| Definition | Clostridium botulinum A str. ATCC 3502, complete genome. |
|---|---|
| Accession | NC_009495 |
| Length | 3,886,916 |
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The map label for this gene is mviN [H]
Identifier: 148381046
GI number: 148381046
Start: 3282030
End: 3283586
Strand: Reverse
Name: mviN [H]
Synonym: CBO3095
Alternate gene names: 148381046
Gene position: 3283586-3282030 (Counterclockwise)
Preceding gene: 148381047
Following gene: 148381045
Centisome position: 84.48
GC content: 26.91
Gene sequence:
>1557_bases ATGAAGGAAAACAAAGCTTTAAAAAGTTCTGTTTTTGTTATGCTATTAATAATATTAGGAAAAGTCTTTGCACTAATAAG AGATTCTTTAATAGCAGCAAAATTTGGAGCTACTGATATAACAGATATATACAATTTTTCATTGGGTATAGTGTACCTTT TAACTACTATAAGCTATGGGTTAACTACCACCTTTATACCAATTCATACGGAGAATTTGGAAAATGGAAGCAAGAAAGAA AGTAATAAATTTGTAAATAATGTGCTTAATACTTTTTCCATAGGAACTATTATCTTAACTATATTAATGATAATATTTGC AAAATATATAATCTATATTTTTGCTCCAGGATTTCAGAAAGACTTAATTGTTTTCAATACTTCTATTAAAATAACTAGAA TAATGTTATTATCTTTGATTTTCATAAGTTTACAAAGTGTTATTACAGGAGTGTTGCAATCCCATAAACAATTTTTAGAA CCCGCGGCTATGGCAATGGTATCTAATATAGTCTATATTATATATCTAGTCTTTTTAGCTAGTAACTATGGAATGATAGG TTTTGCGGTAGCTATAGTATTAGGTTTCTTTGCACAATTCATAATAAATATACCTAAATATAAAAAAATGGGTTATAAAT ATAGTACATATATTAATTTAGAAGATAACAAAACTAGACAAATGTTCAAACTTACAATGCCTGTTATAATAAGCACTTCT GTTATTCAATTAAATTCTGTTATAAATAGAGCTTTTGCTACTACTATTTTTGGGGGAGCAGCTACTATATTAGACAATGC AAATAAAATAAATACATTGGCCTATGAAGTATTCGCTATAGGAATAGCAATGATAGTTTATCCAACGCTATCTGAATTAG CTGCTAAAAATGATAAAAAACAATATAAAGTGGAATTAGGAAGAGCTATAAATATAATACTTGTAATAATGGTACCAGCA GCAGTTGGAATTGCAACCCTTAGGGAGCCACTTATAAATGTAATTTTTAAAAGGGGAGCCTTTAGTGAAAATGCTGCTTC TTTAACGGCACGAGCATTACTTTTATATACTCCAGCTATGATAGCTTATGGGGTAAGAGATATACTAAATAAAGCTTTCT ATGCTATAAAAGATACCAAAACGCCTATGATTAATAGTTTTATAGGTATAATAATAAATGTAGTAATAAATAGTTTATTA ATAAAATATTTAGGTGTGAGTGGGCTTACATTAGCAACTAGTATATCTGCATTTGTTATAACTATAATTATGTTATTAGA TTTAAATAAAAAGCTAAATGGTATAGATATTAAAAATATAATCATATCCTTTTTAAAGGTAATTTTATCTGCTTTGATTA TGGGGATAATAGTTGCTGTTATAAATAAATTTACTTTGTTAAGCTTAGGCAATGAAACTAAAGGAAGTGCGATATCGATT TTAATTTGTATGATTATTGGTGGGATATCCTATACTTTATCCATATATTTATTAAAAGTTAAGGAGATACAAGATATAGT AGGACCATTATTAAAAATATTAAAACTTAAAAAATAA
Upstream 100 bases:
>100_bases TCTATATAATACTGTAATTAATAAATACTCTATGGAGAGTTTTTGTAAATCCTATTATGAATGTTATAAAAATCTGATTT AATGTTTTGGAGTGGATTAA
Downstream 100 bases:
>100_bases ATAGTCAATTATATTGTAAAGGAAATATAATTTTGATATAGTATAAACAGTATTTTAATAATTTGTTTATGATAAATTGT TAAAGTACAATATATGTATA
Product: integral membrane protein MviN
Products: NA
Alternate protein names: NA
Number of amino acids: Translated: 518; Mature: 518
Protein sequence:
>518_residues MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYGLTTTFIPIHTENLENGSKKE SNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQKDLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLE PAAMAMVSNIVYIIYLVFLASNYGMIGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELAAKNDKKQYKVELGRAINIILVIMVPA AVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAMIAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLL IKYLGVSGLTLATSISAFVITIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI LICMIIGGISYTLSIYLLKVKEIQDIVGPLLKILKLKK
Sequences:
>Translated_518_residues MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYGLTTTFIPIHTENLENGSKKE SNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQKDLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLE PAAMAMVSNIVYIIYLVFLASNYGMIGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELAAKNDKKQYKVELGRAINIILVIMVPA AVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAMIAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLL IKYLGVSGLTLATSISAFVITIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI LICMIIGGISYTLSIYLLKVKEIQDIVGPLLKILKLKK >Mature_518_residues MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYGLTTTFIPIHTENLENGSKKE SNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQKDLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLE PAAMAMVSNIVYIIYLVFLASNYGMIGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELAAKNDKKQYKVELGRAINIILVIMVPA AVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAMIAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLL IKYLGVSGLTLATSISAFVITIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI LICMIIGGISYTLSIYLLKVKEIQDIVGPLLKILKLKK
Specific function: Unknown
COG id: COG0728
COG function: function code R; Uncharacterized membrane protein, putative virulence factor
Gene ontology:
Cell location: Cell inner membrane; Multi-pass membrane protein [H]
Metaboloic importance: Unknown [C]
Operon status: Not Known
Operon components: None
Similarity: Belongs to the mviN family [H]
Homologues:
Organism=Escherichia coli, GI1787309, Length=429, Percent_Identity=25.6410256410256, Blast_Score=150, Evalue=2e-37,
Paralogues:
None
Copy number: 10-20 Molecules/Cell [C]
Swissprot (AC and ID): NA
Other databases:
- InterPro: IPR004268 [H]
Pfam domain/function: PF03023 MVIN [H]
EC number: NA
Molecular weight: Translated: 57056; Mature: 57056
Theoretical pI: Translated: 10.28; Mature: 10.28
Prosite motif: NA
Important sites: NA
Signals:
None
Transmembrane regions:
None
Cys/Met content:
0.2 %Cys (Translated Protein) 3.3 %Met (Translated Protein) 3.5 %Cys+Met (Translated Protein) 0.2 %Cys (Mature Protein) 3.3 %Met (Mature Protein) 3.5 %Cys+Met (Mature Protein)
Secondary structure:
>Translated Secondary Structure MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC LTTTFIPIHTENLENGSKKESNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQK HHEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLEPAAMAMVSNIVYIIYLVFLA CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SNYGMIGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELAAKNDKK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH QYKVELGRAINIILVIMVPAAVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLLIKYLGVSGLTLATSISAFVI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH TIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH LICMIIGGISYTLSIYLLKVKEIQDIVGPLLKILKLKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC >Mature Secondary Structure MKENKALKSSVFVMLLIILGKVFALIRDSLIAAKFGATDITDIYNFSLGIVYLLTTISYG CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHC LTTTFIPIHTENLENGSKKESNKFVNNVLNTFSIGTIILTILMIIFAKYIIYIFAPGFQK HHEEEEEEEECCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCC DLIVFNTSIKITRIMLLSLIFISLQSVITGVLQSHKQFLEPAAMAMVSNIVYIIYLVFLA CEEEEECCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHH SNYGMIGFAVAIVLGFFAQFIINIPKYKKMGYKYSTYINLEDNKTRQMFKLTMPVIISTS CCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHCCCEEEEEEEECCCCHHHHHHHHHHHHHHHH VIQLNSVINRAFATTIFGGAATILDNANKINTLAYEVFAIGIAMIVYPTLSELAAKNDKK HHHHHHHHHHHHHHHHHCCHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHH QYKVELGRAINIILVIMVPAAVGIATLREPLINVIFKRGAFSENAASLTARALLLYTPAM HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHH IAYGVRDILNKAFYAIKDTKTPMINSFIGIIINVVINSLLIKYLGVSGLTLATSISAFVI HHHHHHHHHHHHHHHHCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCCCHHHHHHHHHHHH TIIMLLDLNKKLNGIDIKNIIISFLKVILSALIMGIIVAVINKFTLLSLGNETKGSAISI HHHHHHHCCCCCCCCCHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHEECCCCCCCHHHHH LICMIIGGISYTLSIYLLKVKEIQDIVGPLLKILKLKK HHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHHCCC
PDB accession: NA
Resolution: NA
Structure class: Alpha
Cofactors: NA
Metal ions: NA
Kcat value (1/min): NA
Specific activity: NA
Km value (mM): NA
Substrates: NA
Specific reaction: NA
General reaction: NA
Inhibitor: NA
Structure determination priority: 6.0
TargetDB status: NA
Availability: NA
References: 9823893 [H]