Definition Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 chromosome, complete genome.
Accession NC_009515
Length 1,853,160

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The map label for this gene is 148643345

Identifier: 148643345

GI number: 148643345

Start: 1288709

End: 1289971

Strand: Reverse

Name: 148643345

Synonym: Msm_1285

Alternate gene names: NA

Gene position: 1289971-1288709 (Counterclockwise)

Preceding gene: 148643346

Following gene: 148643337

Centisome position: 69.61

GC content: 27.16

Gene sequence:

>1263_bases
ATGAATATTAAAAAATATAAGAATTATTTATTCTTATTACCTTTTATATTTTTATTTTTAATTTTATTGAATTGGCACCA
TTCGATTGGATTATCGATAGATGACTTATTTTTTTACACCATTCCCCAAGAAACAAATATTATGAGCTTTGTTATAGAAA
GATATGATATTTGGAGCTCCAGAATACTGATTGAATATATTTTATGCCATATTTTACAATCCCCTCTTATACTTTGGTGG
TATTTAGATAGCTTAATTTTCACATTTATTGCTGTACTGACTTATAAACTCATTAACGGTGAAAATAAGCTTTTTTATTC
TACATTATCTTGCATATTATGTTTATCCTTCATATTTTCAAGTCATTATGCTTTAGGCTCAGCCGGATTTATTACAACAA
CCATTAATTATACTTGGCCATTGTTCAGTGGCTTGTTGGCCATATATATTTTAAAAAATCATGCTGCAAAGGATACCTGC
AAAACAAAAAGAATATTGGCTTATATAATTTCAGTACTTTGTCTTATGTTTGCAGTAAATAACGAGCAGCTAGCTGTTAT
TTTACTCGGATTGTTTGTGCTGTATTATCTGCTTAACTACAAAACAAAAATCAATAAAAAATGTTATCTAATAGGAATTA
CATCAGTTATAGGAATTATTAATACTGTTATTTGTCCGGGAATTCATAAACGATATATTCTAGAACTAAGATGGTTTCCG
GATTATTTGCAGCTGAATATATTAAATAAACTTAATATCGGATTTTCACACATTATAAATAGATGTGTTACCTGGTGTGA
TCTTACTACTTTAATTTTACTTGGAATTATTGCAATATGTGTTTATTTACTTACTAAAAATAAAAAACAAACCATAATCA
GTTTAATCCCATTTATAATAGCTAGTGGATTTTGGATTCTTACCTTAACAGATAATCTAACACTTATTCAGATAATGAAT
GCAAATATTGTTCGCTATGGCTATGTTCCAATAAGCATTAAAAGAATGATTTTAAGCTTAACAATTTATGCAATTTTCAT
TATAGCATTTCTATACAGCCTATATTCAATATATAAAAATCAAAAAAGTGTTTTATGGCCGATATACAGCATAATGTTTG
TTGGATTTGCTTCCACAATAATGTTTGGTTTTACTCCGTCAACCCCGTCAATGGAGAGAATGTACATATTTTTTTATTAT
GGAAATATGTTAGCTATTCTTATATTTATTAAACAAATTATAGAAAAAAGAATCAAAACATGA

Upstream 100 bases:

>100_bases
TAGCTGAAAGTGACGGTACAACAACAAAAATAGGTTTGGATGCCACCAAATCCTTAAAAACCCTAGATAAATTTGAAAGA
GTTAGTTTCGGAGAGTAATT

Downstream 100 bases:

>100_bases
TATTTAATTTTTTTCCACATTTCATACATTTTTTATTTTTATTTAAAACTTCTGTAGAATAGCTATTTCTTTTTAAAAGA
GTTTCACCACAATTTGAACA

Product: hypothetical protein

Products: NA

Alternate protein names: None

Number of amino acids: Translated: 420; Mature: 420

Protein sequence:

>420_residues
MNIKKYKNYLFLLPFIFLFLILLNWHHSIGLSIDDLFFYTIPQETNIMSFVIERYDIWSSRILIEYILCHILQSPLILWW
YLDSLIFTFIAVLTYKLINGENKLFYSTLSCILCLSFIFSSHYALGSAGFITTTINYTWPLFSGLLAIYILKNHAAKDTC
KTKRILAYIISVLCLMFAVNNEQLAVILLGLFVLYYLLNYKTKINKKCYLIGITSVIGIINTVICPGIHKRYILELRWFP
DYLQLNILNKLNIGFSHIINRCVTWCDLTTLILLGIIAICVYLLTKNKKQTIISLIPFIIASGFWILTLTDNLTLIQIMN
ANIVRYGYVPISIKRMILSLTIYAIFIIAFLYSLYSIYKNQKSVLWPIYSIMFVGFASTIMFGFTPSTPSMERMYIFFYY
GNMLAILIFIKQIIEKRIKT

Sequences:

>Translated_420_residues
MNIKKYKNYLFLLPFIFLFLILLNWHHSIGLSIDDLFFYTIPQETNIMSFVIERYDIWSSRILIEYILCHILQSPLILWW
YLDSLIFTFIAVLTYKLINGENKLFYSTLSCILCLSFIFSSHYALGSAGFITTTINYTWPLFSGLLAIYILKNHAAKDTC
KTKRILAYIISVLCLMFAVNNEQLAVILLGLFVLYYLLNYKTKINKKCYLIGITSVIGIINTVICPGIHKRYILELRWFP
DYLQLNILNKLNIGFSHIINRCVTWCDLTTLILLGIIAICVYLLTKNKKQTIISLIPFIIASGFWILTLTDNLTLIQIMN
ANIVRYGYVPISIKRMILSLTIYAIFIIAFLYSLYSIYKNQKSVLWPIYSIMFVGFASTIMFGFTPSTPSMERMYIFFYY
GNMLAILIFIKQIIEKRIKT
>Mature_420_residues
MNIKKYKNYLFLLPFIFLFLILLNWHHSIGLSIDDLFFYTIPQETNIMSFVIERYDIWSSRILIEYILCHILQSPLILWW
YLDSLIFTFIAVLTYKLINGENKLFYSTLSCILCLSFIFSSHYALGSAGFITTTINYTWPLFSGLLAIYILKNHAAKDTC
KTKRILAYIISVLCLMFAVNNEQLAVILLGLFVLYYLLNYKTKINKKCYLIGITSVIGIINTVICPGIHKRYILELRWFP
DYLQLNILNKLNIGFSHIINRCVTWCDLTTLILLGIIAICVYLLTKNKKQTIISLIPFIIASGFWILTLTDNLTLIQIMN
ANIVRYGYVPISIKRMILSLTIYAIFIIAFLYSLYSIYKNQKSVLWPIYSIMFVGFASTIMFGFTPSTPSMERMYIFFYY
GNMLAILIFIKQIIEKRIKT

Specific function: Unknown

COG id: NA

COG function: NA

Gene ontology:

Cell location: Cytoplasmic

Metaboloic importance: NA

Operon status: Not Known

Operon components: None

Similarity: NA

Homologues:

None

Paralogues:

None

Copy number: NA

Swissprot (AC and ID): NA

Other databases:

NA

Pfam domain/function: NA

EC number: NA

Molecular weight: Translated: 48964; Mature: 48964

Theoretical pI: Translated: 9.57; Mature: 9.57

Prosite motif: NA

Important sites: NA

Signals:

None

Transmembrane regions:

None

Cys/Met content:

2.4 %Cys     (Translated Protein)
2.4 %Met     (Translated Protein)
4.8 %Cys+Met (Translated Protein)
2.4 %Cys     (Mature Protein)
2.4 %Met     (Mature Protein)
4.8 %Cys+Met (Mature Protein)

Secondary structure:

>Translated Secondary Structure
MNIKKYKNYLFLLPFIFLFLILLNWHHSIGLSIDDLFFYTIPQETNIMSFVIERYDIWSS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCEEHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
RILIEYILCHILQSPLILWWYLDSLIFTFIAVLTYKLINGENKLFYSTLSCILCLSFIFS
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SHYALGSAGFITTTINYTWPLFSGLLAIYILKNHAAKDTCKTKRILAYIISVLCLMFAVN
CCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NEQLAVILLGLFVLYYLLNYKTKINKKCYLIGITSVIGIINTVICPGIHKRYILELRWFP
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEEECC
DYLQLNILNKLNIGFSHIINRCVTWCDLTTLILLGIIAICVYLLTKNKKQTIISLIPFII
CHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
ASGFWILTLTDNLTLIQIMNANIVRYGYVPISIKRMILSLTIYAIFIIAFLYSLYSIYKN
HCCEEEEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QKSVLWPIYSIMFVGFASTIMFGFTPSTPSMERMYIFFYYGNMLAILIFIKQIIEKRIKT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
>Mature Secondary Structure
MNIKKYKNYLFLLPFIFLFLILLNWHHSIGLSIDDLFFYTIPQETNIMSFVIERYDIWSS
CCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCCEEHEEEEECCCCCHHHHHHHHHHHHHHH
RILIEYILCHILQSPLILWWYLDSLIFTFIAVLTYKLINGENKLFYSTLSCILCLSFIFS
HHHHHHHHHHHHHCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHH
SHYALGSAGFITTTINYTWPLFSGLLAIYILKNHAAKDTCKTKRILAYIISVLCLMFAVN
CCCCCCCCCEEEEEEECHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCC
NEQLAVILLGLFVLYYLLNYKTKINKKCYLIGITSVIGIINTVICPGIHKRYILELRWFP
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHCCCEEEEEEHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHEEEEEECC
DYLQLNILNKLNIGFSHIINRCVTWCDLTTLILLGIIAICVYLLTKNKKQTIISLIPFII
CHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCHHHHHHHHHHHH
ASGFWILTLTDNLTLIQIMNANIVRYGYVPISIKRMILSLTIYAIFIIAFLYSLYSIYKN
HCCEEEEEEECCEEEEEEECCCEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC
QKSVLWPIYSIMFVGFASTIMFGFTPSTPSMERMYIFFYYGNMLAILIFIKQIIEKRIKT
CCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCCHHHEEEEEEHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC

PDB accession: NA

Resolution: NA

Structure class: Unstructured

Cofactors: NA

Metal ions: NA

Kcat value (1/min): NA

Specific activity: NA

Km value (mM): NA

Substrates: NA

Specific reaction: NA

General reaction: NA

Inhibitor: NA

Structure determination priority: 9.0

TargetDB status: NA

Availability: NA

References: NA