALQYHIGEFGVHFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFILLLFAYSSIIGNYAYAESNIRFIKNKPWFVFLFRLMVLFFVYFGAVRSGNVVWNFAD
HHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHH
TVMAVMAIINLIAILMLSPIVWKLMKDYQHQLKEGKTPEFKIDEYPELRKKIFDSRIWK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MEFEFSKMLEEVLTWIVAHLDGPLWDATIIILLGTGLFFTITTGFVQFRLFPASLREMWF
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHC
GRSVEGSSLTPFQAFTTGLASRVGVGNIGGVATAIALGGEGAVFWMWVTAFIGMSSAFAE
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHCCHHHHHH
STLAQLFKIQDKDGSFRGGPAYYIVQGLKSRCMAVAFALALIFTFGFAFNSVQANSIVEA
HHHHHHHHHCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHH
TSNAWNWKGEYVGISLVILTALIIFGGVKRIAIISSNLVPMMALFYLIMAVIILGMHIDM
CCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
IPSVIHRIVQSAFSFDAAAGGMFGALVSKAMMMGIKRGLFSNEAGMGSAPNSAAAAHVKH
HHHHHHHHHHHHHCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCCCCHHHHHHHH
PVSQGLVQMLGVFVDTMIVCTCTAVIILLSNNYGSETLKSISLTQNALQYHIGEFGVHFL
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH
AFILLLFAYSSIIGNYAYAESNIRFIKNKPWFVFLFRLMVLFFVYFGAVRSGNVVWNFAD
HHHHHHHHHHHHHCCHHHCCCCCEEEECCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCEEEEHHH
TVMAVMAIINLIAILMLSPIVWKLMKDYQHQLKEGKTPEFKIDEYPELRKKIFDSRIWK
HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Alpha

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: Na (I) [Periplasm]; L-alanine [Periplasm] [C]

Specific reaction: Na (I) [Periplasm] + L-alanine [Periplasm] = Na (I) [Cytoplasm] + L-alanine [Cytoplasm] [C]

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 6.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: 7542800 [H]