| Definition | Psychrobacter sp. PRwf-1 chromosome, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009524 |
| Length | 2,978,976 |
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The map label for this gene is yqeW [H]
Identifier: 148654084
GI number: 148654084
Start: 2852842
End: 2854704
Strand: Direct
Name: yqeW [H]
Synonym: PsycPRwf_2287
Alternate gene names: 148654084
Gene position: 2852842-2854704 (Clockwise)
Preceding gene: 148654076
Following gene: 148654085
Centisome position: 95.77
GC content: 46.48
Gene sequence:
>1863_bases ATGAAAAATCGCTATCTCAACAGTATGGTGCCCCCTGTGATATTAAGGCACCTTAAAAAAGCAAAGTTCTTGGGATTGGG GCTGCTGCTTATCGCCTTGGTGTACTCTTTTGTCATGAGCTCAGCTTGGCTGGTATTGTGCTATGGTCTGGCGCTATTTT TGTTTGGTATGCAGTGTATAGAAGGCGCATTGCAAAGCGCGGCTGGCGGTAGGCTTGAGCAGATTATAGCCAAAAGCACT GAGACTCCGATTAAGTCTTTTTTGTTCGGCATTGGGGCCACTTTTTTATTGCAGTCCACCACCTTAGTCTCTTTATTAAC CATCGCTTTTTTGAGCACAGGCATGATTAGTCTTGCCGGCGGACTGGCGGTGATACTGGGCACCAATTTTGGGGCAACCA GTGGTATATGGCTTTTGGCTTGGGCGGGACAAAGCTTAAGCTTAAGTCCGGCTGCACTGCCCATGCTGGTAGTGGGTGTT TTGCTCGGCTTTATAGATAAGCGGCTCAAGGTGTTCGGTCAGGCATTGATTGGTATTGCGTTAATTTTTTTAGGGATCGA TTCCATTAAAGACGGCTTTGGCGCCTTTGGTCAAATTGAGTTGTCTGATATTAAGGCCAGTGGTATCTCTCAAGTGCTGC TATTCACCCTGCTGGGGTTTTTGCTCACTTGTGTACTGCAGTCCTCTCACGCCACTTTAATCTTGGTATTGGCCGCTTTG GCTGCTGGCCAATTAACCCTCACCCAAAGCTTTGCCATTGCGCTAGGGTCTAACTTAGGCAGTAGCTTTACCACCGCCTT GGTGGGTATGCTCAGCAGCGATAGAAATGGTCAGCGCTTGGCACTGGCGCACCTGATATATAACTGGGTGACCGCATTAT TAGCCCTGATACTATGGCTGCCTCTTACCTTTGCTGTGGGGGCGATTGCCACTGTCATTGGGATGCACTCACCGTTGTTG CAACTGGCCTTGTTCCACACCTTATTTAACGTATTGGGCGTTTCAGTATTTTGGGGTATTCAGCAGCCGTTTATCGAAAA GCTGCACCTATTTTTGCCCGATAAATCACCAAAAAAACAACTGCCCGATGGGGCAGAAGCTGTACACCCCCTACATTTGC ACCGCAATATGCTCAAGTCCACAGACACTGCCATTCATGCCGTCCATCAAGAGATTGAGCACTTAACCACCTTAGGGCTT GAGGTGGTTTGTCATGCCATTTATGTGCCCAACGCGCAGCTATATACGCCTTCTTCTGAGCTGCCTAACCCTGCTCGGCC GCTGCAGCTTGATGTGCAAAGCTTATACGAGTGGCAGATTAAGCCACTGTATAGTGAAATATTGAATTTCACCAGTAAAA TAGATATCCATGCTAATAAGGTACAAAAGAAGCTTACCGATGCTCATATCAATGCCTTCCATGTGGTAGAAATGGTTAAG CAAAGCAAGCACTTACAAAAAAATATGCAGCAATTTTTAAATACTCCTGGTACCTCCATTTATCAAGATTACATGGCGCT GCGACAGCATCTTTTTGATATGCTCATAAGCTTTAATCGGGTACGCAGCCTACAAAAACAAAGCCTTGATAGGCAGCAGG CCACCGAGATTTTTGTGCAGCACACAGAAGCATCCATGTCACCACACCACCATGTGCTCGACAAGCTTAGAGAGCATAAG ATTGATAAACTGCAAGCCTCCTCGCTCATTAACGACATGAACTATGTGCGCCGTATTAATAGTGGATTGTCTGAGATTTT AATCAATAGCCAAGATTTAAGCCTTAACAGCGTGAGCACAACTGGGTCTGCCACTAAAGTGATAGACACCCCCAATGGTG TAGACAAGTCAGATAACGCTTAG
Upstream 100 bases:
>100_bases TGGGTTGGCTATAATCTTCAGCTCAGCTTATGATAGTATCAATTGTGCTTATTATAGCCGGATCTACCGCCCTGTCTTGC CGTGACTTATTGGCTGTCTT
Downstream 100 bases:
>100_bases TTATAGCGGTGCAGACAGATGCCTCTTGCCTGCTTTTGCGTATAATGAGAGTATAGGCTATAAATTAGCGATTATCTTTG AGCCTTTGTGCTGTATCTTT
Product: Na+/Pi-cotransporter
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 620; Mature: 620
Protein sequence:
>620_residues MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCIEGALQSAAGGRLEQIIAKST ETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAGGLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGV LLGFIDKRLKVFGQALIGIALIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWLPLTFAVGAIATVIGMHSPLL QLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQLPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGL EVVCHAIYVPNAQLYTPSSELPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQHTEASMSPHHHVLDKLREHK IDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVSTTGSATKVIDTPNGVDKSDNA
Sequences:
>Translated_620_residues MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCIEGALQSAAGGRLEQIIAKST ETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAGGLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGV LLGFIDKRLKVFGQALIGIALIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWLPLTFAVGAIATVIGMHSPLL QLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQLPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGL EVVCHAIYVPNAQLYTPSSELPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQHTEASMSPHHHVLDKLREHK IDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVSTTGSATKVIDTPNGVDKSDNA >Mature_620_residues MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCIEGALQSAAGGRLEQIIAKST ETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAGGLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGV LLGFIDKRLKVFGQALIGIALIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWLPLTFAVGAIATVIGMHSPLL QLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQLPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGL EVVCHAIYVPNAQLYTPSSELPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQHTEASMSPHHHVLDKLREHK IDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVSTTGSATKVIDTPNGVDKSDNA
Specific function: Unknown
COG id: COG1283
COG function: function code P; Na+/phosphate symporter
Gene ontology:
Cell location: Cell membrane; Multi-pass membrane protein (Potential) [H]
Metaboloic importance: Non_Essential [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: To E.coli yjbB [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1790451, Length=352, Percent_Identity=26.1363636363636, Blast_Score=73, Evalue=5e-14,
Paralogues:
None
Copy number: NA
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR003841 - InterPro: IPR004633 [H]
Pfam domain/function: PF02690 Na_Pi_cotrans [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 67775; Mature: 67775
Theoretical pI: Translated: 9.19; Mature: 9.19
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.6 %Cys (Translated Protein) 2.4 %Met (Translated Protein) 3.1 %Cys+Met (Translated Protein) 0.6 %Cys (Mature Protein) 2.4 %Met (Mature Protein) 3.1 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCI CCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EGALQSAAGGRLEQIIAKSTETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAG HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGVLLGFIDKRLKVFGQALIGIA CEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL HHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWL HCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLTFAVGAIATVIGMHSPLLQLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHC LPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGLEVVCHAIYVPNAQLYTPSSE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCC LPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQ HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HTEASMSPHHHVLDKLREHKIDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVST HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC TGSATKVIDTPNGVDKSDNA CCCCCEEEECCCCCCCCCCC >Mature Secondary Structure MKNRYLNSMVPPVILRHLKKAKFLGLGLLLIALVYSFVMSSAWLVLCYGLALFLFGMQCI CCCCCHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH EGALQSAAGGRLEQIIAKSTETPIKSFLFGIGATFLLQSTTLVSLLTIAFLSTGMISLAG HHHHHHHCCHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC GLAVILGTNFGATSGIWLLAWAGQSLSLSPAALPMLVVGVLLGFIDKRLKVFGQALIGIA CEEEEEECCCCCCCCEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH LIFLGIDSIKDGFGAFGQIELSDIKASGISQVLLFTLLGFLLTCVLQSSHATLILVLAAL HHHHHHHHHHHCCCCCCEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHH AAGQLTLTQSFAIALGSNLGSSFTTALVGMLSSDRNGQRLALAHLIYNWVTALLALILWL HCCCHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH PLTFAVGAIATVIGMHSPLLQLALFHTLFNVLGVSVFWGIQQPFIEKLHLFLPDKSPKKQ HHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHCCCCCCHHC LPDGAEAVHPLHLHRNMLKSTDTAIHAVHQEIEHLTTLGLEVVCHAIYVPNAQLYTPSSE CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCEEECCCCC LPNPARPLQLDVQSLYEWQIKPLYSEILNFTSKIDIHANKVQKKLTDAHINAFHVVEMVK CCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH QSKHLQKNMQQFLNTPGTSIYQDYMALRQHLFDMLISFNRVRSLQKQSLDRQQATEIFVQ HHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH HTEASMSPHHHVLDKLREHKIDKLQASSLINDMNYVRRINSGLSEILINSQDLSLNSVST HHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCCCCCC TGSATKVIDTPNGVDKSDNA CCCCCEEEECCCCCCCCCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 8969508; 9023197; 9384377 [H]